MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016051	GAA	2	6	819050	819055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525826
16002	NC_016051	CCG	2	6	819063	819068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525826
16003	NC_016051	C	6	6	819071	819076	0 %	0 %	0 %	100 %	350525826
16004	NC_016051	GTA	2	6	819179	819184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525826
16005	NC_016051	CGG	2	6	819205	819210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525826
16006	NC_016051	GCAG	2	8	819224	819231	25 %	0 %	50 %	25 %	350525826
16007	NC_016051	TC	3	6	819289	819294	0 %	50 %	0 %	50 %	350525826
16008	NC_016051	CAG	2	6	819311	819316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525826
16009	NC_016051	TCC	2	6	819324	819329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525826
16010	NC_016051	CCT	2	6	819405	819410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525827
16011	NC_016051	CCTT	2	8	819474	819481	0 %	50 %	0 %	50 %	350525827
16012	NC_016051	ATCC	2	8	819517	819524	25 %	25 %	0 %	50 %	350525827
16013	NC_016051	CG	3	6	819531	819536	0 %	0 %	50 %	50 %	350525827
16014	NC_016051	GA	3	6	819644	819649	50 %	0 %	50 %	0 %	350525827
16015	NC_016051	TCC	2	6	819717	819722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525827
16016	NC_016051	TCC	2	6	819743	819748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525827
16017	NC_016051	AGG	2	6	819795	819800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525827
16018	NC_016051	TC	3	6	819829	819834	0 %	50 %	0 %	50 %	350525827
16019	NC_016051	CCT	2	6	819837	819842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525827
16020	NC_016051	GGAA	2	8	820079	820086	50 %	0 %	50 %	0 %	350525827
16021	NC_016051	GAGAAG	2	12	820106	820117	50 %	0 %	50 %	0 %	350525827
16022	NC_016051	TCCA	2	8	820135	820142	25 %	25 %	0 %	50 %	350525827
16023	NC_016051	CGC	2	6	820158	820163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525827
16024	NC_016051	CCTCA	2	10	820234	820243	20 %	20 %	0 %	60 %	350525827
16025	NC_016051	C	6	6	820258	820263	0 %	0 %	0 %	100 %	350525828
16026	NC_016051	GAT	2	6	820334	820339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525828
16027	NC_016051	TCG	2	6	820365	820370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525828
16028	NC_016051	TCC	3	9	820403	820411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525828
16029	NC_016051	ATG	2	6	820488	820493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525828
16030	NC_016051	CTG	2	6	820503	820508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525828
16031	NC_016051	AGG	2	6	820608	820613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525828
16032	NC_016051	GGA	2	6	820628	820633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525828
16033	NC_016051	TCGAAG	2	12	820638	820649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	350525828
16034	NC_016051	CT	3	6	820796	820801	0 %	50 %	0 %	50 %	350525828
16035	NC_016051	AGC	2	6	820815	820820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525828
16036	NC_016051	GCA	2	6	820847	820852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478335
16037	NC_016051	GATCA	2	10	820869	820878	40 %	20 %	20 %	20 %	223478335
16038	NC_016051	C	6	6	820900	820905	0 %	0 %	0 %	100 %	223478335
16039	NC_016051	TAT	2	6	820908	820913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478335
16040	NC_016051	CTC	2	6	820932	820937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
16041	NC_016051	TCTCCC	2	12	820982	820993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
16042	NC_016051	ACGAGC	2	12	821008	821019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478335
16043	NC_016051	G	6	6	821081	821086	0 %	0 %	100 %	0 %	223478335
16044	NC_016051	CAT	2	6	821102	821107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478335
16045	NC_016051	CTCCA	2	10	821178	821187	20 %	20 %	0 %	60 %	223478335
16046	NC_016051	TTTC	2	8	821229	821236	0 %	75 %	0 %	25 %	223478335
16047	NC_016051	CAG	2	6	821276	821281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478335
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16049	NC_016051	GCT	2	6	821319	821324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478335
16050	NC_016051	CTC	2	6	821394	821399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
16051	NC_016051	CCTC	2	8	821405	821412	0 %	25 %	0 %	75 %	223478335
16052	NC_016051	CCT	2	6	821450	821455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
16053	NC_016051	TCC	2	6	821476	821481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
16054	NC_016051	TTA	2	6	821486	821491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478335
16055	NC_016051	CTC	2	6	821634	821639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
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16059	NC_016051	CT	3	6	821767	821772	0 %	50 %	0 %	50 %	223478335
16060	NC_016051	CTT	2	6	821781	821786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478335
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16072	NC_016051	TCGA	2	8	822745	822752	25 %	25 %	25 %	25 %	223478335
16073	NC_016051	GA	3	6	822796	822801	50 %	0 %	50 %	0 %	223478335
16074	NC_016051	CTC	2	6	822804	822809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
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16077	NC_016051	TCC	2	6	822961	822966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478335
