MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Taylorella asinigenitalis MCE3 chromosome

Total Repeats: 32340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016043	ATGA	2	8	26827	26834	50 %	25 %	25 %	0 %	348589374
502	NC_016043	ATA	2	6	26884	26889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016043	TAGAA	2	10	26923	26932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016043	TTC	2	6	26972	26977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589375
505	NC_016043	GCG	2	6	26986	26991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589375
506	NC_016043	TGT	2	6	26993	26998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589375
507	NC_016043	CCA	2	6	27060	27065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589375
508	NC_016043	TAA	2	6	27073	27078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589375
509	NC_016043	GAA	2	6	27150	27155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589375
510	NC_016043	CTT	2	6	27243	27248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589375
511	NC_016043	ATG	2	6	27252	27257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589375
512	NC_016043	AGT	2	6	27290	27295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589375
513	NC_016043	TTA	2	6	27437	27442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589376
514	NC_016043	TAAT	2	8	27633	27640	50 %	50 %	0 %	0 %	348589376
515	NC_016043	TTA	2	6	27740	27745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589376
516	NC_016043	CTT	2	6	27774	27779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589376
517	NC_016043	TCA	2	6	27788	27793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589376
518	NC_016043	TCT	2	6	27832	27837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589376
519	NC_016043	CGC	2	6	27879	27884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348589376
520	NC_016043	CTGA	2	8	27891	27898	25 %	25 %	25 %	25 %	348589376
521	NC_016043	CAT	2	6	27918	27923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589376
522	NC_016043	TTTG	2	8	27987	27994	0 %	75 %	25 %	0 %	348589376
523	NC_016043	T	6	6	28003	28008	0 %	100 %	0 %	0 %	348589376
524	NC_016043	ATTG	2	8	28086	28093	25 %	50 %	25 %	0 %	348589376
525	NC_016043	CAG	3	9	28266	28274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589376
526	NC_016043	ACAAT	2	10	28313	28322	60 %	20 %	0 %	20 %	348589376
527	NC_016043	AT	4	8	28369	28376	50 %	50 %	0 %	0 %	348589376
528	NC_016043	TCT	3	9	28419	28427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589376
529	NC_016043	CTA	2	6	28452	28457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589376
530	NC_016043	AGT	2	6	28489	28494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589376
531	NC_016043	ACG	2	6	28632	28637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589376
532	NC_016043	GAA	2	6	28659	28664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589376
533	NC_016043	ATA	2	6	28736	28741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589376
534	NC_016043	CAT	2	6	28746	28751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589376
535	NC_016043	AACC	2	8	28818	28825	50 %	0 %	0 %	50 %	348589376
536	NC_016043	A	6	6	28861	28866	100 %	0 %	0 %	0 %	348589376
537	NC_016043	CATT	2	8	28884	28891	25 %	50 %	0 %	25 %	348589376
538	NC_016043	GATT	2	8	28904	28911	25 %	50 %	25 %	0 %	348589376
539	NC_016043	AGG	2	6	28942	28947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589376
540	NC_016043	TA	3	6	29011	29016	50 %	50 %	0 %	0 %	348589376
541	NC_016043	T	7	7	29017	29023	0 %	100 %	0 %	0 %	348589376
542	NC_016043	ATT	2	6	29047	29052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589377
543	NC_016043	T	9	9	29051	29059	0 %	100 %	0 %	0 %	348589377
544	NC_016043	ATT	2	6	29062	29067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589377
545	NC_016043	ATT	2	6	29122	29127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589377
546	NC_016043	GCA	2	6	29189	29194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589377
547	NC_016043	AGC	2	6	29206	29211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589377
548	NC_016043	TTG	2	6	29251	29256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589377
549	NC_016043	GTT	2	6	29324	29329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589377
550	NC_016043	GGCTTG	2	12	29350	29361	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	348589377
551	NC_016043	CAT	2	6	29374	29379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589377
552	NC_016043	ATG	2	6	29386	29391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589377
553	NC_016043	TGT	2	6	29426	29431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589377
554	NC_016043	GTTG	2	8	29489	29496	0 %	50 %	50 %	0 %	348589377
555	NC_016043	GCCTGA	3	18	29516	29533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	348589377
556	NC_016043	GCA	2	6	29534	29539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589377
557	NC_016043	AGC	2	6	29557	29562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348589377
558	NC_016043	CAT	2	6	29571	29576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589377
559	NC_016043	TCT	2	6	29612	29617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589377
560	NC_016043	GAT	2	6	29700	29705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589377
561	NC_016043	ATT	2	6	29713	29718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589377
562	NC_016043	ATT	2	6	29732	29737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589377
