MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015865	ACC	2	6	172125	172130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581252
3502	NC_015865	CCG	2	6	172138	172143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581252
3503	NC_015865	GAT	2	6	172187	172192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581252
3504	NC_015865	GGC	2	6	172221	172226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581252
3505	NC_015865	GT	3	6	172259	172264	0 %	50 %	50 %	0 %	341581252
3506	NC_015865	GCC	2	6	172292	172297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581252
3507	NC_015865	TTC	2	6	172346	172351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581252
3508	NC_015865	TCC	2	6	172355	172360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581252
3509	NC_015865	ATT	2	6	172422	172427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581252
3510	NC_015865	GT	4	8	172499	172506	0 %	50 %	50 %	0 %	341581252
3511	NC_015865	AAG	2	6	172544	172549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581252
3512	NC_015865	TAT	2	6	172758	172763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581253
3513	NC_015865	CCT	2	6	172799	172804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581253
3514	NC_015865	CGT	2	6	172848	172853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581253
3515	NC_015865	GTT	2	6	172869	172874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581253
3516	NC_015865	TCCC	2	8	172988	172995	0 %	25 %	0 %	75 %	341581253
3517	NC_015865	GTA	2	6	173037	173042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581253
3518	NC_015865	CAG	2	6	173067	173072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581253
3519	NC_015865	AAT	2	6	173079	173084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581253
3520	NC_015865	CGC	2	6	173093	173098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581253
3521	NC_015865	ACC	2	6	173099	173104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_015865	GAA	2	6	173170	173175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_015865	AGT	2	6	173214	173219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581254
3524	NC_015865	AGA	2	6	173247	173252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581254
3525	NC_015865	CTT	2	6	173266	173271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581254
3526	NC_015865	TCC	2	6	173276	173281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3527	NC_015865	TGA	2	6	173301	173306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581254
3528	NC_015865	GTC	2	6	173326	173331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581254
3529	NC_015865	CAT	2	6	173335	173340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581254
3530	NC_015865	AGG	2	6	173417	173422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581254
3531	NC_015865	TTG	2	6	173426	173431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581254
3532	NC_015865	CCT	2	6	173445	173450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3533	NC_015865	GAG	2	6	173452	173457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581254
3534	NC_015865	GCC	2	6	173462	173467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581254
3535	NC_015865	CGA	2	6	173502	173507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581254
3536	NC_015865	TGG	2	6	173513	173518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581254
3537	NC_015865	CTC	2	6	173560	173565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3538	NC_015865	CCG	2	6	173640	173645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581254
3539	NC_015865	TGG	2	6	173669	173674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581254
3540	NC_015865	GGT	3	9	173676	173684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581254
3541	NC_015865	CCCT	2	8	173819	173826	0 %	25 %	0 %	75 %	341581254
3542	NC_015865	CGT	2	6	173877	173882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581254
3543	NC_015865	CCT	2	6	173901	173906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3544	NC_015865	CGGGAA	2	12	173938	173949	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341581254
3545	NC_015865	ACC	2	6	173956	173961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581254
3546	NC_015865	GAC	2	6	173965	173970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581254
3547	NC_015865	CTC	2	6	174028	174033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3548	NC_015865	CGG	2	6	174075	174080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581254
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3550	NC_015865	GAA	2	6	174160	174165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581254
3551	NC_015865	TCA	2	6	174263	174268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581254
3552	NC_015865	TAG	2	6	174287	174292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581254
3553	NC_015865	CG	3	6	174343	174348	0 %	0 %	50 %	50 %	341581254
3554	NC_015865	TCC	2	6	174402	174407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581254
3555	NC_015865	CTG	2	6	174551	174556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_015865	TGA	2	6	174561	174566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_015865	G	6	6	174595	174600	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_015865	GCG	2	6	174604	174609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581255
3559	NC_015865	CGC	2	6	174616	174621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581255
3560	NC_015865	CGG	2	6	174726	174731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581255
3561	NC_015865	G	6	6	174730	174735	0 %	0 %	100 %	0 %	341581255
3562	NC_015865	ACG	2	6	174737	174742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581255
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3564	NC_015865	CTG	2	6	174796	174801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581255
3565	NC_015865	GAG	2	6	174838	174843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581255
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3569	NC_015865	ACG	2	6	175235	175240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581255
3570	NC_015865	CGC	2	6	175264	175269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581255
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3572	NC_015865	CCG	2	6	175440	175445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581255
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3579	NC_015865	CTT	2	6	175705	175710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581255
3580	NC_015865	TGCC	2	8	175723	175730	0 %	25 %	25 %	50 %	341581255
3581	NC_015865	GTA	2	6	175738	175743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581255
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3583	NC_015865	ATT	2	6	175879	175884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_015865	CGG	3	9	175889	175897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3588	NC_015865	GAG	2	6	176083	176088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581256
3589	NC_015865	GAG	2	6	176209	176214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581256
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3593	NC_015865	GGA	2	6	176367	176372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581256
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3595	NC_015865	CGT	2	6	176433	176438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581256
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3600	NC_015865	CGG	2	6	176577	176582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581256
3601	NC_015865	GAG	2	6	176605	176610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581256
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3604	NC_015865	GGC	2	6	176706	176711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581257
3605	NC_015865	GGT	2	6	176822	176827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581257
3606	NC_015865	GGC	2	6	176834	176839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581257
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3609	NC_015865	GC	3	6	177048	177053	0 %	0 %	50 %	50 %	341581257
3610	NC_015865	GC	3	6	177057	177062	0 %	0 %	50 %	50 %	341581257
3611	NC_015865	GAG	2	6	177063	177068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581257
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3613	NC_015865	GAA	2	6	177104	177109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581257
3614	NC_015865	GGTG	2	8	177154	177161	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_015865	GAT	2	6	177166	177171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581258
3616	NC_015865	GAC	2	6	177194	177199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581258
3617	NC_015865	GC	3	6	177233	177238	0 %	0 %	50 %	50 %	341581258
3618	NC_015865	CAG	2	6	177340	177345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581258
3619	NC_015865	GCC	2	6	177401	177406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581258
3620	NC_015865	GAG	2	6	177463	177468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581258
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3622	NC_015865	A	6	6	177543	177548	100 %	0 %	0 %	0 %	341581258
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3987	NC_015865	GT	3	6	195916	195921	0 %	50 %	50 %	0 %	341581276
3988	NC_015865	ATT	2	6	196089	196094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581276
3989	NC_015865	TGG	2	6	196096	196101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581276
3990	NC_015865	CGG	2	6	196174	196179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581276
3991	NC_015865	T	7	7	196207	196213	0 %	100 %	0 %	0 %	341581276
3992	NC_015865	GTG	2	6	196256	196261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581276
3993	NC_015865	AT	3	6	196301	196306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_015865	T	6	6	196352	196357	0 %	100 %	0 %	0 %	341581277
3995	NC_015865	TCC	2	6	196362	196367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581277
3996	NC_015865	TCG	2	6	196390	196395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581277
3997	NC_015865	CGG	2	6	196519	196524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581277
3998	NC_015865	CTT	2	6	196538	196543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581277
3999	NC_015865	AG	3	6	196621	196626	50 %	0 %	50 %	0 %	341581277
4000	NC_015865	CTCGAC	2	12	196688	196699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581277

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