MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_015865	GGA	2	6	1917163	1917168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40002	NC_015865	CGA	2	6	1917187	1917192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583122
40003	NC_015865	AGG	2	6	1917441	1917446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40004	NC_015865	CTC	2	6	1917455	1917460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583122
40005	NC_015865	AGG	2	6	1917573	1917578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40006	NC_015865	GCC	2	6	1917603	1917608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583122
40007	NC_015865	CCA	2	6	1917616	1917621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583122
40008	NC_015865	CTC	2	6	1917656	1917661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583122
40009	NC_015865	ACCT	2	8	1917689	1917696	25 %	25 %	0 %	50 %	341583122
40010	NC_015865	AAG	2	6	1917698	1917703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583122
40011	NC_015865	GGA	2	6	1917709	1917714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40012	NC_015865	AGCA	2	8	1917731	1917738	50 %	0 %	25 %	25 %	341583122
40013	NC_015865	GGT	2	6	1917766	1917771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583122
40014	NC_015865	CCT	2	6	1917775	1917780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583122
40015	NC_015865	GAAA	2	8	1917854	1917861	75 %	0 %	25 %	0 %	341583122
40016	NC_015865	GAG	2	6	1917907	1917912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40017	NC_015865	GGA	2	6	1917919	1917924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40018	NC_015865	AGA	2	6	1917999	1918004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583122
40019	NC_015865	GAAG	2	8	1918009	1918016	50 %	0 %	50 %	0 %	341583122
40020	NC_015865	TCG	2	6	1918053	1918058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583122
40021	NC_015865	AGGA	2	8	1918074	1918081	50 %	0 %	50 %	0 %	341583122
40022	NC_015865	GTC	2	6	1918106	1918111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583122
40023	NC_015865	GGCA	2	8	1918166	1918173	25 %	0 %	50 %	25 %	341583122
40024	NC_015865	CAGG	2	8	1918174	1918181	25 %	0 %	50 %	25 %	341583122
40025	NC_015865	CTA	2	6	1918225	1918230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583122
40026	NC_015865	GCCC	2	8	1918301	1918308	0 %	0 %	25 %	75 %	341583122
40027	NC_015865	A	6	6	1918341	1918346	100 %	0 %	0 %	0 %	341583122
40028	NC_015865	GAG	2	6	1918427	1918432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40029	NC_015865	GAA	2	6	1918459	1918464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583122
40030	NC_015865	GAG	2	6	1918522	1918527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40031	NC_015865	GTGA	2	8	1918601	1918608	25 %	25 %	50 %	0 %	341583122
40032	NC_015865	ATC	2	6	1918655	1918660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583122
40033	NC_015865	ATC	2	6	1918721	1918726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583122
40034	NC_015865	CATC	2	8	1918753	1918760	25 %	25 %	0 %	50 %	341583122
40035	NC_015865	G	6	6	1918773	1918778	0 %	0 %	100 %	0 %	341583122
40036	NC_015865	GCG	2	6	1918784	1918789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583122
40037	NC_015865	G	6	6	1918803	1918808	0 %	0 %	100 %	0 %	341583122
40038	NC_015865	TCC	2	6	1918823	1918828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583122
40039	NC_015865	GAG	2	6	1918835	1918840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40040	NC_015865	AGG	2	6	1918878	1918883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40041	NC_015865	AGAA	2	8	1918886	1918893	75 %	0 %	25 %	0 %	341583122
40042	NC_015865	GAA	2	6	1918915	1918920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583122
40043	NC_015865	CCT	2	6	1918996	1919001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583122
40044	NC_015865	GAG	3	9	1919042	1919050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40045	NC_015865	AGG	2	6	1919055	1919060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40046	NC_015865	AAG	2	6	1919078	1919083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583122
40047	NC_015865	AAGG	2	8	1919095	1919102	50 %	0 %	50 %	0 %	341583122
40048	NC_015865	GGA	2	6	1919122	1919127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583122
40049	NC_015865	CAG	3	9	1919137	1919145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583123
40050	NC_015865	GAC	2	6	1919164	1919169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583123
40051	NC_015865	TGG	2	6	1919179	1919184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583123
40052	NC_015865	GTA	2	6	1919296	1919301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583123
40053	NC_015865	CTC	2	6	1919338	1919343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583123
40054	NC_015865	TTA	2	6	1919403	1919408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583123
40055	NC_015865	AGG	2	6	1919504	1919509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583123
40056	NC_015865	GCTGC	2	10	1919605	1919614	0 %	20 %	40 %	40 %	341583123
40057	NC_015865	CT	3	6	1919625	1919630	0 %	50 %	0 %	50 %	341583123
40058	NC_015865	CCG	2	6	1919631	1919636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583123
40059	NC_015865	GGT	2	6	1919659	1919664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583123
40060	NC_015865	CGT	2	6	1919742	1919747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583123
40061	NC_015865	GA	3	6	1919765	1919770	50 %	0 %	50 %	0 %	341583123
40062	NC_015865	ACC	2	6	1919804	1919809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583123
40063	NC_015865	TCA	2	6	1919829	1919834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583123
40064	NC_015865	TCA	3	9	1919904	1919912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40065	NC_015865	CTGAC	2	10	1919933	1919942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40066	NC_015865	AAG	2	6	1919950	1919955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40067	NC_015865	GTT	2	6	1920006	1920011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40068	NC_015865	GAA	2	6	1920117	1920122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40069	NC_015865	GCGGGG	2	12	1920134	1920145	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
