MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_015865	GCC	2	6	1578390	1578395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582740
33002	NC_015865	CAT	2	6	1578473	1578478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582740
33003	NC_015865	CTC	2	6	1578516	1578521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582740
33004	NC_015865	CTT	2	6	1578572	1578577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582740
33005	NC_015865	TCG	2	6	1578631	1578636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582740
33006	NC_015865	GGT	3	9	1578710	1578718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582740
33007	NC_015865	CCT	2	6	1578730	1578735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582740
33008	NC_015865	GAAG	2	8	1578801	1578808	50 %	0 %	50 %	0 %	341582740
33009	NC_015865	ACTTT	2	10	1578892	1578901	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33010	NC_015865	TTTTC	2	10	1578910	1578919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33011	NC_015865	TTA	2	6	1578928	1578933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33012	NC_015865	CTTTT	2	10	1578976	1578985	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33013	NC_015865	CTC	2	6	1579060	1579065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582741
33014	NC_015865	CTTCTC	2	12	1579069	1579080	0 %	50 %	0 %	50 %	341582741
33015	NC_015865	GTG	2	6	1579146	1579151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582742
33016	NC_015865	GGA	2	6	1579295	1579300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582742
33017	NC_015865	TGG	2	6	1579423	1579428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582742
33018	NC_015865	ACT	2	6	1579435	1579440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582742
33019	NC_015865	AACG	2	8	1579472	1579479	50 %	0 %	25 %	25 %	341582742
33020	NC_015865	ACC	2	6	1579572	1579577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582742
33021	NC_015865	GAG	2	6	1579629	1579634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582742
33022	NC_015865	GTT	2	6	1579653	1579658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582742
33023	NC_015865	GAG	2	6	1579675	1579680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582742
33024	NC_015865	A	6	6	1579693	1579698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33025	NC_015865	TTG	2	6	1579709	1579714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33026	NC_015865	TTG	2	6	1579724	1579729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33027	NC_015865	TAC	2	6	1579858	1579863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33028	NC_015865	CGGGG	2	10	1579878	1579887	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
33029	NC_015865	GAA	2	6	1579935	1579940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33030	NC_015865	TCAGCC	2	12	1579943	1579954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33031	NC_015865	GGGA	2	8	1580014	1580021	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33032	NC_015865	CGT	2	6	1580031	1580036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33033	NC_015865	TGA	2	6	1580039	1580044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33034	NC_015865	GAC	2	6	1580200	1580205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33035	NC_015865	CAC	2	6	1580242	1580247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33036	NC_015865	GAC	2	6	1580257	1580262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33037	NC_015865	C	6	6	1580285	1580290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33038	NC_015865	CTC	2	6	1580319	1580324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33039	NC_015865	GGAAG	2	10	1580353	1580362	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33040	NC_015865	GAAGT	2	10	1580399	1580408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33041	NC_015865	TCC	2	6	1580422	1580427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33042	NC_015865	GGC	2	6	1580515	1580520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33043	NC_015865	G	7	7	1580629	1580635	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33044	NC_015865	ACT	2	6	1580695	1580700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33045	NC_015865	CT	3	6	1580699	1580704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33046	NC_015865	CTA	2	6	1580808	1580813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33047	NC_015865	CCA	2	6	1580931	1580936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33048	NC_015865	GAG	2	6	1580941	1580946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33049	NC_015865	GGA	2	6	1580947	1580952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33050	NC_015865	GAT	2	6	1580995	1581000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33051	NC_015865	CGA	2	6	1581060	1581065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33052	NC_015865	TCC	2	6	1581208	1581213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582743
33053	NC_015865	ATC	2	6	1581261	1581266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582743
33054	NC_015865	CGG	2	6	1581267	1581272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582743
33055	NC_015865	GCG	2	6	1581278	1581283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582743
33056	NC_015865	TGC	2	6	1581353	1581358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33057	NC_015865	AGG	2	6	1581379	1581384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33058	NC_015865	TGA	2	6	1581385	1581390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33059	NC_015865	AAG	2	6	1581404	1581409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582744
33060	NC_015865	TAC	3	9	1581470	1581478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582744
33061	NC_015865	G	6	6	1581504	1581509	0 %	0 %	100 %	0 %	341582744
33062	NC_015865	A	6	6	1581676	1581681	100 %	0 %	0 %	0 %	341582745
33063	NC_015865	CGGC	2	8	1581722	1581729	0 %	0 %	50 %	50 %	341582745
33064	NC_015865	ACT	2	6	1581794	1581799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582745
33065	NC_015865	GAC	2	6	1581921	1581926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582745
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33068	NC_015865	CGG	2	6	1582067	1582072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582745
33069	NC_015865	GAT	2	6	1582135	1582140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582745
