MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 67311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_015958	TGCA	2	8	2297270	2297277	25 %	25 %	25 %	25 %	345018537
55502	NC_015958	TTC	2	6	2297287	2297292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018537
55503	NC_015958	CTTT	2	8	2297298	2297305	0 %	75 %	0 %	25 %	345018537
55504	NC_015958	T	6	6	2297303	2297308	0 %	100 %	0 %	0 %	345018537
55505	NC_015958	A	7	7	2297366	2297372	100 %	0 %	0 %	0 %	345018537
55506	NC_015958	ATC	2	6	2297435	2297440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018537
55507	NC_015958	TC	3	6	2297447	2297452	0 %	50 %	0 %	50 %	345018537
55508	NC_015958	TCT	2	6	2297457	2297462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018537
55509	NC_015958	GAAG	2	8	2297508	2297515	50 %	0 %	50 %	0 %	345018537
55510	NC_015958	GAA	2	6	2297565	2297570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345018537
55511	NC_015958	TTC	2	6	2297645	2297650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018537
55512	NC_015958	CTC	2	6	2297720	2297725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345018537
55513	NC_015958	ATC	2	6	2297741	2297746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018537
55514	NC_015958	ATC	2	6	2297780	2297785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018537
55515	NC_015958	AT	3	6	2297789	2297794	50 %	50 %	0 %	0 %	345018537
55516	NC_015958	TTAA	2	8	2297808	2297815	50 %	50 %	0 %	0 %	345018537
55517	NC_015958	TCT	2	6	2297838	2297843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018537
55518	NC_015958	TTA	2	6	2297902	2297907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018537
55519	NC_015958	TAT	2	6	2297927	2297932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018537
55520	NC_015958	TTTA	2	8	2297939	2297946	25 %	75 %	0 %	0 %	345018537
55521	NC_015958	A	6	6	2298028	2298033	100 %	0 %	0 %	0 %	345018537
55522	NC_015958	AAT	2	6	2298107	2298112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018537
55523	NC_015958	TTTAT	2	10	2298114	2298123	20 %	80 %	0 %	0 %	345018537
55524	NC_015958	AGT	2	6	2298140	2298145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018537
55525	NC_015958	AGTTAT	2	12	2298155	2298166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345018537
55526	NC_015958	A	6	6	2298250	2298255	100 %	0 %	0 %	0 %	345018537
55527	NC_015958	GTA	2	6	2298267	2298272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018537
55528	NC_015958	ATA	2	6	2298300	2298305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018537
55529	NC_015958	TCC	2	6	2298353	2298358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55530	NC_015958	ACT	2	6	2298391	2298396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55531	NC_015958	TCT	2	6	2298450	2298455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018538
55532	NC_015958	TTC	2	6	2298456	2298461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018538
55533	NC_015958	CCA	2	6	2298471	2298476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345018538
55534	NC_015958	TAT	2	6	2298478	2298483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018538
55535	NC_015958	GCA	2	6	2298486	2298491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018538
55536	NC_015958	ATT	2	6	2298495	2298500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018538
55537	NC_015958	CTG	2	6	2298502	2298507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018538
55538	NC_015958	CAT	2	6	2298518	2298523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018538
55539	NC_015958	CTT	2	6	2298534	2298539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018538
55540	NC_015958	CTT	2	6	2298582	2298587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018538
55541	NC_015958	CAC	2	6	2298622	2298627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345018538
55542	NC_015958	ATT	2	6	2298665	2298670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018538
55543	NC_015958	CTT	2	6	2298676	2298681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018538
55544	NC_015958	TTA	2	6	2298718	2298723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018538
55545	NC_015958	T	6	6	2298745	2298750	0 %	100 %	0 %	0 %	345018538
55546	NC_015958	ATTA	2	8	2298785	2298792	50 %	50 %	0 %	0 %	345018538
55547	NC_015958	T	6	6	2298803	2298808	0 %	100 %	0 %	0 %	345018538
55548	NC_015958	TAT	2	6	2298811	2298816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018538
55549	NC_015958	AGGA	2	8	2298827	2298834	50 %	0 %	50 %	0 %	345018538
55550	NC_015958	CT	3	6	2298836	2298841	0 %	50 %	0 %	50 %	345018538
