MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_015865	ATATA	2	10	1485052	1485061	60 %	40 %	0 %	0 %	341582638
31002	NC_015865	GAGG	2	8	1485167	1485174	25 %	0 %	75 %	0 %	341582638
31003	NC_015865	CAA	2	6	1485185	1485190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582638
31004	NC_015865	TTTC	2	8	1485195	1485202	0 %	75 %	0 %	25 %	341582638
31005	NC_015865	TTC	2	6	1485257	1485262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582638
31006	NC_015865	GAT	2	6	1485263	1485268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582638
31007	NC_015865	TAT	2	6	1485311	1485316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582638
31008	NC_015865	AAT	2	6	1485335	1485340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582638
31009	NC_015865	TTA	2	6	1485352	1485357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582638
31010	NC_015865	TCT	2	6	1485519	1485524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582638
31011	NC_015865	TCC	2	6	1485540	1485545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582638
31012	NC_015865	TCT	2	6	1485744	1485749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582638
31013	NC_015865	TTTAA	2	10	1485816	1485825	40 %	60 %	0 %	0 %	341582638
31014	NC_015865	A	6	6	1485882	1485887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_015865	CTG	2	6	1485890	1485895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31016	NC_015865	TCA	2	6	1485915	1485920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31017	NC_015865	AGT	2	6	1485981	1485986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_015865	T	7	7	1486013	1486019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_015865	CAC	2	6	1486059	1486064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31020	NC_015865	GTT	2	6	1486104	1486109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31021	NC_015865	TCA	2	6	1486126	1486131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31022	NC_015865	GGT	2	6	1486136	1486141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_015865	TTG	2	6	1486179	1486184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582639
31024	NC_015865	AT	3	6	1486201	1486206	50 %	50 %	0 %	0 %	341582639
31025	NC_015865	TGG	2	6	1486216	1486221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582639
31026	NC_015865	GAA	2	6	1486254	1486259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582639
31027	NC_015865	TGA	2	6	1486325	1486330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582639
31028	NC_015865	GAA	2	6	1486370	1486375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582639
31029	NC_015865	AGAGA	2	10	1486409	1486418	60 %	0 %	40 %	0 %	341582639
31030	NC_015865	GAT	2	6	1486535	1486540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582639
31031	NC_015865	ACT	2	6	1486628	1486633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582639
31032	NC_015865	TAA	2	6	1486652	1486657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582639
31033	NC_015865	AAC	2	6	1486667	1486672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582639
31034	NC_015865	AC	3	6	1486731	1486736	50 %	0 %	0 %	50 %	341582639
31035	NC_015865	ATT	2	6	1486773	1486778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582639
31036	NC_015865	TGAC	2	8	1486870	1486877	25 %	25 %	25 %	25 %	341582639
31037	NC_015865	CAG	2	6	1486937	1486942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582639
31038	NC_015865	TTAT	2	8	1486953	1486960	25 %	75 %	0 %	0 %	341582639
31039	NC_015865	GAG	2	6	1486968	1486973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582639
31040	NC_015865	AAATG	2	10	1487090	1487099	60 %	20 %	20 %	0 %	341582639
31041	NC_015865	AGAA	2	8	1487178	1487185	75 %	0 %	25 %	0 %	341582639
31042	NC_015865	GTT	2	6	1487196	1487201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582639
31043	NC_015865	ATA	2	6	1487221	1487226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582639
31044	NC_015865	CT	3	6	1487232	1487237	0 %	50 %	0 %	50 %	341582639
31045	NC_015865	AT	3	6	1487264	1487269	50 %	50 %	0 %	0 %	341582639
31046	NC_015865	TAC	2	6	1487309	1487314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582639
31047	NC_015865	TTG	2	6	1487398	1487403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582639
31048	NC_015865	CAATT	2	10	1487414	1487423	40 %	40 %	0 %	20 %	341582639
31049	NC_015865	ACGA	2	8	1487606	1487613	50 %	0 %	25 %	25 %	341582639
31050	NC_015865	TA	3	6	1487615	1487620	50 %	50 %	0 %	0 %	341582639
31051	NC_015865	GGCT	2	8	1487623	1487630	0 %	25 %	50 %	25 %	341582639
31052	NC_015865	ATG	2	6	1487641	1487646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582639
