MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016051	CGT	2	6	100493	100498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478817
2002	NC_016051	GTC	2	6	100512	100517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478817
2003	NC_016051	A	6	6	100527	100532	100 %	0 %	0 %	0 %	223478817
2004	NC_016051	AGG	2	6	100565	100570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478817
2005	NC_016051	GCT	2	6	100743	100748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478817
2006	NC_016051	CTT	2	6	100758	100763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478817
2007	NC_016051	G	6	6	100808	100813	0 %	0 %	100 %	0 %	223478817
2008	NC_016051	AAT	2	6	100845	100850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478817
2009	NC_016051	TCA	2	6	100868	100873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478817
2010	NC_016051	CGG	3	9	100900	100908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_016051	AATA	2	8	100909	100916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_016051	A	6	6	100933	100938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_016051	TCCCCT	2	12	100973	100984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
2014	NC_016051	CGT	2	6	100993	100998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478567
2015	NC_016051	GCTCG	2	10	101021	101030	0 %	20 %	40 %	40 %	223478567
2016	NC_016051	CTC	2	6	101072	101077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
2017	NC_016051	TGT	2	6	101110	101115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478567
2018	NC_016051	CGA	2	6	101143	101148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478567
2019	NC_016051	CGA	2	6	101167	101172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478567
2020	NC_016051	TTA	2	6	101251	101256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478567
2021	NC_016051	TCT	2	6	101302	101307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478567
2022	NC_016051	ATC	2	6	101322	101327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478567
2023	NC_016051	TCC	2	6	101400	101405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
2024	NC_016051	ATC	2	6	101409	101414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478567
2025	NC_016051	TCC	2	6	101415	101420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
2026	NC_016051	CTC	2	6	101480	101485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
2027	NC_016051	CGC	2	6	101537	101542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478567
2028	NC_016051	CTC	2	6	101636	101641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478567
2029	NC_016051	GTC	2	6	101657	101662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478567
2030	NC_016051	CAGTT	2	10	101675	101684	20 %	40 %	20 %	20 %	223478567
2031	NC_016051	CAG	2	6	101709	101714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478567
2032	NC_016051	CGC	2	6	101851	101856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478567
2033	NC_016051	TGCC	2	8	101859	101866	0 %	25 %	25 %	50 %	223478567
2034	NC_016051	TTCTC	2	10	101961	101970	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2035	NC_016051	GAGC	2	8	102041	102048	25 %	0 %	50 %	25 %	223478504
2036	NC_016051	TCA	2	6	102049	102054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478504
2037	NC_016051	GCC	2	6	102057	102062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478504
2038	NC_016051	CT	3	6	102121	102126	0 %	50 %	0 %	50 %	223478504
2039	NC_016051	GGC	2	6	102132	102137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478504
2040	NC_016051	CCT	2	6	102187	102192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478504
2041	NC_016051	CT	3	6	102430	102435	0 %	50 %	0 %	50 %	223478504
2042	NC_016051	CTG	2	6	102445	102450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478504
2043	NC_016051	TCA	2	6	102472	102477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478504
2044	NC_016051	ACGA	2	8	102480	102487	50 %	0 %	25 %	25 %	223478504
2045	NC_016051	CGA	2	6	102508	102513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478504
2046	NC_016051	GGA	2	6	102558	102563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478504
2047	NC_016051	CGT	2	6	102614	102619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478504
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2050	NC_016051	ATA	2	6	102942	102947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478504
2051	NC_016051	GAG	2	6	102948	102953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478504
2052	NC_016051	CCG	2	6	102985	102990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478504
2053	NC_016051	CGG	2	6	103043	103048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478504
2054	NC_016051	ACGG	2	8	103131	103138	25 %	0 %	50 %	25 %	223478504
2055	NC_016051	CCGA	2	8	103140	103147	25 %	0 %	25 %	50 %	223478504
2056	NC_016051	TGGA	2	8	103165	103172	25 %	25 %	50 %	0 %	223478504
2057	NC_016051	CGTTGA	2	12	103202	103213	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	223478504
2058	NC_016051	GC	3	6	103261	103266	0 %	0 %	50 %	50 %	223478504
