MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016051	ATGA	2	8	357941	357948	50 %	25 %	25 %	0 %	350525739
7002	NC_016051	CTC	2	6	357955	357960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525739
7003	NC_016051	CGG	2	6	358134	358139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525739
7004	NC_016051	AGA	2	6	358176	358181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525739
7005	NC_016051	GTC	2	6	358255	358260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525739
7006	NC_016051	CGT	2	6	358269	358274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525739
7007	NC_016051	GGA	2	6	358359	358364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525739
7008	NC_016051	TTCC	2	8	358397	358404	0 %	50 %	0 %	50 %	350525739
7009	NC_016051	GCCA	2	8	358414	358421	25 %	0 %	25 %	50 %	350525739
7010	NC_016051	GA	3	6	358433	358438	50 %	0 %	50 %	0 %	350525739
7011	NC_016051	CCT	2	6	358495	358500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525739
7012	NC_016051	GA	3	6	358530	358535	50 %	0 %	50 %	0 %	350525739
7013	NC_016051	ACG	2	6	358589	358594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525739
7014	NC_016051	CAG	2	6	358696	358701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525739
7015	NC_016051	TC	3	6	358723	358728	0 %	50 %	0 %	50 %	350525739
7016	NC_016051	TGA	2	6	358745	358750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476851
7017	NC_016051	ATC	2	6	358798	358803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223476851
7018	NC_016051	GAA	2	6	358842	358847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476851
7019	NC_016051	TGA	2	6	358850	358855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476851
7020	NC_016051	GCG	2	6	358864	358869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223476851
7021	NC_016051	ACG	2	6	358876	358881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476851
7022	NC_016051	GTC	2	6	358908	358913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476851
7023	NC_016051	CCT	2	6	358934	358939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476851
7024	NC_016051	AGG	2	6	359011	359016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476851
7025	NC_016051	C	6	6	359110	359115	0 %	0 %	0 %	100 %	223476851
7026	NC_016051	GCC	2	6	359163	359168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476851
7027	NC_016051	ACC	2	6	359182	359187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7028	NC_016051	GAGG	2	8	359310	359317	25 %	0 %	75 %	0 %	223476859
7029	NC_016051	GGA	2	6	359322	359327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476859
7030	NC_016051	AGG	2	6	359473	359478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476859
7031	NC_016051	AGG	2	6	359539	359544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476859
7032	NC_016051	TCG	2	6	359554	359559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476859
7033	NC_016051	TC	3	6	359583	359588	0 %	50 %	0 %	50 %	223476859
7034	NC_016051	A	6	6	359597	359602	100 %	0 %	0 %	0 %	223476859
7035	NC_016051	CCT	2	6	359636	359641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476859
7036	NC_016051	TCA	2	6	359720	359725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_016051	AAT	2	6	359804	359809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_016051	A	6	6	359819	359824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_016051	A	6	6	359895	359900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_016051	GTA	2	6	359926	359931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476846
7041	NC_016051	CGT	3	9	359949	359957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476846
7042	NC_016051	AGT	2	6	360066	360071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476846
7043	NC_016051	GCT	2	6	360126	360131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476846
7044	NC_016051	GCC	2	6	360149	360154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476846
7045	NC_016051	GGA	2	6	360210	360215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476846
7046	NC_016051	CGA	2	6	360300	360305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476846
7047	NC_016051	GTA	2	6	360406	360411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223476846
7048	NC_016051	GCT	2	6	360418	360423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476846
7049	NC_016051	CCGG	2	8	360434	360441	0 %	0 %	50 %	50 %	223476846
7050	NC_016051	ACA	2	6	360461	360466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223476846
7051	NC_016051	GTT	2	6	360516	360521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_016051	TTTC	2	8	360554	360561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7053	NC_016051	GA	3	6	360580	360585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_016051	CAC	2	6	360586	360591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7055	NC_016051	GAA	2	6	360670	360675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476849
7056	NC_016051	GTC	2	6	360788	360793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476849
7057	NC_016051	CCG	2	6	360838	360843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223476849
7058	NC_016051	TCT	2	6	360901	360906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223476849
7059	NC_016051	ACC	2	6	360956	360961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223476849
7060	NC_016051	TCG	2	6	360984	360989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476849
7061	NC_016051	CCT	2	6	360997	361002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476849
7062	NC_016051	TCC	2	6	361089	361094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476849
7063	NC_016051	GAG	2	6	361304	361309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525740
7064	NC_016051	GCA	2	6	361360	361365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525740
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7067	NC_016051	ATG	2	6	361694	361699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525740