563	NC_016043	AAG	2	6	29740	29745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589377
564	NC_016043	TTG	2	6	29797	29802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589377
565	NC_016043	CT	3	6	29836	29841	0 %	50 %	0 %	50 %	348589377
566	NC_016043	AATTA	2	10	29896	29905	60 %	40 %	0 %	0 %	348589377
567	NC_016043	AAT	2	6	29926	29931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589377
568	NC_016043	AG	4	8	29972	29979	50 %	0 %	50 %	0 %	348589377
569	NC_016043	AAT	2	6	29983	29988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589377
570	NC_016043	AT	3	6	30020	30025	50 %	50 %	0 %	0 %	348589377
571	NC_016043	AATA	2	8	30148	30155	75 %	25 %	0 %	0 %	348589377
572	NC_016043	TTC	2	6	30174	30179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589377
573	NC_016043	TAA	2	6	30207	30212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589377
574	NC_016043	TGTT	2	8	30224	30231	0 %	75 %	25 %	0 %	348589377
575	NC_016043	AT	3	6	30289	30294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016043	AAT	2	6	30304	30309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016043	TAA	2	6	30342	30347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589378
578	NC_016043	A	7	7	30491	30497	100 %	0 %	0 %	0 %	348589378
579	NC_016043	ATT	2	6	30516	30521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589378
580	NC_016043	TAA	2	6	30579	30584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589378
581	NC_016043	GAA	2	6	30693	30698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589378
582	NC_016043	TA	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	348589378
583	NC_016043	T	6	6	30771	30776	0 %	100 %	0 %	0 %	348589378
584	NC_016043	TA	3	6	30782	30787	50 %	50 %	0 %	0 %	348589378
585	NC_016043	AGA	2	6	30791	30796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589378
586	NC_016043	TGATAA	2	12	30798	30809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	348589378
587	NC_016043	GCAA	2	8	30860	30867	50 %	0 %	25 %	25 %	348589378
588	NC_016043	GATT	2	8	30893	30900	25 %	50 %	25 %	0 %	348589378
589	NC_016043	CT	3	6	30945	30950	0 %	50 %	0 %	50 %	348589378
590	NC_016043	A	7	7	30958	30964	100 %	0 %	0 %	0 %	348589378
591	NC_016043	AAT	2	6	31013	31018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016043	TAT	2	6	31019	31024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016043	T	6	6	31066	31071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016043	A	6	6	31080	31085	100 %	0 %	0 %	0 %	348589379
595	NC_016043	TCTGTA	2	12	31092	31103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	348589379
596	NC_016043	TGACGT	2	12	31114	31125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	348589379
597	NC_016043	TTG	2	6	31192	31197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589379
598	NC_016043	TGT	2	6	31202	31207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589379
599	NC_016043	TTGT	2	8	31281	31288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016043	ATA	2	6	31336	31341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016043	A	6	6	31364	31369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016043	T	7	7	31376	31382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016043	TAA	2	6	31410	31415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016043	TAA	2	6	31452	31457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589380
605	NC_016043	CTT	2	6	31786	31791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589380
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607	NC_016043	T	7	7	32008	32014	0 %	100 %	0 %	0 %	348589381
608	NC_016043	ATT	2	6	32053	32058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589381
609	NC_016043	TGAT	2	8	32134	32141	25 %	50 %	25 %	0 %	348589381
610	NC_016043	T	6	6	32195	32200	0 %	100 %	0 %	0 %	348589381
611	NC_016043	T	6	6	32230	32235	0 %	100 %	0 %	0 %	348589381
612	NC_016043	AAT	2	6	32253	32258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589381
613	NC_016043	GGC	2	6	32300	32305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589381
614	NC_016043	TCA	2	6	32310	32315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589381
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616	NC_016043	T	6	6	32366	32371	0 %	100 %	0 %	0 %	348589381
617	NC_016043	TAG	2	6	32449	32454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589381
618	NC_016043	A	6	6	32461	32466	100 %	0 %	0 %	0 %	348589381
619	NC_016043	ATTA	2	8	32483	32490	50 %	50 %	0 %	0 %	348589381
620	NC_016043	CT	3	6	32521	32526	0 %	50 %	0 %	50 %	348589382
621	NC_016043	TTC	2	6	32557	32562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589382
622	NC_016043	TGT	2	6	32630	32635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589382
623	NC_016043	TTG	2	6	32639	32644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589382
624	NC_016043	TCA	2	6	32672	32677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589382
625	NC_016043	AAC	2	6	32758	32763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589382
626	NC_016043	CTT	2	6	32835	32840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589382
627	NC_016043	A	6	6	32923	32928	100 %	0 %	0 %	0 %	348589382
628	NC_016043	TCT	2	6	33043	33048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589382
629	NC_016043	ATT	2	6	33070	33075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589382
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631	NC_016043	CTCTAT	2	12	33159	33170	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	348589382
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