55551	NC_015958	CCT	2	6	2298876	2298881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55552	NC_015958	CTA	2	6	2298911	2298916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55553	NC_015958	T	8	8	2298942	2298949	0 %	100 %	0 %	0 %	345018539
55554	NC_015958	GCTT	2	8	2298985	2298992	0 %	50 %	25 %	25 %	345018539
55555	NC_015958	GCA	2	6	2299009	2299014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018539
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55557	NC_015958	CTT	2	6	2299191	2299196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018539
55558	NC_015958	TAC	2	6	2299212	2299217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018539
55559	NC_015958	CTC	2	6	2299226	2299231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345018539
55560	NC_015958	AGC	2	6	2299260	2299265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018539
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55562	NC_015958	TTG	2	6	2299313	2299318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345018539
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55564	NC_015958	AAAT	2	8	2299339	2299346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55565	NC_015958	AAT	2	6	2299352	2299357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55566	NC_015958	ATT	2	6	2299376	2299381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018540
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55568	NC_015958	CA	3	6	2299430	2299435	50 %	0 %	0 %	50 %	345018540
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55570	NC_015958	T	7	7	2299505	2299511	0 %	100 %	0 %	0 %	345018540
55571	NC_015958	TTC	2	6	2299521	2299526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018540
55572	NC_015958	ATT	2	6	2299567	2299572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018540
55573	NC_015958	ACC	2	6	2299597	2299602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345018540
55574	NC_015958	TCC	2	6	2299638	2299643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55575	NC_015958	AC	3	6	2299664	2299669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55576	NC_015958	TAA	2	6	2299671	2299676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55577	NC_015958	TTGC	2	8	2299731	2299738	0 %	50 %	25 %	25 %	345018541
55578	NC_015958	TCT	2	6	2299752	2299757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018541
55579	NC_015958	T	7	7	2299793	2299799	0 %	100 %	0 %	0 %	345018541
55580	NC_015958	ACA	2	6	2299800	2299805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345018541
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55582	NC_015958	TAT	2	6	2299856	2299861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018541
55583	NC_015958	GTC	2	6	2299929	2299934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018541
55584	NC_015958	AGC	2	6	2299946	2299951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018541
55585	NC_015958	AAGA	2	8	2299956	2299963	75 %	0 %	25 %	0 %	345018541
55586	NC_015958	GCC	2	6	2299977	2299982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345018541
55587	NC_015958	CTT	2	6	2300004	2300009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018541
55588	NC_015958	T	6	6	2300042	2300047	0 %	100 %	0 %	0 %	345018541
55589	NC_015958	TCT	2	6	2300112	2300117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018541
55590	NC_015958	ACTTTT	2	12	2300118	2300129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	345018541
55591	NC_015958	TCA	2	6	2300131	2300136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018541
55592	NC_015958	TTA	3	9	2300143	2300151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018541
55593	NC_015958	ATTT	2	8	2300168	2300175	25 %	75 %	0 %	0 %	345018541
55594	NC_015958	AAGT	2	8	2300217	2300224	50 %	25 %	25 %	0 %	345018541
55595	NC_015958	CAT	2	6	2300314	2300319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018541
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55597	NC_015958	CTTCT	3	15	2300392	2300406	0 %	60 %	0 %	40 %	345018541
55598	NC_015958	ACA	2	6	2300424	2300429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345018541
55599	NC_015958	GCA	2	6	2300586	2300591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018541
55600	NC_015958	T	6	6	2300731	2300736	0 %	100 %	0 %	0 %	345018541
55601	NC_015958	TCT	2	6	2300765	2300770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018541
55602	NC_015958	TAT	2	6	2300822	2300827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018541
55603	NC_015958	ATT	2	6	2300847	2300852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018541
55604	NC_015958	TCT	2	6	2300871	2300876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018541
