MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_015865	GAG	2	6	1322858	1322863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582463
27502	NC_015865	TCG	2	6	1322874	1322879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27503	NC_015865	CAT	2	6	1322924	1322929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582463
27504	NC_015865	GGA	2	6	1322947	1322952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582463
27505	NC_015865	GAC	2	6	1322972	1322977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27506	NC_015865	TCC	2	6	1323033	1323038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582463
27507	NC_015865	GAT	2	6	1323116	1323121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582463
27508	NC_015865	GGCTCT	2	12	1323136	1323147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27509	NC_015865	CTG	2	6	1323203	1323208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27510	NC_015865	TCC	2	6	1323256	1323261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582463
27511	NC_015865	GGT	2	6	1323284	1323289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582463
27512	NC_015865	CGT	2	6	1323317	1323322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27513	NC_015865	CTC	2	6	1323464	1323469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582463
27514	NC_015865	TCT	2	6	1323475	1323480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582463
27515	NC_015865	CTC	2	6	1323548	1323553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582463
27516	NC_015865	CGT	2	6	1323571	1323576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27517	NC_015865	CGG	2	6	1323604	1323609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582463
27518	NC_015865	CCAG	2	8	1323637	1323644	25 %	0 %	25 %	50 %	341582463
27519	NC_015865	AGT	2	6	1323658	1323663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582463
27520	NC_015865	CTT	2	6	1323671	1323676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582463
27521	NC_015865	CCT	2	6	1323679	1323684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582463
27522	NC_015865	TGG	2	6	1323694	1323699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582463
27523	NC_015865	GAC	2	6	1323782	1323787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27524	NC_015865	TCC	2	6	1323810	1323815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582463
27525	NC_015865	CGA	2	6	1323841	1323846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582463
27526	NC_015865	GAA	2	6	1324065	1324070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27527	NC_015865	TAC	2	6	1324133	1324138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27528	NC_015865	A	6	6	1324176	1324181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27529	NC_015865	TGA	2	6	1324193	1324198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27530	NC_015865	CAT	2	6	1324245	1324250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582464
27531	NC_015865	CGG	2	6	1324281	1324286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582464
27532	NC_015865	GAG	2	6	1324531	1324536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582464
27533	NC_015865	C	6	6	1324572	1324577	0 %	0 %	0 %	100 %	341582464
27534	NC_015865	GGA	2	6	1324578	1324583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582464
27535	NC_015865	GAGG	2	8	1324680	1324687	25 %	0 %	75 %	0 %	341582464
27536	NC_015865	CG	3	6	1324694	1324699	0 %	0 %	50 %	50 %	341582464
27537	NC_015865	GGT	2	6	1324704	1324709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582464
27538	NC_015865	GA	4	8	1324720	1324727	50 %	0 %	50 %	0 %	341582464
27539	NC_015865	CG	3	6	1324744	1324749	0 %	0 %	50 %	50 %	341582464
27540	NC_015865	GAG	2	6	1324759	1324764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582464
27541	NC_015865	CGG	2	6	1324769	1324774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582464
27542	NC_015865	G	6	6	1324823	1324828	0 %	0 %	100 %	0 %	341582464
27543	NC_015865	ACG	2	6	1324838	1324843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582464
27544	NC_015865	CGG	2	6	1324923	1324928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582464
27545	NC_015865	GAGG	2	8	1324995	1325002	25 %	0 %	75 %	0 %	341582464
27546	NC_015865	GAA	2	6	1325007	1325012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582464
27547	NC_015865	CAG	2	6	1325070	1325075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582465
27548	NC_015865	AGG	2	6	1325110	1325115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582465
27549	NC_015865	CAG	2	6	1325133	1325138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582465
27550	NC_015865	CGC	2	6	1325163	1325168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582465
27551	NC_015865	GCG	2	6	1325192	1325197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582465
27552	NC_015865	AAGGGC	2	12	1325235	1325246	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341582465
27553	NC_015865	CCG	2	6	1325269	1325274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582465
27554	NC_015865	ATG	2	6	1325347	1325352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582465
27555	NC_015865	AGG	3	9	1325365	1325373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582465
27556	NC_015865	GCG	2	6	1325376	1325381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582465
27557	NC_015865	CAG	2	6	1325394	1325399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582465
