MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_016051	GAC	2	6	843028	843033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478077
16502	NC_016051	GAT	2	6	843039	843044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478077
16503	NC_016051	CT	3	6	843109	843114	0 %	50 %	0 %	50 %	223478077
16504	NC_016051	TC	3	6	843121	843126	0 %	50 %	0 %	50 %	223478077
16505	NC_016051	CGA	2	6	843147	843152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478077
16506	NC_016051	CCA	2	6	843200	843205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16507	NC_016051	CGG	2	6	843241	843246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_016051	TCT	2	6	843288	843293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478239
16509	NC_016051	TCT	2	6	843374	843379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478239
16510	NC_016051	CTC	2	6	843457	843462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478239
16511	NC_016051	CGG	2	6	843486	843491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478239
16512	NC_016051	TCC	2	6	843494	843499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478239
16513	NC_016051	GAG	2	6	843508	843513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478239
16514	NC_016051	CTC	2	6	843514	843519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478239
16515	NC_016051	CCT	2	6	843540	843545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478239
16516	NC_016051	GAG	2	6	843574	843579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478239
16517	NC_016051	GAC	2	6	843667	843672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478239
16518	NC_016051	ACGCGG	2	12	843803	843814	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	223478239
16519	NC_016051	CCCTT	2	10	843834	843843	0 %	40 %	0 %	60 %	223478239
16520	NC_016051	GCC	2	6	843853	843858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478239
16521	NC_016051	CCT	2	6	843907	843912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478239
16522	NC_016051	GAT	2	6	843982	843987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478239
16523	NC_016051	CTT	2	6	843994	843999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478239
16524	NC_016051	GCT	2	6	844020	844025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478239
16525	NC_016051	TCC	2	6	844121	844126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478239
16526	NC_016051	TAA	2	6	844285	844290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_016051	GGT	2	6	844313	844318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_016051	ACA	2	6	844339	844344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478067
16529	NC_016051	AGG	2	6	844360	844365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478067
16530	NC_016051	TGA	2	6	844516	844521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478067
16531	NC_016051	ATC	2	6	844545	844550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478067
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16533	NC_016051	GCCG	2	8	844643	844650	0 %	0 %	50 %	50 %	223478067
16534	NC_016051	CG	3	6	844660	844665	0 %	0 %	50 %	50 %	223478067
16535	NC_016051	GAA	2	6	844700	844705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478067
16536	NC_016051	GGA	2	6	844709	844714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478067
16537	NC_016051	GC	4	8	844819	844826	0 %	0 %	50 %	50 %	223478067
16538	NC_016051	GAA	2	6	844874	844879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478067
16539	NC_016051	AGC	2	6	844959	844964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478067
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16547	NC_016051	GCGG	2	8	845315	845322	0 %	0 %	75 %	25 %	223478067
16548	NC_016051	GAG	2	6	845381	845386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478067
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16551	NC_016051	ACT	2	6	845566	845571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478067
16552	NC_016051	AGGA	2	8	845640	845647	50 %	0 %	50 %	0 %	223478067
16553	NC_016051	GGA	2	6	845708	845713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478067
16554	NC_016051	GA	3	6	845752	845757	50 %	0 %	50 %	0 %	223478067
16555	NC_016051	CTT	2	6	845797	845802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16556	NC_016051	CT	3	6	845815	845820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16557	NC_016051	AGAT	2	8	845843	845850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_016051	GAA	2	6	845861	845866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_016051	CTT	2	6	845927	845932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478061
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16562	NC_016051	GTC	2	6	846015	846020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478061
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16570	NC_016051	TTCG	2	8	846556	846563	0 %	50 %	25 %	25 %	350525832
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16573	NC_016051	GA	3	6	846660	846665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16574	NC_016051	G	6	6	846714	846719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16575	NC_016051	AAG	2	6	846783	846788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16594	NC_016051	CCT	2	6	847851	847856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478266
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16601	NC_016051	ATG	2	6	848387	848392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16603	NC_016051	TAAT	2	8	848443	848450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16604	NC_016051	ATT	2	6	848466	848471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16605	NC_016051	AAAT	2	8	848491	848498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16606	NC_016051	ATA	2	6	848509	848514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16607	NC_016051	T	7	7	848543	848549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16608	NC_016051	AGTT	2	8	848550	848557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16609	NC_016051	ACT	2	6	848559	848564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16610	NC_016051	AT	3	6	848576	848581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16611	NC_016051	CAC	2	6	848582	848587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16612	NC_016051	GAACT	2	10	848591	848600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16613	NC_016051	AAG	2	6	848650	848655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16614	NC_016051	ACAT	2	8	848670	848677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16615	NC_016051	TTG	2	6	848831	848836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_016051	GAG	2	6	848857	848862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16618	NC_016051	AAT	2	6	848885	848890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16619	NC_016051	GGTTAG	2	12	848902	848913	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16621	NC_016051	ACA	2	6	849111	849116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16622	NC_016051	TAA	2	6	849168	849173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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