33070	NC_015865	CGA	2	6	1582254	1582259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582745
33071	NC_015865	TGG	2	6	1582317	1582322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582745
33072	NC_015865	CT	3	6	1582403	1582408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33073	NC_015865	CTC	2	6	1582414	1582419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33074	NC_015865	CTG	2	6	1582442	1582447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33075	NC_015865	ATT	2	6	1582457	1582462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33076	NC_015865	TA	3	6	1582527	1582532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33077	NC_015865	TA	3	6	1582551	1582556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33078	NC_015865	AGG	2	6	1582580	1582585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33079	NC_015865	AAG	2	6	1582664	1582669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582746
33080	NC_015865	CGG	3	9	1582683	1582691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582746
33081	NC_015865	GA	3	6	1582712	1582717	50 %	0 %	50 %	0 %	341582746
33082	NC_015865	AGG	3	9	1582761	1582769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582746
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33085	NC_015865	CGAG	2	8	1582839	1582846	25 %	0 %	50 %	25 %	341582746
33086	NC_015865	GGA	2	6	1582852	1582857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582746
33087	NC_015865	GGA	2	6	1582861	1582866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582746
33088	NC_015865	GAA	2	6	1583005	1583010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582746
33089	NC_015865	AGG	2	6	1583016	1583021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582746
33090	NC_015865	CGGC	2	8	1583031	1583038	0 %	0 %	50 %	50 %	341582746
33091	NC_015865	GGC	2	6	1583054	1583059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582746
33092	NC_015865	TTC	2	6	1583060	1583065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582746
33093	NC_015865	GTG	2	6	1583125	1583130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33094	NC_015865	GTC	2	6	1583170	1583175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582747
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33099	NC_015865	GGA	2	6	1583580	1583585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582747
33100	NC_015865	CGT	3	9	1583634	1583642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582747
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33103	NC_015865	CTCA	2	8	1583898	1583905	25 %	25 %	0 %	50 %	341582747
33104	NC_015865	GGGAAG	2	12	1583932	1583943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582747
33105	NC_015865	ACG	2	6	1583950	1583955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582747
33106	NC_015865	GAC	2	6	1583977	1583982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582747
33107	NC_015865	CGG	2	6	1583997	1584002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582747
33108	NC_015865	CG	3	6	1584017	1584022	0 %	0 %	50 %	50 %	341582747
33109	NC_015865	CGG	2	6	1584060	1584065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582747
33110	NC_015865	GAGC	2	8	1584180	1584187	25 %	0 %	50 %	25 %	341582747
33111	NC_015865	GAA	2	6	1584246	1584251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582747
33112	NC_015865	ATA	2	6	1584268	1584273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582747
33113	NC_015865	ACG	2	6	1584341	1584346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582747
33114	NC_015865	TGG	2	6	1584349	1584354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582747
33115	NC_015865	GAG	2	6	1584415	1584420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582747
33116	NC_015865	G	6	6	1584461	1584466	0 %	0 %	100 %	0 %	341582747
33117	NC_015865	CTT	2	6	1584502	1584507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582748
33118	NC_015865	TAT	2	6	1584511	1584516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582748
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33120	NC_015865	GTG	2	6	1584608	1584613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582748
33121	NC_015865	GAA	2	6	1584754	1584759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582748
33122	NC_015865	CGA	2	6	1584807	1584812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582748
33123	NC_015865	CGA	2	6	1584864	1584869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582748
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33132	NC_015865	CTC	2	6	1585243	1585248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582749
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33134	NC_015865	CGA	2	6	1585350	1585355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582749
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33139	NC_015865	CAGG	2	8	1585615	1585622	25 %	0 %	50 %	25 %	341582749
33140	NC_015865	CGA	2	6	1585626	1585631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582749
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33143	NC_015865	GA	3	6	1585743	1585748	50 %	0 %	50 %	0 %	341582750
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33186	NC_015865	CGG	2	6	1587744	1587749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33187	NC_015865	CTCC	2	8	1587798	1587805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33188	NC_015865	TGA	2	6	1587808	1587813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33189	NC_015865	ATG	2	6	1587852	1587857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582754
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33227	NC_015865	TCC	2	6	1589767	1589772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582756
33228	NC_015865	T	6	6	1589860	1589865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33229	NC_015865	GGT	2	6	1589930	1589935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33230	NC_015865	GAG	2	6	1589966	1589971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582757
33231	NC_015865	C	6	6	1590104	1590109	0 %	0 %	0 %	100 %	341582757
33232	NC_015865	ACG	2	6	1590144	1590149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582757
33233	NC_015865	CTTC	2	8	1590153	1590160	0 %	50 %	0 %	50 %	341582757
33234	NC_015865	GGAG	2	8	1590170	1590177	25 %	0 %	75 %	0 %	341582757
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