MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_015865	TCC	2	6	1508766	1508771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582667
31502	NC_015865	CGA	2	6	1508838	1508843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582667
31503	NC_015865	GGA	2	6	1508934	1508939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582667
31504	NC_015865	ACC	2	6	1508950	1508955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582667
31505	NC_015865	GAG	2	6	1508980	1508985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582667
31506	NC_015865	TCT	2	6	1509014	1509019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31507	NC_015865	TTC	2	6	1509123	1509128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31508	NC_015865	GAA	2	6	1509207	1509212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582668
31509	NC_015865	GAG	2	6	1509223	1509228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
31510	NC_015865	CGT	2	6	1509324	1509329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31511	NC_015865	TTC	3	9	1509388	1509396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582668
31512	NC_015865	CGT	2	6	1509507	1509512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31513	NC_015865	ACG	2	6	1509527	1509532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31514	NC_015865	AGGA	2	8	1509608	1509615	50 %	0 %	50 %	0 %	341582668
31515	NC_015865	GTC	2	6	1509685	1509690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31516	NC_015865	GA	3	6	1509749	1509754	50 %	0 %	50 %	0 %	341582668
31517	NC_015865	GCC	2	6	1509778	1509783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582668
31518	NC_015865	TCC	2	6	1509806	1509811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582668
31519	NC_015865	CGT	2	6	1509822	1509827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31520	NC_015865	CGG	2	6	1509840	1509845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582668
31521	NC_015865	GAG	3	9	1509852	1509860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
31522	NC_015865	TCG	2	6	1509908	1509913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31523	NC_015865	AAG	2	6	1509925	1509930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582668
31524	NC_015865	ATA	2	6	1509943	1509948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582668
31525	NC_015865	GAC	2	6	1509957	1509962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31526	NC_015865	CGG	2	6	1509993	1509998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582668
31527	NC_015865	CGG	2	6	1510005	1510010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582668
31528	NC_015865	AGG	2	6	1510073	1510078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
31529	NC_015865	ACT	2	6	1510112	1510117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582668
31530	NC_015865	GAA	2	6	1510149	1510154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582668
31531	NC_015865	GAC	2	6	1510158	1510163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31532	NC_015865	GCG	2	6	1510166	1510171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582668
31533	NC_015865	GGT	2	6	1510182	1510187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582668
31534	NC_015865	AAG	2	6	1510192	1510197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582668
31535	NC_015865	CCA	2	6	1510209	1510214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582668
31536	NC_015865	CGC	2	6	1510293	1510298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582668
31537	NC_015865	CGATG	2	10	1510299	1510308	20 %	20 %	40 %	20 %	341582668
31538	NC_015865	GGA	2	6	1510383	1510388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
31539	NC_015865	AGG	2	6	1510421	1510426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
31540	NC_015865	CTC	2	6	1510429	1510434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582668
31541	NC_015865	GCGA	2	8	1510450	1510457	25 %	0 %	50 %	25 %	341582668
31542	NC_015865	CGA	2	6	1510563	1510568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31543	NC_015865	CGA	2	6	1510655	1510660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582668
31544	NC_015865	GGA	2	6	1510746	1510751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
31545	NC_015865	AGA	2	6	1510760	1510765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582668
31546	NC_015865	GATG	2	8	1510829	1510836	25 %	25 %	50 %	0 %	341582668
31547	NC_015865	GGA	2	6	1510890	1510895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
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31550	NC_015865	CCG	2	6	1510994	1510999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582668
31551	NC_015865	GAG	2	6	1511005	1511010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582668
31552	NC_015865	GAGTG	2	10	1511111	1511120	20 %	20 %	60 %	0 %	341582668
31553	NC_015865	T	6	6	1511132	1511137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31554	NC_015865	CTTC	2	8	1511138	1511145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31555	NC_015865	AAC	2	6	1511150	1511155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31556	NC_015865	CGG	2	6	1511226	1511231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582669
31557	NC_015865	CGG	2	6	1511301	1511306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582669
31558	NC_015865	CCT	2	6	1511397	1511402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582669
31559	NC_015865	GGA	2	6	1511464	1511469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582669
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31563	NC_015865	GGGC	2	8	1511733	1511740	0 %	0 %	75 %	25 %	341582669
31564	NC_015865	CGG	2	6	1511805	1511810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582669
31565	NC_015865	AAGAGG	2	12	1511821	1511832	50 %	0 %	50 %	0 %	341582669
31566	NC_015865	TCA	2	6	1511864	1511869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582669
31567	NC_015865	GAT	2	6	1511881	1511886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582669
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31569	NC_015865	CGAG	2	8	1511996	1512003	25 %	0 %	50 %	25 %	341582669
31570	NC_015865	CGT	2	6	1512054	1512059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582669
31571	NC_015865	CCA	2	6	1512153	1512158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582669
31572	NC_015865	GCAGA	2	10	1512184	1512193	40 %	0 %	40 %	20 %	341582669