27558	NC_015865	GCG	2	6	1325417	1325422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582465
27559	NC_015865	CTT	2	6	1325437	1325442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582465
27560	NC_015865	CCT	2	6	1325489	1325494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582466
27561	NC_015865	TAT	2	6	1325507	1325512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582466
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27565	NC_015865	GAG	2	6	1325690	1325695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582466
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27567	NC_015865	TGT	2	6	1325770	1325775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582466
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27570	NC_015865	GGC	2	6	1325921	1325926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582466
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27572	NC_015865	GCTC	2	8	1326001	1326008	0 %	25 %	25 %	50 %	341582466
27573	NC_015865	CTT	2	6	1326233	1326238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582466
27574	NC_015865	GAA	2	6	1326248	1326253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582466
27575	NC_015865	AGCTC	2	10	1326271	1326280	20 %	20 %	20 %	40 %	341582466
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27582	NC_015865	CTC	2	6	1326650	1326655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582466
27583	NC_015865	TTCC	2	8	1326707	1326714	0 %	50 %	0 %	50 %	341582466
27584	NC_015865	GAG	2	6	1326794	1326799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582467
27585	NC_015865	CGT	2	6	1326895	1326900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582467
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27587	NC_015865	TCC	2	6	1327005	1327010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
27588	NC_015865	CCT	2	6	1327066	1327071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
27589	NC_015865	CGA	2	6	1327090	1327095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582467
27590	NC_015865	CCT	2	6	1327096	1327101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
27591	NC_015865	TCC	2	6	1327131	1327136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
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27593	NC_015865	TATCTC	2	12	1327163	1327174	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341582467
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27596	NC_015865	GAACTC	2	12	1327433	1327444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341582467
27597	NC_015865	TCT	2	6	1327450	1327455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582467
27598	NC_015865	TGAAC	2	10	1327504	1327513	40 %	20 %	20 %	20 %	341582467
27599	NC_015865	CAGG	2	8	1327576	1327583	25 %	0 %	50 %	25 %	341582467
27600	NC_015865	TCC	2	6	1327584	1327589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
27601	NC_015865	CCTT	2	8	1327660	1327667	0 %	50 %	0 %	50 %	341582467
27602	NC_015865	TCC	2	6	1327704	1327709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
27603	NC_015865	CGT	2	6	1327796	1327801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582468
27604	NC_015865	TGA	2	6	1327811	1327816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582468
27605	NC_015865	GTGA	2	8	1327817	1327824	25 %	25 %	50 %	0 %	341582468
27606	NC_015865	TCC	2	6	1327876	1327881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582468
27607	NC_015865	GGA	2	6	1327919	1327924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582468
27608	NC_015865	CGCCTC	2	12	1327978	1327989	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	341582468
27609	NC_015865	AGAA	2	8	1328014	1328021	75 %	0 %	25 %	0 %	341582468
27610	NC_015865	GCCA	2	8	1328050	1328057	25 %	0 %	25 %	50 %	341582468
27611	NC_015865	GAT	2	6	1328109	1328114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582468
27612	NC_015865	GAG	2	6	1328115	1328120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582468
27613	NC_015865	TCC	2	6	1328186	1328191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582469
27614	NC_015865	CCTC	2	8	1328367	1328374	0 %	25 %	0 %	75 %	341582469
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27616	NC_015865	GCGCC	2	10	1328520	1328529	0 %	0 %	40 %	60 %	341582469
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27965	NC_015865	TGA	2	6	1343322	1343327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582484
27966	NC_015865	CTG	2	6	1343449	1343454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582484
27967	NC_015865	AGC	2	6	1343495	1343500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582484
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27972	NC_015865	ATG	2	6	1343687	1343692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582484
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27976	NC_015865	CGA	2	6	1343817	1343822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582484
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27983	NC_015865	CCG	2	6	1344278	1344283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27984	NC_015865	CAC	2	6	1344402	1344407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582485
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27991	NC_015865	A	6	6	1344724	1344729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27995	NC_015865	CTCG	2	8	1344927	1344934	0 %	25 %	25 %	50 %	341582486
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