MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_016051	TCG	2	6	793485	793490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525820
15502	NC_016051	CAT	2	6	793513	793518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525820
15503	NC_016051	TCC	2	6	793608	793613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478113
15504	NC_016051	AGT	2	6	793630	793635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478113
15505	NC_016051	AGG	2	6	793758	793763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478113
15506	NC_016051	CCAGA	2	10	793769	793778	40 %	0 %	20 %	40 %	223478113
15507	NC_016051	TCG	2	6	793816	793821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478113
15508	NC_016051	TCGCG	2	10	793912	793921	0 %	20 %	40 %	40 %	223478113
15509	NC_016051	TCC	3	9	793938	793946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478113
15510	NC_016051	CTC	2	6	794129	794134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478113
15511	NC_016051	GTT	2	6	794249	794254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478113
15512	NC_016051	TTC	2	6	794391	794396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478113
15513	NC_016051	CCTC	2	8	794404	794411	0 %	25 %	0 %	75 %	223478113
15514	NC_016051	CCA	2	6	794415	794420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15515	NC_016051	CGG	2	6	794436	794441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_016051	TA	3	6	794466	794471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_016051	GGT	2	6	794494	794499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_016051	GAG	2	6	794536	794541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478241
15519	NC_016051	GA	3	6	794547	794552	50 %	0 %	50 %	0 %	223478241
15520	NC_016051	GGGA	2	8	794573	794580	25 %	0 %	75 %	0 %	223478241
15521	NC_016051	CTG	2	6	794596	794601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478241
15522	NC_016051	GAC	2	6	794647	794652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478241
15523	NC_016051	TCA	2	6	794766	794771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478248
15524	NC_016051	GTC	2	6	794801	794806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478248
15525	NC_016051	A	6	6	794896	794901	100 %	0 %	0 %	0 %	223478248
15526	NC_016051	TGA	2	6	794917	794922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478248
15527	NC_016051	CCT	2	6	794950	794955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478248
15528	NC_016051	TCCAT	2	10	795006	795015	20 %	40 %	0 %	40 %	223478248
15529	NC_016051	CTC	2	6	795017	795022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478248
15530	NC_016051	TTGA	2	8	795038	795045	25 %	50 %	25 %	0 %	223478248
15531	NC_016051	TCC	2	6	795171	795176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478248
15532	NC_016051	GA	3	6	795184	795189	50 %	0 %	50 %	0 %	223478248
15533	NC_016051	GGA	2	6	795255	795260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478068
15534	NC_016051	TGG	2	6	795299	795304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478068
15535	NC_016051	GAA	2	6	795349	795354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478068
15536	NC_016051	GTCAGG	2	12	795436	795447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	223478068
15537	NC_016051	AGA	2	6	795452	795457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478068
15538	NC_016051	AGG	2	6	795527	795532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478068
15539	NC_016051	GATG	2	8	795587	795594	25 %	25 %	50 %	0 %	223478068
15540	NC_016051	CGA	2	6	795690	795695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478413
15541	NC_016051	GA	3	6	795784	795789	50 %	0 %	50 %	0 %	223478413
15542	NC_016051	AG	3	6	795793	795798	50 %	0 %	50 %	0 %	223478413
15543	NC_016051	TCGAGC	2	12	795803	795814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	223478413
15544	NC_016051	AGGG	2	8	795829	795836	25 %	0 %	75 %	0 %	223478413
15545	NC_016051	TTC	2	6	795838	795843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478413
15546	NC_016051	CCG	2	6	795922	795927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478413
15547	NC_016051	ACAGGG	2	12	796049	796060	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223478413
15548	NC_016051	ACG	2	6	796114	796119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478413
15549	NC_016051	CG	3	6	796137	796142	0 %	0 %	50 %	50 %	223478413
15550	NC_016051	CTC	2	6	796185	796190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478413
15551	NC_016051	GAT	2	6	796197	796202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478413
15552	NC_016051	CGT	2	6	796245	796250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478413
15553	NC_016051	AGA	2	6	796268	796273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478413
15554	NC_016051	CGG	2	6	796308	796313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478413
15555	NC_016051	CCT	2	6	796374	796379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478413
15556	NC_016051	CGAG	2	8	796427	796434	25 %	0 %	50 %	25 %	223478413
