MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016051	AGG	2	6	307108	307113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478439
6002	NC_016051	TCGACA	2	12	307129	307140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223478439
6003	NC_016051	AGA	2	6	307153	307158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478439
6004	NC_016051	GAGC	2	8	307181	307188	25 %	0 %	50 %	25 %	223478439
6005	NC_016051	GTC	2	6	307200	307205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6006	NC_016051	AGG	2	6	307213	307218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478439
6007	NC_016051	AAG	2	6	307290	307295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478439
6008	NC_016051	AGG	2	6	307357	307362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478439
6009	NC_016051	AGA	2	6	307363	307368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478439
6010	NC_016051	CGT	2	6	307412	307417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6011	NC_016051	CGA	2	6	307436	307441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6012	NC_016051	AAG	2	6	307494	307499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478439
6013	NC_016051	TCG	2	6	307591	307596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6014	NC_016051	GA	3	6	307615	307620	50 %	0 %	50 %	0 %	223478439
6015	NC_016051	TCG	2	6	307630	307635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6016	NC_016051	TCA	2	6	307669	307674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478439
6017	NC_016051	GTC	2	6	307734	307739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6018	NC_016051	GGA	2	6	307751	307756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478439
6019	NC_016051	CGGC	2	8	307771	307778	0 %	0 %	50 %	50 %	223478439
6020	NC_016051	CGA	2	6	307811	307816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6021	NC_016051	AGG	2	6	307840	307845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478439
6022	NC_016051	TCA	2	6	307942	307947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478439
6023	NC_016051	ATC	2	6	308025	308030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478439
6024	NC_016051	CGA	2	6	308099	308104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478439
6025	NC_016051	CGC	2	6	308111	308116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478439
6026	NC_016051	GAGG	2	8	308133	308140	25 %	0 %	75 %	0 %	223478439
6027	NC_016051	CGG	2	6	308147	308152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478439
6028	NC_016051	GGC	2	6	308175	308180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478439
6029	NC_016051	CTT	2	6	308242	308247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_016051	CTG	2	6	308325	308330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478444
6031	NC_016051	CGG	2	6	308351	308356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478444
6032	NC_016051	ATG	2	6	308373	308378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478444
6033	NC_016051	TCA	2	6	308404	308409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478444
6034	NC_016051	GGCC	2	8	308516	308523	0 %	0 %	50 %	50 %	223478444
6035	NC_016051	CCGA	2	8	308550	308557	25 %	0 %	25 %	50 %	223478444
6036	NC_016051	AGGA	2	8	308579	308586	50 %	0 %	50 %	0 %	223478444
6037	NC_016051	GTC	2	6	308601	308606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478444
6038	NC_016051	ACG	2	6	308785	308790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478444
6039	NC_016051	ACA	2	6	308803	308808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478444
6040	NC_016051	GCG	2	6	308814	308819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478444
6041	NC_016051	GCG	2	6	308847	308852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478444
6042	NC_016051	CTC	2	6	308949	308954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478444
6043	NC_016051	AGCC	2	8	309050	309057	25 %	0 %	25 %	50 %	223478444
6044	NC_016051	TCT	2	6	309058	309063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478444
6045	NC_016051	CCG	2	6	309072	309077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478444
6046	NC_016051	GGA	2	6	309113	309118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478444
6047	NC_016051	AAT	2	6	309168	309173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_016051	TCG	2	6	309293	309298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
6049	NC_016051	GAG	2	6	309414	309419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478603
6050	NC_016051	ACG	2	6	309439	309444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478603
6051	NC_016051	TCTT	2	8	309460	309467	0 %	75 %	0 %	25 %	223478603
6052	NC_016051	CAC	2	6	309510	309515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478603
6053	NC_016051	CT	3	6	309523	309528	0 %	50 %	0 %	50 %	223478603
6054	NC_016051	AACG	2	8	309585	309592	50 %	0 %	25 %	25 %	223478603
6055	NC_016051	CGGC	2	8	309596	309603	0 %	0 %	50 %	50 %	223478603
6056	NC_016051	GCT	2	6	309648	309653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
6057	NC_016051	CATTGC	2	12	309675	309686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	223478603
6058	NC_016051	CGTAA	2	10	309702	309711	40 %	20 %	20 %	20 %	223478603
6059	NC_016051	TCC	2	6	309763	309768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478603
6060	NC_016051	TCG	2	6	309799	309804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
6061	NC_016051	AGC	2	6	309805	309810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478603
6062	NC_016051	GCT	3	9	309854	309862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
6063	NC_016051	GCC	2	6	309864	309869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478603
6064	NC_016051	TGG	2	6	309877	309882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478603
6065	NC_016051	TCC	2	6	309949	309954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478603
6066	NC_016051	CTC	2	6	310131	310136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478603
6067	NC_016051	ATC	2	6	310147	310152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478603