2059	NC_016051	T	6	6	103440	103445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_016051	TCT	2	6	103536	103541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_016051	TAG	2	6	103594	103599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_016051	TGA	2	6	103671	103676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_016051	TTC	2	6	103691	103696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_016051	TAG	2	6	103795	103800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_016051	CAG	2	6	103828	103833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_016051	CCA	2	6	103854	103859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2068	NC_016051	TC	3	6	103953	103958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2069	NC_016051	CCT	2	6	103985	103990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2070	NC_016051	ATT	2	6	104039	104044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_016051	TGG	2	6	104100	104105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_016051	CAAT	2	8	104110	104117	50 %	25 %	0 %	25 %	223478835
2073	NC_016051	TAA	2	6	104138	104143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478835
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2080	NC_016051	CTCG	2	8	104580	104587	0 %	25 %	25 %	50 %	223478835
2081	NC_016051	TCG	2	6	104621	104626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478835
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2089	NC_016051	CCT	2	6	104899	104904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2091	NC_016051	TCG	2	6	104990	104995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478750
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2093	NC_016051	CGGAG	2	10	105063	105072	20 %	0 %	60 %	20 %	223478750
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2099	NC_016051	CT	4	8	105566	105573	0 %	50 %	0 %	50 %	223478750
2100	NC_016051	ACG	2	6	105584	105589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478750
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2102	NC_016051	TCG	2	6	105822	105827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478493
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2105	NC_016051	TCC	2	6	106014	106019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478493
2106	NC_016051	TCG	2	6	106083	106088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478493
2107	NC_016051	AGA	2	6	106143	106148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478493
2108	NC_016051	CGT	2	6	106231	106236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478493
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2110	NC_016051	AGGGA	2	10	106389	106398	40 %	0 %	60 %	0 %	223478493
2111	NC_016051	GCCC	2	8	106470	106477	0 %	0 %	25 %	75 %	223478510
2112	NC_016051	CAG	2	6	106619	106624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478510
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2115	NC_016051	TATT	2	8	106891	106898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_016051	CAT	2	6	106950	106955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478621
2117	NC_016051	CGA	2	6	106959	106964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478621
2118	NC_016051	AGAA	2	8	107074	107081	75 %	0 %	25 %	0 %	223478621
2119	NC_016051	AAG	2	6	107089	107094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478621
2120	NC_016051	TGA	2	6	107157	107162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478621
2121	NC_016051	CGG	2	6	107192	107197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478621
2122	NC_016051	AGTCG	2	10	107289	107298	20 %	20 %	40 %	20 %	223478621
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2124	NC_016051	GAA	3	9	107391	107399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478621
2125	NC_016051	GGA	2	6	107403	107408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478621
2126	NC_016051	GAT	2	6	107421	107426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478621
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2128	NC_016051	GCC	2	6	107642	107647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2129	NC_016051	CGG	2	6	107671	107676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2133	NC_016051	GCAG	2	8	107869	107876	25 %	0 %	50 %	25 %	223478818
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2237	NC_016051	CTT	2	6	113754	113759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478799
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2241	NC_016051	CTG	2	6	114123	114128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525700
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2243	NC_016051	GAG	2	6	114212	114217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525700
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2245	NC_016051	CCAGTG	2	12	114261	114272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	350525701
2246	NC_016051	GGA	2	6	114309	114314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525701
2247	NC_016051	GAG	2	6	114409	114414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525701
2248	NC_016051	ACGA	2	8	114416	114423	50 %	0 %	25 %	25 %	350525701
2249	NC_016051	ATT	2	6	114428	114433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525701
2250	NC_016051	GAG	2	6	114440	114445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525701
2251	NC_016051	AGGAAC	2	12	114587	114598	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	350525701
2252	NC_016051	GAG	2	6	114631	114636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525701
2253	NC_016051	TTC	2	6	114665	114670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525701
2254	NC_016051	GCC	2	6	114703	114708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525701
