MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28003	NC_015865	GTA	2	6	1345380	1345385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582486
28004	NC_015865	ATG	2	6	1345411	1345416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582486
28005	NC_015865	CGGGG	2	10	1345434	1345443	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28006	NC_015865	TAA	2	6	1345467	1345472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28007	NC_015865	CAT	2	6	1345501	1345506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582487
28008	NC_015865	GTC	2	6	1345511	1345516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582487
28009	NC_015865	GGT	2	6	1345546	1345551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582487
28010	NC_015865	GGC	2	6	1345570	1345575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582487
28011	NC_015865	TTC	2	6	1345637	1345642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582487
28012	NC_015865	GGGC	2	8	1345669	1345676	0 %	0 %	75 %	25 %	341582487
28013	NC_015865	AAAG	2	8	1345708	1345715	75 %	0 %	25 %	0 %	341582487
28014	NC_015865	TTC	2	6	1345724	1345729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582487
28015	NC_015865	CGG	2	6	1345752	1345757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582487
28016	NC_015865	TGG	2	6	1345811	1345816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582487
28017	NC_015865	GGA	2	6	1345820	1345825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582487
28018	NC_015865	TCA	2	6	1345944	1345949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582487
28019	NC_015865	CGG	2	6	1345956	1345961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582487
28020	NC_015865	GAGC	2	8	1345972	1345979	25 %	0 %	50 %	25 %	341582487
28021	NC_015865	GTG	2	6	1345991	1345996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582487
28022	NC_015865	AGG	2	6	1346058	1346063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582487
28023	NC_015865	TCA	2	6	1346100	1346105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582487
28024	NC_015865	AGGCG	2	10	1346133	1346142	20 %	0 %	60 %	20 %	341582487
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28027	NC_015865	AG	3	6	1346236	1346241	50 %	0 %	50 %	0 %	341582487
28028	NC_015865	GGT	2	6	1346245	1346250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582487
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28032	NC_015865	GGA	2	6	1346413	1346418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582487
28033	NC_015865	GAG	3	9	1346447	1346455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582487
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28053	NC_015865	GA	3	6	1347940	1347945	50 %	0 %	50 %	0 %	341582488
28054	NC_015865	CGT	2	6	1347977	1347982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582488
28055	NC_015865	GTC	2	6	1348129	1348134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582488
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28059	NC_015865	CGA	2	6	1348413	1348418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582489
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28091	NC_015865	GA	3	6	1350000	1350005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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28236	NC_015865	TTG	2	6	1356732	1356737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582498
28237	NC_015865	TGG	2	6	1356768	1356773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582498
28238	NC_015865	TAC	2	6	1356779	1356784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582498
28239	NC_015865	GAG	2	6	1356830	1356835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582498
28240	NC_015865	CGATGA	2	12	1356904	1356915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341582498
28241	NC_015865	GCT	2	6	1356916	1356921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582498
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28263	NC_015865	GAG	2	6	1357645	1357650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582500
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28327	NC_015865	ACC	2	6	1360419	1360424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28328	NC_015865	CACC	2	8	1360437	1360444	25 %	0 %	0 %	75 %	341582503
28329	NC_015865	CG	4	8	1360449	1360456	0 %	0 %	50 %	50 %	341582503
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28336	NC_015865	ATG	2	6	1360681	1360686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582503
28337	NC_015865	CAC	2	6	1360740	1360745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582503
28338	NC_015865	CTT	2	6	1360752	1360757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582503
28339	NC_015865	GAC	2	6	1360968	1360973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582503
28340	NC_015865	TTC	2	6	1361030	1361035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582503
28341	NC_015865	GGC	2	6	1361127	1361132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582503
28342	NC_015865	GC	3	6	1361150	1361155	0 %	0 %	50 %	50 %	341582503
28343	NC_015865	GTA	2	6	1361157	1361162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582503
28344	NC_015865	GAT	2	6	1361178	1361183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582503
28345	NC_015865	CTT	2	6	1361217	1361222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582503
28346	NC_015865	CGA	2	6	1361252	1361257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582503
28347	NC_015865	GGT	2	6	1361258	1361263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582503
28348	NC_015865	CG	3	6	1361459	1361464	0 %	0 %	50 %	50 %	341582503
28349	NC_015865	GAG	2	6	1361487	1361492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582503
28350	NC_015865	CGT	2	6	1361507	1361512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582503
28351	NC_015865	CAA	2	6	1361687	1361692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582503
28352	NC_015865	CGC	2	6	1361699	1361704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582503
28353	NC_015865	GTT	2	6	1361706	1361711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582503
28354	NC_015865	CTC	2	6	1361757	1361762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582503
28355	NC_015865	GC	3	6	1361769	1361774	0 %	0 %	50 %	50 %	341582503
28356	NC_015865	CCGGCA	2	12	1361779	1361790	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	341582503
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28358	NC_015865	GAG	2	6	1361943	1361948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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28360	NC_015865	TTTC	2	8	1362070	1362077	0 %	75 %	0 %	25 %	341582504
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28432	NC_015865	GT	3	6	1365096	1365101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28433	NC_015865	GAGAA	2	10	1365128	1365137	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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28456	NC_015865	ATG	2	6	1366481	1366486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582509
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28458	NC_015865	ATC	2	6	1366610	1366615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582510
28459	NC_015865	A	6	6	1366627	1366632	100 %	0 %	0 %	0 %	341582510
28460	NC_015865	CAG	2	6	1366646	1366651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582510
28461	NC_015865	GA	3	6	1366652	1366657	50 %	0 %	50 %	0 %	341582510
28462	NC_015865	GGAA	2	8	1366680	1366687	50 %	0 %	50 %	0 %	341582510
28463	NC_015865	ATG	2	6	1366803	1366808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582510
28464	NC_015865	ATG	2	6	1366824	1366829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582510
28465	NC_015865	CCA	2	6	1367028	1367033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582512
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