MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30003	NC_015865	TAG	2	6	1436639	1436644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582587
30004	NC_015865	GTTG	2	8	1436701	1436708	0 %	50 %	50 %	0 %	341582587
30005	NC_015865	CTT	2	6	1436713	1436718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582587
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30014	NC_015865	ATC	2	6	1437346	1437351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582588
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30018	NC_015865	TTG	2	6	1437553	1437558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582588
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30042	NC_015865	CT	3	6	1438941	1438946	0 %	50 %	0 %	50 %	341582589
30043	NC_015865	TGA	3	9	1438957	1438965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582589
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30051	NC_015865	GC	3	6	1439232	1439237	0 %	0 %	50 %	50 %	341582590
30052	NC_015865	GTC	2	6	1439272	1439277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582590
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30054	NC_015865	TAT	2	6	1439380	1439385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582590
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30099	NC_015865	GAG	2	6	1441716	1441721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582593
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30106	NC_015865	GA	3	6	1442052	1442057	50 %	0 %	50 %	0 %	341582594
30107	NC_015865	GTGAGC	2	12	1442082	1442093	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341582594
30108	NC_015865	GAG	2	6	1442198	1442203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582594
30109	NC_015865	ATG	2	6	1442223	1442228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582594
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30111	NC_015865	AGG	2	6	1442268	1442273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582594
30112	NC_015865	TGA	2	6	1442308	1442313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582594
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30114	NC_015865	CGC	2	6	1442347	1442352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582595
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30116	NC_015865	GCCC	2	8	1442466	1442473	0 %	0 %	25 %	75 %	341582595
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30232	NC_015865	GGT	3	9	1448539	1448547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582606
30233	NC_015865	CGT	2	6	1448560	1448565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582607
30234	NC_015865	TCC	2	6	1448594	1448599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582607
30235	NC_015865	TTC	2	6	1448602	1448607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582607
30236	NC_015865	TTC	2	6	1448624	1448629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582607
30237	NC_015865	CGT	2	6	1448652	1448657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582607
30238	NC_015865	CTC	2	6	1448718	1448723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582607
30239	NC_015865	TAC	2	6	1448839	1448844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582607
30240	NC_015865	ACA	2	6	1448858	1448863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582607
30241	NC_015865	GGT	2	6	1448913	1448918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582607
30242	NC_015865	TAC	2	6	1448950	1448955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582607
30243	NC_015865	CCTGG	2	10	1449012	1449021	0 %	20 %	40 %	40 %	341582607
30244	NC_015865	GAA	2	6	1449034	1449039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582607
30245	NC_015865	TCG	2	6	1449071	1449076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582607
30246	NC_015865	GAAG	2	8	1449083	1449090	50 %	0 %	50 %	0 %	341582607
30247	NC_015865	TCA	2	6	1449102	1449107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582607
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30250	NC_015865	CGTT	2	8	1449266	1449273	0 %	50 %	25 %	25 %	341582608
30251	NC_015865	GTCGTG	2	12	1449315	1449326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	341582608
30252	NC_015865	CTT	2	6	1449345	1449350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582608
30253	NC_015865	ATCGC	2	10	1449362	1449371	20 %	20 %	20 %	40 %	341582608
30254	NC_015865	TTC	2	6	1449376	1449381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582608
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30257	NC_015865	GGTG	2	8	1449518	1449525	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30258	NC_015865	GAT	2	6	1449580	1449585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582609
30259	NC_015865	GCT	2	6	1449593	1449598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582609
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30261	NC_015865	CGG	2	6	1449694	1449699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582609
30262	NC_015865	ACT	2	6	1449807	1449812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582609
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30264	NC_015865	ACT	2	6	1449927	1449932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582609
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30295	NC_015865	GGT	2	6	1451304	1451309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30302	NC_015865	CGA	2	6	1451528	1451533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582610
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30310	NC_015865	TC	3	6	1451739	1451744	0 %	50 %	0 %	50 %	341582610
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30312	NC_015865	TCG	2	6	1451867	1451872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582610
30313	NC_015865	CCT	2	6	1451979	1451984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582610
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30323	NC_015865	CGG	2	6	1452308	1452313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582610
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30328	NC_015865	CGT	2	6	1452592	1452597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582611