40070	NC_015865	ACGGG	2	10	1920166	1920175	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40071	NC_015865	GCC	2	6	1920276	1920281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40072	NC_015865	C	7	7	1920391	1920397	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40073	NC_015865	TCT	2	6	1920416	1920421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40074	NC_015865	GACGGG	2	12	1920618	1920629	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	341583124
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40084	NC_015865	CGA	2	6	1921098	1921103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583124
40085	NC_015865	TGG	2	6	1921118	1921123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583124
40086	NC_015865	TCT	2	6	1921211	1921216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583124
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40090	NC_015865	CGC	2	6	1921374	1921379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583124
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40092	NC_015865	ACT	2	6	1921418	1921423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583124
40093	NC_015865	AAGG	2	8	1921487	1921494	50 %	0 %	50 %	0 %	341583124
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40099	NC_015865	GA	3	6	1921683	1921688	50 %	0 %	50 %	0 %	341583124
40100	NC_015865	GTG	2	6	1921731	1921736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583124
40101	NC_015865	TAT	2	6	1921749	1921754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40102	NC_015865	ATC	2	6	1921782	1921787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40103	NC_015865	TGCA	2	8	1921838	1921845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40104	NC_015865	CCCG	2	8	1921919	1921926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40105	NC_015865	TA	3	6	1921951	1921956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40106	NC_015865	CTT	2	6	1921960	1921965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40107	NC_015865	ATGC	2	8	1921986	1921993	25 %	25 %	25 %	25 %	341583125
40108	NC_015865	TTG	2	6	1921997	1922002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583125
40109	NC_015865	GAAG	2	8	1922026	1922033	50 %	0 %	50 %	0 %	341583125
40110	NC_015865	CTT	2	6	1922091	1922096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583125
40111	NC_015865	CCCG	2	8	1922097	1922104	0 %	0 %	25 %	75 %	341583125
40112	NC_015865	TC	3	6	1922163	1922168	0 %	50 %	0 %	50 %	341583125
40113	NC_015865	TC	3	6	1922214	1922219	0 %	50 %	0 %	50 %	341583125
40114	NC_015865	CCA	2	6	1922259	1922264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583126
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40116	NC_015865	GCC	2	6	1922345	1922350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583126
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40118	NC_015865	ATC	2	6	1922423	1922428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583126
40119	NC_015865	G	6	6	1922431	1922436	0 %	0 %	100 %	0 %	341583126
40120	NC_015865	GCG	2	6	1922445	1922450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583126
40121	NC_015865	GAA	2	6	1922668	1922673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583126
40122	NC_015865	GAA	2	6	1922701	1922706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583126
40123	NC_015865	TCC	2	6	1922731	1922736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583126
40124	NC_015865	TCG	2	6	1922757	1922762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583126
40125	NC_015865	ACG	2	6	1922792	1922797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583126
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40127	NC_015865	GGC	2	6	1922884	1922889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583126
40128	NC_015865	CGTCA	2	10	1922899	1922908	20 %	20 %	20 %	40 %	341583126
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40131	NC_015865	TCC	2	6	1923190	1923195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583127
40132	NC_015865	CTC	2	6	1923201	1923206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583127
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40134	NC_015865	GCCGA	2	10	1923325	1923334	20 %	0 %	40 %	40 %	341583127
40135	NC_015865	CCT	2	6	1923351	1923356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583127
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40139	NC_015865	GAA	2	6	1923492	1923497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583128
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40148	NC_015865	GCA	2	6	1923717	1923722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583128
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40152	NC_015865	AAG	2	6	1923842	1923847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583128
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40154	NC_015865	TCC	2	6	1923996	1924001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583129
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40165	NC_015865	TCT	2	6	1924329	1924334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583129
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40202	NC_015865	TAA	2	6	1925893	1925898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40216	NC_015865	GCT	2	6	1926259	1926264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583132
40217	NC_015865	GC	3	6	1926327	1926332	0 %	0 %	50 %	50 %	341583132
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40226	NC_015865	TCC	2	6	1926780	1926785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583132
40227	NC_015865	CAG	2	6	1926830	1926835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583132
40228	NC_015865	CCT	2	6	1926841	1926846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583132
40229	NC_015865	CGT	2	6	1926884	1926889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583132
