MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016051	AGGA	2	8	128431	128438	50 %	0 %	50 %	0 %	223478896
2502	NC_016051	AGG	2	6	128461	128466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478896
2503	NC_016051	CCCA	2	8	128560	128567	25 %	0 %	0 %	75 %	223478731
2504	NC_016051	GGA	2	6	128582	128587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478731
2505	NC_016051	GAT	2	6	128659	128664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478454
2506	NC_016051	CCT	2	6	128668	128673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478454
2507	NC_016051	CGC	2	6	128743	128748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478454
2508	NC_016051	TCA	2	6	128820	128825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478454
2509	NC_016051	AAG	2	6	128828	128833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478454
2510	NC_016051	TCG	2	6	128841	128846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478454
2511	NC_016051	GAA	2	6	128854	128859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478454
2512	NC_016051	CTA	2	6	128866	128871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478454
2513	NC_016051	CGA	2	6	128884	128889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478454
2514	NC_016051	ATC	3	9	128906	128914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478454
2515	NC_016051	CAG	2	6	128924	128929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478454
2516	NC_016051	CCG	2	6	128933	128938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478454
2517	NC_016051	GGT	2	6	128962	128967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478454
2518	NC_016051	ATA	2	6	129011	129016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478454
2519	NC_016051	GGC	2	6	129023	129028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478454
2520	NC_016051	GGC	2	6	129067	129072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478454
2521	NC_016051	GAG	2	6	129083	129088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478454
2522	NC_016051	TAC	2	6	129098	129103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478454
2523	NC_016051	GGT	2	6	129133	129138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478454
2524	NC_016051	GGAG	2	8	129141	129148	25 %	0 %	75 %	0 %	223478454
2525	NC_016051	CGGC	2	8	129174	129181	0 %	0 %	50 %	50 %	223478454
2526	NC_016051	GC	3	6	129337	129342	0 %	0 %	50 %	50 %	223478454
2527	NC_016051	GAG	2	6	129353	129358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478454
2528	NC_016051	TCT	2	6	129478	129483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_016051	CGC	2	6	129487	129492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_016051	T	6	6	129543	129548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_016051	GTG	2	6	129598	129603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_016051	CGGA	2	8	129617	129624	25 %	0 %	50 %	25 %	223478643
2533	NC_016051	CAAGC	2	10	129708	129717	40 %	0 %	20 %	40 %	223478643
2534	NC_016051	CTG	2	6	129727	129732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478643
2535	NC_016051	TGA	2	6	129761	129766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478643
2536	NC_016051	ACA	2	6	129770	129775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478643
2537	NC_016051	GGA	2	6	129787	129792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478643
2538	NC_016051	TCG	2	6	129806	129811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478643
2539	NC_016051	ATA	2	6	129820	129825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478643
2540	NC_016051	TTC	2	6	129892	129897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478643
2541	NC_016051	CGG	2	6	129903	129908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478643
2542	NC_016051	AAC	2	6	129912	129917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478643
2543	NC_016051	CGT	2	6	129945	129950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478643
2544	NC_016051	TCG	2	6	129959	129964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478643
2545	NC_016051	CTA	2	6	129966	129971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478643
2546	NC_016051	TCG	2	6	130046	130051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478643
2547	NC_016051	CGG	2	6	130052	130057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478643
2548	NC_016051	CGC	2	6	130176	130181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478643
2549	NC_016051	CGG	2	6	130196	130201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478643
2550	NC_016051	TCC	2	6	130253	130258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478643
2551	NC_016051	CTC	2	6	130298	130303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478581
2552	NC_016051	TCG	2	6	130308	130313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478581
2553	NC_016051	ACG	2	6	130362	130367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478581
2554	NC_016051	ACA	2	6	130476	130481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478581
2555	NC_016051	TCG	2	6	130551	130556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478581
2556	NC_016051	CTA	2	6	130564	130569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478581
2557	NC_016051	CCT	3	9	130602	130610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478581
2558	NC_016051	ATTT	2	8	130613	130620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016051	T	6	6	130618	130623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016051	GGT	2	6	130624	130629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_016051	TCT	2	6	130689	130694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478853
2562	NC_016051	GGT	2	6	130780	130785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478853
2563	NC_016051	GGA	2	6	130794	130799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478853
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2565	NC_016051	GGGTCT	2	12	130881	130892	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	223478853
2566	NC_016051	AGGG	2	8	130985	130992	25 %	0 %	75 %	0 %	223478853
2567	NC_016051	TACGC	2	10	131014	131023	20 %	20 %	20 %	40 %	223478853
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2570	NC_016051	GAG	2	6	131194	131199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478853
2571	NC_016051	AGG	2	6	131241	131246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478853
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2573	NC_016051	TCG	2	6	131406	131411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478853
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2575	NC_016051	GACA	2	8	131661	131668	50 %	0 %	25 %	25 %	223478617
2576	NC_016051	CGG	2	6	131677	131682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478617
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2581	NC_016051	TCC	2	6	131921	131926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478617
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2586	NC_016051	GGAA	2	8	132000	132007	50 %	0 %	50 %	0 %	223478617
2587	NC_016051	CGT	2	6	132012	132017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478617
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2589	NC_016051	TCGCC	2	10	132045	132054	0 %	20 %	20 %	60 %	223478617
2590	NC_016051	GTG	2	6	132067	132072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478617
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2592	NC_016051	AGG	2	6	132212	132217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478617
2593	NC_016051	CCT	2	6	132237	132242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478617
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2595	NC_016051	CAGGCC	2	12	132434	132445	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	223478922
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2598	NC_016051	CGGTC	2	10	132523	132532	0 %	20 %	40 %	40 %	223478922
2599	NC_016051	CCG	2	6	132651	132656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478922
