MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32003	NC_015865	TAC	2	6	1533098	1533103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582694
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32009	NC_015865	AGAA	2	8	1533278	1533285	75 %	0 %	25 %	0 %	341582694
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32211	NC_015865	TCCT	2	8	1541960	1541967	0 %	50 %	0 %	50 %	341582704
32212	NC_015865	TCA	2	6	1541987	1541992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582704
32213	NC_015865	TCG	2	6	1542035	1542040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582704
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32215	NC_015865	TGA	2	6	1542114	1542119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582704
32216	NC_015865	CTG	2	6	1542125	1542130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582704
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32219	NC_015865	CTT	2	6	1542199	1542204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582704
32220	NC_015865	GC	3	6	1542210	1542215	0 %	0 %	50 %	50 %	341582704
32221	NC_015865	CCT	2	6	1542219	1542224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582704
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32228	NC_015865	TTCTCG	2	12	1542662	1542673	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	341582704
32229	NC_015865	CCT	2	6	1542708	1542713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582704
32230	NC_015865	GTT	2	6	1542715	1542720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582704
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32348	NC_015865	ATC	2	6	1547805	1547810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582711
32349	NC_015865	TGTA	2	8	1547817	1547824	25 %	50 %	25 %	0 %	341582711
32350	NC_015865	GCTC	2	8	1547914	1547921	0 %	25 %	25 %	50 %	341582711
32351	NC_015865	CTC	2	6	1547987	1547992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32352	NC_015865	CGG	2	6	1548027	1548032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582711
32353	NC_015865	CTC	2	6	1548047	1548052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32354	NC_015865	TTG	2	6	1548114	1548119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582711
32355	NC_015865	ACC	2	6	1548126	1548131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582711
32356	NC_015865	TCT	2	6	1548188	1548193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582711
32357	NC_015865	C	6	6	1548199	1548204	0 %	0 %	0 %	100 %	341582711
32358	NC_015865	CGG	2	6	1548290	1548295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582711
32359	NC_015865	CCG	2	6	1548342	1548347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582711
32360	NC_015865	TCG	3	9	1548361	1548369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582711
32361	NC_015865	GTG	2	6	1548378	1548383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582711
32362	NC_015865	TCC	2	6	1548408	1548413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32363	NC_015865	CCT	2	6	1548487	1548492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32364	NC_015865	CT	3	6	1548512	1548517	0 %	50 %	0 %	50 %	341582711
32365	NC_015865	CTG	2	6	1548584	1548589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582711
32366	NC_015865	CCT	2	6	1548652	1548657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32367	NC_015865	CCT	2	6	1548709	1548714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32368	NC_015865	CTC	2	6	1548872	1548877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32369	NC_015865	CTTTCC	2	12	1548881	1548892	0 %	50 %	0 %	50 %	341582711
32370	NC_015865	TGT	2	6	1548895	1548900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582711
32371	NC_015865	CTC	2	6	1548911	1548916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32372	NC_015865	CAG	2	6	1548962	1548967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582711
32373	NC_015865	CTC	2	6	1548968	1548973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32374	NC_015865	CTC	2	6	1548977	1548982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582711
32375	NC_015865	TTA	2	6	1549012	1549017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582711
32376	NC_015865	TGG	2	6	1549133	1549138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32377	NC_015865	ACG	2	6	1549151	1549156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582712
32378	NC_015865	CTC	2	6	1549189	1549194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582712
32379	NC_015865	ACA	2	6	1549262	1549267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582712
32380	NC_015865	GAC	2	6	1549275	1549280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582712
32381	NC_015865	GCCCTC	2	12	1549300	1549311	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	341582712
32382	NC_015865	GTG	2	6	1549332	1549337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582712
32383	NC_015865	CGC	2	6	1549365	1549370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582712
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32385	NC_015865	TCG	2	6	1549406	1549411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582712
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32387	NC_015865	AGAAGG	2	12	1549481	1549492	50 %	0 %	50 %	0 %	341582712
32388	NC_015865	GAG	2	6	1549495	1549500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582712
32389	NC_015865	CGTTTT	2	12	1549511	1549522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32390	NC_015865	CAT	2	6	1549541	1549546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582713
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32392	NC_015865	TCC	3	9	1549655	1549663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582713
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32394	NC_015865	TTA	2	6	1549734	1549739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582713
