MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016051	AGT	2	6	282764	282769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525730
5502	NC_016051	TAT	2	6	282828	282833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350525730
5503	NC_016051	TCC	2	6	282865	282870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5504	NC_016051	GAG	2	6	282897	282902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5505	NC_016051	CTCTT	2	10	282913	282922	0 %	60 %	0 %	40 %	350525730
5506	NC_016051	GGAG	2	8	283076	283083	25 %	0 %	75 %	0 %	350525730
5507	NC_016051	GAG	2	6	283086	283091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5508	NC_016051	CCT	2	6	283100	283105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5509	NC_016051	TC	3	6	283266	283271	0 %	50 %	0 %	50 %	350525730
5510	NC_016051	GAG	2	6	283293	283298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5511	NC_016051	CTC	2	6	283374	283379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5512	NC_016051	GTT	2	6	283410	283415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5513	NC_016051	CTT	2	6	283422	283427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525730
5514	NC_016051	GAGG	2	8	283428	283435	25 %	0 %	75 %	0 %	350525730
5515	NC_016051	CCT	2	6	283481	283486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5516	NC_016051	GTT	2	6	283538	283543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5517	NC_016051	GAG	3	9	283554	283562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5518	NC_016051	TTC	2	6	283566	283571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525730
5519	NC_016051	GC	3	6	283582	283587	0 %	0 %	50 %	50 %	350525730
5520	NC_016051	CCT	2	6	283643	283648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5521	NC_016051	GAG	3	9	283671	283679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525730
5522	NC_016051	TCG	2	6	283690	283695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5523	NC_016051	GGTTTT	2	12	283861	283872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5524	NC_016051	AGC	2	6	283887	283892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5525	NC_016051	CGC	2	6	283895	283900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525730
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5527	NC_016051	CGG	2	6	283922	283927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525730
5528	NC_016051	G	6	6	283995	284000	0 %	0 %	100 %	0 %	350525730
5529	NC_016051	GTA	2	6	284011	284016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525730
5530	NC_016051	GTT	2	6	284017	284022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5531	NC_016051	GTT	2	6	284059	284064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5532	NC_016051	GTG	2	6	284065	284070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525730
5533	NC_016051	TGG	2	6	284079	284084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525730
5534	NC_016051	GA	3	6	284097	284102	50 %	0 %	50 %	0 %	350525730
5535	NC_016051	GTT	2	6	284113	284118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5536	NC_016051	CTC	2	6	284154	284159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525730
5537	NC_016051	GGCT	2	8	284298	284305	0 %	25 %	50 %	25 %	350525730
5538	NC_016051	GTC	2	6	284353	284358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5539	NC_016051	GTT	2	6	284431	284436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5540	NC_016051	GTT	2	6	284560	284565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5541	NC_016051	GTT	2	6	284722	284727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525730
5542	NC_016051	CTTT	2	8	284782	284789	0 %	75 %	0 %	25 %	350525730
5543	NC_016051	TCCG	2	8	284877	284884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_016051	CAGC	2	8	284914	284921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_016051	AAT	2	6	284949	284954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_016051	GAA	2	6	285050	285055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016051	CCAG	2	8	285093	285100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_016051	AAT	2	6	285105	285110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_016051	CCG	2	6	285160	285165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_016051	TCA	2	6	285196	285201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_016051	AAT	2	6	285261	285266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_016051	GGCAAT	2	12	285279	285290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5553	NC_016051	CCG	2	6	285316	285321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_016051	TCT	2	6	285326	285331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_016051	TCT	2	6	285376	285381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_016051	AAT	2	6	285417	285422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_016051	GGCAAC	2	12	285435	285446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_016051	CCG	2	6	285472	285477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_016051	T	6	6	285482	285487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016051	GAA	2	6	285518	285523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016051	ATA	2	6	285534	285539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_016051	AAT	2	6	285573	285578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_016051	GGCAAT	2	12	285591	285602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5564	NC_016051	CCG	2	6	285628	285633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_016051	TCT	2	6	285638	285643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_016051	ACC	2	6	285693	285698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_016051	TTC	2	6	285716	285721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_016051	GGCAAC	2	12	285747	285758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_016051	CCG	2	6	285784	285789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_016051	T	6	6	285794	285799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_016051	GAA	2	6	285830	285835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_016051	ATA	2	6	285846	285851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016051	AAT	2	6	285885	285890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_016051	TCA	2	6	285925	285930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_016051	GCC	2	6	285939	285944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5577	NC_016051	ACTC	2	8	285996	286003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_016051	AGG	2	6	286006	286011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_016051	CAC	2	6	286060	286065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_016051	CTA	2	6	286071	286076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478763
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5584	NC_016051	CTT	2	6	286253	286258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478763
5585	NC_016051	TCCC	2	8	286303	286310	0 %	25 %	0 %	75 %	223478763
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5592	NC_016051	TCC	2	6	286571	286576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478763
5593	NC_016051	TCCT	2	8	286591	286598	0 %	50 %	0 %	50 %	223478763
5594	NC_016051	AAGT	2	8	286729	286736	50 %	25 %	25 %	0 %	223478763
5595	NC_016051	TTCCT	2	10	286743	286752	0 %	60 %	0 %	40 %	223478763
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5604	NC_016051	CAC	2	6	286899	286904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478763
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5616	NC_016051	TA	3	6	287570	287575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_016051	TGG	2	6	287626	287631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223479002
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5623	NC_016051	TCT	2	6	287825	287830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223479002
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5625	NC_016051	CGA	2	6	287937	287942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223479002
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5991	NC_016051	GCC	2	6	306777	306782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478439
5992	NC_016051	GAT	2	6	306785	306790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478439
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5994	NC_016051	ACC	2	6	306837	306842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478439
5995	NC_016051	CGT	2	6	306845	306850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478439
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