MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016051	CGGC	2	8	562444	562451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11002	NC_016051	TTA	2	6	562460	562465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_016051	TAA	2	6	562495	562500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_016051	AGT	2	6	562605	562610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477170
11005	NC_016051	CAA	2	6	562673	562678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477170
11006	NC_016051	ACC	2	6	562693	562698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477170
11007	NC_016051	CAC	2	6	562739	562744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477170
11008	NC_016051	CAACG	2	10	562745	562754	40 %	0 %	20 %	40 %	223477170
11009	NC_016051	GAGG	2	8	562808	562815	25 %	0 %	75 %	0 %	223477170
11010	NC_016051	TCC	2	6	562843	562848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477170
11011	NC_016051	AGA	2	6	562888	562893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477170
11012	NC_016051	GAT	2	6	562917	562922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477170
11013	NC_016051	GC	3	6	562927	562932	0 %	0 %	50 %	50 %	223477170
11014	NC_016051	TACC	2	8	563057	563064	25 %	25 %	0 %	50 %	223477170
11015	NC_016051	CGC	2	6	563186	563191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477170
11016	NC_016051	TGG	2	6	563277	563282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477170
11017	NC_016051	CA	3	6	563298	563303	50 %	0 %	0 %	50 %	223477170
11018	NC_016051	TCC	2	6	563440	563445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476962
11019	NC_016051	AGA	2	6	563452	563457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
11020	NC_016051	TC	4	8	563491	563498	0 %	50 %	0 %	50 %	223476962
11021	NC_016051	TCG	2	6	563533	563538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476962
11022	NC_016051	GGA	2	6	563608	563613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
11023	NC_016051	AGGG	2	8	563661	563668	25 %	0 %	75 %	0 %	223476962
11024	NC_016051	ACA	2	6	563677	563682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476962
11025	NC_016051	GCG	2	6	563692	563697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
11026	NC_016051	CGT	2	6	563759	563764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476962
11027	NC_016051	GGA	2	6	563811	563816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
11028	NC_016051	CTC	2	6	563828	563833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476962
11029	NC_016051	CTG	2	6	563841	563846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476962
11030	NC_016051	GAA	2	6	563918	563923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
11031	NC_016051	AGG	2	6	563965	563970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
11032	NC_016051	GGC	2	6	563987	563992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
11033	NC_016051	AGC	2	6	564057	564062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476962
11034	NC_016051	GAA	2	6	564137	564142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
11035	NC_016051	ATA	2	6	564159	564164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223476962
11036	NC_016051	AG	3	6	564191	564196	50 %	0 %	50 %	0 %	223476962
11037	NC_016051	GAT	2	6	564212	564217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476962
11038	NC_016051	GAT	2	6	564228	564233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476962
11039	NC_016051	GTG	2	6	564323	564328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476962
11040	NC_016051	GGGAT	2	10	564362	564371	20 %	20 %	60 %	0 %	223476962
11041	NC_016051	GAA	2	6	564386	564391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
11042	NC_016051	TTC	2	6	564414	564419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476962
11043	NC_016051	CGG	2	6	564428	564433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
11044	NC_016051	GAGC	2	8	564484	564491	25 %	0 %	50 %	25 %	223476962
11045	NC_016051	CTCC	2	8	564527	564534	0 %	25 %	0 %	75 %	223476962
11046	NC_016051	GCA	2	6	564544	564549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476962
11047	NC_016051	GCC	2	6	564606	564611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476962
11048	NC_016051	AAC	2	6	564629	564634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476962
11049	NC_016051	GGT	2	6	564668	564673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476962
11050	NC_016051	GGC	2	6	564710	564715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
11051	NC_016051	ATC	2	6	564771	564776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476962
11052	NC_016051	CT	3	6	564895	564900	0 %	50 %	0 %	50 %	223476962
11053	NC_016051	GCGT	2	8	564909	564916	0 %	25 %	50 %	25 %	223476962
11054	NC_016051	CT	3	6	564924	564929	0 %	50 %	0 %	50 %	223476962
11055	NC_016051	ACT	2	6	564958	564963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476962
11056	NC_016051	GAA	2	6	564974	564979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476962
11057	NC_016051	GGA	2	6	565061	565066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476962
11058	NC_016051	GGC	2	6	565196	565201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476962
11059	NC_016051	TTCA	2	8	565205	565212	25 %	50 %	0 %	25 %	223476962
11060	NC_016051	A	6	6	565260	565265	100 %	0 %	0 %	0 %	223476962
11061	NC_016051	TTG	2	6	565423	565428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476962
11062	NC_016051	GCC	2	6	565442	565447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476962
11063	NC_016051	GTG	2	6	565460	565465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476962
11064	NC_016051	GTT	2	6	565474	565479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477278
11065	NC_016051	TCA	2	6	565577	565582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477278
11066	NC_016051	TTACC	2	10	565722	565731	20 %	40 %	0 %	40 %	223477278
11067	NC_016051	AGG	2	6	565733	565738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477278
11068	NC_016051	ACTG	2	8	565755	565762	25 %	25 %	25 %	25 %	223477278
11069	NC_016051	TG	3	6	565761	565766	0 %	50 %	50 %	0 %	223477278
11070	NC_016051	TCT	2	6	565778	565783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477278
11071	NC_016051	GTG	3	9	565886	565894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477278
11072	NC_016051	GTT	2	6	565911	565916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477278