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32398	NC_015865	CAT	2	6	1549873	1549878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582713
32399	NC_015865	ACC	2	6	1549883	1549888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32400	NC_015865	GGC	2	6	1550044	1550049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582714
32401	NC_015865	CTT	2	6	1550056	1550061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582714
32402	NC_015865	GA	3	6	1550084	1550089	50 %	0 %	50 %	0 %	341582714
32403	NC_015865	GGA	2	6	1550125	1550130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582714
32404	NC_015865	ACT	2	6	1550156	1550161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582715
32405	NC_015865	TCC	2	6	1550170	1550175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582715
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32410	NC_015865	GC	3	6	1550388	1550393	0 %	0 %	50 %	50 %	341582715
32411	NC_015865	CTC	2	6	1550424	1550429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582715
32412	NC_015865	CCT	2	6	1550435	1550440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582715
32413	NC_015865	GTA	2	6	1550445	1550450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582715
32414	NC_015865	CTC	2	6	1550499	1550504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582715
32415	NC_015865	TCC	2	6	1550521	1550526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582715
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32417	NC_015865	TTC	2	6	1550593	1550598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582715
32418	NC_015865	CCT	2	6	1550612	1550617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582715
32419	NC_015865	GTA	2	6	1550622	1550627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582715
32420	NC_015865	AG	3	6	1550648	1550653	50 %	0 %	50 %	0 %	341582715
32421	NC_015865	CGG	2	6	1550666	1550671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582715
32422	NC_015865	GGC	2	6	1550706	1550711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582715
32423	NC_015865	TCCA	2	8	1550716	1550723	25 %	25 %	0 %	50 %	341582715
32424	NC_015865	CCG	2	6	1550744	1550749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582715
32425	NC_015865	GCCC	2	8	1550802	1550809	0 %	0 %	25 %	75 %	341582715
32426	NC_015865	CGA	2	6	1550885	1550890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582715
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32428	NC_015865	CGA	2	6	1550918	1550923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582715
32429	NC_015865	GAA	2	6	1551036	1551041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582715
32430	NC_015865	AGC	3	9	1551091	1551099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582715
32431	NC_015865	GCC	2	6	1551105	1551110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582715
32432	NC_015865	GTA	2	6	1551239	1551244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582716
32433	NC_015865	CGT	2	6	1551253	1551258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582716
32434	NC_015865	ACG	2	6	1551264	1551269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582716
32435	NC_015865	AAC	2	6	1551281	1551286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582716
32436	NC_015865	TCC	2	6	1551301	1551306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582716
32437	NC_015865	CCA	2	6	1551357	1551362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582716
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32439	NC_015865	GAT	2	6	1551482	1551487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582716
32440	NC_015865	ATA	2	6	1551696	1551701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582716
32441	NC_015865	GGT	2	6	1551742	1551747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32442	NC_015865	GC	3	6	1551797	1551802	0 %	0 %	50 %	50 %	341582717
32443	NC_015865	GAG	2	6	1551895	1551900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582717
32444	NC_015865	GCC	2	6	1551942	1551947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582717
32445	NC_015865	CTG	2	6	1551952	1551957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582717
32446	NC_015865	GAG	2	6	1552063	1552068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582717
32447	NC_015865	CGG	2	6	1552098	1552103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582717
32448	NC_015865	CTG	2	6	1552235	1552240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582717
32449	NC_015865	TCA	2	6	1552307	1552312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582717
32450	NC_015865	GAC	2	6	1552357	1552362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582717
32451	NC_015865	GC	3	6	1552393	1552398	0 %	0 %	50 %	50 %	341582717
32452	NC_015865	CTC	2	6	1552456	1552461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582717
32453	NC_015865	TAAA	2	8	1552640	1552647	75 %	25 %	0 %	0 %	341582717
32454	NC_015865	AGC	2	6	1552706	1552711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582718
32455	NC_015865	GTC	2	6	1552742	1552747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582718
32456	NC_015865	GAGG	2	8	1552825	1552832	25 %	0 %	75 %	0 %	341582718
32457	NC_015865	AGG	2	6	1552865	1552870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582718
32458	NC_015865	CCTG	2	8	1552903	1552910	0 %	25 %	25 %	50 %	341582718
32459	NC_015865	GAGC	2	8	1552936	1552943	25 %	0 %	50 %	25 %	341582718
32460	NC_015865	CCG	2	6	1553052	1553057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582718
32461	NC_015865	GGA	2	6	1553140	1553145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582718
32462	NC_015865	GAG	2	6	1553150	1553155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582718
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32464	NC_015865	GGA	2	6	1553278	1553283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582718
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