MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016051	GGACC	2	10	690795	690804	20 %	0 %	40 %	40 %	223476946
13502	NC_016051	TCA	2	6	690810	690815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476946
13503	NC_016051	CGT	2	6	690894	690899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13504	NC_016051	AGG	2	6	690977	690982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476946
13505	NC_016051	GAA	2	6	691024	691029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476946
13506	NC_016051	CGA	2	6	691050	691055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13507	NC_016051	CTT	2	6	691096	691101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476946
13508	NC_016051	CCT	2	6	691107	691112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476946
13509	NC_016051	CCCT	2	8	691145	691152	0 %	25 %	0 %	75 %	223476946
13510	NC_016051	TCG	2	6	691169	691174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13511	NC_016051	TGT	2	6	691203	691208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476946
13512	NC_016051	CGA	2	6	691230	691235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13513	NC_016051	CTT	2	6	691243	691248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476946
13514	NC_016051	GAC	2	6	691267	691272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13515	NC_016051	CGG	2	6	691276	691281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476946
13516	NC_016051	AACGTC	2	12	691285	691296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223476946
13517	NC_016051	GAG	2	6	691360	691365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476946
13518	NC_016051	TCG	2	6	691382	691387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13519	NC_016051	GGGTC	2	10	691401	691410	0 %	20 %	60 %	20 %	223476946
13520	NC_016051	ACG	2	6	691487	691492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13521	NC_016051	TCT	2	6	691530	691535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476946
13522	NC_016051	CATCG	2	10	691558	691567	20 %	20 %	20 %	40 %	223476946
13523	NC_016051	CGA	2	6	691584	691589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13524	NC_016051	CTG	2	6	691648	691653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13525	NC_016051	TGA	2	6	691677	691682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476946
13526	NC_016051	CCT	2	6	691689	691694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476946
13527	NC_016051	GAT	2	6	691759	691764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476946
13528	NC_016051	GAC	2	6	691771	691776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13529	NC_016051	TGGCC	2	10	691812	691821	0 %	20 %	40 %	40 %	223476946
13530	NC_016051	GAC	2	6	691900	691905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13531	NC_016051	GAC	3	9	691915	691923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13532	NC_016051	TTG	2	6	691964	691969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476946
13533	NC_016051	CGA	2	6	691977	691982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13534	NC_016051	TCT	2	6	692004	692009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476946
13535	NC_016051	GTA	2	6	692038	692043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476946
13536	NC_016051	CCGAA	2	10	692046	692055	40 %	0 %	20 %	40 %	223476946
13537	NC_016051	CTC	2	6	692101	692106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476946
13538	NC_016051	TGA	2	6	692121	692126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476946
13539	NC_016051	TGA	2	6	692196	692201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476946
13540	NC_016051	TTG	2	6	692213	692218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476946
13541	NC_016051	GCCT	2	8	692252	692259	0 %	25 %	25 %	50 %	223476946
13542	NC_016051	CGGTCT	2	12	692265	692276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13543	NC_016051	CAC	2	6	692349	692354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476946
13544	NC_016051	TGA	2	6	692388	692393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476946
13545	NC_016051	CCTGCT	2	12	692460	692471	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	223476946
13546	NC_016051	GCT	2	6	692490	692495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13547	NC_016051	GTC	2	6	692552	692557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476946
13548	NC_016051	GCG	2	6	692576	692581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476946
13549	NC_016051	TC	3	6	692599	692604	0 %	50 %	0 %	50 %	223476946
13550	NC_016051	TCA	2	6	692613	692618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476946
13551	NC_016051	ATC	2	6	692636	692641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476946
13552	NC_016051	CTT	2	6	692648	692653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476946
13553	NC_016051	CAC	2	6	692663	692668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13554	NC_016051	CTTAA	2	10	692688	692697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13555	NC_016051	GAG	2	6	692761	692766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476972
13556	NC_016051	AACT	2	8	692773	692780	50 %	25 %	0 %	25 %	223476972
13557	NC_016051	C	6	6	692817	692822	0 %	0 %	0 %	100 %	223476972
13558	NC_016051	AGCG	2	8	692852	692859	25 %	0 %	50 %	25 %	223476972
13559	NC_016051	CCGC	2	8	692897	692904	0 %	0 %	25 %	75 %	223476972
13560	NC_016051	TTC	2	6	692918	692923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476972
13561	NC_016051	CTTCGG	2	12	692932	692943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476972
13562	NC_016051	AGC	2	6	692954	692959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476972
13563	NC_016051	GAC	2	6	693037	693042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476972
13564	NC_016051	ACGA	2	8	693073	693080	50 %	0 %	25 %	25 %	223476972
13565	NC_016051	CTC	2	6	693104	693109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476972
13566	NC_016051	TCG	2	6	693152	693157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476972
13567	NC_016051	GTG	2	6	693217	693222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476972
13568	NC_016051	CAT	2	6	693241	693246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476972
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13570	NC_016051	ATG	2	6	693278	693283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476972
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13572	NC_016051	CGC	2	6	693420	693425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476972
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13574	NC_016051	GAT	2	6	693481	693486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476972
13575	NC_016051	GCG	2	6	693596	693601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476972
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13578	NC_016051	CGA	2	6	693765	693770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476972
13579	NC_016051	TCG	2	6	693785	693790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476972
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13581	NC_016051	TTAA	2	8	694019	694026	50 %	50 %	0 %	0 %	350525804
13582	NC_016051	CCTTT	2	10	694030	694039	0 %	60 %	0 %	40 %	350525804
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13586	NC_016051	TCC	2	6	694170	694175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478252
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13588	NC_016051	GGA	2	6	694222	694227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478252
13589	NC_016051	TCA	2	6	694273	694278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478252
13590	NC_016051	CAC	2	6	694279	694284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13591	NC_016051	AGAA	2	8	694301	694308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_016051	GAC	2	6	694328	694333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478136
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13600	NC_016051	GAA	2	6	695100	695105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478086
13601	NC_016051	CGC	2	6	695125	695130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478086
13602	NC_016051	TGA	2	6	695146	695151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478086
13603	NC_016051	CTC	2	6	695165	695170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478086
13604	NC_016051	GA	4	8	695226	695233	50 %	0 %	50 %	0 %	223478086
13605	NC_016051	GTA	2	6	695249	695254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478086
13606	NC_016051	CGC	2	6	695257	695262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478086
13607	NC_016051	TTA	2	6	695308	695313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478086
13608	NC_016051	GGCCT	2	10	695391	695400	0 %	20 %	40 %	40 %	223478086
13609	NC_016051	GGT	2	6	695468	695473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478086
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13611	NC_016051	TGC	2	6	695533	695538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478086
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13614	NC_016051	CATC	2	8	695605	695612	25 %	25 %	0 %	50 %	223478086
13615	NC_016051	GAC	3	9	695624	695632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478086
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13617	NC_016051	TTC	2	6	695817	695822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13619	NC_016051	GGCTGT	2	12	696021	696032	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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13983	NC_016051	G	6	6	714398	714403	0 %	0 %	100 %	0 %	223478235
13984	NC_016051	TTTCC	2	10	714464	714473	0 %	60 %	0 %	40 %	223478235
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13987	NC_016051	CTG	2	6	714613	714618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478071
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