MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016051	TGG	2	6	25284	25289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478876
502	NC_016051	GGT	2	6	25294	25299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478876
503	NC_016051	GC	3	6	25312	25317	0 %	0 %	50 %	50 %	223478480
504	NC_016051	TAC	2	6	25412	25417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478480
505	NC_016051	GTC	2	6	25469	25474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478480
506	NC_016051	GGA	2	6	25551	25556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478480
507	NC_016051	AGA	2	6	25557	25562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478480
508	NC_016051	GAC	2	6	25600	25605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478480
509	NC_016051	CTG	2	6	25616	25621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478480
510	NC_016051	TTCA	2	8	25655	25662	25 %	50 %	0 %	25 %	223478480
511	NC_016051	GGA	2	6	25682	25687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478480
512	NC_016051	GAG	2	6	25695	25700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478480
513	NC_016051	CTG	2	6	25721	25726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478480
514	NC_016051	CGGT	2	8	25809	25816	0 %	25 %	50 %	25 %	223478480
515	NC_016051	GGC	2	6	25835	25840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478480
516	NC_016051	CTGGGG	2	12	25870	25881	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	223478480
517	NC_016051	GCG	2	6	25908	25913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478480
518	NC_016051	GAACT	2	10	25956	25965	40 %	20 %	20 %	20 %	223478480
519	NC_016051	CAT	2	6	25972	25977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478480
520	NC_016051	ACA	2	6	25980	25985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478480
521	NC_016051	AGG	2	6	25992	25997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478480
522	NC_016051	CTA	2	6	26031	26036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478921
523	NC_016051	AAG	2	6	26086	26091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478921
524	NC_016051	CTC	2	6	26146	26151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478921
525	NC_016051	GAG	2	6	26338	26343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478921
526	NC_016051	AGG	2	6	26347	26352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478921
527	NC_016051	CTC	2	6	26382	26387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478684
528	NC_016051	CTT	2	6	26411	26416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478684
529	NC_016051	TAC	2	6	26457	26462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478684
530	NC_016051	GGCG	2	8	26549	26556	0 %	0 %	75 %	25 %	223478684
531	NC_016051	TCG	2	6	26620	26625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478684
532	NC_016051	TCC	2	6	26704	26709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478684
533	NC_016051	ACA	2	6	26812	26817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478684
534	NC_016051	GGC	2	6	26828	26833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478684
535	NC_016051	CTT	2	6	26879	26884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478684
536	NC_016051	CTC	2	6	26994	26999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478684
537	NC_016051	GCC	2	6	27066	27071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478684
538	NC_016051	TCG	2	6	27103	27108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478684
539	NC_016051	GGCC	2	8	27113	27120	0 %	0 %	50 %	50 %	223478684
540	NC_016051	GCT	2	6	27137	27142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478684
541	NC_016051	GTC	2	6	27189	27194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478684
542	NC_016051	GGC	2	6	27200	27205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478684
543	NC_016051	GAT	2	6	27260	27265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478684
544	NC_016051	CTC	2	6	27272	27277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478684
545	NC_016051	GGCG	2	8	27326	27333	0 %	0 %	75 %	25 %	223478684
546	NC_016051	CTC	2	6	27381	27386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478684
547	NC_016051	CGG	2	6	27419	27424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478684
548	NC_016051	AGG	2	6	27456	27461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478684
549	NC_016051	GCC	2	6	27501	27506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478684
550	NC_016051	TCT	2	6	27529	27534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478684
551	NC_016051	CGT	2	6	27611	27616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478684
552	NC_016051	AC	3	6	27644	27649	50 %	0 %	0 %	50 %	223478684
553	NC_016051	TGC	2	6	27721	27726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478684
554	NC_016051	ACT	2	6	27754	27759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478684
555	NC_016051	ATG	2	6	27845	27850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478684
556	NC_016051	CTC	3	9	27884	27892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
557	NC_016051	ATTC	2	8	27939	27946	25 %	50 %	0 %	25 %	223478664
558	NC_016051	CGC	2	6	27987	27992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478664
559	NC_016051	TTC	2	6	28070	28075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478664
560	NC_016051	GCC	2	6	28112	28117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478664
561	NC_016051	CGC	3	9	28123	28131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478664
562	NC_016051	GAG	2	6	28159	28164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
563	NC_016051	GT	3	6	28212	28217	0 %	50 %	50 %	0 %	223478664
564	NC_016051	CTT	2	6	28240	28245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478664
565	NC_016051	ATG	2	6	28280	28285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478664
566	NC_016051	ACA	2	6	28296	28301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478664