55605	NC_015958	ATC	2	6	2300903	2300908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018541
55606	NC_015958	TCT	2	6	2300945	2300950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018541
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55608	NC_015958	CT	3	6	2301047	2301052	0 %	50 %	0 %	50 %	345018541
55609	NC_015958	AAT	2	6	2301077	2301082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018541
55610	NC_015958	CAT	2	6	2301167	2301172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018541
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55612	NC_015958	TCTT	2	8	2301263	2301270	0 %	75 %	0 %	25 %	345018541
55613	NC_015958	TTAC	2	8	2301309	2301316	25 %	50 %	0 %	25 %	345018541
55614	NC_015958	CTT	2	6	2301328	2301333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018541
55615	NC_015958	GCT	2	6	2301390	2301395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018541
55616	NC_015958	CTG	2	6	2301442	2301447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018541
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55618	NC_015958	CTA	2	6	2301508	2301513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018541
55619	NC_015958	TCTA	2	8	2301554	2301561	25 %	50 %	0 %	25 %	345018541
55620	NC_015958	TGT	2	6	2301611	2301616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345018541
55621	NC_015958	ATT	2	6	2301621	2301626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018541
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55646	NC_015958	GCA	2	6	2302986	2302991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345018541
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55648	NC_015958	A	6	6	2303140	2303145	100 %	0 %	0 %	0 %	345018541
55649	NC_015958	TCACC	2	10	2303197	2303206	20 %	20 %	0 %	60 %	345018541
55650	NC_015958	T	6	6	2303224	2303229	0 %	100 %	0 %	0 %	345018541
55651	NC_015958	A	6	6	2303302	2303307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55652	NC_015958	ATC	2	6	2303346	2303351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018542
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55696	NC_015958	AT	3	6	2305293	2305298	50 %	50 %	0 %	0 %	345018542
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55700	NC_015958	TCC	2	6	2305505	2305510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345018542
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55703	NC_015958	CT	3	6	2305604	2305609	0 %	50 %	0 %	50 %	345018542
55704	NC_015958	GCT	2	6	2305614	2305619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345018542
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55707	NC_015958	TTCT	2	8	2305681	2305688	0 %	75 %	0 %	25 %	345018542
55708	NC_015958	ACT	2	6	2305692	2305697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018542
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55717	NC_015958	TAT	2	6	2306023	2306028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345018542
55718	NC_015958	TAC	2	6	2306042	2306047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018542
55719	NC_015958	CTA	2	6	2306056	2306061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018542
55720	NC_015958	CTA	2	6	2306068	2306073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018542
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55722	NC_015958	CTTTT	2	10	2306105	2306114	0 %	80 %	0 %	20 %	345018542
55723	NC_015958	TC	3	6	2306122	2306127	0 %	50 %	0 %	50 %	345018542
55724	NC_015958	CTT	2	6	2306128	2306133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018542
55725	NC_015958	CTA	2	6	2306134	2306139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345018542
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55727	NC_015958	T	6	6	2306213	2306218	0 %	100 %	0 %	0 %	345018542
55728	NC_015958	A	6	6	2306267	2306272	100 %	0 %	0 %	0 %	345018542
55729	NC_015958	GGC	2	6	2306310	2306315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345018542
55730	NC_015958	CTT	2	6	2306356	2306361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018542
55731	NC_015958	GTA	2	6	2306370	2306375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345018542
55732	NC_015958	TAA	2	6	2306459	2306464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345018542
55733	NC_015958	TCT	2	6	2306523	2306528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018542
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55999	NC_015958	TCT	2	6	2316623	2316628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345018556
56000	NC_015958	CCT	2	6	2316654	2316659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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