MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_016051	GA	3	6	1316257	1316262	50 %	0 %	50 %	0 %	223477981
26003	NC_016051	CAG	2	6	1316310	1316315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477981
26004	NC_016051	CTT	2	6	1316487	1316492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477981
26005	NC_016051	AGC	2	6	1316579	1316584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477981
26006	NC_016051	ACC	2	6	1316591	1316596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477981
26007	NC_016051	TGG	2	6	1316648	1316653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477981
26008	NC_016051	TGA	2	6	1316718	1316723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477981
26009	NC_016051	CGG	2	6	1316906	1316911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477981
26010	NC_016051	GAC	2	6	1316926	1316931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477981
26011	NC_016051	AGC	2	6	1316969	1316974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477981
26012	NC_016051	A	6	6	1316995	1317000	100 %	0 %	0 %	0 %	223477981
26013	NC_016051	GCC	2	6	1317001	1317006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477981
26014	NC_016051	CAGG	2	8	1317012	1317019	25 %	0 %	50 %	25 %	223477981
26015	NC_016051	AAG	2	6	1317055	1317060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477981
26016	NC_016051	GA	3	6	1317091	1317096	50 %	0 %	50 %	0 %	223477981
26017	NC_016051	GAA	2	6	1317117	1317122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477981
26018	NC_016051	GAG	2	6	1317127	1317132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477981
26019	NC_016051	TAC	2	6	1317169	1317174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477981
26020	NC_016051	CCT	2	6	1317201	1317206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477981
26021	NC_016051	CGG	2	6	1317220	1317225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477981
26022	NC_016051	CAA	2	6	1317294	1317299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477981
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26024	NC_016051	GA	3	6	1317412	1317417	50 %	0 %	50 %	0 %	223477981
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26029	NC_016051	CG	3	6	1317624	1317629	0 %	0 %	50 %	50 %	223477981
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26032	NC_016051	AGC	2	6	1317695	1317700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477981
26033	NC_016051	CTG	2	6	1317718	1317723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477981
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26035	NC_016051	CGA	2	6	1317753	1317758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477981
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26042	NC_016051	CG	3	6	1318073	1318078	0 %	0 %	50 %	50 %	223477981
26043	NC_016051	ATG	2	6	1318114	1318119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477981
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26051	NC_016051	GAG	2	6	1318497	1318502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477924
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26054	NC_016051	TCG	2	6	1318594	1318599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477924
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26058	NC_016051	ATC	2	6	1318797	1318802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477924
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26115	NC_016051	CTC	2	6	1321744	1321749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477872
26116	NC_016051	TGC	2	6	1321752	1321757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477872
26117	NC_016051	ATC	2	6	1321837	1321842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477872
26118	NC_016051	CGA	3	9	1321859	1321867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477872
26119	NC_016051	ACC	2	6	1321876	1321881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477872
26120	NC_016051	CGC	2	6	1321902	1321907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477872
26121	NC_016051	AGC	2	6	1321917	1321922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477872
26122	NC_016051	GCC	2	6	1321956	1321961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477872
26123	NC_016051	CAT	2	6	1321962	1321967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477872
26124	NC_016051	GGA	2	6	1321986	1321991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477872
26125	NC_016051	GA	3	6	1321990	1321995	50 %	0 %	50 %	0 %	223477872
26126	NC_016051	GAT	2	6	1322061	1322066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477872
26127	NC_016051	ATG	2	6	1322116	1322121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477872
26128	NC_016051	GCG	2	6	1322141	1322146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477872
26129	NC_016051	AGG	2	6	1322174	1322179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477872
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26131	NC_016051	CGA	2	6	1322225	1322230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477872
26132	NC_016051	CCTCGG	2	12	1322271	1322282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	223477872
26133	NC_016051	CCG	2	6	1322306	1322311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477872
26134	NC_016051	ATG	2	6	1322335	1322340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477872
26135	NC_016051	CT	3	6	1322344	1322349	0 %	50 %	0 %	50 %	223477872
26136	NC_016051	GAT	2	6	1322367	1322372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477872
26137	NC_016051	GC	4	8	1322405	1322412	0 %	0 %	50 %	50 %	223477872
26138	NC_016051	GAA	2	6	1322434	1322439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477872
26139	NC_016051	CGT	2	6	1322505	1322510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477872
26140	NC_016051	CTC	2	6	1322530	1322535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477872
26141	NC_016051	T	6	6	1322544	1322549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26142	NC_016051	GGT	2	6	1322601	1322606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26143	NC_016051	AAT	2	6	1322625	1322630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477919
26144	NC_016051	AGGTC	2	10	1322702	1322711	20 %	20 %	40 %	20 %	223477919
26145	NC_016051	AAT	2	6	1322751	1322756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477919
26146	NC_016051	TTC	2	6	1322771	1322776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477919
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26152	NC_016051	CGT	3	9	1322892	1322900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477919
26153	NC_016051	GTC	2	6	1322920	1322925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477919
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26173	NC_016051	CCT	2	6	1323468	1323473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26174	NC_016051	GGT	2	6	1323484	1323489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26175	NC_016051	TGGA	2	8	1323490	1323497	25 %	25 %	50 %	0 %	223478036
