MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 41295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016051	GAG	2	6	233835	233840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4502	NC_016051	CTG	2	6	233874	233879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478646
4503	NC_016051	GATACA	2	12	233929	233940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	223478646
4504	NC_016051	GGTAA	2	10	234024	234033	40 %	20 %	40 %	0 %	223478646
4505	NC_016051	GAG	2	6	234117	234122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4506	NC_016051	GAA	2	6	234195	234200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478646
4507	NC_016051	GGAA	2	8	234285	234292	50 %	0 %	50 %	0 %	223478646
4508	NC_016051	GGC	2	6	234445	234450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478646
4509	NC_016051	GGT	2	6	234521	234526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478646
4510	NC_016051	CGA	2	6	234532	234537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478646
4511	NC_016051	GA	3	6	234609	234614	50 %	0 %	50 %	0 %	223478646
4512	NC_016051	TCG	2	6	234631	234636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478646
4513	NC_016051	CTG	2	6	234639	234644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478646
4514	NC_016051	GGA	2	6	234734	234739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4515	NC_016051	GCG	2	6	234838	234843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478646
4516	NC_016051	GCG	2	6	234877	234882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478646
4517	NC_016051	ATG	2	6	234993	234998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478646
4518	NC_016051	CGA	2	6	235064	235069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478646
4519	NC_016051	GCC	2	6	235083	235088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478646
4520	NC_016051	AG	3	6	235142	235147	50 %	0 %	50 %	0 %	223478646
4521	NC_016051	GAG	2	6	235158	235163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4522	NC_016051	GGT	2	6	235169	235174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478646
4523	NC_016051	TTC	2	6	235210	235215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478646
4524	NC_016051	GGA	2	6	235298	235303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4525	NC_016051	AGGTCG	2	12	235321	235332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	223478646
4526	NC_016051	GAG	2	6	235347	235352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478646
4527	NC_016051	CTA	2	6	235388	235393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478646
4528	NC_016051	GCG	2	6	235417	235422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478646
4529	NC_016051	GAAGCT	2	12	235463	235474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	223478646
4530	NC_016051	AGG	2	6	235528	235533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525719
4531	NC_016051	CTT	2	6	235567	235572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525719
4532	NC_016051	TCG	2	6	235577	235582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525719
4533	NC_016051	ATC	2	6	235588	235593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525719
4534	NC_016051	CCT	2	6	235615	235620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525719
4535	NC_016051	TGG	2	6	235661	235666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525719
4536	NC_016051	CAGAT	2	10	235736	235745	40 %	20 %	20 %	20 %	350525719
4537	NC_016051	CA	3	6	235770	235775	50 %	0 %	0 %	50 %	350525719
4538	NC_016051	CCGGC	2	10	235976	235985	0 %	0 %	40 %	60 %	350525719
4539	NC_016051	CAA	2	6	236009	236014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350525719
4540	NC_016051	G	6	6	236200	236205	0 %	0 %	100 %	0 %	350525719
4541	NC_016051	GAG	2	6	236239	236244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525719
4542	NC_016051	TC	3	6	236273	236278	0 %	50 %	0 %	50 %	350525719
4543	NC_016051	GGAGG	2	10	236320	236329	20 %	0 %	80 %	0 %	350525719
4544	NC_016051	GGT	2	6	236424	236429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525719
4545	NC_016051	CT	3	6	236454	236459	0 %	50 %	0 %	50 %	223478499
4546	NC_016051	GAT	2	6	236466	236471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478499
4547	NC_016051	CTC	2	6	236523	236528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478499
4548	NC_016051	CCT	2	6	236531	236536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478499
4549	NC_016051	CCT	3	9	236691	236699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478499
4550	NC_016051	CGA	2	6	236720	236725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478499
4551	NC_016051	TCC	2	6	236743	236748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478499
4552	NC_016051	TCG	2	6	236786	236791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478499
4553	NC_016051	GAC	2	6	236805	236810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478499
4554	NC_016051	CAT	2	6	236816	236821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478499
4555	NC_016051	TCG	2	6	236828	236833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478499
4556	NC_016051	TCGC	2	8	236848	236855	0 %	25 %	25 %	50 %	223478499
4557	NC_016051	GTA	2	6	236904	236909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478499
4558	NC_016051	TCG	2	6	236959	236964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478499
4559	NC_016051	CGT	2	6	236969	236974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478499
4560	NC_016051	GCCTT	2	10	237032	237041	0 %	40 %	20 %	40 %	223478499
4561	NC_016051	CGT	2	6	237084	237089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478499
4562	NC_016051	TCT	2	6	237095	237100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478499
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4569	NC_016051	GC	3	6	237363	237368	0 %	0 %	50 %	50 %	223478499
4570	NC_016051	TCG	2	6	237614	237619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478668