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2601	NC_016051	GAG	3	9	132730	132738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478922
2602	NC_016051	ACG	2	6	132755	132760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478922
2603	NC_016051	CTT	2	6	132793	132798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478922
2604	NC_016051	CAG	2	6	132915	132920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525707
2605	NC_016051	GCA	2	6	132956	132961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525707
2606	NC_016051	ATC	2	6	132973	132978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525707
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2609	NC_016051	CGA	2	6	133130	133135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525707
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2612	NC_016051	GCCT	2	8	133246	133253	0 %	25 %	25 %	50 %	350525707
2613	NC_016051	GCAA	2	8	133290	133297	50 %	0 %	25 %	25 %	350525707
2614	NC_016051	CGT	2	6	133320	133325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525707
2615	NC_016051	AACC	2	8	133371	133378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_016051	GCTCA	2	10	133383	133392	20 %	20 %	20 %	40 %	223478549
2617	NC_016051	CTT	2	6	133396	133401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478549
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2619	NC_016051	CCCTTG	2	12	133561	133572	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223478549
2620	NC_016051	GTA	2	6	133640	133645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478549
2621	NC_016051	TCA	2	6	133656	133661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478549
2622	NC_016051	CTT	2	6	133676	133681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478549
2623	NC_016051	CGA	2	6	133816	133821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478549
2624	NC_016051	GTT	2	6	133856	133861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478549
2625	NC_016051	TCA	2	6	133875	133880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478549
2626	NC_016051	GTA	2	6	133902	133907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478549
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2637	NC_016051	GGGT	2	8	134512	134519	0 %	25 %	75 %	0 %	223478549
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2645	NC_016051	CTG	2	6	134991	134996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478968
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2653	NC_016051	GCTC	2	8	135369	135376	0 %	25 %	25 %	50 %	223478859
2654	NC_016051	GGAG	2	8	135393	135400	25 %	0 %	75 %	0 %	223478859
2655	NC_016051	CTT	2	6	135403	135408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478859
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2675	NC_016051	GAGAA	2	10	136415	136424	60 %	0 %	40 %	0 %	223478859
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2688	NC_016051	GTA	2	6	136938	136943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478520
2689	NC_016051	TCG	2	6	136969	136974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478520
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2691	NC_016051	CGA	2	6	137051	137056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478520
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2693	NC_016051	CGG	2	6	137075	137080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478520
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2697	NC_016051	CGGG	2	8	137220	137227	0 %	0 %	75 %	25 %	223478520
2698	NC_016051	TC	3	6	137229	137234	0 %	50 %	0 %	50 %	223478520
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2703	NC_016051	CCCTGC	2	12	137609	137620	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	223478788
2704	NC_016051	ATG	2	6	137746	137751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478788
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2706	NC_016051	GGTT	2	8	137798	137805	0 %	50 %	50 %	0 %	223478788
2707	NC_016051	CTT	2	6	137826	137831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478788
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2709	NC_016051	TCGCTC	2	12	137896	137907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223478788
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2711	NC_016051	GAG	2	6	138012	138017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478788
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2715	NC_016051	ATT	2	6	138229	138234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478788
2716	NC_016051	CGA	2	6	138272	138277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478788
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2719	NC_016051	CGG	2	6	138509	138514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2720	NC_016051	CGA	2	6	138555	138560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478741
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2722	NC_016051	GCC	2	6	138791	138796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478741
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2724	NC_016051	GTA	2	6	138859	138864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478741
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2729	NC_016051	CTC	2	6	139381	139386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478741
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2738	NC_016051	CCTCG	2	10	139756	139765	0 %	20 %	20 %	60 %	223478741
2739	NC_016051	TAA	2	6	139924	139929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2740	NC_016051	GTTTC	2	10	139932	139941	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2741	NC_016051	CTC	2	6	140020	140025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478789
2742	NC_016051	CGT	2	6	140112	140117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478789
2743	NC_016051	CCTTC	2	10	140136	140145	0 %	40 %	0 %	60 %	223478789
2744	NC_016051	TCA	2	6	140169	140174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478789
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2746	NC_016051	TCGT	2	8	140291	140298	0 %	50 %	25 %	25 %	223478789
2747	NC_016051	CTT	2	6	140340	140345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478789
2748	NC_016051	GAG	2	6	140401	140406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478789
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2754	NC_016051	G	6	6	140885	140890	0 %	0 %	100 %	0 %	223478844
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2764	NC_016051	GAG	2	6	141681	141686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478844
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2782	NC_016051	ACC	2	6	142538	142543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478690
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2815	NC_016051	TAAA	2	8	144107	144114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2816	NC_016051	TAT	2	6	144144	144149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2817	NC_016051	TA	4	8	144180	144187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2818	NC_016051	CTA	2	6	144236	144241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2855	NC_016051	CGA	2	6	146033	146038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478585
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2988	NC_016051	GAA	2	6	152850	152855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478462
2989	NC_016051	GAC	2	6	153058	153063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478462
2990	NC_016051	TCT	2	6	153104	153109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478462
2991	NC_016051	GAG	2	6	153166	153171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478462
2992	NC_016051	GAG	2	6	153175	153180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478462
2993	NC_016051	GAAG	2	8	153186	153193	50 %	0 %	50 %	0 %	223478462
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2995	NC_016051	GAC	2	6	153231	153236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478462
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