7068	NC_016051	CGATAA	2	12	361704	361715	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	350525740
7069	NC_016051	TCT	2	6	361785	361790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525740
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7076	NC_016051	AGATGA	2	12	362004	362015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	350525740
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7080	NC_016051	CCGA	2	8	362162	362169	25 %	0 %	25 %	50 %	350525740
7081	NC_016051	CGG	2	6	362197	362202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525740
7082	NC_016051	ACC	2	6	362216	362221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525740
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7087	NC_016051	CGA	2	6	362413	362418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476854
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7089	NC_016051	CAGC	2	8	362502	362509	25 %	0 %	25 %	50 %	223476854
7090	NC_016051	GAA	2	6	362533	362538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476854
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7094	NC_016051	CTC	2	6	362795	362800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476854
7095	NC_016051	CTG	2	6	362842	362847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476854
7096	NC_016051	GA	3	6	362960	362965	50 %	0 %	50 %	0 %	223476856
7097	NC_016051	CTG	2	6	363030	363035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476856
7098	NC_016051	GAG	2	6	363191	363196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476856
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7101	NC_016051	GAGG	2	8	363266	363273	25 %	0 %	75 %	0 %	223476856
7102	NC_016051	GGA	2	6	363284	363289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476856
7103	NC_016051	AAACC	2	10	363294	363303	60 %	0 %	0 %	40 %	223476856
7104	NC_016051	CT	3	6	363322	363327	0 %	50 %	0 %	50 %	223476856
7105	NC_016051	ACG	2	6	363379	363384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476856
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7107	NC_016051	GGA	2	6	363442	363447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223476856
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7109	NC_016051	ACG	2	6	363631	363636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223476856
7110	NC_016051	GAA	2	6	363752	363757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476856
7111	NC_016051	CTG	2	6	363798	363803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223476856
7112	NC_016051	CGAG	2	8	363883	363890	25 %	0 %	50 %	25 %	223476856
7113	NC_016051	AAG	2	6	363903	363908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223476856
7114	NC_016051	CGAG	2	8	364045	364052	25 %	0 %	50 %	25 %	223476856
7115	NC_016051	ATA	3	9	364053	364061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	223476856
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7117	NC_016051	ATA	2	6	364220	364225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525741
7118	NC_016051	CCT	2	6	364246	364251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525741
7119	NC_016051	GAA	2	6	364281	364286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525741
7120	NC_016051	TTCGT	2	10	364301	364310	0 %	60 %	20 %	20 %	350525741
7121	NC_016051	GAG	2	6	364526	364531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525741
7122	NC_016051	GTC	2	6	364570	364575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525742
7123	NC_016051	CTC	2	6	364585	364590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525742
7124	NC_016051	CCT	2	6	364659	364664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525742
7125	NC_016051	CAG	2	6	364666	364671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525742
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7159	NC_016051	CCGT	2	8	366047	366054	0 %	25 %	25 %	50 %	223476858
7160	NC_016051	CTC	2	6	366063	366068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223476858
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7201	NC_016051	AAGAA	2	10	367659	367668	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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7230	NC_016051	TC	3	6	369153	369158	0 %	50 %	0 %	50 %	223477196
7231	NC_016051	CTT	2	6	369165	369170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477196
7232	NC_016051	CTT	2	6	369204	369209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477196
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7234	NC_016051	TCCTC	2	10	369269	369278	0 %	40 %	0 %	60 %	223477196
7235	NC_016051	TCA	2	6	369323	369328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223477196
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7241	NC_016051	CAG	2	6	369588	369593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223477196
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7243	NC_016051	CTT	2	6	369645	369650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223477196
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7367	NC_016051	ATT	2	6	375833	375838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223477205
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7400	NC_016051	TG	3	6	377442	377447	0 %	50 %	50 %	0 %	223477088
7401	NC_016051	GGTTGT	2	12	377454	377465	0 %	50 %	50 %	0 %	223477088
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7487	NC_016051	CGT	2	6	381683	381688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477033
7488	NC_016051	TCG	2	6	381736	381741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477033
7489	NC_016051	AGCCG	2	10	381797	381806	20 %	0 %	40 %	40 %	223477033
7490	NC_016051	TCG	2	6	381844	381849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477033
7491	NC_016051	TCG	2	6	381959	381964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223477033
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7493	NC_016051	C	6	6	382039	382044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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