MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_015865	AGG	2	6	1461113	1461118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582620
30503	NC_015865	TTC	2	6	1461211	1461216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582620
30504	NC_015865	GAG	2	6	1461238	1461243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582620
30505	NC_015865	AAGG	2	8	1461268	1461275	50 %	0 %	50 %	0 %	341582620
30506	NC_015865	CTTT	2	8	1461285	1461292	0 %	75 %	0 %	25 %	341582621
30507	NC_015865	TTTC	2	8	1461298	1461305	0 %	75 %	0 %	25 %	341582621
30508	NC_015865	AGA	2	6	1461331	1461336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582621
30509	NC_015865	CGT	2	6	1461379	1461384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582621
30510	NC_015865	GGT	2	6	1461526	1461531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582621
30511	NC_015865	GGT	2	6	1461583	1461588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582621
30512	NC_015865	TCCG	2	8	1461632	1461639	0 %	25 %	25 %	50 %	341582621
30513	NC_015865	CGG	2	6	1461652	1461657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582621
30514	NC_015865	ACCC	2	8	1461669	1461676	25 %	0 %	0 %	75 %	341582621
30515	NC_015865	CCCCCT	2	12	1461700	1461711	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	341582621
30516	NC_015865	CCG	2	6	1461712	1461717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582621
30517	NC_015865	CT	3	6	1461771	1461776	0 %	50 %	0 %	50 %	341582621
30518	NC_015865	GAA	2	6	1461824	1461829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582621
30519	NC_015865	CTG	2	6	1461894	1461899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582621
30520	NC_015865	CCT	3	9	1461932	1461940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582621
30521	NC_015865	ATT	2	6	1461991	1461996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30522	NC_015865	CATC	2	8	1462074	1462081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30523	NC_015865	AAT	2	6	1462100	1462105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30524	NC_015865	A	6	6	1462128	1462133	100 %	0 %	0 %	0 %	341582622
30525	NC_015865	CTA	2	6	1462149	1462154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582622
30526	NC_015865	AGA	2	6	1462172	1462177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582622
30527	NC_015865	CTGT	2	8	1462216	1462223	0 %	50 %	25 %	25 %	341582622
30528	NC_015865	GCC	2	6	1462249	1462254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582622
30529	NC_015865	TGA	2	6	1462307	1462312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582622
30530	NC_015865	CGT	2	6	1462320	1462325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582622
30531	NC_015865	CGG	2	6	1462371	1462376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582622
30532	NC_015865	GAC	2	6	1462402	1462407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
30533	NC_015865	CGA	2	6	1462488	1462493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
30534	NC_015865	ACCTAC	2	12	1462528	1462539	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	341582622
30535	NC_015865	CCG	2	6	1462589	1462594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582622
30536	NC_015865	CGC	2	6	1462598	1462603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582622
30537	NC_015865	TGA	2	6	1462694	1462699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582622
30538	NC_015865	TTC	2	6	1462745	1462750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582622
30539	NC_015865	CAA	2	6	1462758	1462763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582622
30540	NC_015865	GTC	2	6	1462840	1462845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582622
30541	NC_015865	CGT	2	6	1462890	1462895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582622
30542	NC_015865	CG	3	6	1463030	1463035	0 %	0 %	50 %	50 %	341582622
30543	NC_015865	CGAG	2	8	1463069	1463076	25 %	0 %	50 %	25 %	341582622
30544	NC_015865	GAA	2	6	1463096	1463101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582622
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30546	NC_015865	GAG	2	6	1463230	1463235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582622
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30549	NC_015865	GAG	2	6	1463389	1463394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582622
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30551	NC_015865	GGA	2	6	1463466	1463471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582622
30552	NC_015865	TCG	2	6	1463525	1463530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582622
30553	NC_015865	TCGA	2	8	1463542	1463549	25 %	25 %	25 %	25 %	341582622
30554	NC_015865	CTA	2	6	1463574	1463579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582622
30555	NC_015865	CT	3	6	1463604	1463609	0 %	50 %	0 %	50 %	341582622
30556	NC_015865	CTCAAC	2	12	1463626	1463637	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	341582622
30557	NC_015865	CGA	2	6	1463757	1463762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582622
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30559	NC_015865	GTC	2	6	1463848	1463853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582622
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30567	NC_015865	CTCC	2	8	1464165	1464172	0 %	25 %	0 %	75 %	341582622
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30587	NC_015865	TCC	2	6	1465342	1465347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582623
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30598	NC_015865	CGA	2	6	1465799	1465804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582623
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30601	NC_015865	GGA	2	6	1465860	1465865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582623
30602	NC_015865	CGG	2	6	1465895	1465900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582623
30603	NC_015865	TCA	2	6	1465954	1465959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582623
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30606	NC_015865	CTA	2	6	1466150	1466155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582623
30607	NC_015865	CGT	2	6	1466186	1466191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582623
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30612	NC_015865	GCA	2	6	1466307	1466312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582623
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