15557	NC_016051	AACGAC	2	12	796501	796512	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	223478413
15558	NC_016051	CTT	2	6	796521	796526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478413
15559	NC_016051	CAGG	2	8	796723	796730	25 %	0 %	50 %	25 %	350525821
15560	NC_016051	AG	3	6	796754	796759	50 %	0 %	50 %	0 %	350525821
15561	NC_016051	TCG	2	6	796795	796800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525821
15562	NC_016051	GAA	2	6	796814	796819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525821
15563	NC_016051	GTT	2	6	796821	796826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525821
15564	NC_016051	GAGC	2	8	796839	796846	25 %	0 %	50 %	25 %	350525821
15565	NC_016051	CTC	2	6	796902	796907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525821
15566	NC_016051	CTA	2	6	796919	796924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525821
15567	NC_016051	AGGAG	2	10	796975	796984	40 %	0 %	60 %	0 %	350525821
15568	NC_016051	AAT	2	6	797025	797030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_016051	AGG	2	6	797045	797050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_016051	GAC	2	6	797147	797152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478114
15571	NC_016051	CAGGA	2	10	797174	797183	40 %	0 %	40 %	20 %	223478114
15572	NC_016051	GCC	2	6	797195	797200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478114
15573	NC_016051	GGC	2	6	797279	797284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478114
15574	NC_016051	CGC	2	6	797287	797292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478114
15575	NC_016051	AAGG	2	8	797303	797310	50 %	0 %	50 %	0 %	223478114
15576	NC_016051	ACG	2	6	797445	797450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478114
15577	NC_016051	TCG	2	6	797487	797492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478114
15578	NC_016051	GAG	2	6	797507	797512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478114
15579	NC_016051	ATC	2	6	797531	797536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478114
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15585	NC_016051	TCCGC	2	10	797755	797764	0 %	20 %	20 %	60 %	223478114
15586	NC_016051	GAC	2	6	797768	797773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478114
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15588	NC_016051	AAGA	2	8	797894	797901	75 %	0 %	25 %	0 %	223478114
15589	NC_016051	CAG	2	6	797997	798002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478114
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15591	NC_016051	CTT	2	6	798133	798138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478114
15592	NC_016051	TCG	2	6	798168	798173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478114
15593	NC_016051	GAA	2	6	798233	798238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478114
15594	NC_016051	GGA	2	6	798256	798261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478114
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15600	NC_016051	AG	3	6	798477	798482	50 %	0 %	50 %	0 %	223478114
15601	NC_016051	CCG	2	6	798483	798488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478114
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15603	NC_016051	AG	3	6	798574	798579	50 %	0 %	50 %	0 %	223478114
15604	NC_016051	CG	3	6	798606	798611	0 %	0 %	50 %	50 %	223478114
15605	NC_016051	GAG	2	6	798635	798640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478114
15606	NC_016051	CG	4	8	798643	798650	0 %	0 %	50 %	50 %	223478114
15607	NC_016051	TCG	2	6	798672	798677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478114
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15610	NC_016051	AAGGG	2	10	798899	798908	40 %	0 %	60 %	0 %	223478114
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15856	NC_016051	AG	4	8	811809	811816	50 %	0 %	50 %	0 %	223478420
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15866	NC_016051	C	6	6	812182	812187	0 %	0 %	0 %	100 %	223478420
15867	NC_016051	TCC	2	6	812225	812230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478420
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15869	NC_016051	CTC	2	6	812321	812326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478420
15870	NC_016051	CTC	2	6	812333	812338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478288
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15897	NC_016051	ATCA	2	8	813548	813555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15985	NC_016051	ATCG	2	8	818267	818274	25 %	25 %	25 %	25 %	350525826
15986	NC_016051	C	6	6	818349	818354	0 %	0 %	0 %	100 %	350525826
15987	NC_016051	ACG	2	6	818412	818417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525826
15988	NC_016051	GGC	2	6	818501	818506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525826
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15990	NC_016051	ACG	2	6	818556	818561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525826
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