MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016051	GTGTAG	2	12	512347	512358	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	223477044
10002	NC_016051	CG	3	6	512359	512364	0 %	0 %	50 %	50 %	223477044
10003	NC_016051	CGA	2	6	512378	512383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477044
10004	NC_016051	CGA	2	6	512387	512392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477044
10005	NC_016051	CTG	2	6	512395	512400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477044
10006	NC_016051	AGT	2	6	512450	512455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477044
10007	NC_016051	GAA	2	6	512505	512510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477044
10008	NC_016051	TCG	2	6	512546	512551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477044
10009	NC_016051	GGAA	2	8	512558	512565	50 %	0 %	50 %	0 %	223477044
10010	NC_016051	AAG	2	6	512638	512643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477044
10011	NC_016051	TCG	2	6	512651	512656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477044
10012	NC_016051	GAG	2	6	512823	512828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477044
10013	NC_016051	GTA	2	6	512835	512840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477044
10014	NC_016051	GAG	2	6	512889	512894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477044
10015	NC_016051	CTC	2	6	513088	513093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477044
10016	NC_016051	GAA	2	6	513123	513128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477044
10017	NC_016051	CGA	2	6	513218	513223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477116
10018	NC_016051	CTTC	2	8	513236	513243	0 %	50 %	0 %	50 %	223477116
10019	NC_016051	TCG	2	6	513244	513249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477116
10020	NC_016051	CGT	2	6	513290	513295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477116
10021	NC_016051	CCA	2	6	513305	513310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477116
10022	NC_016051	GT	3	6	513323	513328	0 %	50 %	50 %	0 %	223477116
10023	NC_016051	GAA	2	6	513462	513467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477116
10024	NC_016051	ACC	2	6	513497	513502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477116
10025	NC_016051	GAA	2	6	513513	513518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477116
10026	NC_016051	CCA	2	6	513533	513538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477116
10027	NC_016051	CGA	2	6	513548	513553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477116
10028	NC_016051	C	6	6	513687	513692	0 %	0 %	0 %	100 %	223477244
10029	NC_016051	GTAG	2	8	513752	513759	25 %	25 %	50 %	0 %	223477244
10030	NC_016051	CAG	2	6	513761	513766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477244
10031	NC_016051	CTC	2	6	513845	513850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477244
10032	NC_016051	CGG	2	6	513875	513880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477244
10033	NC_016051	ATG	2	6	513954	513959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477244
10034	NC_016051	GAG	2	6	514004	514009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477244
10035	NC_016051	GAG	2	6	514043	514048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477244
10036	NC_016051	ATC	2	6	514056	514061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477244
10037	NC_016051	AGG	2	6	514192	514197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477288
10038	NC_016051	GCC	2	6	514215	514220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477288
10039	NC_016051	GAGC	2	8	514235	514242	25 %	0 %	50 %	25 %	223477288
10040	NC_016051	AGGCC	2	10	514259	514268	20 %	0 %	40 %	40 %	223477288
10041	NC_016051	TC	3	6	514311	514316	0 %	50 %	0 %	50 %	223477288
10042	NC_016051	AGG	2	6	514348	514353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477288
10043	NC_016051	ATTATC	2	12	514438	514449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	223477288
10044	NC_016051	ACG	2	6	514450	514455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477288
10045	NC_016051	CCTCG	2	10	514503	514512	0 %	20 %	20 %	60 %	223477288
10046	NC_016051	TCT	2	6	514526	514531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477288
10047	NC_016051	TCG	2	6	514537	514542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477288
10048	NC_016051	GAA	2	6	514581	514586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477288
10049	NC_016051	CTC	2	6	514719	514724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477288
10050	NC_016051	AGGA	2	8	514786	514793	50 %	0 %	50 %	0 %	223477288
10051	NC_016051	CGA	2	6	514799	514804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477288
10052	NC_016051	GGC	2	6	514919	514924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477160
10053	NC_016051	GAA	2	6	514946	514951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477160
10054	NC_016051	GAC	2	6	515036	515041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477160
10055	NC_016051	CAG	2	6	515054	515059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477160
10056	NC_016051	ATC	2	6	515070	515075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477160
10057	NC_016051	CCT	2	6	515083	515088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477064
