MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_015865	AGCC	2	8	1630023	1630030	25 %	0 %	25 %	50 %	341582797
34002	NC_015865	AGC	2	6	1630092	1630097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582797
34003	NC_015865	TCCAG	2	10	1630139	1630148	20 %	20 %	20 %	40 %	341582797
34004	NC_015865	GCC	2	6	1630177	1630182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582797
34005	NC_015865	AGT	3	9	1630186	1630194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582797
34006	NC_015865	TAT	2	6	1630199	1630204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582797
34007	NC_015865	GAA	2	6	1630298	1630303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582797
34008	NC_015865	CTG	2	6	1630411	1630416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582797
34009	NC_015865	GTA	2	6	1630427	1630432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582797
34010	NC_015865	CCG	2	6	1630444	1630449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582797
34011	NC_015865	CTC	2	6	1630493	1630498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582797
34012	NC_015865	T	6	6	1630505	1630510	0 %	100 %	0 %	0 %	341582797
34013	NC_015865	CAG	2	6	1630526	1630531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582797
34014	NC_015865	AGC	3	9	1630538	1630546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582797
34015	NC_015865	AGCC	2	8	1630563	1630570	25 %	0 %	25 %	50 %	341582797
34016	NC_015865	CCA	2	6	1630585	1630590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34017	NC_015865	A	6	6	1630590	1630595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34018	NC_015865	TGA	2	6	1630660	1630665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582798
34019	NC_015865	GAC	2	6	1630679	1630684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582798
34020	NC_015865	GTC	2	6	1630773	1630778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582798
34021	NC_015865	CTC	2	6	1630934	1630939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582798
34022	NC_015865	AGTC	2	8	1630946	1630953	25 %	25 %	25 %	25 %	341582798
34023	NC_015865	CTT	2	6	1631004	1631009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582798
34024	NC_015865	CCG	2	6	1631037	1631042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582798
34025	NC_015865	CCA	2	6	1631104	1631109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582798
34026	NC_015865	GGGA	2	8	1631165	1631172	25 %	0 %	75 %	0 %	341582798
34027	NC_015865	GGT	2	6	1631197	1631202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582798
34028	NC_015865	TCGG	2	8	1631205	1631212	0 %	25 %	50 %	25 %	341582798
34029	NC_015865	GCA	2	6	1631278	1631283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582798
34030	NC_015865	CAG	2	6	1631321	1631326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582798
34031	NC_015865	CTC	2	6	1631331	1631336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582798
34032	NC_015865	CTC	2	6	1631348	1631353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582798
34033	NC_015865	CAC	3	9	1631363	1631371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582798
34034	NC_015865	CT	3	6	1631394	1631399	0 %	50 %	0 %	50 %	341582798
34035	NC_015865	AGC	2	6	1631430	1631435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582798
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34037	NC_015865	TCC	2	6	1631476	1631481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582798
34038	NC_015865	GTT	2	6	1631566	1631571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34039	NC_015865	AAGCTT	2	12	1631581	1631592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34040	NC_015865	GGT	2	6	1631619	1631624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34041	NC_015865	TTC	2	6	1631752	1631757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582799
34042	NC_015865	GAA	2	6	1631796	1631801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582799
34043	NC_015865	GAC	2	6	1631824	1631829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582799
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34045	NC_015865	TCC	2	6	1631999	1632004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582799
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34051	NC_015865	TTCGT	2	10	1632184	1632193	0 %	60 %	20 %	20 %	341582799
34052	NC_015865	AGGG	2	8	1632238	1632245	25 %	0 %	75 %	0 %	341582799
34053	NC_015865	AGGG	2	8	1632259	1632266	25 %	0 %	75 %	0 %	341582799
34054	NC_015865	GCCG	2	8	1632333	1632340	0 %	0 %	50 %	50 %	341582799
34055	NC_015865	ACC	2	6	1632347	1632352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582799
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34062	NC_015865	GGCCTG	2	12	1632589	1632600	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	341582799