567	NC_016051	GAT	2	6	28417	28422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478664
568	NC_016051	TCC	2	6	28488	28493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
569	NC_016051	ACCA	2	8	28559	28566	50 %	0 %	0 %	50 %	223478664
570	NC_016051	CTT	2	6	28579	28584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478664
571	NC_016051	GCG	2	6	28587	28592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478664
572	NC_016051	CTC	2	6	28637	28642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
573	NC_016051	AGG	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
574	NC_016051	CTC	2	6	28775	28780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
575	NC_016051	CTC	2	6	28786	28791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
576	NC_016051	TTC	2	6	28859	28864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478664
577	NC_016051	CCG	2	6	28911	28916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478664
578	NC_016051	TCC	2	6	28923	28928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
579	NC_016051	CGG	2	6	28957	28962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478664
580	NC_016051	CCG	2	6	29030	29035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478664
581	NC_016051	CA	3	6	29085	29090	50 %	0 %	0 %	50 %	223478664
582	NC_016051	TCG	2	6	29097	29102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
583	NC_016051	CGT	2	6	29143	29148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
584	NC_016051	GAG	2	6	29204	29209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
585	NC_016051	CGCTCC	2	12	29214	29225	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	223478664
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587	NC_016051	GCG	2	6	29319	29324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478664
588	NC_016051	TGC	2	6	29326	29331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
589	NC_016051	CTA	2	6	29338	29343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478664
590	NC_016051	ATCTAC	2	12	29426	29437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478664
591	NC_016051	GGA	2	6	29497	29502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
592	NC_016051	AGG	2	6	29519	29524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
593	NC_016051	GGA	2	6	29611	29616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
594	NC_016051	GAGG	2	8	29632	29639	25 %	0 %	75 %	0 %	223478664
595	NC_016051	TGC	2	6	29688	29693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
596	NC_016051	G	6	6	29709	29714	0 %	0 %	100 %	0 %	223478664
597	NC_016051	TGT	2	6	29715	29720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478664
598	NC_016051	CTTCAT	2	12	29785	29796	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	350525686
599	NC_016051	AGG	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525686
600	NC_016051	ATA	2	6	29861	29866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525686
601	NC_016051	AAG	2	6	29888	29893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525686
602	NC_016051	CTTC	2	8	29968	29975	0 %	50 %	0 %	50 %	350525686
603	NC_016051	CAG	2	6	29998	30003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525686
604	NC_016051	TCG	2	6	30018	30023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525686
605	NC_016051	CCT	2	6	30031	30036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525686
606	NC_016051	AAT	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525686
607	NC_016051	TGG	2	6	30126	30131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525686
608	NC_016051	TAC	2	6	30176	30181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525686
609	NC_016051	TCG	2	6	30204	30209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525686
610	NC_016051	TGG	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525686
611	NC_016051	CGC	2	6	30376	30381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525686
612	NC_016051	CA	3	6	30391	30396	50 %	0 %	0 %	50 %	350525686
613	NC_016051	CTT	2	6	30427	30432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525686
614	NC_016051	CGG	2	6	30448	30453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525686
615	NC_016051	CTC	2	6	30473	30478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525686
616	NC_016051	TTC	2	6	30560	30565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525686
617	NC_016051	CGA	2	6	30576	30581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525686
618	NC_016051	AAT	2	6	30589	30594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525686
619	NC_016051	GGT	2	6	30617	30622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016051	AGA	2	6	30706	30711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478529
621	NC_016051	GCG	2	6	30742	30747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478529
622	NC_016051	GCC	2	6	30758	30763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478529
623	NC_016051	ATG	2	6	30801	30806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478529
624	NC_016051	CCCCG	2	10	30812	30821	0 %	0 %	20 %	80 %	223478529
625	NC_016051	ATC	2	6	30879	30884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478529
626	NC_016051	GAT	2	6	30896	30901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478529
627	NC_016051	CGG	2	6	30947	30952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478529
628	NC_016051	CGT	2	6	30974	30979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478529
629	NC_016051	CGAT	2	8	31003	31010	25 %	25 %	25 %	25 %	223478529
630	NC_016051	AG	3	6	31116	31121	50 %	0 %	50 %	0 %	223478529
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739	NC_016051	TA	3	6	36301	36306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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742	NC_016051	GGAA	2	8	36380	36387	50 %	0 %	50 %	0 %	223478717
743	NC_016051	CAT	2	6	36434	36439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478717
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