40230	NC_015865	TAA	2	6	1926986	1926991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40231	NC_015865	T	6	6	1927061	1927066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40232	NC_015865	AGA	2	6	1927097	1927102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40233	NC_015865	CTC	2	6	1927121	1927126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583133
40234	NC_015865	GGCCTC	2	12	1927142	1927153	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	341583133
40235	NC_015865	GAT	2	6	1927253	1927258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583133
40236	NC_015865	CGG	2	6	1927342	1927347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583133
40237	NC_015865	CGG	2	6	1927363	1927368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583133
40238	NC_015865	CTC	2	6	1927404	1927409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583133
40239	NC_015865	GCCT	2	8	1927425	1927432	0 %	25 %	25 %	50 %	341583133
40240	NC_015865	TCG	2	6	1927518	1927523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583133
40241	NC_015865	TCT	2	6	1927528	1927533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583133
40242	NC_015865	CAG	2	6	1927565	1927570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583133
40243	NC_015865	TCG	2	6	1927572	1927577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583133
40244	NC_015865	CTC	2	6	1927599	1927604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583133
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40246	NC_015865	CG	3	6	1927759	1927764	0 %	0 %	50 %	50 %	341583133
40247	NC_015865	GAT	2	6	1927802	1927807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583133
40248	NC_015865	GAA	2	6	1927808	1927813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583133
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40250	NC_015865	CATT	2	8	1927961	1927968	25 %	50 %	0 %	25 %	341583133
40251	NC_015865	CTCC	2	8	1927969	1927976	0 %	25 %	0 %	75 %	341583134
40252	NC_015865	CGA	2	6	1927996	1928001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583134
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40255	NC_015865	CTC	2	6	1928156	1928161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583134
40256	NC_015865	T	6	6	1928177	1928182	0 %	100 %	0 %	0 %	341583134
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40261	NC_015865	CTGCG	2	10	1928440	1928449	0 %	20 %	40 %	40 %	341583134
40262	NC_015865	AGG	2	6	1928571	1928576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583134
40263	NC_015865	GCA	2	6	1928662	1928667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583134
40264	NC_015865	GTC	2	6	1928729	1928734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583134
40265	NC_015865	GGTC	2	8	1928737	1928744	0 %	25 %	50 %	25 %	341583134
40266	NC_015865	CCG	2	6	1928815	1928820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583134
40267	NC_015865	CGG	2	6	1928891	1928896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583134
40268	NC_015865	TCGG	2	8	1928935	1928942	0 %	25 %	50 %	25 %	341583134
40269	NC_015865	TGC	2	6	1929014	1929019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583134
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40272	NC_015865	GAT	2	6	1929128	1929133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583134
40273	NC_015865	GTGC	2	8	1929244	1929251	0 %	25 %	50 %	25 %	341583134
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40277	NC_015865	TAC	2	6	1929336	1929341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40278	NC_015865	GCC	2	6	1929492	1929497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583135
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40299	NC_015865	GA	3	6	1930818	1930823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40300	NC_015865	TCA	3	9	1930883	1930891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583138
40301	NC_015865	GAG	2	6	1931053	1931058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583138
40302	NC_015865	CCGCT	2	10	1931110	1931119	0 %	20 %	20 %	60 %	341583138
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40306	NC_015865	GAT	2	6	1931281	1931286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40307	NC_015865	CGC	2	6	1931329	1931334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40308	NC_015865	CGGG	2	8	1931337	1931344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40309	NC_015865	GCCC	2	8	1931407	1931414	0 %	0 %	25 %	75 %	341583139
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40318	NC_015865	GGT	2	6	1931950	1931955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40339	NC_015865	TATC	2	8	1933244	1933251	25 %	50 %	0 %	25 %	341583141
40340	NC_015865	CGG	2	6	1933265	1933270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583141
40341	NC_015865	GGGA	2	8	1933314	1933321	25 %	0 %	75 %	0 %	341583141
40342	NC_015865	CGA	2	6	1933370	1933375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583141
40343	NC_015865	AG	3	6	1933386	1933391	50 %	0 %	50 %	0 %	341583141
40344	NC_015865	G	6	6	1933408	1933413	0 %	0 %	100 %	0 %	341583141
40345	NC_015865	GAT	2	6	1933419	1933424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583141
40346	NC_015865	CTC	2	6	1933429	1933434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583142
40347	NC_015865	CTC	2	6	1933447	1933452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583142
40348	NC_015865	ATT	2	6	1933520	1933525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583142
40349	NC_015865	TCG	2	6	1933547	1933552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583142
40350	NC_015865	TCC	2	6	1933583	1933588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583142
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40470	NC_015865	GGC	2	6	1939768	1939773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583148
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40500	NC_015865	GAT	2	6	1941200	1941205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583150

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