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2256	NC_016051	GAG	2	6	114760	114765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525701
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2265	NC_016051	CGT	2	6	115207	115212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478667
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2269	NC_016051	CGT	2	6	115405	115410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478667
2270	NC_016051	CGT	2	6	115601	115606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478667
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2274	NC_016051	GAAG	2	8	115960	115967	50 %	0 %	50 %	0 %	223478667
2275	NC_016051	AGG	2	6	115968	115973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478667
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2317	NC_016051	AGT	2	6	118087	118092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478878
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2326	NC_016051	TGCC	2	8	118516	118523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2359	NC_016051	A	6	6	120007	120012	100 %	0 %	0 %	0 %	350525704
2360	NC_016051	GCG	2	6	120087	120092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525704
2361	NC_016051	GAA	2	6	120127	120132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525704
2362	NC_016051	C	6	6	120244	120249	0 %	0 %	0 %	100 %	350525704
2363	NC_016051	AGG	2	6	120329	120334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525704
2364	NC_016051	CAG	2	6	120337	120342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525704
2365	NC_016051	GAC	2	6	120346	120351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525704
2366	NC_016051	GGGA	2	8	120486	120493	25 %	0 %	75 %	0 %	350525704
2367	NC_016051	GGC	2	6	120771	120776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525705
2368	NC_016051	CTGG	2	8	120777	120784	0 %	25 %	50 %	25 %	350525705
2369	NC_016051	CCT	2	6	120887	120892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525705
2370	NC_016051	GAA	2	6	120998	121003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525705
2371	NC_016051	TCG	2	6	121029	121034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525705
2372	NC_016051	GTA	2	6	121085	121090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525705
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2374	NC_016051	TGA	2	6	121252	121257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525705
2375	NC_016051	CAG	2	6	121307	121312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525705
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2379	NC_016051	AGT	2	6	121531	121536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525705
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2381	NC_016051	GTA	2	6	121592	121597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525705
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2383	NC_016051	CCCT	2	8	121611	121618	0 %	25 %	0 %	75 %	350525705
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2386	NC_016051	GAA	3	9	121761	121769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2387	NC_016051	ACA	2	6	121788	121793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2388	NC_016051	GC	3	6	121919	121924	0 %	0 %	50 %	50 %	223478450
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2392	NC_016051	TCCA	2	8	122046	122053	25 %	25 %	0 %	50 %	223478450
2393	NC_016051	TCG	2	6	122062	122067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478450
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2404	NC_016051	TCG	2	6	122751	122756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478450
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2451	NC_016051	AGGG	2	8	125592	125599	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2476	NC_016051	GAG	2	6	127408	127413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478917
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2479	NC_016051	CCA	2	6	127586	127591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2480	NC_016051	AAGG	2	8	127653	127660	50 %	0 %	50 %	0 %	223478896
2481	NC_016051	AG	3	6	127663	127668	50 %	0 %	50 %	0 %	223478896
2482	NC_016051	GAG	2	6	127675	127680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478896
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2488	NC_016051	CCT	2	6	127962	127967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478896
2489	NC_016051	GCC	2	6	127975	127980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478896
2490	NC_016051	GAG	3	9	128035	128043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478896
2491	NC_016051	CGC	2	6	128058	128063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478896
2492	NC_016051	ATC	2	6	128143	128148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478896
2493	NC_016051	AGG	2	6	128234	128239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478896
2494	NC_016051	GC	3	6	128251	128256	0 %	0 %	50 %	50 %	223478896
2495	NC_016051	GAG	2	6	128269	128274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478896
2496	NC_016051	ACT	2	6	128342	128347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478896
2497	NC_016051	AGA	2	6	128355	128360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478896
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2499	NC_016051	TCC	2	6	128387	128392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478896
2500	NC_016051	GCGG	2	8	128407	128414	0 %	0 %	75 %	25 %	223478896

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