31053	NC_015865	TTTTG	2	10	1487678	1487687	0 %	80 %	20 %	0 %	341582639
31054	NC_015865	GA	3	6	1487704	1487709	50 %	0 %	50 %	0 %	341582639
31055	NC_015865	ACA	2	6	1487710	1487715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582639
31056	NC_015865	A	6	6	1487717	1487722	100 %	0 %	0 %	0 %	341582639
31057	NC_015865	GAA	2	6	1487747	1487752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582639
31058	NC_015865	GA	4	8	1487779	1487786	50 %	0 %	50 %	0 %	341582639
31059	NC_015865	CAT	2	6	1487870	1487875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582639
31060	NC_015865	AT	3	6	1487874	1487879	50 %	50 %	0 %	0 %	341582639
31061	NC_015865	CTT	2	6	1487901	1487906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582639
31062	NC_015865	GTATAT	2	12	1487936	1487947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341582639
31063	NC_015865	TC	3	6	1488070	1488075	0 %	50 %	0 %	50 %	341582639
31064	NC_015865	TTTGTT	2	12	1488108	1488119	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31065	NC_015865	GGGAA	2	10	1488243	1488252	40 %	0 %	60 %	0 %	341582640
31066	NC_015865	GCC	2	6	1488261	1488266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582640
31067	NC_015865	CGG	2	6	1488296	1488301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582640
31068	NC_015865	TCC	2	6	1488313	1488318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582640
31069	NC_015865	AGA	3	9	1488352	1488360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582640
31070	NC_015865	GCG	2	6	1488370	1488375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582640
31071	NC_015865	GAGCCC	2	12	1488417	1488428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	341582640
31072	NC_015865	GAC	2	6	1488429	1488434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582640
31073	NC_015865	AG	3	6	1488448	1488453	50 %	0 %	50 %	0 %	341582640
31074	NC_015865	GC	3	6	1488461	1488466	0 %	0 %	50 %	50 %	341582640
31075	NC_015865	AGG	2	6	1488469	1488474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582640
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31077	NC_015865	GAG	2	6	1488552	1488557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582640
31078	NC_015865	TCA	2	6	1488568	1488573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582640
31079	NC_015865	GGA	2	6	1488623	1488628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582640
31080	NC_015865	GAGG	2	8	1488662	1488669	25 %	0 %	75 %	0 %	341582640
31081	NC_015865	GAG	2	6	1488701	1488706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582640
31082	NC_015865	TCC	2	6	1488735	1488740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31083	NC_015865	TTAG	2	8	1488770	1488777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31084	NC_015865	GAGC	2	8	1488841	1488848	25 %	0 %	50 %	25 %	341582641
31085	NC_015865	GTT	2	6	1488899	1488904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582641
31086	NC_015865	GC	3	6	1488919	1488924	0 %	0 %	50 %	50 %	341582641
31087	NC_015865	CCT	2	6	1488946	1488951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582641
31088	NC_015865	GCCG	2	8	1488967	1488974	0 %	0 %	50 %	50 %	341582641
31089	NC_015865	GCC	2	6	1488980	1488985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582641
31090	NC_015865	GAG	2	6	1489004	1489009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582641
31091	NC_015865	ATC	2	6	1489049	1489054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582641
31092	NC_015865	TTTTC	2	10	1489095	1489104	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31093	NC_015865	GGA	2	6	1489128	1489133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31094	NC_015865	CTC	2	6	1489187	1489192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582642
31095	NC_015865	CGC	2	6	1489265	1489270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582642
31096	NC_015865	CGG	2	6	1489321	1489326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582642
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31100	NC_015865	CGG	2	6	1489427	1489432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582642
31101	NC_015865	CGA	2	6	1489499	1489504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582642
31102	NC_015865	CTGCT	2	10	1489553	1489562	0 %	40 %	20 %	40 %	341582642
31103	NC_015865	GTC	2	6	1489568	1489573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582642
31104	NC_015865	TGA	2	6	1489594	1489599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582642
31105	NC_015865	CCT	2	6	1489613	1489618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582642
31106	NC_015865	CCG	2	6	1489632	1489637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582642
