MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_015865	GGC	2	6	1391127	1391132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582532
29003	NC_015865	CATAGG	2	12	1391162	1391173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341582532
29004	NC_015865	TTCC	2	8	1391375	1391382	0 %	50 %	0 %	50 %	341582532
29005	NC_015865	GTC	2	6	1391451	1391456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582532
29006	NC_015865	TCG	2	6	1391458	1391463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582532
29007	NC_015865	GCG	2	6	1391464	1391469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582532
29008	NC_015865	CAA	2	6	1391477	1391482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582532
29009	NC_015865	TGA	2	6	1391506	1391511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
29010	NC_015865	CTT	2	6	1391531	1391536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582532
29011	NC_015865	TCC	2	6	1391540	1391545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582532
29012	NC_015865	GAT	2	6	1391573	1391578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
29013	NC_015865	G	7	7	1391607	1391613	0 %	0 %	100 %	0 %	341582532
29014	NC_015865	GGA	2	6	1391627	1391632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582532
29015	NC_015865	GTA	2	6	1391673	1391678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
29016	NC_015865	TGT	2	6	1391716	1391721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582533
29017	NC_015865	TCC	2	6	1391724	1391729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582533
29018	NC_015865	AGG	2	6	1391762	1391767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582533
29019	NC_015865	TGG	2	6	1391856	1391861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582533
29020	NC_015865	TCT	2	6	1391916	1391921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582533
29021	NC_015865	AGC	2	6	1391960	1391965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582533
29022	NC_015865	GAG	2	6	1391971	1391976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582533
29023	NC_015865	GGAGG	2	10	1391996	1392005	20 %	0 %	80 %	0 %	341582533
29024	NC_015865	CGG	2	6	1392025	1392030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582533
29025	NC_015865	GGA	2	6	1392166	1392171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582533
29026	NC_015865	CGA	2	6	1392183	1392188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582533
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29028	NC_015865	GCG	2	6	1392231	1392236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582533
29029	NC_015865	CTG	2	6	1392353	1392358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582533
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29032	NC_015865	TCC	2	6	1392512	1392517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582534
29033	NC_015865	AGGT	2	8	1392556	1392563	25 %	25 %	50 %	0 %	341582534
29034	NC_015865	TAT	2	6	1392588	1392593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582534
29035	NC_015865	CTCC	2	8	1392594	1392601	0 %	25 %	0 %	75 %	341582534
29036	NC_015865	ATC	2	6	1392646	1392651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582534
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29040	NC_015865	AGGT	2	8	1392904	1392911	25 %	25 %	50 %	0 %	341582534
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29042	NC_015865	CGC	2	6	1393082	1393087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582534
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29053	NC_015865	CGA	2	6	1393552	1393557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582535
29054	NC_015865	GAC	2	6	1393574	1393579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582535
29055	NC_015865	GTA	2	6	1393628	1393633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582535
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29058	NC_015865	CCA	2	6	1393820	1393825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582535
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29064	NC_015865	GTA	2	6	1394060	1394065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582535
29065	NC_015865	TGT	2	6	1394107	1394112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582535
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29068	NC_015865	GAG	2	6	1394180	1394185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582535
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29100	NC_015865	GTA	2	6	1395139	1395144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582536
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29106	NC_015865	ACCAG	2	10	1395381	1395390	40 %	0 %	20 %	40 %	341582536
29107	NC_015865	ATT	2	6	1395395	1395400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582536
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29115	NC_015865	TGA	2	6	1395680	1395685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582537
29116	NC_015865	GC	3	6	1395699	1395704	0 %	0 %	50 %	50 %	341582537
29117	NC_015865	GAG	2	6	1395780	1395785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582537
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29231	NC_015865	CTC	2	6	1401902	1401907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582541
29232	NC_015865	GTA	2	6	1401908	1401913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582541
29233	NC_015865	GTC	2	6	1401975	1401980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582541
29234	NC_015865	CCAG	2	8	1401999	1402006	25 %	0 %	25 %	50 %	341582541
29235	NC_015865	GGC	2	6	1402061	1402066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582541
29236	NC_015865	TTG	2	6	1402134	1402139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582541
29237	NC_015865	GGA	2	6	1402150	1402155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582541
29238	NC_015865	GGA	2	6	1402159	1402164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582541
29239	NC_015865	TCC	2	6	1402236	1402241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582541
29240	NC_015865	TCT	3	9	1402276	1402284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582541
29241	NC_015865	ATC	2	6	1402305	1402310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582541
29242	NC_015865	CTG	2	6	1402326	1402331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582541
29243	NC_015865	TCCG	2	8	1402389	1402396	0 %	25 %	25 %	50 %	341582541
29244	NC_015865	GCT	2	6	1402474	1402479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582541
29245	NC_015865	CGC	2	6	1402528	1402533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582541
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29249	NC_015865	GAC	2	6	1402691	1402696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582541
29250	NC_015865	CGC	2	6	1402751	1402756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582541
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29252	NC_015865	GAG	2	6	1402883	1402888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582542
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29258	NC_015865	CCA	2	6	1403127	1403132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582542
29259	NC_015865	TAC	2	6	1403162	1403167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582542
29260	NC_015865	GGA	2	6	1403179	1403184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582542
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29262	NC_015865	GAG	2	6	1403246	1403251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582542
29263	NC_015865	GAG	2	6	1403342	1403347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582542
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29265	NC_015865	CGG	2	6	1403405	1403410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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29274	NC_015865	CG	3	6	1403766	1403771	0 %	0 %	50 %	50 %	341582543
29275	NC_015865	GCC	2	6	1403813	1403818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582543
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29282	NC_015865	GGT	2	6	1403997	1404002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29283	NC_015865	TCG	2	6	1404047	1404052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582544
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29315	NC_015865	GGT	3	9	1405692	1405700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582546
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29320	NC_015865	CG	3	6	1405878	1405883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29321	NC_015865	GATAC	2	10	1406187	1406196	40 %	20 %	20 %	20 %	341582547
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29327	NC_015865	ACT	2	6	1406377	1406382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29328	NC_015865	TAG	2	6	1406385	1406390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29329	NC_015865	TA	4	8	1406415	1406422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29330	NC_015865	TCC	2	6	1406426	1406431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29331	NC_015865	C	6	6	1406530	1406535	0 %	0 %	0 %	100 %	341582548
29332	NC_015865	GGGCAG	2	12	1406592	1406603	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	341582548
29333	NC_015865	AAC	2	6	1406650	1406655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582548
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29335	NC_015865	CCT	2	6	1406772	1406777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582548
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29339	NC_015865	ACC	2	6	1407097	1407102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582548
29340	NC_015865	GA	3	6	1407103	1407108	50 %	0 %	50 %	0 %	341582548
29341	NC_015865	CTC	2	6	1407172	1407177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582548
29342	NC_015865	AAC	2	6	1407181	1407186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582548
29343	NC_015865	GTG	2	6	1407187	1407192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582548
29344	NC_015865	AAG	2	6	1407217	1407222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582548
29345	NC_015865	GGA	2	6	1407254	1407259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582548
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29347	NC_015865	GCA	2	6	1407284	1407289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582548
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