6068	NC_016051	CGT	2	6	310158	310163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478603
6069	NC_016051	GAG	2	6	310188	310193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478603
6070	NC_016051	CGG	2	6	310238	310243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478603
6071	NC_016051	GAC	2	6	310355	310360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478781
6072	NC_016051	CTC	2	6	310406	310411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478781
6073	NC_016051	GGT	2	6	310444	310449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478781
6074	NC_016051	TGA	2	6	310534	310539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478781
6075	NC_016051	TTC	2	6	310554	310559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478781
6076	NC_016051	TCG	2	6	310561	310566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478781
6077	NC_016051	GAG	2	6	310776	310781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478781
6078	NC_016051	GGC	2	6	310798	310803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478781
6079	NC_016051	GAAC	2	8	310930	310937	50 %	0 %	25 %	25 %	223478781
6080	NC_016051	GTT	2	6	310943	310948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478781
6081	NC_016051	ACG	2	6	310957	310962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478781
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6084	NC_016051	GCCG	2	8	311083	311090	0 %	0 %	50 %	50 %	223478781
6085	NC_016051	TCT	2	6	311158	311163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478781
6086	NC_016051	GAG	2	6	311168	311173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478781
6087	NC_016051	ATG	2	6	311187	311192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478781
6088	NC_016051	TGGTA	2	10	311372	311381	20 %	40 %	40 %	0 %	223478781
6089	NC_016051	CGC	2	6	311423	311428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478781
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6091	NC_016051	C	6	6	311556	311561	0 %	0 %	0 %	100 %	223478781
6092	NC_016051	GCC	2	6	311601	311606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478781
6093	NC_016051	GGC	2	6	311637	311642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478781
6094	NC_016051	AAC	2	6	311672	311677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478781
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6100	NC_016051	CAG	2	6	311912	311917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478781
6101	NC_016051	AAGA	2	8	311967	311974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_016051	GAG	2	6	312030	312035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478630
6103	NC_016051	CAG	2	6	312137	312142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478630
6104	NC_016051	GAG	2	6	312161	312166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478630
6105	NC_016051	GCC	3	9	312186	312194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478630
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6107	NC_016051	TAT	2	6	312341	312346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478630
6108	NC_016051	GAC	2	6	312377	312382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478630
6109	NC_016051	CTT	2	6	312401	312406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478630
6110	NC_016051	AGT	2	6	312409	312414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478630
6111	NC_016051	GGC	2	6	312455	312460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478630
6112	NC_016051	GTT	2	6	312503	312508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478630
6113	NC_016051	GGGA	2	8	312519	312526	25 %	0 %	75 %	0 %	223478630
6114	NC_016051	CTT	2	6	312560	312565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478630
6115	NC_016051	TAT	2	6	312578	312583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478630
6116	NC_016051	TCA	2	6	312691	312696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478630
6117	NC_016051	TTC	2	6	312708	312713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478630
6118	NC_016051	CA	3	6	312744	312749	50 %	0 %	0 %	50 %	223478630
6119	NC_016051	GAT	2	6	312758	312763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478630
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6121	NC_016051	TCG	2	6	312861	312866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478630
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6238	NC_016051	CAT	2	6	318626	318631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6240	NC_016051	GT	5	10	318722	318731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6241	NC_016051	CCA	3	9	318744	318752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6244	NC_016051	CTT	2	6	318909	318914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478442
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6488	NC_016051	GTT	2	6	332404	332409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478882
6489	NC_016051	AGC	2	6	332522	332527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478882
6490	NC_016051	GGC	2	6	332575	332580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478882
6491	NC_016051	GAG	2	6	332599	332604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478882
6492	NC_016051	GAC	2	6	332743	332748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478882
6493	NC_016051	TAT	2	6	332983	332988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478882
6494	NC_016051	TGT	2	6	333057	333062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478882
6495	NC_016051	TAAGC	2	10	333098	333107	40 %	20 %	20 %	20 %	223478882
6496	NC_016051	CTC	2	6	333224	333229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478535
6497	NC_016051	TAT	2	6	333230	333235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478535
6498	NC_016051	CAA	2	6	333274	333279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	223478535
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6500	NC_016051	GTT	2	6	333437	333442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478535

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