31107	NC_015865	GGC	2	6	1489640	1489645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582642
31108	NC_015865	TCAA	2	8	1489740	1489747	50 %	25 %	0 %	25 %	341582643
31109	NC_015865	AG	3	6	1489771	1489776	50 %	0 %	50 %	0 %	341582643
31110	NC_015865	TTG	2	6	1489782	1489787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582643
31111	NC_015865	TC	3	6	1489939	1489944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31112	NC_015865	TCT	2	6	1490009	1490014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582644
31113	NC_015865	CT	3	6	1490018	1490023	0 %	50 %	0 %	50 %	341582644
31114	NC_015865	TCC	2	6	1490029	1490034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582644
31115	NC_015865	CCT	2	6	1490054	1490059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582644
31116	NC_015865	ATC	2	6	1490167	1490172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582644
31117	NC_015865	TTC	3	9	1490192	1490200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31119	NC_015865	TCC	2	6	1490370	1490375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582645
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31237	NC_015865	CTT	2	6	1496074	1496079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582651
31238	NC_015865	GAT	2	6	1496122	1496127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582651
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31250	NC_015865	GAAG	2	8	1496752	1496759	50 %	0 %	50 %	0 %	341582653
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31348	NC_015865	A	6	6	1501337	1501342	100 %	0 %	0 %	0 %	341582659
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31470	NC_015865	GAT	2	6	1507396	1507401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31471	NC_015865	TTA	2	6	1507480	1507485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31472	NC_015865	GGA	2	6	1507521	1507526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582666
31473	NC_015865	CGA	3	9	1507563	1507571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582666
31474	NC_015865	AGG	2	6	1507579	1507584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582666
31475	NC_015865	CGA	2	6	1507608	1507613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582666
31476	NC_015865	TTCAGG	2	12	1507619	1507630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341582666
31477	NC_015865	CAT	2	6	1507644	1507649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582666
31478	NC_015865	TCG	2	6	1507655	1507660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582666
31479	NC_015865	AAG	2	6	1507684	1507689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582666
31480	NC_015865	GAG	2	6	1507690	1507695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582666
31481	NC_015865	TCA	2	6	1507706	1507711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582666
31482	NC_015865	GAG	2	6	1507723	1507728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582666
31483	NC_015865	GAGT	2	8	1507750	1507757	25 %	25 %	50 %	0 %	341582666
31484	NC_015865	ATC	2	6	1507815	1507820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31485	NC_015865	GGT	2	6	1507868	1507873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31486	NC_015865	CGG	2	6	1507926	1507931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582667
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31488	NC_015865	CAT	2	6	1508013	1508018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582667
31489	NC_015865	GCG	2	6	1508039	1508044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582667
31490	NC_015865	TCA	2	6	1508057	1508062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582667
31491	NC_015865	GGCCT	2	10	1508101	1508110	0 %	20 %	40 %	40 %	341582667
31492	NC_015865	GAG	2	6	1508122	1508127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582667
31493	NC_015865	CCA	2	6	1508129	1508134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582667
31494	NC_015865	CCT	2	6	1508175	1508180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582667
31495	NC_015865	GGA	2	6	1508439	1508444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582667
31496	NC_015865	CCT	2	6	1508454	1508459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582667
31497	NC_015865	TCA	2	6	1508489	1508494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582667
31498	NC_015865	AGG	2	6	1508510	1508515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582667
31499	NC_015865	GAC	2	6	1508599	1508604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582667
31500	NC_015865	CTGC	2	8	1508635	1508642	0 %	25 %	25 %	50 %	341582667

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