MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_015865	TATT	2	8	1769531	1769538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37002	NC_015865	GTG	2	6	1769559	1769564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37003	NC_015865	ATC	2	6	1769585	1769590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582953
37004	NC_015865	GAA	2	6	1769698	1769703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582953
37005	NC_015865	GAC	2	6	1769872	1769877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37006	NC_015865	CGA	2	6	1769910	1769915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37007	NC_015865	TCG	2	6	1769945	1769950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37008	NC_015865	ACA	2	6	1769969	1769974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582954
37009	NC_015865	CGC	2	6	1770138	1770143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582954
37010	NC_015865	GCT	2	6	1770235	1770240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37011	NC_015865	GTT	2	6	1770244	1770249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582954
37012	NC_015865	TCG	2	6	1770302	1770307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37013	NC_015865	TAC	2	6	1770388	1770393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582954
37014	NC_015865	TCA	3	9	1770404	1770412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582954
37015	NC_015865	CTC	2	6	1770427	1770432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582954
37016	NC_015865	CGC	2	6	1770459	1770464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582954
37017	NC_015865	CGA	2	6	1770477	1770482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37018	NC_015865	ATA	2	6	1770484	1770489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582954
37019	NC_015865	CCAT	2	8	1770529	1770536	25 %	25 %	0 %	50 %	341582954
37020	NC_015865	CGG	2	6	1770579	1770584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582954
37021	NC_015865	GCC	2	6	1770586	1770591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582954
37022	NC_015865	TTCAC	2	10	1770704	1770713	20 %	40 %	0 %	40 %	341582954
37023	NC_015865	GA	3	6	1770737	1770742	50 %	0 %	50 %	0 %	341582954
37024	NC_015865	ACG	2	6	1770746	1770751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37025	NC_015865	GTC	2	6	1770832	1770837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37026	NC_015865	TCA	2	6	1770848	1770853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582954
37027	NC_015865	ACA	2	6	1770923	1770928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582954
37028	NC_015865	GAA	2	6	1771014	1771019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582954
37029	NC_015865	CGA	2	6	1771056	1771061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582954
37030	NC_015865	TTC	2	6	1771083	1771088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37031	NC_015865	GGT	2	6	1771107	1771112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37032	NC_015865	TTA	2	6	1771126	1771131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582955
37033	NC_015865	ACC	2	6	1771164	1771169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582955
37034	NC_015865	CT	3	6	1771192	1771197	0 %	50 %	0 %	50 %	341582955
37035	NC_015865	GTG	2	6	1771221	1771226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582955
37036	NC_015865	TGA	2	6	1771309	1771314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582955
37037	NC_015865	GAGATC	2	12	1771401	1771412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341582955
37038	NC_015865	GAG	2	6	1771433	1771438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582955
37039	NC_015865	CCT	2	6	1771451	1771456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582955
37040	NC_015865	GACTAC	2	12	1771470	1771481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341582955
37041	NC_015865	CCG	2	6	1771497	1771502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582955
37042	NC_015865	CTC	2	6	1771650	1771655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582955
37043	NC_015865	CAA	2	6	1771667	1771672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582955
37044	NC_015865	GAC	2	6	1771748	1771753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582955
37045	NC_015865	TTCGAG	2	12	1771806	1771817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341582955
37046	NC_015865	GGT	2	6	1771862	1771867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582955
37047	NC_015865	GAA	2	6	1771983	1771988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582956
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37049	NC_015865	AGA	2	6	1772000	1772005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582956
37050	NC_015865	GAG	2	6	1772056	1772061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582956
37051	NC_015865	GAG	2	6	1772064	1772069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582956
37052	NC_015865	CTA	3	9	1772103	1772111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582956
37053	NC_015865	GAA	2	6	1772133	1772138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582956
37054	NC_015865	GAG	2	6	1772143	1772148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582956
37055	NC_015865	GAG	2	6	1772163	1772168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582956
37056	NC_015865	TGGA	2	8	1772282	1772289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37057	NC_015865	AAT	2	6	1772309	1772314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37058	NC_015865	ATT	2	6	1772381	1772386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582957
37059	NC_015865	CGA	2	6	1772511	1772516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582957