10058	NC_016051	TTC	2	6	515104	515109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477064
10059	NC_016051	CTC	2	6	515110	515115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477064
10060	NC_016051	CT	3	6	515158	515163	0 %	50 %	0 %	50 %	223477064
10061	NC_016051	ACC	2	6	515192	515197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477064
10062	NC_016051	AGG	2	6	515200	515205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477064
10063	NC_016051	CTT	2	6	515206	515211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477064
10064	NC_016051	AGG	2	6	515270	515275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477064
10065	NC_016051	GAA	2	6	515311	515316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477064
10066	NC_016051	GGT	2	6	515334	515339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477064
10067	NC_016051	CCA	2	6	515349	515354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223477064
10068	NC_016051	GCG	2	6	515378	515383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477064
10069	NC_016051	CGC	2	6	515452	515457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477064
10070	NC_016051	GAG	2	6	515479	515484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477064
10071	NC_016051	ACCTCC	2	12	515530	515541	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	223477125
10072	NC_016051	GTA	2	6	515562	515567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477125
10073	NC_016051	CGC	2	6	515606	515611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477125
10074	NC_016051	ATG	2	6	515620	515625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223477125
10075	NC_016051	CGC	2	6	515658	515663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223477125
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10077	NC_016051	CG	3	6	515724	515729	0 %	0 %	50 %	50 %	223477125
10078	NC_016051	CGG	2	6	515765	515770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477125
10079	NC_016051	GAC	2	6	515793	515798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477125
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10082	NC_016051	GA	3	6	515867	515872	50 %	0 %	50 %	0 %	223476981
10083	NC_016051	CGT	3	9	515980	515988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476981
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10086	NC_016051	CAGG	2	8	516034	516041	25 %	0 %	50 %	25 %	223476981
10087	NC_016051	TGT	2	6	516112	516117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476981
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10089	NC_016051	AGC	2	6	516129	516134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476981
10090	NC_016051	CGCCA	2	10	516182	516191	20 %	0 %	20 %	60 %	223476981
10091	NC_016051	GAG	3	9	516194	516202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10092	NC_016051	GGGGA	2	10	516254	516263	20 %	0 %	80 %	0 %	223476981
10093	NC_016051	TCC	2	6	516381	516386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476981
10094	NC_016051	CCTC	2	8	516394	516401	0 %	25 %	0 %	75 %	223476981
10095	NC_016051	TCC	2	6	516421	516426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476981
10096	NC_016051	CGAGG	2	10	516440	516449	20 %	0 %	60 %	20 %	223476981
10097	NC_016051	CAT	2	6	516499	516504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476981
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10099	NC_016051	TGA	2	6	516592	516597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476981
10100	NC_016051	ACG	2	6	516606	516611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476981
10101	NC_016051	GGA	2	6	516619	516624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10102	NC_016051	CTC	2	6	516650	516655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476981
10103	NC_016051	GAA	2	6	516683	516688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476981
10104	NC_016051	GGA	2	6	516724	516729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10105	NC_016051	GC	3	6	516778	516783	0 %	0 %	50 %	50 %	223476981
10106	NC_016051	CGG	2	6	516928	516933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476981
10107	NC_016051	GGA	2	6	516934	516939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10108	NC_016051	GAA	2	6	516941	516946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476981
10109	NC_016051	GAG	2	6	516986	516991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10110	NC_016051	AGCG	2	8	517017	517024	25 %	0 %	50 %	25 %	223476981
10111	NC_016051	GAG	2	6	517097	517102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10112	NC_016051	GGT	2	6	517159	517164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223476981
10113	NC_016051	GAG	2	6	517205	517210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10114	NC_016051	CCG	2	6	517297	517302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476981
10115	NC_016051	TGT	2	6	517345	517350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223476981
10116	NC_016051	GAG	3	9	517358	517366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10117	NC_016051	GGTT	2	8	517387	517394	0 %	50 %	50 %	0 %	223476981
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10119	NC_016051	GAG	2	6	517478	517483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476981
10120	NC_016051	TCG	2	6	517516	517521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476981
