MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016051	TCA	2	6	944708	944713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18502	NC_016051	GCGG	2	8	944720	944727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18503	NC_016051	TTCG	2	8	944795	944802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18504	NC_016051	CAT	2	6	944846	944851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478411
18505	NC_016051	CGTT	2	8	944857	944864	0 %	50 %	25 %	25 %	223478411
18506	NC_016051	CTG	2	6	944916	944921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478411
18507	NC_016051	AGGG	2	8	944922	944929	25 %	0 %	75 %	0 %	223478411
18508	NC_016051	GAGG	2	8	944981	944988	25 %	0 %	75 %	0 %	223478411
18509	NC_016051	TGC	2	6	945000	945005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478411
18510	NC_016051	CTT	2	6	945058	945063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478411
18511	NC_016051	TGGC	2	8	945123	945130	0 %	25 %	50 %	25 %	223478411
18512	NC_016051	GCC	2	6	945162	945167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478411
18513	NC_016051	GTT	2	6	945168	945173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478411
18514	NC_016051	TGA	2	6	945184	945189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478411
18515	NC_016051	CGA	3	9	945193	945201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478411
18516	NC_016051	GGA	2	6	945217	945222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478411
18517	NC_016051	CGGG	2	8	945266	945273	0 %	0 %	75 %	25 %	223478411
18518	NC_016051	CGTA	2	8	945283	945290	25 %	25 %	25 %	25 %	223478411
18519	NC_016051	ACCA	2	8	945297	945304	50 %	0 %	0 %	50 %	223478411
18520	NC_016051	CGA	2	6	945323	945328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478411
18521	NC_016051	GGAGA	2	10	945345	945354	40 %	0 %	60 %	0 %	223478411
18522	NC_016051	GGA	2	6	945431	945436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478411
18523	NC_016051	GGT	2	6	945476	945481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478411
18524	NC_016051	A	6	6	945534	945539	100 %	0 %	0 %	0 %	223478411
18525	NC_016051	GGT	2	6	945568	945573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478411
18526	NC_016051	GGA	3	9	945592	945600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478157
18527	NC_016051	GAG	2	6	945761	945766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478157
18528	NC_016051	ATA	2	6	945854	945859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223478157
18529	NC_016051	GAA	2	6	945900	945905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478157
18530	NC_016051	GAG	2	6	945949	945954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478250
18531	NC_016051	GGA	2	6	945960	945965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478250
18532	NC_016051	AGG	2	6	945991	945996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478250
18533	NC_016051	CCT	2	6	945999	946004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478250
18534	NC_016051	AGG	2	6	946088	946093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478250
18535	NC_016051	GAGAA	2	10	946156	946165	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_016051	GA	3	6	946167	946172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_016051	GC	3	6	946278	946283	0 %	0 %	50 %	50 %	223478285
18538	NC_016051	GAA	2	6	946302	946307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478285
18539	NC_016051	TCG	3	9	946312	946320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478285
18540	NC_016051	AGC	2	6	946390	946395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478285
18541	NC_016051	GGA	2	6	946398	946403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478285
18542	NC_016051	GAG	2	6	946416	946421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478285
18543	NC_016051	CGA	2	6	946430	946435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478285
18544	NC_016051	GCT	2	6	946465	946470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478285
18545	NC_016051	ATG	2	6	946471	946476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478285
18546	NC_016051	CGT	2	6	946505	946510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478285
18547	NC_016051	GAG	2	6	946515	946520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478285
18548	NC_016051	TCT	2	6	946523	946528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478285
18549	NC_016051	GAG	2	6	946650	946655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478285
18550	NC_016051	TTC	2	6	946656	946661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478285
18551	NC_016051	CTT	3	9	946668	946676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478285
18552	NC_016051	CTC	2	6	946686	946691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478285
18553	NC_016051	CTG	2	6	946701	946706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478285
18554	NC_016051	CTC	2	6	946710	946715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478285
18555	NC_016051	TTG	2	6	946759	946764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478285
18556	NC_016051	GGCT	2	8	946774	946781	0 %	25 %	50 %	25 %	223478285
