MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Taylorella asinigenitalis MCE3 chromosome

Total Repeats: 32340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016043	CTT	2	6	276169	276174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589622
5502	NC_016043	AGT	2	6	276189	276194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5503	NC_016043	TTGGT	2	10	276234	276243	0 %	60 %	40 %	0 %	348589622
5504	NC_016043	CA	3	6	276295	276300	50 %	0 %	0 %	50 %	348589622
5505	NC_016043	TCA	2	6	276313	276318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589622
5506	NC_016043	CCA	2	6	276469	276474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589622
5507	NC_016043	TGT	2	6	276555	276560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589622
5508	NC_016043	TCA	2	6	276681	276686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589622
5509	NC_016043	A	6	6	276771	276776	100 %	0 %	0 %	0 %	348589622
5510	NC_016043	ATTA	2	8	276813	276820	50 %	50 %	0 %	0 %	348589622
5511	NC_016043	ATTC	2	8	276827	276834	25 %	50 %	0 %	25 %	348589622
5512	NC_016043	CCA	2	6	276845	276850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589622
5513	NC_016043	TAA	2	6	276855	276860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5514	NC_016043	AGA	2	6	276937	276942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589622
5515	NC_016043	AAT	2	6	276943	276948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5516	NC_016043	T	7	7	276954	276960	0 %	100 %	0 %	0 %	348589622
5517	NC_016043	GTATGA	2	12	276978	276989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5518	NC_016043	GGC	2	6	277000	277005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589622
5519	NC_016043	TCT	2	6	277176	277181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589622
5520	NC_016043	GAT	2	6	277201	277206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5521	NC_016043	TTG	2	6	277217	277222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589622
5522	NC_016043	TGG	2	6	277245	277250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589622
5523	NC_016043	TACA	2	8	277314	277321	50 %	25 %	0 %	25 %	348589622
5524	NC_016043	GGAT	2	8	277365	277372	25 %	25 %	50 %	0 %	348589622
5525	NC_016043	AGA	3	9	277404	277412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589622
5526	NC_016043	AAT	2	6	277414	277419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5527	NC_016043	AT	3	6	277488	277493	50 %	50 %	0 %	0 %	348589622
5528	NC_016043	AT	3	6	277500	277505	50 %	50 %	0 %	0 %	348589622
5529	NC_016043	TAA	2	6	277512	277517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5530	NC_016043	AATC	2	8	277527	277534	50 %	25 %	0 %	25 %	348589622
5531	NC_016043	TAA	2	6	277560	277565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5532	NC_016043	GA	3	6	277583	277588	50 %	0 %	50 %	0 %	348589622
5533	NC_016043	AAAT	2	8	277770	277777	75 %	25 %	0 %	0 %	348589622
5534	NC_016043	ACA	2	6	277793	277798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589622
5535	NC_016043	ATA	2	6	277838	277843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5536	NC_016043	TAA	2	6	277992	277997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5537	NC_016043	ATG	2	6	278110	278115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5538	NC_016043	TGG	2	6	278244	278249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589622
5539	NC_016043	TGG	2	6	278309	278314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589622
5540	NC_016043	TCT	2	6	278335	278340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589622
5541	NC_016043	AAT	2	6	278458	278463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5542	NC_016043	CAA	2	6	278483	278488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589622
5543	NC_016043	AG	3	6	278532	278537	50 %	0 %	50 %	0 %	348589622
5544	NC_016043	CGG	2	6	278607	278612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348589622
5545	NC_016043	AT	3	6	278752	278757	50 %	50 %	0 %	0 %	348589622
5546	NC_016043	CTA	2	6	278783	278788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589622
5547	NC_016043	ACA	2	6	278792	278797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589622
5548	NC_016043	GTT	2	6	278851	278856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589622
5549	NC_016043	ATG	2	6	278915	278920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5550	NC_016043	ATTT	2	8	278992	278999	25 %	75 %	0 %	0 %	348589622
5551	NC_016043	CTAT	2	8	279095	279102	25 %	50 %	0 %	25 %	348589622
5552	NC_016043	ATGG	2	8	279142	279149	25 %	25 %	50 %	0 %	348589622
5553	NC_016043	TAG	2	6	279159	279164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5554	NC_016043	TGA	2	6	279174	279179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5555	NC_016043	AGG	2	6	279222	279227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348589622
5556	NC_016043	TAG	2	6	279266	279271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5557	NC_016043	TTG	2	6	279281	279286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589622
5558	NC_016043	TGA	2	6	279321	279326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5559	NC_016043	ATGGCT	2	12	279391	279402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	348589622
