MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016051	AGG	2	6	258456	258461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478973
5002	NC_016051	CGG	2	6	258484	258489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478973
5003	NC_016051	CCT	2	6	258546	258551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
5004	NC_016051	CAG	2	6	258566	258571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
5005	NC_016051	CGA	2	6	258742	258747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
5006	NC_016051	CAC	2	6	258857	258862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478973
5007	NC_016051	GAG	2	6	259031	259036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016051	CAG	2	6	259040	259045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_016051	GAA	2	6	259057	259062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016051	CTC	2	6	259095	259100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5011	NC_016051	TCT	2	6	259151	259156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
5012	NC_016051	AGCG	2	8	259201	259208	25 %	0 %	50 %	25 %	223478518
5013	NC_016051	CCT	2	6	259209	259214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5014	NC_016051	CCT	2	6	259286	259291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5015	NC_016051	CTC	2	6	259338	259343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5016	NC_016051	TGA	2	6	259397	259402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478518
5017	NC_016051	TCC	2	6	259442	259447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5018	NC_016051	TCG	2	6	259471	259476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478518
5019	NC_016051	GTTG	2	8	259491	259498	0 %	50 %	50 %	0 %	223478518
5020	NC_016051	TCAG	2	8	259552	259559	25 %	25 %	25 %	25 %	223478518
5021	NC_016051	TCC	2	6	259574	259579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5022	NC_016051	TCG	2	6	259610	259615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478518
5023	NC_016051	TGG	2	6	259694	259699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478518
5024	NC_016051	GAA	2	6	259743	259748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478518
5025	NC_016051	CGG	3	9	259766	259774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478518
5026	NC_016051	GAG	2	6	259782	259787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478518
5027	NC_016051	TGGA	2	8	259837	259844	25 %	25 %	50 %	0 %	223478518
5028	NC_016051	GAC	2	6	259869	259874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478518
5029	NC_016051	TCA	2	6	259900	259905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478518
5030	NC_016051	TCC	2	6	260001	260006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5031	NC_016051	GCC	2	6	260010	260015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478518
5032	NC_016051	CCTT	2	8	260023	260030	0 %	50 %	0 %	50 %	223478518
5033	NC_016051	CTC	2	6	260067	260072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5034	NC_016051	CCT	2	6	260075	260080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478518
5035	NC_016051	CTT	2	6	260097	260102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
5036	NC_016051	CTT	2	6	260106	260111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
5037	NC_016051	TCG	2	6	260134	260139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478518
5038	NC_016051	GCT	2	6	260150	260155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478518
5039	NC_016051	CTT	2	6	260181	260186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478518
5040	NC_016051	CTTT	2	8	260207	260214	0 %	75 %	0 %	25 %	223478518
5041	NC_016051	CAG	2	6	260256	260261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478518
5042	NC_016051	CCT	2	6	260294	260299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_016051	GAG	2	6	260392	260397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525724
5044	NC_016051	CTC	2	6	260422	260427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525724
5045	NC_016051	CTC	2	6	260478	260483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525724
5046	NC_016051	TCGC	2	8	260501	260508	0 %	25 %	25 %	50 %	350525724
5047	NC_016051	AACATC	2	12	260546	260557	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	350525724
5048	NC_016051	GCC	2	6	260576	260581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525724
5049	NC_016051	CGT	2	6	260589	260594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5050	NC_016051	AGGT	2	8	260639	260646	25 %	25 %	50 %	0 %	350525724
5051	NC_016051	ACTG	2	8	260672	260679	25 %	25 %	25 %	25 %	350525724
5052	NC_016051	CTC	2	6	260686	260691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525724
5053	NC_016051	GAT	2	6	260716	260721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525724
5054	NC_016051	CGG	2	6	260758	260763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525724
5055	NC_016051	TCG	2	6	260771	260776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5056	NC_016051	GAC	2	6	260791	260796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5057	NC_016051	GTC	2	6	260806	260811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5058	NC_016051	GTT	2	6	260951	260956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525724
5059	NC_016051	GAG	2	6	261019	261024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525724
5060	NC_016051	CTG	2	6	261062	261067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5061	NC_016051	GGAAT	2	10	261177	261186	40 %	20 %	40 %	0 %	350525724
5062	NC_016051	TC	3	6	261252	261257	0 %	50 %	0 %	50 %	350525724
5063	NC_016051	TCG	2	6	261281	261286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5064	NC_016051	GCC	2	6	261355	261360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525724
5065	NC_016051	TGG	2	6	261499	261504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525724
5066	NC_016051	CT	3	6	261527	261532	0 %	50 %	0 %	50 %	350525724
5067	NC_016051	TTC	2	6	261665	261670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525724
5068	NC_016051	TCGAGG	2	12	261698	261709	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	350525724
5069	NC_016051	T	6	6	261761	261766	0 %	100 %	0 %	0 %	350525724
5070	NC_016051	CGA	2	6	261798	261803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5071	NC_016051	TTTG	2	8	261840	261847	0 %	75 %	25 %	0 %	350525724
5072	NC_016051	GTA	2	6	261865	261870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525724
5073	NC_016051	ACG	2	6	261902	261907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525724
5074	NC_016051	AG	3	6	261929	261934	50 %	0 %	50 %	0 %	350525724
5075	NC_016051	CTT	2	6	261937	261942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525724
5076	NC_016051	T	6	6	261961	261966	0 %	100 %	0 %	0 %	350525724
5077	NC_016051	TCTT	2	8	261971	261978	0 %	75 %	0 %	25 %	350525724
5078	NC_016051	AACTTC	2	12	262006	262017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525724