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4572	NC_016051	GGC	2	6	237816	237821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478668
4573	NC_016051	CGT	2	6	237831	237836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478668
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4575	NC_016051	CAT	2	6	237894	237899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478668
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4586	NC_016051	AAG	2	6	238483	238488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478668
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4588	NC_016051	TGAG	2	8	238524	238531	25 %	25 %	50 %	0 %	223478668
4589	NC_016051	GTG	2	6	238542	238547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478563
4590	NC_016051	TTC	2	6	238647	238652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478563
4591	NC_016051	CCGAAG	2	12	238664	238675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478563
4592	NC_016051	TACG	2	8	238687	238694	25 %	25 %	25 %	25 %	223478563
4593	NC_016051	TA	3	6	238740	238745	50 %	50 %	0 %	0 %	223478563
4594	NC_016051	TA	3	6	238810	238815	50 %	50 %	0 %	0 %	223478563
4595	NC_016051	TAT	2	6	238840	238845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	223478563
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4597	NC_016051	TA	3	6	238930	238935	50 %	50 %	0 %	0 %	223478563
4598	NC_016051	AAGA	2	8	238998	239005	75 %	0 %	25 %	0 %	223478563
4599	NC_016051	CATT	2	8	239010	239017	25 %	50 %	0 %	25 %	223478563
4600	NC_016051	CAC	2	6	239081	239086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478563
4601	NC_016051	CACT	2	8	239124	239131	25 %	25 %	0 %	50 %	223478563
4602	NC_016051	GTC	2	6	239185	239190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478563
4603	NC_016051	TGCA	2	8	239252	239259	25 %	25 %	25 %	25 %	223478563
4604	NC_016051	CAC	2	6	239260	239265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478563
4605	NC_016051	GAT	2	6	239305	239310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478563
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4607	NC_016051	GTTGA	2	10	239423	239432	20 %	40 %	40 %	0 %	223478563
4608	NC_016051	AG	3	6	239457	239462	50 %	0 %	50 %	0 %	223478563
4609	NC_016051	GTT	2	6	239476	239481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478563
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4611	NC_016051	CCGGAA	2	12	239555	239566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478563
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4613	NC_016051	CGT	2	6	239607	239612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478563
4614	NC_016051	TGACT	2	10	239619	239628	20 %	40 %	20 %	20 %	223478563
4615	NC_016051	TCG	2	6	239733	239738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478563
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4617	NC_016051	CTGAAC	2	12	239869	239880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	223478563
4618	NC_016051	ATTA	2	8	239963	239970	50 %	50 %	0 %	0 %	223478563
4619	NC_016051	TTA	2	6	240010	240015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_016051	GGT	2	6	240038	240043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016051	TA	3	6	240156	240161	50 %	50 %	0 %	0 %	223478640
4622	NC_016051	CCT	2	6	240224	240229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478640
4623	NC_016051	AAG	2	6	240237	240242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478640
4624	NC_016051	GTC	2	6	240375	240380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478640
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4642	NC_016051	TA	3	6	241254	241259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4643	NC_016051	GGC	2	6	241319	241324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4645	NC_016051	AAT	2	6	241395	241400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4646	NC_016051	TTTG	2	8	241420	241427	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4647	NC_016051	TCATT	2	10	241438	241447	20 %	60 %	0 %	20 %	223479001
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4661	NC_016051	ACC	3	9	242092	242100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4861	NC_016051	GTT	2	6	251242	251247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478954
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4863	NC_016051	TGT	2	6	251365	251370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350525720
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4865	NC_016051	TGA	2	6	251425	251430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350525720
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4886	NC_016051	CTTC	2	8	252555	252562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4887	NC_016051	TCTT	2	8	252572	252579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4888	NC_016051	CTG	2	6	252586	252591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4894	NC_016051	AGG	2	6	252752	252757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4989	NC_016051	CGTC	2	8	257749	257756	0 %	25 %	25 %	50 %	223478973
4990	NC_016051	CCT	2	6	257773	257778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478973
4991	NC_016051	CCGC	2	8	257920	257927	0 %	0 %	25 %	75 %	223478973
4992	NC_016051	GAC	2	6	258005	258010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4993	NC_016051	CAG	2	6	258149	258154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4994	NC_016051	CGC	3	9	258166	258174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478973
4995	NC_016051	TTC	2	6	258183	258188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478973
4996	NC_016051	ACTTC	2	10	258252	258261	20 %	40 %	0 %	40 %	223478973
4997	NC_016051	CGT	2	6	258289	258294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478973
4998	NC_016051	GTA	2	6	258302	258307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478973
4999	NC_016051	CG	3	6	258424	258429	0 %	0 %	50 %	50 %	223478973
5000	NC_016051	TCCG	2	8	258443	258450	0 %	25 %	25 %	50 %	223478973

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