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16081	NC_016051	CGGC	2	8	823137	823144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16083	NC_016051	CCT	2	6	823177	823182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478092
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16091	NC_016051	CCA	2	6	823587	823592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16092	NC_016051	A	6	6	823650	823655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16105	NC_016051	GTA	2	6	824673	824678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478108
16106	NC_016051	ACC	2	6	824695	824700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478108
16107	NC_016051	GTA	2	6	824724	824729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478108
16108	NC_016051	GCC	2	6	824736	824741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478108
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16110	NC_016051	C	6	6	824819	824824	0 %	0 %	0 %	100 %	223478108
16111	NC_016051	CAA	2	6	824846	824851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478108
16112	NC_016051	TTCA	2	8	824892	824899	25 %	50 %	0 %	25 %	223478108
16113	NC_016051	AGA	2	6	824905	824910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478108
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16115	NC_016051	TGTT	2	8	825069	825076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_016051	TA	3	6	825084	825089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_016051	GTTT	2	8	825184	825191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_016051	A	6	6	825259	825264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_016051	AAC	2	6	825300	825305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_016051	TGA	2	6	825323	825328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478165
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16122	NC_016051	GGC	2	6	825396	825401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478165
16123	NC_016051	GCA	2	6	825409	825414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478165
16124	NC_016051	TCC	2	6	825437	825442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478165
16125	NC_016051	CAGA	2	8	825465	825472	50 %	0 %	25 %	25 %	223478165
16126	NC_016051	CAG	2	6	825525	825530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478165
16127	NC_016051	AT	3	6	825677	825682	50 %	50 %	0 %	0 %	223478165
16128	NC_016051	GTC	2	6	825739	825744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478165
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16138	NC_016051	CAGA	2	8	826130	826137	50 %	0 %	25 %	25 %	223478175
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16146	NC_016051	ATCGGC	2	12	826736	826747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	223478263
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16159	NC_016051	GGC	2	6	827454	827459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478421
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16162	NC_016051	TA	3	6	827625	827630	50 %	50 %	0 %	0 %	223478421
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16225	NC_016051	ACC	2	6	829769	829774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478289
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16227	NC_016051	CAA	2	6	829985	829990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478144
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16230	NC_016051	AGG	2	6	830039	830044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478144
16231	NC_016051	TC	3	6	830063	830068	0 %	50 %	0 %	50 %	223478144
16232	NC_016051	GAT	2	6	830131	830136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478144
16233	NC_016051	CTC	2	6	830191	830196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478144
16234	NC_016051	GT	3	6	830201	830206	0 %	50 %	50 %	0 %	223478144
16235	NC_016051	TCA	2	6	830339	830344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478144
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16237	NC_016051	CCAG	2	8	830391	830398	25 %	0 %	25 %	50 %	223478144
16238	NC_016051	GGC	2	6	830429	830434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478311
16239	NC_016051	AGG	2	6	830435	830440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478311
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16241	NC_016051	GCACT	2	10	830818	830827	20 %	20 %	20 %	40 %	223478311
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16345	NC_016051	CCA	2	6	835726	835731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16346	NC_016051	GAT	2	6	835745	835750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16353	NC_016051	AGGG	2	8	836150	836157	25 %	0 %	75 %	0 %	223478059
16354	NC_016051	CAA	2	6	836158	836163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478059
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16482	NC_016051	GAA	2	6	842071	842076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525831
16483	NC_016051	TCG	2	6	842090	842095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525831
16484	NC_016051	TC	3	6	842191	842196	0 %	50 %	0 %	50 %	350525831
16485	NC_016051	A	6	6	842209	842214	100 %	0 %	0 %	0 %	350525831
16486	NC_016051	GAA	2	6	842238	842243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525831
16487	NC_016051	TCG	2	6	842411	842416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478077
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16490	NC_016051	TTG	2	6	842612	842617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478077
16491	NC_016051	CTG	2	6	842660	842665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478077
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