MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_016051	CTC	2	6	868141	868146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
17003	NC_016051	TCG	2	6	868166	868171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478104
17004	NC_016051	CTC	2	6	868213	868218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
17005	NC_016051	A	6	6	868306	868311	100 %	0 %	0 %	0 %	223478104
17006	NC_016051	CTC	2	6	868352	868357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
17007	NC_016051	TCC	2	6	868359	868364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
17008	NC_016051	CAT	2	6	868405	868410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478104
17009	NC_016051	TCG	2	6	868526	868531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478104
17010	NC_016051	GC	3	6	868640	868645	0 %	0 %	50 %	50 %	223478104
17011	NC_016051	AGA	2	6	868692	868697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478104
17012	NC_016051	CTC	2	6	868748	868753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478104
17013	NC_016051	ACG	2	6	868766	868771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478104
17014	NC_016051	TA	4	8	868868	868875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_016051	TAA	2	6	868927	868932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_016051	GTTC	2	8	868972	868979	0 %	50 %	25 %	25 %	223478125
17017	NC_016051	CCG	2	6	868980	868985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478125
17018	NC_016051	AAC	2	6	869024	869029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478125
17019	NC_016051	CGTC	2	8	869128	869135	0 %	25 %	25 %	50 %	223478125
17020	NC_016051	CTC	2	6	869139	869144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478125
17021	NC_016051	CCG	2	6	869148	869153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478125
17022	NC_016051	TCG	2	6	869157	869162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
17023	NC_016051	CTT	2	6	869183	869188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478125
17024	NC_016051	TCG	2	6	869268	869273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
17025	NC_016051	CCT	2	6	869308	869313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478125
17026	NC_016051	GCCTC	2	10	869326	869335	0 %	20 %	20 %	60 %	223478125
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17028	NC_016051	TTC	2	6	869456	869461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478125
17029	NC_016051	GGTC	2	8	869584	869591	0 %	25 %	50 %	25 %	223478125
17030	NC_016051	GC	3	6	869638	869643	0 %	0 %	50 %	50 %	223478125
17031	NC_016051	CCG	2	6	869652	869657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478125
17032	NC_016051	TCG	2	6	869664	869669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
17033	NC_016051	TCCT	2	8	869706	869713	0 %	50 %	0 %	50 %	223478125
17034	NC_016051	CTC	2	6	869717	869722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478125
17035	NC_016051	TCGC	2	8	869760	869767	0 %	25 %	25 %	50 %	223478125
17036	NC_016051	GCTCG	2	10	869803	869812	0 %	20 %	40 %	40 %	223478125
17037	NC_016051	TAT	2	6	869876	869881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478125
17038	NC_016051	CT	3	6	869892	869897	0 %	50 %	0 %	50 %	223478125
17039	NC_016051	CGT	2	6	869905	869910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478125
17040	NC_016051	ATG	2	6	869934	869939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478125
17041	NC_016051	GGA	2	6	869992	869997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478125
17042	NC_016051	CT	3	6	870010	870015	0 %	50 %	0 %	50 %	223478125
17043	NC_016051	CTC	2	6	870182	870187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478200
17044	NC_016051	CTC	2	6	870212	870217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478200
17045	NC_016051	TATCG	2	10	870365	870374	20 %	40 %	20 %	20 %	223478200
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17047	NC_016051	TGA	2	6	870565	870570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478200
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17049	NC_016051	GA	3	6	870832	870837	50 %	0 %	50 %	0 %	223478052
17050	NC_016051	CTC	2	6	870912	870917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
17051	NC_016051	CTC	2	6	870989	870994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
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17053	NC_016051	CTC	3	9	871072	871080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
17054	NC_016051	CTGG	2	8	871154	871161	0 %	25 %	50 %	25 %	223478052
17055	NC_016051	CCT	2	6	871286	871291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478052
17056	NC_016051	TC	3	6	871299	871304	0 %	50 %	0 %	50 %	223478052
17057	NC_016051	AGCC	2	8	871384	871391	25 %	0 %	25 %	50 %	223478052
17058	NC_016051	CCG	2	6	871462	871467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478052
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17061	NC_016051	TCACC	2	10	871581	871590	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17062	NC_016051	TACG	2	8	871631	871638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17063	NC_016051	GTG	2	6	871639	871644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_016051	CTG	2	6	871840	871845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478112
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17066	NC_016051	GC	3	6	871874	871879	0 %	0 %	50 %	50 %	223478112
17067	NC_016051	TTC	2	6	871972	871977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478112
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17070	NC_016051	GCT	2	6	872115	872120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478112
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17072	NC_016051	GTG	2	6	872142	872147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478112
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17092	NC_016051	GAGC	2	8	873173	873180	25 %	0 %	50 %	25 %	223478089
17093	NC_016051	GGA	2	6	873190	873195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
17094	NC_016051	CAGGG	2	10	873201	873210	20 %	0 %	60 %	20 %	223478089
17095	NC_016051	GAG	2	6	873254	873259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478089
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17101	NC_016051	GGA	2	6	873857	873862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478163
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17243	NC_016051	CAG	2	6	880956	880961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525836
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