MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016051	ACG	2	6	587979	587984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525787
11502	NC_016051	A	6	6	588004	588009	100 %	0 %	0 %	0 %	350525787
11503	NC_016051	TCG	2	6	588045	588050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525787
11504	NC_016051	AAAC	2	8	588212	588219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_016051	GTT	2	6	588294	588299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_016051	CAT	2	6	588373	588378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_016051	GAG	2	6	588393	588398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_016051	TCT	2	6	588551	588556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_016051	TGA	2	6	588560	588565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_016051	GAA	2	6	588655	588660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477117
11511	NC_016051	GAC	2	6	588692	588697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477117
11512	NC_016051	CGG	2	6	588711	588716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477117
11513	NC_016051	CGT	2	6	588805	588810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477117
11514	NC_016051	ATC	2	6	588826	588831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477117
11515	NC_016051	CGG	2	6	588865	588870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477117
11516	NC_016051	CTT	2	6	588928	588933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477117
11517	NC_016051	GCC	2	6	589082	589087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477117
11518	NC_016051	GGCC	2	8	589099	589106	0 %	0 %	50 %	50 %	223477117
11519	NC_016051	GAT	2	6	589174	589179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477117
11520	NC_016051	TCG	2	6	589215	589220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477117
11521	NC_016051	GAG	2	6	589249	589254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477117
11522	NC_016051	CAT	2	6	589276	589281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477117
11523	NC_016051	AGGGCA	2	12	589322	589333	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	223477117
11524	NC_016051	GAG	2	6	589340	589345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477117
11525	NC_016051	T	6	6	589398	589403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_016051	GCG	2	6	589426	589431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_016051	GTT	2	6	589432	589437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_016051	TAA	2	6	589493	589498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477124
11529	NC_016051	CTG	2	6	589552	589557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477124
11530	NC_016051	TCG	2	6	589595	589600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477124
11531	NC_016051	GCGGT	2	10	589601	589610	0 %	20 %	60 %	20 %	223477124
11532	NC_016051	TCT	2	6	589697	589702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477124
11533	NC_016051	CAG	2	6	589800	589805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477124
11534	NC_016051	TCG	2	6	589817	589822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477124
11535	NC_016051	TCC	2	6	589877	589882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477124
11536	NC_016051	ACGGC	2	10	589928	589937	20 %	0 %	40 %	40 %	223477124
11537	NC_016051	AAG	2	6	589960	589965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477124
11538	NC_016051	CGC	2	6	589986	589991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477124
11539	NC_016051	CGA	2	6	590030	590035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477124
11540	NC_016051	CTC	2	6	590110	590115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477124
11541	NC_016051	AGG	2	6	590152	590157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477124
11542	NC_016051	GCG	2	6	590173	590178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477124
11543	NC_016051	ATA	2	6	590179	590184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477124
11544	NC_016051	GGA	2	6	590215	590220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477124
11545	NC_016051	ATA	2	6	590257	590262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477124
11546	NC_016051	ATA	2	6	590314	590319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477124
11547	NC_016051	GCG	2	6	590320	590325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477124
11548	NC_016051	TCG	2	6	590549	590554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477124
11549	NC_016051	GAAG	2	8	590808	590815	50 %	0 %	50 %	0 %	223477066
11550	NC_016051	GAA	2	6	590940	590945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_016051	TA	3	6	591031	591036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_016051	AGA	2	6	591084	591089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476944
11553	NC_016051	TCG	2	6	591162	591167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476944
11554	NC_016051	CTGTT	2	10	591204	591213	0 %	60 %	20 %	20 %	223476944
11555	NC_016051	CGA	2	6	591249	591254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
11556	NC_016051	ACC	2	6	591292	591297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476944
11557	NC_016051	CAA	2	6	591328	591333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476944
11558	NC_016051	CGA	2	6	591355	591360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
11559	NC_016051	AGG	2	6	591380	591385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
11560	NC_016051	TCA	2	6	591522	591527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476944
11561	NC_016051	GA	3	6	591542	591547	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
11562	NC_016051	A	6	6	591592	591597	100 %	0 %	0 %	0 %	223476944
11563	NC_016051	AAG	2	6	591620	591625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476944
11564	NC_016051	GGA	2	6	591628	591633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
11565	NC_016051	TCT	2	6	591652	591657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476944
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11568	NC_016051	ACG	2	6	591705	591710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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11570	NC_016051	GA	3	6	591771	591776	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
11571	NC_016051	GAG	2	6	591800	591805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
11572	NC_016051	GAG	3	9	591830	591838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
11573	NC_016051	AGGGAA	2	12	591890	591901	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
11574	NC_016051	GGA	2	6	591925	591930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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11579	NC_016051	TCG	2	6	592188	592193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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11581	NC_016051	AAG	2	6	592274	592279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476944
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11583	NC_016051	CGAGG	2	10	592462	592471	20 %	0 %	60 %	20 %	223476944
11584	NC_016051	GAAGA	2	10	592496	592505	60 %	0 %	40 %	0 %	223476944
11585	NC_016051	GAG	2	6	592550	592555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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11588	NC_016051	GTT	2	6	592727	592732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476944
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11591	NC_016051	A	6	6	592778	592783	100 %	0 %	0 %	0 %	223476944
11592	NC_016051	TCC	2	6	592800	592805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476944
11593	NC_016051	CAA	2	6	592810	592815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476944
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11598	NC_016051	GCT	2	6	593002	593007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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11602	NC_016051	GAAG	2	8	593110	593117	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
11603	NC_016051	CTC	2	6	593246	593251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476944
11604	NC_016051	GGA	2	6	593254	593259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
11605	NC_016051	GA	3	6	593366	593371	50 %	0 %	50 %	0 %	223476944
11606	NC_016051	AGG	2	6	593475	593480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
11607	NC_016051	CAG	2	6	593485	593490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476944
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11611	NC_016051	GAG	2	6	593657	593662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
11612	NC_016051	AAG	2	6	593666	593671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476944
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11616	NC_016051	AAGGA	2	10	593942	593951	60 %	0 %	40 %	0 %	223476944
11617	NC_016051	GGA	3	9	593962	593970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476944
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11983	NC_016051	CT	3	6	613124	613129	0 %	50 %	0 %	50 %	223477075
11984	NC_016051	ACG	2	6	613145	613150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477075
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11991	NC_016051	AGGA	2	8	613345	613352	50 %	0 %	50 %	0 %	223477075
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