MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015865	ATA	2	6	1966485	1966490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41002	NC_015865	A	6	6	1966521	1966526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41003	NC_015865	GAA	2	6	1966663	1966668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41004	NC_015865	T	6	6	1966674	1966679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41005	NC_015865	TTA	2	6	1966720	1966725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41006	NC_015865	GGT	2	6	1966751	1966756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41007	NC_015865	GAC	2	6	1966771	1966776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583181
41008	NC_015865	TTG	2	6	1966785	1966790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583181
41009	NC_015865	TAC	2	6	1966803	1966808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583181
41010	NC_015865	GAC	2	6	1966832	1966837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583181
41011	NC_015865	GAA	2	6	1966859	1966864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583181
41012	NC_015865	ACA	2	6	1966868	1966873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583181
41013	NC_015865	GGATGG	2	12	1966903	1966914	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	341583181
41014	NC_015865	ACAG	2	8	1966970	1966977	50 %	0 %	25 %	25 %	341583181
41015	NC_015865	GAA	2	6	1966997	1967002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583181
41016	NC_015865	CA	3	6	1967015	1967020	50 %	0 %	0 %	50 %	341583181
41017	NC_015865	AGGAC	2	10	1967029	1967038	40 %	0 %	40 %	20 %	341583181
41018	NC_015865	GAA	2	6	1967066	1967071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583181
41019	NC_015865	CT	3	6	1967120	1967125	0 %	50 %	0 %	50 %	341583181
41020	NC_015865	TGA	2	6	1967131	1967136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41021	NC_015865	ACG	2	6	1967141	1967146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583181
41022	NC_015865	CTA	2	6	1967160	1967165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583181
41023	NC_015865	AGATGG	2	12	1967176	1967187	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341583181
41024	NC_015865	TTTAC	2	10	1967214	1967223	20 %	60 %	0 %	20 %	341583181
41025	NC_015865	GACGGT	2	12	1967246	1967257	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341583181
41026	NC_015865	GAA	2	6	1967270	1967275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583181
41027	NC_015865	A	6	6	1967350	1967355	100 %	0 %	0 %	0 %	341583181
41028	NC_015865	ATG	2	6	1967385	1967390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41029	NC_015865	CT	3	6	1967462	1967467	0 %	50 %	0 %	50 %	341583181
41030	NC_015865	ACA	2	6	1967490	1967495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583181
41031	NC_015865	TC	3	6	1967504	1967509	0 %	50 %	0 %	50 %	341583181
41032	NC_015865	GAA	2	6	1967609	1967614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583181
41033	NC_015865	TGA	2	6	1967653	1967658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41034	NC_015865	ACT	2	6	1967730	1967735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583181
41035	NC_015865	ATG	2	6	1967796	1967801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41036	NC_015865	AG	3	6	1967837	1967842	50 %	0 %	50 %	0 %	341583181
41037	NC_015865	ATG	2	6	1967877	1967882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41038	NC_015865	TAA	2	6	1967920	1967925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583181
41039	NC_015865	ACTT	2	8	1967989	1967996	25 %	50 %	0 %	25 %	341583181
41040	NC_015865	TAC	2	6	1968056	1968061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583181
41041	NC_015865	CAG	2	6	1968099	1968104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583181
41042	NC_015865	TGT	2	6	1968108	1968113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583181
41043	NC_015865	TATT	2	8	1968137	1968144	25 %	75 %	0 %	0 %	341583181
41044	NC_015865	TAT	2	6	1968254	1968259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583181
41045	NC_015865	TTG	2	6	1968270	1968275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583181
41046	NC_015865	GAT	2	6	1968289	1968294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41047	NC_015865	GGAT	2	8	1968367	1968374	25 %	25 %	50 %	0 %	341583181
41048	NC_015865	CATA	2	8	1968393	1968400	50 %	25 %	0 %	25 %	341583181
41049	NC_015865	AAG	2	6	1968474	1968479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583181
41050	NC_015865	ATG	2	6	1968594	1968599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41051	NC_015865	AGT	2	6	1968640	1968645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583181
41052	NC_015865	CAA	2	6	1968698	1968703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583181
41053	NC_015865	TTG	2	6	1968723	1968728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583181
41054	NC_015865	ATT	2	6	1968729	1968734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583181
41055	NC_015865	ACAATA	2	12	1968749	1968760	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341583181
41056	NC_015865	ACC	2	6	1968764	1968769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583181
41057	NC_015865	CAC	2	6	1968775	1968780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583181
41058	NC_015865	T	6	6	1968877	1968882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41059	NC_015865	CTT	2	6	1968883	1968888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41060	NC_015865	CAA	2	6	1968900	1968905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41061	NC_015865	GCGG	2	8	1968983	1968990	0 %	0 %	75 %	25 %	341583182
41062	NC_015865	GGA	2	6	1969006	1969011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583182
41063	NC_015865	GGA	2	6	1969015	1969020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583182
41064	NC_015865	GAG	2	6	1969025	1969030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583182
41065	NC_015865	CCA	2	6	1969086	1969091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583182
41066	NC_015865	TGG	2	6	1969170	1969175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583182
41067	NC_015865	CGC	2	6	1969192	1969197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583182
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41069	NC_015865	CAG	2	6	1969297	1969302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583182
41070	NC_015865	CGG	2	6	1969311	1969316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583182
41071	NC_015865	TGC	2	6	1969416	1969421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583182
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41083	NC_015865	CCA	2	6	1969934	1969939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583183
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41086	NC_015865	GGAG	2	8	1970084	1970091	25 %	0 %	75 %	0 %	341583183
41087	NC_015865	CCG	2	6	1970107	1970112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583183
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41100	NC_015865	CGG	2	6	1970724	1970729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41101	NC_015865	TAA	2	6	1970864	1970869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583184
41102	NC_015865	GCT	2	6	1970910	1970915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583184
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41104	NC_015865	CGT	2	6	1970976	1970981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583184
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41110	NC_015865	GAGACG	2	12	1971271	1971282	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341583184
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41112	NC_015865	A	6	6	1971290	1971295	100 %	0 %	0 %	0 %	341583184
41113	NC_015865	GGA	2	6	1971405	1971410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583184
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41231	NC_015865	AAATG	2	10	1976454	1976463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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41235	NC_015865	CTG	2	6	1976532	1976537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583188
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41336	NC_015865	AGCA	2	8	1981049	1981056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41337	NC_015865	A	7	7	1981056	1981062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41338	NC_015865	GGA	2	6	1981064	1981069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41464	NC_015865	TA	3	6	1987227	1987232	50 %	50 %	0 %	0 %	341583195
41465	NC_015865	GTTC	2	8	1987338	1987345	0 %	50 %	25 %	25 %	341583195
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