MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016051	GCG	2	6	639780	639785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477210
12502	NC_016051	AAT	2	6	639884	639889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477210
12503	NC_016051	TC	3	6	640093	640098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_016051	CCTC	2	8	640182	640189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12505	NC_016051	CTC	2	6	640199	640204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_016051	CTC	2	6	640208	640213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_016051	CGG	2	6	640218	640223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_016051	A	6	6	640260	640265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_016051	ACCTCT	2	12	640287	640298	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12510	NC_016051	CCT	2	6	640426	640431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_016051	CGG	2	6	640471	640476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477256
12512	NC_016051	TC	3	6	640542	640547	0 %	50 %	0 %	50 %	223477256
12513	NC_016051	CTT	2	6	640567	640572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477256
12514	NC_016051	CT	3	6	640597	640602	0 %	50 %	0 %	50 %	223477256
12515	NC_016051	CTT	2	6	640622	640627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477256
12516	NC_016051	CTT	2	6	640733	640738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477256
12517	NC_016051	CCA	2	6	640784	640789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477256
12518	NC_016051	CCGAG	2	10	640864	640873	20 %	0 %	40 %	40 %	223477256
12519	NC_016051	CCG	2	6	640891	640896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477256
12520	NC_016051	CCT	2	6	640909	640914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477256
12521	NC_016051	CTTG	2	8	641006	641013	0 %	50 %	25 %	25 %	223477256
12522	NC_016051	CGCT	2	8	641146	641153	0 %	25 %	25 %	50 %	223477256
12523	NC_016051	AGT	2	6	641173	641178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477256
12524	NC_016051	TTC	2	6	641195	641200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477256
12525	NC_016051	CCT	2	6	641218	641223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477256
12526	NC_016051	AGGA	2	8	641229	641236	50 %	0 %	50 %	0 %	223477256
12527	NC_016051	GAA	2	6	641384	641389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477256
12528	NC_016051	TCC	2	6	641422	641427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477256
12529	NC_016051	TCTTCG	2	12	641503	641514	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	223477256
12530	NC_016051	GGA	2	6	641539	641544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477256
12531	NC_016051	GGT	2	6	641560	641565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477256
12532	NC_016051	CAG	2	6	641573	641578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477256
12533	NC_016051	TCG	2	6	641586	641591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477256
12534	NC_016051	ATGGT	2	10	641732	641741	20 %	40 %	40 %	0 %	223477256
12535	NC_016051	TTC	2	6	641812	641817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477256
12536	NC_016051	GCCG	2	8	641818	641825	0 %	0 %	50 %	50 %	223477256
12537	NC_016051	TGT	2	6	641854	641859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477256
12538	NC_016051	TCC	2	6	641983	641988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476961
12539	NC_016051	CCTT	2	8	642022	642029	0 %	50 %	0 %	50 %	223476961
12540	NC_016051	AATC	2	8	642203	642210	50 %	25 %	0 %	25 %	223476961
12541	NC_016051	CCA	2	6	642225	642230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476961
12542	NC_016051	C	6	6	642365	642370	0 %	0 %	0 %	100 %	223476999
12543	NC_016051	AT	3	6	642394	642399	50 %	50 %	0 %	0 %	223476999
12544	NC_016051	CGT	2	6	642574	642579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476999
12545	NC_016051	CAG	2	6	642643	642648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476999
12546	NC_016051	TCG	2	6	642659	642664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476999
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12550	NC_016051	CTT	2	6	642854	642859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476999
12551	NC_016051	GAG	2	6	642919	642924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476999
12552	NC_016051	TCG	2	6	643019	643024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476999
12553	NC_016051	ATT	2	6	643028	643033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223476999
12554	NC_016051	TC	3	6	643113	643118	0 %	50 %	0 %	50 %	223476999
12555	NC_016051	GTA	2	6	643153	643158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476999
12556	NC_016051	ACGAG	2	10	643190	643199	40 %	0 %	40 %	20 %	223476999
12557	NC_016051	TC	3	6	643262	643267	0 %	50 %	0 %	50 %	223476999
12558	NC_016051	CTC	3	9	643279	643287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476999
12559	NC_016051	TCA	2	6	643397	643402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_016051	GAT	2	6	643404	643409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_016051	CAT	2	6	643526	643531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477283
12562	NC_016051	GGAA	2	8	643535	643542	50 %	0 %	50 %	0 %	223477283
12563	NC_016051	CTT	2	6	643615	643620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_016051	T	6	6	643619	643624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_016051	TAC	2	6	643626	643631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_016051	AGGTG	2	10	643650	643659	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_016051	GAA	2	6	643660	643665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_016051	AGA	2	6	643696	643701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476975
