MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_016051	GAC	2	6	1515897	1515902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477642
30003	NC_016051	T	6	6	1515903	1515908	0 %	100 %	0 %	0 %	223477642
30004	NC_016051	CTT	2	6	1515933	1515938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477642
30005	NC_016051	ACTGC	2	10	1515994	1516003	20 %	20 %	20 %	40 %	223477642
30006	NC_016051	GCC	2	6	1516042	1516047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477642
30007	NC_016051	CCGG	2	8	1516069	1516076	0 %	0 %	50 %	50 %	223477642
30008	NC_016051	TGA	2	6	1516115	1516120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477642
30009	NC_016051	TCT	2	6	1516148	1516153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477642
30010	NC_016051	TCG	2	6	1516232	1516237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477642
30011	NC_016051	GCC	2	6	1516458	1516463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477642
30012	NC_016051	CAT	2	6	1516493	1516498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477642
30013	NC_016051	CCG	2	6	1516534	1516539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477642
30014	NC_016051	TAT	2	6	1516551	1516556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477642
30015	NC_016051	ACC	2	6	1516572	1516577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30016	NC_016051	GAAGA	2	10	1516580	1516589	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30017	NC_016051	CTC	2	6	1516633	1516638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30018	NC_016051	TTAT	2	8	1516822	1516829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30019	NC_016051	T	6	6	1516829	1516834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30020	NC_016051	A	6	6	1516927	1516932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30021	NC_016051	TCT	2	6	1517011	1517016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30022	NC_016051	CTC	2	6	1517171	1517176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30023	NC_016051	CTT	2	6	1517180	1517185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30024	NC_016051	ATT	2	6	1517207	1517212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30025	NC_016051	AGAA	2	8	1517233	1517240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30026	NC_016051	TTG	2	6	1517257	1517262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30027	NC_016051	TGA	2	6	1517270	1517275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30028	NC_016051	ATA	2	6	1517377	1517382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525926
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30034	NC_016051	ATT	2	6	1517764	1517769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525926
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30036	NC_016051	GCCG	2	8	1518003	1518010	0 %	0 %	50 %	50 %	223477606
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30039	NC_016051	TCT	2	6	1518239	1518244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477606
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30041	NC_016051	TCG	2	6	1518344	1518349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477606
30042	NC_016051	TCG	2	6	1518436	1518441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477606
30043	NC_016051	TCGC	2	8	1518547	1518554	0 %	25 %	25 %	50 %	223477606
30044	NC_016051	TGA	2	6	1518569	1518574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477606
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30053	NC_016051	CCT	2	6	1518866	1518871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477606
30054	NC_016051	AGT	2	6	1518887	1518892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477606
30055	NC_016051	CTC	2	6	1518924	1518929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477606
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30098	NC_016051	CCG	2	6	1521143	1521148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30099	NC_016051	AC	3	6	1521154	1521159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30100	NC_016051	ACTC	2	8	1521199	1521206	25 %	25 %	0 %	50 %	223477396
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30111	NC_016051	C	6	6	1521506	1521511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30112	NC_016051	GTG	2	6	1521535	1521540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30113	NC_016051	CAT	2	6	1521551	1521556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30114	NC_016051	CCA	2	6	1521663	1521668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30115	NC_016051	TCA	2	6	1521692	1521697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30116	NC_016051	GGGT	2	8	1521732	1521739	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30117	NC_016051	TTA	2	6	1521828	1521833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30118	NC_016051	AAAC	2	8	1521834	1521841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30119	NC_016051	CCT	2	6	1521943	1521948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30236	NC_016051	GGA	2	6	1527678	1527683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525927
30237	NC_016051	TCG	2	6	1527731	1527736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525927
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30295	NC_016051	GA	3	6	1530412	1530417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30296	NC_016051	AGG	2	6	1530557	1530562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30301	NC_016051	G	6	6	1531108	1531113	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30302	NC_016051	TGC	2	6	1531232	1531237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30320	NC_016051	GTTT	2	8	1532318	1532325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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30333	NC_016051	CGG	2	6	1532932	1532937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477408
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30341	NC_016051	TCCCC	2	10	1533500	1533509	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
30342	NC_016051	CTC	2	6	1533569	1533574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477538
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30350	NC_016051	CCG	2	6	1534220	1534225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477538
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30352	NC_016051	CCCG	2	8	1534347	1534354	0 %	0 %	25 %	75 %	223477509
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