5560	NC_016043	TAA	2	6	279420	279425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5561	NC_016043	TATT	2	8	279465	279472	25 %	75 %	0 %	0 %	348589622
5562	NC_016043	ATT	2	6	279508	279513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589622
5563	NC_016043	TGG	2	6	279528	279533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589622
5564	NC_016043	GGT	2	6	279586	279591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589622
5565	NC_016043	TAA	2	6	279720	279725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5566	NC_016043	TCTA	2	8	279767	279774	25 %	50 %	0 %	25 %	348589622
5567	NC_016043	CTG	2	6	279791	279796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589622
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5569	NC_016043	TTC	2	6	279886	279891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348589622
5570	NC_016043	TGC	2	6	279900	279905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589622
5571	NC_016043	AAT	3	9	279934	279942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5572	NC_016043	A	6	6	280126	280131	100 %	0 %	0 %	0 %	348589622
5573	NC_016043	GAAG	2	8	280207	280214	50 %	0 %	50 %	0 %	348589622
5574	NC_016043	CAT	2	6	280293	280298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589622
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5580	NC_016043	GCT	2	6	280723	280728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589622
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5582	NC_016043	TGC	2	6	280851	280856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589622
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5584	NC_016043	CAA	2	6	281004	281009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589622
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5587	NC_016043	CAAA	2	8	281181	281188	75 %	0 %	0 %	25 %	348589622
5588	NC_016043	ATT	2	6	281258	281263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348589622
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5590	NC_016043	TA	3	6	281348	281353	50 %	50 %	0 %	0 %	348589622
5591	NC_016043	TAG	2	6	281375	281380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5592	NC_016043	TAC	2	6	281394	281399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589622
5593	NC_016043	T	6	6	281449	281454	0 %	100 %	0 %	0 %	348589622
5594	NC_016043	TGC	2	6	281700	281705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348589622
5595	NC_016043	GGCTCA	2	12	282019	282030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	348589622
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5599	NC_016043	TCAA	2	8	282428	282435	50 %	25 %	0 %	25 %	348589622
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5601	NC_016043	AAAC	2	8	282582	282589	75 %	0 %	0 %	25 %	348589622
5602	NC_016043	AGAT	2	8	282615	282622	50 %	25 %	25 %	0 %	348589622
5603	NC_016043	AAC	2	6	282653	282658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589622
5604	NC_016043	CAA	2	6	282663	282668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589622
5605	NC_016043	TTTA	2	8	282699	282706	25 %	75 %	0 %	0 %	348589622
5606	NC_016043	TGA	2	6	282717	282722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
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5608	NC_016043	TCGA	2	8	282782	282789	25 %	25 %	25 %	25 %	348589622
5609	NC_016043	TGA	2	6	282876	282881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348589622
5610	NC_016043	TTTA	2	8	282888	282895	25 %	75 %	0 %	0 %	348589622
5611	NC_016043	ATA	2	6	282992	282997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
5612	NC_016043	AGA	2	6	283026	283031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348589622
5613	NC_016043	GCAT	2	8	283052	283059	25 %	25 %	25 %	25 %	348589622
5614	NC_016043	TGT	2	6	283149	283154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589622
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5616	NC_016043	TTG	2	6	283249	283254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348589622
5617	NC_016043	GTG	2	6	283313	283318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348589622
5618	NC_016043	TAC	2	6	283348	283353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589622
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5622	NC_016043	ATA	2	6	283523	283528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348589622
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5731	NC_016043	A	6	6	288860	288865	100 %	0 %	0 %	0 %	348589628
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5742	NC_016043	AC	3	6	289169	289174	50 %	0 %	0 %	50 %	348589629
5743	NC_016043	AG	3	6	289178	289183	50 %	0 %	50 %	0 %	348589629
5744	NC_016043	A	7	7	289301	289307	100 %	0 %	0 %	0 %	348589629
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5996	NC_016043	ATC	2	6	301961	301966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348589643
5997	NC_016043	GA	3	6	302061	302066	50 %	0 %	50 %	0 %	348589643
5998	NC_016043	A	7	7	302104	302110	100 %	0 %	0 %	0 %	348589643
5999	NC_016043	CCA	2	6	302111	302116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348589643
6000	NC_016043	CAA	2	6	302133	302138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348589643

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