MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_015865	CACC	2	8	1368739	1368746	25 %	0 %	0 %	75 %	341582514
28503	NC_015865	TGGAT	2	10	1368749	1368758	20 %	40 %	40 %	0 %	341582514
28504	NC_015865	GAA	2	6	1368767	1368772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582514
28505	NC_015865	ATA	2	6	1368784	1368789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582514
28506	NC_015865	CAC	2	6	1368841	1368846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582514
28507	NC_015865	AAG	2	6	1368910	1368915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582514
28508	NC_015865	GAA	2	6	1368999	1369004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582514
28509	NC_015865	TCT	2	6	1369037	1369042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582514
28510	NC_015865	CCAT	2	8	1369098	1369105	25 %	25 %	0 %	50 %	341582514
28511	NC_015865	CTGG	2	8	1369116	1369123	0 %	25 %	50 %	25 %	341582514
28512	NC_015865	A	6	6	1369146	1369151	100 %	0 %	0 %	0 %	341582514
28513	NC_015865	ACC	2	6	1369160	1369165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582514
28514	NC_015865	TA	4	8	1369238	1369245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28515	NC_015865	ACAG	2	8	1369253	1369260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28516	NC_015865	AAT	2	6	1369456	1369461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28517	NC_015865	TAA	2	6	1369491	1369496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28518	NC_015865	GGT	2	6	1369522	1369527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28519	NC_015865	GCG	2	6	1369627	1369632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582515
28520	NC_015865	GAT	2	6	1369662	1369667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582515
28521	NC_015865	CCCA	2	8	1369692	1369699	25 %	0 %	0 %	75 %	341582515
28522	NC_015865	CTC	2	6	1369730	1369735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582515
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28524	NC_015865	CGG	2	6	1369869	1369874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582515
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28530	NC_015865	GA	3	6	1370057	1370062	50 %	0 %	50 %	0 %	341582515
28531	NC_015865	CCCGA	2	10	1370077	1370086	20 %	0 %	20 %	60 %	341582515
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28536	NC_015865	GAG	2	6	1370322	1370327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582516
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28539	NC_015865	CGA	2	6	1370511	1370516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582516
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28541	NC_015865	TGC	2	6	1370621	1370626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582516
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28543	NC_015865	GAG	2	6	1370730	1370735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582517
28544	NC_015865	GCTG	2	8	1370825	1370832	0 %	25 %	50 %	25 %	341582517
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28550	NC_015865	CGGAG	2	10	1371113	1371122	20 %	0 %	60 %	20 %	341582517
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28553	NC_015865	GGC	2	6	1371166	1371171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582517
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28555	NC_015865	GATG	2	8	1371203	1371210	25 %	25 %	50 %	0 %	341582517
28556	NC_015865	ATT	2	6	1371232	1371237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582517
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28586	NC_015865	TTTC	2	8	1372557	1372564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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28592	NC_015865	CTC	2	6	1372809	1372814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582519
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28602	NC_015865	CGCT	2	8	1373224	1373231	0 %	25 %	25 %	50 %	341582519
28603	NC_015865	TCG	2	6	1373233	1373238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582519
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28616	NC_015865	C	6	6	1373817	1373822	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28617	NC_015865	T	6	6	1373988	1373993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28972	NC_015865	TCA	2	6	1389737	1389742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582531
28973	NC_015865	CGG	2	6	1389759	1389764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582531
28974	NC_015865	ACG	2	6	1389785	1389790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582531
28975	NC_015865	CGA	3	9	1389870	1389878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582531
28976	NC_015865	GCTC	2	8	1390031	1390038	0 %	25 %	25 %	50 %	341582531
28977	NC_015865	CG	3	6	1390060	1390065	0 %	0 %	50 %	50 %	341582531
28978	NC_015865	GAG	2	6	1390096	1390101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582531
28979	NC_015865	GGA	2	6	1390104	1390109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582531
28980	NC_015865	TCA	2	6	1390169	1390174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582531
28981	NC_015865	CGG	2	6	1390182	1390187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582531
28982	NC_015865	GAG	2	6	1390249	1390254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582531
28983	NC_015865	TTCC	2	8	1390276	1390283	0 %	50 %	0 %	50 %	341582531
28984	NC_015865	GTC	2	6	1390360	1390365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582531
28985	NC_015865	CGA	2	6	1390371	1390376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582531
28986	NC_015865	CTC	2	6	1390390	1390395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582531
28987	NC_015865	GCC	2	6	1390407	1390412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582531
28988	NC_015865	GCT	2	6	1390521	1390526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582531
28989	NC_015865	GCC	2	6	1390567	1390572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582531
28990	NC_015865	GTGG	2	8	1390663	1390670	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28991	NC_015865	GAT	2	6	1390709	1390714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582532
28992	NC_015865	CA	3	6	1390740	1390745	50 %	0 %	0 %	50 %	341582532
28993	NC_015865	ACG	2	6	1390803	1390808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582532
28994	NC_015865	G	6	6	1390814	1390819	0 %	0 %	100 %	0 %	341582532
28995	NC_015865	AGG	2	6	1390831	1390836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582532
28996	NC_015865	CGG	2	6	1390837	1390842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582532
28997	NC_015865	CAT	2	6	1390845	1390850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582532
28998	NC_015865	CTC	2	6	1390857	1390862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582532
28999	NC_015865	GACGTT	2	12	1390911	1390922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341582532
29000	NC_015865	CGT	2	6	1390964	1390969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582532

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