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26188	NC_016051	CGA	2	6	1324200	1324205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478036
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26191	NC_016051	TTC	2	6	1324511	1324516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26192	NC_016051	CCA	2	6	1324558	1324563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477730
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26214	NC_016051	A	6	6	1325775	1325780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26215	NC_016051	GAG	2	6	1325872	1325877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477883
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26217	NC_016051	CGA	2	6	1325997	1326002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477883
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26220	NC_016051	TCC	2	6	1326119	1326124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477883
26221	NC_016051	TCC	2	6	1326164	1326169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477883
26222	NC_016051	TTC	2	6	1326170	1326175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477883
26223	NC_016051	CTT	3	9	1326202	1326210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477883
26224	NC_016051	T	6	6	1326214	1326219	0 %	100 %	0 %	0 %	223477883
26225	NC_016051	CTC	2	6	1326220	1326225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477883
26226	NC_016051	CTT	2	6	1326397	1326402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477853
26227	NC_016051	CCT	2	6	1326429	1326434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477853
26228	NC_016051	CCG	2	6	1326468	1326473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477853
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26230	NC_016051	TCGTTA	2	12	1326495	1326506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	223477853
26231	NC_016051	CTG	2	6	1326509	1326514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477853
26232	NC_016051	TCG	2	6	1326530	1326535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477853
26233	NC_016051	CGA	2	6	1326546	1326551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477853
26234	NC_016051	GGGGA	2	10	1326583	1326592	20 %	0 %	80 %	0 %	223477853
26235	NC_016051	TCG	2	6	1326620	1326625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477853
26236	NC_016051	GTC	2	6	1326677	1326682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477853
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26243	NC_016051	CCT	2	6	1327177	1327182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477909
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26245	NC_016051	CTC	2	6	1327277	1327282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477909
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26247	NC_016051	CGG	2	6	1327417	1327422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477909
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26262	NC_016051	CTT	2	6	1328146	1328151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477967
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26280	NC_016051	CCT	2	6	1329275	1329280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525893
26281	NC_016051	AGT	2	6	1329391	1329396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477873
26282	NC_016051	AGT	2	6	1329412	1329417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477873
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26299	NC_016051	CCTG	2	8	1330146	1330153	0 %	25 %	25 %	50 %	223477873
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26306	NC_016051	CAC	2	6	1330452	1330457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26307	NC_016051	AGG	2	6	1330532	1330537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
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26319	NC_016051	GA	3	6	1330888	1330893	50 %	0 %	50 %	0 %	223477983
26320	NC_016051	GAG	3	9	1330915	1330923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477983
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26322	NC_016051	A	6	6	1331047	1331052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26323	NC_016051	A	6	6	1331061	1331066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26324	NC_016051	AAC	2	6	1331083	1331088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26326	NC_016051	A	9	9	1331112	1331120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26327	NC_016051	TGG	2	6	1331134	1331139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26328	NC_016051	TTA	2	6	1331221	1331226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478019
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26331	NC_016051	AAC	2	6	1331249	1331254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478019
26332	NC_016051	TAA	2	6	1331491	1331496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478019
26333	NC_016051	TGGG	2	8	1331519	1331526	0 %	25 %	75 %	0 %	223478019
26334	NC_016051	TGA	2	6	1331528	1331533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478019
26335	NC_016051	GTT	2	6	1331628	1331633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478019
26336	NC_016051	AGA	2	6	1331744	1331749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
26337	NC_016051	ATG	2	6	1331797	1331802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478019
26338	NC_016051	GAA	2	6	1331807	1331812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478019
26339	NC_016051	GGCTGT	2	12	1331825	1331836	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	223478019
26340	NC_016051	ACCC	2	8	1331848	1331855	25 %	0 %	0 %	75 %	223478019
26341	NC_016051	TTG	2	6	1331890	1331895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478019
26342	NC_016051	TACT	2	8	1331901	1331908	25 %	50 %	0 %	25 %	223478019
26343	NC_016051	AGGA	2	8	1331959	1331966	50 %	0 %	50 %	0 %	223478019
26344	NC_016051	TTC	2	6	1331982	1331987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478019
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26346	NC_016051	CGA	2	6	1332071	1332076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478019
26347	NC_016051	GGA	2	6	1332083	1332088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478019
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26349	NC_016051	TAC	2	6	1332132	1332137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478019
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26464	NC_016051	AACG	2	8	1338856	1338863	50 %	0 %	25 %	25 %	223477735
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26466	NC_016051	ACG	2	6	1339001	1339006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477735
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26492	NC_016051	TC	3	6	1340466	1340471	0 %	50 %	0 %	50 %	350525894
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