30329	NC_015865	AGG	2	6	1452717	1452722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582611
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30331	NC_015865	GGA	2	6	1452769	1452774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582611
30332	NC_015865	GCC	2	6	1452815	1452820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582611
30333	NC_015865	GCT	2	6	1452838	1452843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582611
30334	NC_015865	AAG	2	6	1452848	1452853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582611
30335	NC_015865	TCC	2	6	1452888	1452893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582611
30336	NC_015865	AG	3	6	1452964	1452969	50 %	0 %	50 %	0 %	341582611
30337	NC_015865	AG	3	6	1453021	1453026	50 %	0 %	50 %	0 %	341582611
30338	NC_015865	ATG	2	6	1453190	1453195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582611
30339	NC_015865	CTT	2	6	1453244	1453249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30340	NC_015865	TGG	2	6	1453251	1453256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30341	NC_015865	GGA	2	6	1453261	1453266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582612
30342	NC_015865	CTGG	2	8	1453319	1453326	0 %	25 %	50 %	25 %	341582612
30343	NC_015865	GGT	2	6	1453366	1453371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582612
30344	NC_015865	GCTTCT	2	12	1453388	1453399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	341582613
30345	NC_015865	ACC	2	6	1453452	1453457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582613
30346	NC_015865	AT	3	6	1453468	1453473	50 %	50 %	0 %	0 %	341582613
30347	NC_015865	CGGCT	2	10	1453482	1453491	0 %	20 %	40 %	40 %	341582613
30348	NC_015865	TCC	2	6	1453543	1453548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582613
30349	NC_015865	TTCTGC	2	12	1453552	1453563	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	341582613
30350	NC_015865	TC	3	6	1453574	1453579	0 %	50 %	0 %	50 %	341582613
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30353	NC_015865	CGTT	2	8	1453876	1453883	0 %	50 %	25 %	25 %	341582613
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30378	NC_015865	CTG	2	6	1455202	1455207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582614
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30380	NC_015865	CCG	2	6	1455305	1455310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582614
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30384	NC_015865	CTC	2	6	1455405	1455410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582614
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30410	NC_015865	CG	3	6	1456553	1456558	0 %	0 %	50 %	50 %	341582615
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30417	NC_015865	CTC	2	6	1456790	1456795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582615
30418	NC_015865	GGC	2	6	1456808	1456813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582615
30419	NC_015865	CTC	2	6	1456869	1456874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582616
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30427	NC_015865	TGGG	2	8	1457394	1457401	0 %	25 %	75 %	0 %	341582616
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30430	NC_015865	CTA	2	6	1457495	1457500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582616
30431	NC_015865	CTG	2	6	1457532	1457537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582616
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30433	NC_015865	TCC	2	6	1457560	1457565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582616
30434	NC_015865	ACG	2	6	1457598	1457603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582616
30435	NC_015865	GGGC	2	8	1457749	1457756	0 %	0 %	75 %	25 %	341582616
30436	NC_015865	CTG	2	6	1457823	1457828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582616
30437	NC_015865	GTC	2	6	1457838	1457843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582616
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30439	NC_015865	TTC	2	6	1457865	1457870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582616
30440	NC_015865	GTTC	2	8	1457896	1457903	0 %	50 %	25 %	25 %	341582616
30441	NC_015865	TGG	3	9	1457946	1457954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582616
30442	NC_015865	GTC	2	6	1457967	1457972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582616
30443	NC_015865	GGA	2	6	1458011	1458016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582616
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30445	NC_015865	GAA	2	6	1458061	1458066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30446	NC_015865	GA	3	6	1458068	1458073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30447	NC_015865	ATC	2	6	1458085	1458090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582617
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30449	NC_015865	ACG	2	6	1458178	1458183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582617
30450	NC_015865	CCT	2	6	1458212	1458217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582617
30451	NC_015865	CTTTC	2	10	1458256	1458265	0 %	60 %	0 %	40 %	341582617
30452	NC_015865	TCT	2	6	1458464	1458469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582618
30453	NC_015865	A	7	7	1458485	1458491	100 %	0 %	0 %	0 %	341582618
30454	NC_015865	ATA	2	6	1458496	1458501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582618
30455	NC_015865	ATC	2	6	1458553	1458558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582618
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30457	NC_015865	CGC	2	6	1458587	1458592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582618
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30459	NC_015865	G	6	6	1458753	1458758	0 %	0 %	100 %	0 %	341582618
30460	NC_015865	ATA	2	6	1458766	1458771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582618
30461	NC_015865	GA	3	6	1458776	1458781	50 %	0 %	50 %	0 %	341582618
30462	NC_015865	GGA	2	6	1458815	1458820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582618
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