MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_015865	ACCGTG	2	12	1941258	1941269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341583150
40502	NC_015865	GT	3	6	1941342	1941347	0 %	50 %	50 %	0 %	341583150
40503	NC_015865	TTA	2	6	1941373	1941378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583150
40504	NC_015865	G	6	6	1941388	1941393	0 %	0 %	100 %	0 %	341583150
40505	NC_015865	GTG	2	6	1941419	1941424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583150
40506	NC_015865	CTTC	2	8	1941479	1941486	0 %	50 %	0 %	50 %	341583150
40507	NC_015865	CAT	2	6	1941488	1941493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583150
40508	NC_015865	GCG	2	6	1941546	1941551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583150
40509	NC_015865	TGA	2	6	1941583	1941588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583150
40510	NC_015865	TTG	2	6	1941606	1941611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583150
40511	NC_015865	CCG	2	6	1941951	1941956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583151
40512	NC_015865	GC	3	6	1942003	1942008	0 %	0 %	50 %	50 %	341583151
40513	NC_015865	CCG	2	6	1942022	1942027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583151
40514	NC_015865	TTG	2	6	1942043	1942048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583151
40515	NC_015865	CCG	3	9	1942073	1942081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583151
40516	NC_015865	CTT	2	6	1942114	1942119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583151
40517	NC_015865	CTC	2	6	1942126	1942131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583151
40518	NC_015865	CCT	3	9	1942323	1942331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583151
40519	NC_015865	CGA	2	6	1942341	1942346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583151
40520	NC_015865	CGA	2	6	1942389	1942394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583151
40521	NC_015865	GTC	2	6	1942414	1942419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583151
40522	NC_015865	TGA	2	6	1942476	1942481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583151
40523	NC_015865	CTC	2	6	1942571	1942576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583151
40524	NC_015865	GCG	2	6	1942596	1942601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583151
40525	NC_015865	GGA	2	6	1942707	1942712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583151
40526	NC_015865	TTC	2	6	1942718	1942723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583151
40527	NC_015865	GCCCTT	2	12	1942783	1942794	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341583151
40528	NC_015865	TCG	2	6	1942835	1942840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583151
40529	NC_015865	AAC	2	6	1942864	1942869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583151
40530	NC_015865	T	6	6	1943131	1943136	0 %	100 %	0 %	0 %	341583152
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40532	NC_015865	GAA	2	6	1943241	1943246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583152
40533	NC_015865	CCT	2	6	1943258	1943263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583152
40534	NC_015865	TCC	2	6	1943356	1943361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583152
40535	NC_015865	CCT	2	6	1943397	1943402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583152
40536	NC_015865	TCC	2	6	1943407	1943412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583152
40537	NC_015865	TCC	2	6	1943443	1943448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583152
40538	NC_015865	CGG	2	6	1943489	1943494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583152
40539	NC_015865	CGC	2	6	1943511	1943516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583152
40540	NC_015865	AGG	2	6	1943566	1943571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583152
40541	NC_015865	TGA	2	6	1943609	1943614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583152
40542	NC_015865	CTC	2	6	1943616	1943621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583152
40543	NC_015865	GGA	2	6	1943677	1943682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40544	NC_015865	GAC	2	6	1943700	1943705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583153
40545	NC_015865	CTG	2	6	1943707	1943712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583153
40546	NC_015865	GAG	2	6	1943785	1943790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583153
40547	NC_015865	GGA	2	6	1943823	1943828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583153
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40549	NC_015865	GGA	2	6	1943914	1943919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583153
40550	NC_015865	TTGGT	2	10	1943978	1943987	0 %	60 %	40 %	0 %	341583153
40551	NC_015865	GGAA	2	8	1944017	1944024	50 %	0 %	50 %	0 %	341583153
40552	NC_015865	GAA	2	6	1944207	1944212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583153
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40571	NC_015865	GGCC	2	8	1945037	1945044	0 %	0 %	50 %	50 %	341583154
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40582	NC_015865	AGGGC	2	10	1945469	1945478	20 %	0 %	60 %	20 %	341583154
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40586	NC_015865	GA	3	6	1945739	1945744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40587	NC_015865	GCGA	2	8	1945797	1945804	25 %	0 %	50 %	25 %	341583155
40588	NC_015865	GTAA	2	8	1945815	1945822	50 %	25 %	25 %	0 %	341583155
40589	NC_015865	GGCTT	2	10	1945833	1945842	0 %	40 %	40 %	20 %	341583155
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40600	NC_015865	AG	3	6	1946261	1946266	50 %	0 %	50 %	0 %	341583155
40601	NC_015865	GAG	2	6	1946280	1946285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583155
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40607	NC_015865	CCGG	2	8	1946543	1946550	0 %	0 %	50 %	50 %	341583155
40608	NC_015865	C	6	6	1946568	1946573	0 %	0 %	0 %	100 %	341583155
40609	NC_015865	AGCC	2	8	1946584	1946591	25 %	0 %	25 %	50 %	341583155
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40999	NC_015865	GATA	2	8	1966465	1966472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41000	NC_015865	T	7	7	1966474	1966480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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