18557	NC_016051	CTT	2	6	946794	946799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478285
18558	NC_016051	CGT	2	6	946817	946822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478285
18559	NC_016051	GGA	2	6	946940	946945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478285
18560	NC_016051	ACC	3	9	946975	946983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18561	NC_016051	T	6	6	947024	947029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_016051	A	6	6	947177	947182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_016051	GAAAA	2	10	947206	947215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_016051	TCCT	2	8	947248	947255	0 %	50 %	0 %	50 %	223478253
18565	NC_016051	GTTC	2	8	947286	947293	0 %	50 %	25 %	25 %	223478253
18566	NC_016051	TCT	2	6	947337	947342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478253
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18568	NC_016051	TGA	2	6	947391	947396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478253
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18570	NC_016051	GTA	2	6	947464	947469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478253
18571	NC_016051	GGA	2	6	947475	947480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478253
18572	NC_016051	TAT	2	6	947542	947547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478253
18573	NC_016051	CTT	2	6	947587	947592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478253
18574	NC_016051	CGG	2	6	947647	947652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478253
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18577	NC_016051	TCG	2	6	947892	947897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478253
18578	NC_016051	CGTG	2	8	947910	947917	0 %	25 %	50 %	25 %	223478253
18579	NC_016051	CTC	2	6	947950	947955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478253
18580	NC_016051	TGC	2	6	948000	948005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478253
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18582	NC_016051	GTG	2	6	948083	948088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478253
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18585	NC_016051	GA	3	6	948163	948168	50 %	0 %	50 %	0 %	223478253
18586	NC_016051	CTT	2	6	948247	948252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478253
18587	NC_016051	CT	3	6	948280	948285	0 %	50 %	0 %	50 %	223478253
18588	NC_016051	GTATC	2	10	948345	948354	20 %	40 %	20 %	20 %	223478253
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18592	NC_016051	AGG	2	6	948584	948589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478253
18593	NC_016051	TCCG	2	8	948634	948641	0 %	25 %	25 %	50 %	223478253
18594	NC_016051	ACC	2	6	948721	948726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478253
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18596	NC_016051	G	6	6	948840	948845	0 %	0 %	100 %	0 %	223478253
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18600	NC_016051	GTC	2	6	948994	948999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478253
18601	NC_016051	ACG	2	6	949031	949036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478253
18602	NC_016051	GTACTT	2	12	949048	949059	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	223478253
18603	NC_016051	TC	3	6	949075	949080	0 %	50 %	0 %	50 %	223478253
18604	NC_016051	GAG	2	6	949168	949173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478253
18605	NC_016051	TTC	2	6	949241	949246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478253
18606	NC_016051	GAG	2	6	949414	949419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478253
18607	NC_016051	CTT	2	6	949425	949430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478253
18608	NC_016051	GTCG	2	8	949591	949598	0 %	25 %	50 %	25 %	223478253
18609	NC_016051	CGG	2	6	949603	949608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478253
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18611	NC_016051	CCT	2	6	949641	949646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478253
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18614	NC_016051	CCTCG	2	10	949912	949921	0 %	20 %	20 %	60 %	223478253
18615	NC_016051	GGCC	2	8	949957	949964	0 %	0 %	50 %	50 %	223478253
18616	NC_016051	TCT	2	6	950040	950045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478253
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18621	NC_016051	C	6	6	950314	950319	0 %	0 %	0 %	100 %	223478253
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18981	NC_016051	GAG	2	6	967509	967514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478348
18982	NC_016051	GAC	2	6	967522	967527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478348
18983	NC_016051	TCC	2	6	967553	967558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478348
18984	NC_016051	AAGG	2	8	967561	967568	50 %	0 %	50 %	0 %	223478348
18985	NC_016051	ACG	2	6	967624	967629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478348
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18988	NC_016051	A	6	6	967703	967708	100 %	0 %	0 %	0 %	223478348
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