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34071	NC_015865	GCCG	2	8	1633266	1633273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34072	NC_015865	ACA	2	6	1633284	1633289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34073	NC_015865	CTCC	2	8	1633302	1633309	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34074	NC_015865	GGT	2	6	1633320	1633325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34085	NC_015865	CTTTT	2	10	1633915	1633924	0 %	80 %	0 %	20 %	341582801
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34100	NC_015865	GC	3	6	1634436	1634441	0 %	0 %	50 %	50 %	341582801
34101	NC_015865	GGGA	2	8	1634444	1634451	25 %	0 %	75 %	0 %	341582801
34102	NC_015865	GAC	2	6	1634467	1634472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582801
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34104	NC_015865	ATC	2	6	1634522	1634527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582801
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34327	NC_015865	ACTCA	2	10	1645559	1645568	40 %	20 %	0 %	40 %	341582813
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34352	NC_015865	CTC	2	6	1647001	1647006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582814
34353	NC_015865	TC	3	6	1647051	1647056	0 %	50 %	0 %	50 %	341582814
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34389	NC_015865	GGCC	2	8	1648767	1648774	0 %	0 %	50 %	50 %	341582817
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34461	NC_015865	A	6	6	1652346	1652351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34462	NC_015865	AGA	2	6	1652440	1652445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582821
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34468	NC_015865	ACC	2	6	1652624	1652629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582821
34469	NC_015865	CGT	2	6	1652722	1652727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582821
34470	NC_015865	AGG	2	6	1652787	1652792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582821
34471	NC_015865	TCCA	2	8	1652810	1652817	25 %	25 %	0 %	50 %	341582821
34472	NC_015865	CGC	2	6	1652869	1652874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582821
34473	NC_015865	CGA	2	6	1652875	1652880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582821
34474	NC_015865	TAC	2	6	1652882	1652887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582821
34475	NC_015865	CAC	2	6	1652890	1652895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582821
34476	NC_015865	GGA	2	6	1652896	1652901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582821
34477	NC_015865	CG	3	6	1652907	1652912	0 %	0 %	50 %	50 %	341582821
34478	NC_015865	CGG	2	6	1652980	1652985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582821
34479	NC_015865	GCTC	2	8	1652997	1653004	0 %	25 %	25 %	50 %	341582821
34480	NC_015865	AAG	2	6	1653005	1653010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582821
34481	NC_015865	CCA	2	6	1653042	1653047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582821
34482	NC_015865	TGG	2	6	1653069	1653074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582821
34483	NC_015865	ACG	2	6	1653111	1653116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582821
34484	NC_015865	GAC	2	6	1653176	1653181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582821
34485	NC_015865	CAG	2	6	1653196	1653201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582821
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34487	NC_015865	G	6	6	1653249	1653254	0 %	0 %	100 %	0 %	341582821
34488	NC_015865	TCA	2	6	1653279	1653284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582822
34489	NC_015865	GAG	2	6	1653317	1653322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582822
34490	NC_015865	CCG	2	6	1653404	1653409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582822
34491	NC_015865	ACA	2	6	1653537	1653542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582822
34492	NC_015865	AGG	2	6	1653576	1653581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582822
34493	NC_015865	CG	4	8	1653664	1653671	0 %	0 %	50 %	50 %	341582822
34494	NC_015865	CGT	2	6	1653739	1653744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582822
34495	NC_015865	TCG	2	6	1653942	1653947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582822
34496	NC_015865	ACCGTC	2	12	1653953	1653964	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582822
34497	NC_015865	GAG	2	6	1653965	1653970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582822
34498	NC_015865	GCT	2	6	1654024	1654029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582822
34499	NC_015865	GAA	2	6	1654144	1654149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582822
34500	NC_015865	GC	3	6	1654190	1654195	0 %	0 %	50 %	50 %	341582822

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