31573	NC_015865	CGA	2	6	1512234	1512239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582669
31574	NC_015865	CTG	2	6	1512253	1512258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582669
31575	NC_015865	ACCT	2	8	1512265	1512272	25 %	25 %	0 %	50 %	341582669
31576	NC_015865	TCG	2	6	1512344	1512349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582669
31577	NC_015865	GCC	2	6	1512363	1512368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582669
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31579	NC_015865	GCT	2	6	1512477	1512482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31581	NC_015865	AACG	2	8	1512551	1512558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31582	NC_015865	TCC	2	6	1512565	1512570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31583	NC_015865	TATC	2	8	1512577	1512584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31584	NC_015865	TTC	2	6	1512641	1512646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582670
31585	NC_015865	GAG	2	6	1512670	1512675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31586	NC_015865	TGCTT	2	10	1512777	1512786	0 %	60 %	20 %	20 %	341582670
31587	NC_015865	CCAC	2	8	1512809	1512816	25 %	0 %	0 %	75 %	341582670
31588	NC_015865	CAG	2	6	1512883	1512888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582670
31589	NC_015865	CGA	2	6	1512935	1512940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582670
31590	NC_015865	ACG	2	6	1513013	1513018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582670
31591	NC_015865	GGA	2	6	1513041	1513046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31592	NC_015865	GTC	2	6	1513057	1513062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582670
31593	NC_015865	GGA	2	6	1513065	1513070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31594	NC_015865	GGA	2	6	1513085	1513090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31595	NC_015865	ATC	2	6	1513135	1513140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582670
31596	NC_015865	GCGGTG	2	12	1513178	1513189	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	341582670
31597	NC_015865	GAG	2	6	1513204	1513209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31598	NC_015865	GGA	2	6	1513272	1513277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31599	NC_015865	AT	3	6	1513289	1513294	50 %	50 %	0 %	0 %	341582670
31600	NC_015865	CGGCG	2	10	1513317	1513326	0 %	0 %	60 %	40 %	341582670
31601	NC_015865	CGA	2	6	1513344	1513349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582670
31602	NC_015865	GAG	2	6	1513375	1513380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31603	NC_015865	TAC	2	6	1513390	1513395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582670
31604	NC_015865	GAG	2	6	1513396	1513401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582670
31605	NC_015865	AAG	2	6	1513411	1513416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582670
31606	NC_015865	CGC	2	6	1513440	1513445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582670
31607	NC_015865	TCG	2	6	1513454	1513459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582670
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31610	NC_015865	TCC	2	6	1513569	1513574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31611	NC_015865	CTT	2	6	1513579	1513584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31612	NC_015865	TTC	2	6	1513620	1513625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582671
31613	NC_015865	CTG	2	6	1513632	1513637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582671
31614	NC_015865	TGG	2	6	1513638	1513643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582671
31615	NC_015865	TTC	2	6	1513647	1513652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582671
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31718	NC_015865	CCTC	2	8	1518927	1518934	0 %	25 %	0 %	75 %	341582676
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31966	NC_015865	GA	3	6	1531475	1531480	50 %	0 %	50 %	0 %	341582692
31967	NC_015865	AGG	2	6	1531512	1531517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582692
31968	NC_015865	CGGG	2	8	1531531	1531538	0 %	0 %	75 %	25 %	341582692
31969	NC_015865	GTC	2	6	1531545	1531550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582692
31970	NC_015865	GGA	2	6	1531589	1531594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582692
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31972	NC_015865	AGG	2	6	1531633	1531638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582692
31973	NC_015865	TCG	2	6	1531680	1531685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582692
31974	NC_015865	AG	3	6	1531703	1531708	50 %	0 %	50 %	0 %	341582692
31975	NC_015865	GGT	2	6	1531709	1531714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582692
31976	NC_015865	G	7	7	1531730	1531736	0 %	0 %	100 %	0 %	341582692
31977	NC_015865	GAG	2	6	1531785	1531790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582692
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31980	NC_015865	CCTTTC	2	12	1531850	1531861	0 %	50 %	0 %	50 %	341582692
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31982	NC_015865	TCC	2	6	1532187	1532192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31984	NC_015865	CCCG	2	8	1532366	1532373	0 %	0 %	25 %	75 %	341582693
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31989	NC_015865	TGA	2	6	1532484	1532489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582693
31990	NC_015865	CGG	2	6	1532502	1532507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582693
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31994	NC_015865	CTC	2	6	1532783	1532788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582694
31995	NC_015865	GCG	2	6	1532808	1532813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582694
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31997	NC_015865	AGA	3	9	1532844	1532852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582694
31998	NC_015865	GCTG	2	8	1532941	1532948	0 %	25 %	50 %	25 %	341582694
31999	NC_015865	TAC	3	9	1532987	1532995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582694
32000	NC_015865	AAG	2	6	1533038	1533043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582694

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