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12570	NC_016051	AGG	2	6	643790	643795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476975
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12574	NC_016051	TGA	2	6	643898	643903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476975
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12601	NC_016051	CA	3	6	644893	644898	50 %	0 %	0 %	50 %	223476975
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12605	NC_016051	AAAAT	2	10	645187	645196	80 %	20 %	0 %	0 %	223476975
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12609	NC_016051	A	6	6	645314	645319	100 %	0 %	0 %	0 %	223476975
12610	NC_016051	AT	3	6	645354	645359	50 %	50 %	0 %	0 %	223476975
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12615	NC_016051	GCC	2	6	645564	645569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_016051	GAA	2	6	645584	645589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_016051	ACC	2	6	645608	645613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_016051	GTAG	2	8	645621	645628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_016051	A	6	6	645635	645640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_016051	A	7	7	645652	645658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_016051	TCG	2	6	645682	645687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477043
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12623	NC_016051	ACG	2	6	645786	645791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477043
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12743	NC_016051	CAT	2	6	653124	653129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477207
12744	NC_016051	GAG	2	6	653203	653208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525794
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12749	NC_016051	C	6	6	653781	653786	0 %	0 %	0 %	100 %	223477257
12750	NC_016051	AG	3	6	653803	653808	50 %	0 %	50 %	0 %	223477257
12751	NC_016051	CTC	2	6	653823	653828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477257
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12765	NC_016051	CA	3	6	654587	654592	50 %	0 %	0 %	50 %	223476988
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12783	NC_016051	GAG	3	9	655281	655289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477031
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12794	NC_016051	GAAA	2	8	655673	655680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12795	NC_016051	TCG	2	6	655719	655724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477118
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12823	NC_016051	CAGG	2	8	657036	657043	25 %	0 %	50 %	25 %	223477193
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12850	NC_016051	ACA	2	6	658552	658557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477193
12851	NC_016051	GAT	2	6	658652	658657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477193
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12856	NC_016051	CCT	2	6	658814	658819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477193
12857	NC_016051	GAT	2	6	658859	658864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477193
12858	NC_016051	GAC	2	6	658871	658876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477193
12859	NC_016051	ACT	2	6	658897	658902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477193
12860	NC_016051	CTA	2	6	658907	658912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477193
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12981	NC_016051	GAC	2	6	664817	664822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477233
12982	NC_016051	ACG	2	6	664859	664864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477233
12983	NC_016051	AGA	2	6	664873	664878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477233
12984	NC_016051	GA	3	6	664941	664946	50 %	0 %	50 %	0 %	223477233
12985	NC_016051	AAC	2	6	665008	665013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477233
12986	NC_016051	ATC	2	6	665111	665116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477233
12987	NC_016051	GAAGG	2	10	665122	665131	40 %	0 %	60 %	0 %	223477233
12988	NC_016051	CTA	2	6	665134	665139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477233
12989	NC_016051	ATA	2	6	665183	665188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477233
12990	NC_016051	GTC	2	6	665254	665259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477233
12991	NC_016051	GACG	2	8	665341	665348	25 %	0 %	50 %	25 %	223477233
12992	NC_016051	CTG	2	6	665418	665423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477233
12993	NC_016051	ACA	2	6	665493	665498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477233
12994	NC_016051	GGAAG	2	10	665511	665520	40 %	0 %	60 %	0 %	223477233
12995	NC_016051	CA	3	6	665544	665549	50 %	0 %	0 %	50 %	223477233
12996	NC_016051	CCG	2	6	665595	665600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477233
12997	NC_016051	GAG	2	6	665615	665620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477233
12998	NC_016051	ACGCGA	2	12	665628	665639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477233
12999	NC_016051	GAGG	2	8	665672	665679	25 %	0 %	75 %	0 %	223477233
13000	NC_016051	ACCT	2	8	665681	665688	25 %	25 %	0 %	50 %	223477233

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