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10199	NC_016051	GAAAG	2	10	522423	522432	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10227	NC_016051	GCCGAG	2	12	523687	523698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	223477284
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10229	NC_016051	TCC	2	6	523726	523731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477284
10230	NC_016051	CTGT	2	8	523744	523751	0 %	50 %	25 %	25 %	223477284
10231	NC_016051	CGG	2	6	523845	523850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477284
10232	NC_016051	CTCG	2	8	523894	523901	0 %	25 %	25 %	50 %	223477284
10233	NC_016051	ACGTCA	2	12	523916	523927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223477284
10234	NC_016051	GC	3	6	523960	523965	0 %	0 %	50 %	50 %	223477284
10235	NC_016051	CGG	2	6	523977	523982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477284
10236	NC_016051	CCT	2	6	523985	523990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477284
10237	NC_016051	GTA	2	6	524030	524035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_016051	TGG	2	6	524040	524045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_016051	GT	3	6	524051	524056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10240	NC_016051	AAG	3	9	524122	524130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_016051	GGT	2	6	524148	524153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_016051	CTG	2	6	524221	524226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477127
10243	NC_016051	TGG	2	6	524234	524239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477127
10244	NC_016051	CGT	2	6	524256	524261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477127
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10248	NC_016051	GAG	2	6	524450	524455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_016051	AACG	2	8	524601	524608	50 %	0 %	25 %	25 %	223477087
10250	NC_016051	GGC	2	6	524625	524630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223477087
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10253	NC_016051	GAGTTC	2	12	524695	524706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	223477087
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10261	NC_016051	CAT	2	6	524946	524951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477087
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10325	NC_016051	GGT	2	6	528300	528305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10352	NC_016051	ACT	2	6	529304	529309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477079
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10357	NC_016051	TCG	2	6	529697	529702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477076
10358	NC_016051	AGG	2	6	529711	529716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477076
10359	NC_016051	GAG	2	6	529807	529812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477076
10360	NC_016051	CGT	2	6	529848	529853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477076
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10377	NC_016051	GTC	2	6	530807	530812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477270
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10476	NC_016051	CGA	2	6	536222	536227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477219
10477	NC_016051	GGT	2	6	536292	536297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477219
10478	NC_016051	CCGC	2	8	536307	536314	0 %	0 %	25 %	75 %	223477219
10479	NC_016051	GGCA	2	8	536394	536401	25 %	0 %	50 %	25 %	223477219
10480	NC_016051	CGT	2	6	536433	536438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477219
10481	NC_016051	CTC	2	6	536533	536538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223477219
10482	NC_016051	GAG	2	6	536574	536579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477219
10483	NC_016051	GGT	2	6	536681	536686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223477137
10484	NC_016051	ACGGG	2	10	536704	536713	20 %	0 %	60 %	20 %	223477137
10485	NC_016051	AGG	2	6	536800	536805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477137
10486	NC_016051	CTGC	2	8	536843	536850	0 %	25 %	25 %	50 %	223477137
10487	NC_016051	CGCT	2	8	536852	536859	0 %	25 %	25 %	50 %	223477137
10488	NC_016051	AGGGG	2	10	536862	536871	20 %	0 %	80 %	0 %	223477137
10489	NC_016051	GA	3	6	536892	536897	50 %	0 %	50 %	0 %	223477137
10490	NC_016051	G	6	6	536943	536948	0 %	0 %	100 %	0 %	223477137
10491	NC_016051	GAG	2	6	536951	536956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477137
10492	NC_016051	TC	3	6	536964	536969	0 %	50 %	0 %	50 %	223477137
10493	NC_016051	CG	3	6	537032	537037	0 %	0 %	50 %	50 %	223477137
10494	NC_016051	AGA	2	6	537044	537049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223477137
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10496	NC_016051	GTC	2	6	537099	537104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477137
10497	NC_016051	GAG	2	6	537117	537122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477137
10498	NC_016051	GGGA	2	8	537189	537196	25 %	0 %	75 %	0 %	223477137
10499	NC_016051	GGA	2	6	537284	537289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477104
10500	NC_016051	GAG	2	6	537301	537306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223477104

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