11073	NC_016051	TGA	2	6	565929	565934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477278
11074	NC_016051	CTC	2	6	565948	565953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477278
11075	NC_016051	GTT	2	6	565996	566001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223477278
11076	NC_016051	TC	3	6	566007	566012	0 %	50 %	0 %	50 %	223477278
11077	NC_016051	AGGG	2	8	566022	566029	25 %	0 %	75 %	0 %	223477278
11078	NC_016051	CAA	2	6	566076	566081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223477278
11079	NC_016051	ATA	2	6	566092	566097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223477278
11080	NC_016051	GGA	2	6	566098	566103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477278
11081	NC_016051	G	6	6	566122	566127	0 %	0 %	100 %	0 %	223477278
11082	NC_016051	G	6	6	566144	566149	0 %	0 %	100 %	0 %	223477278
11083	NC_016051	AGG	2	6	566164	566169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477278
11084	NC_016051	CCCTT	2	10	566202	566211	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11085	NC_016051	CCG	2	6	566240	566245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_016051	TGA	2	6	566270	566275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_016051	GATGGT	2	12	566300	566311	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	223477194
11088	NC_016051	CGA	2	6	566396	566401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477194
11089	NC_016051	CGA	2	6	566438	566443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477194
11090	NC_016051	CGAG	2	8	566455	566462	25 %	0 %	50 %	25 %	223477194
11091	NC_016051	CCT	2	6	566483	566488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477194
11092	NC_016051	GAG	2	6	566510	566515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477194
11093	NC_016051	ATC	2	6	566532	566537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477194
11094	NC_016051	GCTG	2	8	566549	566556	0 %	25 %	50 %	25 %	223477194
11095	NC_016051	TAG	2	6	566589	566594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477194
11096	NC_016051	TCTT	2	8	566644	566651	0 %	75 %	0 %	25 %	223477152
11097	NC_016051	GCC	2	6	566652	566657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477152
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11099	NC_016051	CGT	2	6	566665	566670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477152
11100	NC_016051	TAT	2	6	566774	566779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477152
11101	NC_016051	GTC	2	6	566834	566839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477152
11102	NC_016051	TCG	2	6	566901	566906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477152
11103	NC_016051	GAG	2	6	566917	566922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477152
11104	NC_016051	CTC	2	6	566943	566948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477152
11105	NC_016051	CGT	2	6	566953	566958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477152
11106	NC_016051	GCCT	2	8	567039	567046	0 %	25 %	25 %	50 %	223477152
11107	NC_016051	TCTCC	2	10	567122	567131	0 %	40 %	0 %	60 %	223477152
11108	NC_016051	TC	3	6	567133	567138	0 %	50 %	0 %	50 %	223477152
11109	NC_016051	CCA	2	6	567292	567297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_016051	ATG	2	6	567350	567355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525781
11111	NC_016051	G	6	6	567396	567401	0 %	0 %	100 %	0 %	350525781
11112	NC_016051	CTGGC	2	10	567407	567416	0 %	20 %	40 %	40 %	350525781
11113	NC_016051	TCC	2	6	567557	567562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525781
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11115	NC_016051	CGT	2	6	567897	567902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525781
11116	NC_016051	CCG	2	6	567956	567961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525781
11117	NC_016051	CTG	2	6	568037	568042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525781
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11119	NC_016051	GGT	2	6	568137	568142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11121	NC_016051	GCC	2	6	568217	568222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477054
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11151	NC_016051	GGAG	2	8	569705	569712	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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11245	NC_016051	CTT	2	6	573799	573804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477071
11246	NC_016051	GTA	2	6	573832	573837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477071
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11263	NC_016051	TAA	2	6	574637	574642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11264	NC_016051	TGA	2	6	574656	574661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11469	NC_016051	TCCA	2	8	586522	586529	25 %	25 %	0 %	50 %	223477111
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11479	NC_016051	T	6	6	586808	586813	0 %	100 %	0 %	0 %	223477111
11480	NC_016051	CTCC	2	8	586814	586821	0 %	25 %	0 %	75 %	223477111
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11482	NC_016051	TCCTC	2	10	586904	586913	0 %	40 %	0 %	60 %	223477111
11483	NC_016051	ACC	2	6	587014	587019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11484	NC_016051	TGT	2	6	587026	587031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11485	NC_016051	CTT	2	6	587100	587105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477248
11486	NC_016051	TTC	2	6	587128	587133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477248
11487	NC_016051	TCCA	2	8	587188	587195	25 %	25 %	0 %	50 %	223477248
11488	NC_016051	TCG	2	6	587218	587223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477248
11489	NC_016051	GGA	2	6	587237	587242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477248
11490	NC_016051	CTC	2	6	587301	587306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477248
11491	NC_016051	GTC	2	6	587418	587423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477248
11492	NC_016051	TC	3	6	587436	587441	0 %	50 %	0 %	50 %	223477248
11493	NC_016051	TAC	2	6	587605	587610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476964
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11499	NC_016051	GAC	2	6	587929	587934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476964
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