5079	NC_016051	TACT	2	8	262037	262044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_016051	CAGG	2	8	262134	262141	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_016051	TCCG	2	8	262144	262151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_016051	GAA	2	6	262161	262166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_016051	CCG	2	6	262271	262276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_016051	GAA	2	6	262317	262322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016051	GAT	2	6	262372	262377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_016051	TCC	2	6	262426	262431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_016051	CAT	2	6	262485	262490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_016051	GAT	2	6	262528	262533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016051	ATT	2	6	262615	262620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016051	CAT	2	6	262641	262646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_016051	AAT	2	6	262684	262689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_016051	TCA	2	6	262724	262729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_016051	CCG	2	6	262739	262744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_016051	TCT	2	6	262749	262754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_016051	ACC	2	6	262804	262809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_016051	ATT	2	6	262927	262932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016051	GAA	2	6	262941	262946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_016051	TAT	2	6	262993	262998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016051	CAT	2	6	263022	263027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_016051	CAA	3	9	263124	263132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_016051	ACAGCC	2	12	263153	263164	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_016051	GCCCG	2	10	263173	263182	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5103	NC_016051	ACC	2	6	263209	263214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525725
5104	NC_016051	ATG	2	6	263293	263298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525725
5105	NC_016051	GA	3	6	263554	263559	50 %	0 %	50 %	0 %	350525725
5106	NC_016051	AGCTC	2	10	263630	263639	20 %	20 %	20 %	40 %	350525725
5107	NC_016051	TC	3	6	263676	263681	0 %	50 %	0 %	50 %	350525725
5108	NC_016051	AAGGA	2	10	263685	263694	60 %	0 %	40 %	0 %	350525725
5109	NC_016051	CT	3	6	263771	263776	0 %	50 %	0 %	50 %	350525725
5110	NC_016051	TCC	2	6	263782	263787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525725
5111	NC_016051	C	6	6	263858	263863	0 %	0 %	0 %	100 %	350525725
5112	NC_016051	AGCA	2	8	263871	263878	50 %	0 %	25 %	25 %	350525725
5113	NC_016051	CTG	2	6	263938	263943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525725
5114	NC_016051	TCC	2	6	263965	263970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525725
5115	NC_016051	CCT	2	6	263982	263987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525726
5116	NC_016051	GGC	2	6	264056	264061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525726
5117	NC_016051	GTC	2	6	264103	264108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525726
5118	NC_016051	TACG	2	8	264175	264182	25 %	25 %	25 %	25 %	350525726
5119	NC_016051	TCCC	2	8	264186	264193	0 %	25 %	0 %	75 %	350525726
5120	NC_016051	GCG	2	6	264227	264232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525726
5121	NC_016051	AG	3	6	264238	264243	50 %	0 %	50 %	0 %	350525726
5122	NC_016051	TCC	2	6	264300	264305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525726
5123	NC_016051	GTT	2	6	264367	264372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525726
5124	NC_016051	CAC	3	9	264373	264381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350525726
5125	NC_016051	CTC	2	6	264388	264393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525726
5126	NC_016051	CCT	2	6	264397	264402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525726
5127	NC_016051	CTCC	2	8	264499	264506	0 %	25 %	0 %	75 %	350525726
5128	NC_016051	TCG	2	6	264507	264512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525726
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5130	NC_016051	ACA	2	6	264533	264538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_016051	ACC	2	6	264678	264683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_016051	CTC	2	6	264754	264759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223479013
5133	NC_016051	CTC	2	6	264939	264944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223479013
5134	NC_016051	ACC	2	6	264967	264972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223479013
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5162	NC_016051	GCTTTG	2	12	266509	266520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	350525727
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5212	NC_016051	ATTAC	2	10	269181	269190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5221	NC_016051	CCA	2	6	269628	269633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5230	NC_016051	TAA	2	6	269887	269892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_016051	ATC	2	6	269930	269935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5238	NC_016051	CGG	2	6	270333	270338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5239	NC_016051	AGAA	2	8	270366	270373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_016051	TTCC	2	8	270526	270533	0 %	50 %	0 %	50 %	223478723
5241	NC_016051	GGA	3	9	270609	270617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478723
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5246	NC_016051	GCTC	2	8	270804	270811	0 %	25 %	25 %	50 %	223478723
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5372	NC_016051	CGCC	2	8	277432	277439	0 %	0 %	25 %	75 %	223478852
5373	NC_016051	GGTC	2	8	277450	277457	0 %	25 %	50 %	25 %	223478852
5374	NC_016051	TGTT	2	8	277632	277639	0 %	75 %	25 %	0 %	223478852
5375	NC_016051	TCT	2	6	277654	277659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478852
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5377	NC_016051	TCC	2	6	277785	277790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478852
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5379	NC_016051	A	6	6	277874	277879	100 %	0 %	0 %	0 %	223478852
5380	NC_016051	GAA	2	6	277886	277891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478852
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5464	NC_016051	CAA	2	6	281376	281381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5491	NC_016051	TCT	2	6	282185	282190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525730
5492	NC_016051	TCA	2	6	282244	282249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525730
5493	NC_016051	CGT	2	6	282329	282334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5494	NC_016051	CGA	2	6	282341	282346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5495	NC_016051	CGA	2	6	282437	282442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525730
5496	NC_016051	GCC	2	6	282483	282488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525730
5497	NC_016051	CTCACC	2	12	282601	282612	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	350525730
5498	NC_016051	GAGC	2	8	282627	282634	25 %	0 %	50 %	25 %	350525730
5499	NC_016051	GAAGTC	2	12	282660	282671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	350525730
5500	NC_016051	ACTCT	2	10	282737	282746	20 %	40 %	0 %	40 %	350525730

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