37060	NC_015865	C	6	6	1772555	1772560	0 %	0 %	0 %	100 %	341582957
37061	NC_015865	CCA	2	6	1772583	1772588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582957
37062	NC_015865	TCC	2	6	1772618	1772623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582957
37063	NC_015865	TCG	2	6	1772666	1772671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582957
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37065	NC_015865	AGG	2	6	1772744	1772749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582957
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37070	NC_015865	TTC	2	6	1772859	1772864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582958
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37072	NC_015865	ACGAAG	2	12	1772955	1772966	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341582958
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37077	NC_015865	ACG	2	6	1773060	1773065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582958
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37082	NC_015865	TCCT	2	8	1773219	1773226	0 %	50 %	0 %	50 %	341582958
37083	NC_015865	TCTCC	2	10	1773247	1773256	0 %	40 %	0 %	60 %	341582958
37084	NC_015865	CTTC	2	8	1773292	1773299	0 %	50 %	0 %	50 %	341582958
37085	NC_015865	TCGC	2	8	1773386	1773393	0 %	25 %	25 %	50 %	341582959
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37087	NC_015865	GTCC	2	8	1773421	1773428	0 %	25 %	25 %	50 %	341582959
37088	NC_015865	GCC	2	6	1773454	1773459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582959
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37090	NC_015865	CGA	2	6	1773642	1773647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582959
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37099	NC_015865	CAC	2	6	1774208	1774213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582960
37100	NC_015865	ATC	2	6	1774218	1774223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582960
37101	NC_015865	GAA	2	6	1774235	1774240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582960
37102	NC_015865	CT	3	6	1774286	1774291	0 %	50 %	0 %	50 %	341582960
37103	NC_015865	GCG	2	6	1774334	1774339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582960
37104	NC_015865	CTT	2	6	1774442	1774447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582960
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37106	NC_015865	TCTGAA	2	12	1774850	1774861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341582961
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37108	NC_015865	CAT	2	6	1774966	1774971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582961
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37111	NC_015865	GGA	2	6	1775143	1775148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582962
37112	NC_015865	AAT	2	6	1775149	1775154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582962
37113	NC_015865	AT	3	6	1775179	1775184	50 %	50 %	0 %	0 %	341582962
37114	NC_015865	ATC	2	6	1775186	1775191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582962
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37116	NC_015865	TGCT	2	8	1775271	1775278	0 %	50 %	25 %	25 %	341582962
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37468	NC_015865	AGG	2	6	1792681	1792686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582979
37469	NC_015865	GAGC	2	8	1792722	1792729	25 %	0 %	50 %	25 %	341582979
37470	NC_015865	GGTC	2	8	1792746	1792753	0 %	25 %	50 %	25 %	341582979
37471	NC_015865	GAA	2	6	1792808	1792813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582979
37472	NC_015865	TAC	2	6	1792846	1792851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582979
37473	NC_015865	CCAGG	2	10	1792953	1792962	20 %	0 %	40 %	40 %	341582979
37474	NC_015865	GGA	2	6	1793073	1793078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582979
37475	NC_015865	CTG	2	6	1793086	1793091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582979
37476	NC_015865	TTC	2	6	1793113	1793118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582979
37477	NC_015865	CTTC	2	8	1793285	1793292	0 %	50 %	0 %	50 %	341582980
37478	NC_015865	CTC	2	6	1793361	1793366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582980
37479	NC_015865	CTT	3	9	1793370	1793378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582980
37480	NC_015865	TGA	2	6	1793444	1793449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582980
37481	NC_015865	CAT	2	6	1793469	1793474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582980
37482	NC_015865	C	6	6	1793479	1793484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37483	NC_015865	GTG	2	6	1793546	1793551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37484	NC_015865	GAA	2	6	1793553	1793558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37487	NC_015865	AGG	2	6	1793683	1793688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582981
37488	NC_015865	TCC	2	6	1793690	1793695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582981
37489	NC_015865	CCA	2	6	1793709	1793714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37490	NC_015865	ATG	2	6	1793799	1793804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582982
37491	NC_015865	ATC	2	6	1793811	1793816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582982
37492	NC_015865	G	6	6	1793896	1793901	0 %	0 %	100 %	0 %	341582982
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37496	NC_015865	TGA	2	6	1794017	1794022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582982
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37500	NC_015865	GTA	2	6	1794275	1794280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582983

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