MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_015865	GGC	2	6	1276580	1276585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582420
26503	NC_015865	CGC	2	6	1276599	1276604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582420
26504	NC_015865	CTC	2	6	1276620	1276625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582420
26505	NC_015865	GAA	2	6	1276634	1276639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582420
26506	NC_015865	CCT	2	6	1276640	1276645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582420
26507	NC_015865	CCA	2	6	1276664	1276669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582420
26508	NC_015865	CTT	2	6	1276752	1276757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582420
26509	NC_015865	TCA	2	6	1276769	1276774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582420
26510	NC_015865	GTC	2	6	1276782	1276787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582420
26511	NC_015865	GAG	2	6	1276818	1276823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582420
26512	NC_015865	TCC	2	6	1276852	1276857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582420
26513	NC_015865	GAG	2	6	1276929	1276934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582420
26514	NC_015865	CTGC	2	8	1276943	1276950	0 %	25 %	25 %	50 %	341582420
26515	NC_015865	GTA	2	6	1277007	1277012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582420
26516	NC_015865	TCCG	2	8	1277099	1277106	0 %	25 %	25 %	50 %	341582420
26517	NC_015865	GTC	2	6	1277112	1277117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582420
26518	NC_015865	GCT	2	6	1277129	1277134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582420
26519	NC_015865	CCT	2	6	1277141	1277146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582420
26520	NC_015865	CTC	2	6	1277152	1277157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582420
26521	NC_015865	TC	3	6	1277235	1277240	0 %	50 %	0 %	50 %	341582420
26522	NC_015865	TCC	2	6	1277266	1277271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582420
26523	NC_015865	CCT	2	6	1277326	1277331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26524	NC_015865	TCA	2	6	1277429	1277434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582421
26525	NC_015865	CAT	2	6	1277463	1277468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582421
26526	NC_015865	TCA	2	6	1277579	1277584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582421
26527	NC_015865	CCG	2	6	1277600	1277605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582421
26528	NC_015865	CGG	2	6	1277630	1277635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582421
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26530	NC_015865	CGG	2	6	1277660	1277665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582421
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26532	NC_015865	TCC	2	6	1277932	1277937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582421
26533	NC_015865	AGG	2	6	1277941	1277946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582421
26534	NC_015865	ATG	2	6	1277980	1277985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582421
26535	NC_015865	GAG	2	6	1278106	1278111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582422
26536	NC_015865	GCG	2	6	1278114	1278119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582422
26537	NC_015865	CGT	2	6	1278127	1278132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582422
26538	NC_015865	ATT	2	6	1278176	1278181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582422
26539	NC_015865	GAGG	2	8	1278253	1278260	25 %	0 %	75 %	0 %	341582422
26540	NC_015865	GGA	2	6	1278360	1278365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582422
26541	NC_015865	CGA	2	6	1278396	1278401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582422
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26543	NC_015865	AGAA	2	8	1278647	1278654	75 %	0 %	25 %	0 %	341582422
26544	NC_015865	AGG	2	6	1278659	1278664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582422
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26547	NC_015865	TGAGGA	2	12	1278741	1278752	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341582422
26548	NC_015865	CGT	2	6	1278762	1278767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582422
26549	NC_015865	CGA	2	6	1278768	1278773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582422
26550	NC_015865	CGG	2	6	1278777	1278782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582422
26551	NC_015865	TCG	2	6	1278789	1278794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582422
26552	NC_015865	CCT	2	6	1278814	1278819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582422
26553	NC_015865	TCG	2	6	1278855	1278860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582422
26554	NC_015865	TCA	2	6	1278864	1278869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582422
26555	NC_015865	ACC	2	6	1278962	1278967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582422
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26557	NC_015865	GCTC	2	8	1279002	1279009	0 %	25 %	25 %	50 %	341582422
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26562	NC_015865	GAG	2	6	1279235	1279240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582423
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26569	NC_015865	TAAG	2	8	1279622	1279629	50 %	25 %	25 %	0 %	341582423
26570	NC_015865	TATGGC	2	12	1279685	1279696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341582423
26571	NC_015865	CT	3	6	1279728	1279733	0 %	50 %	0 %	50 %	341582423
26572	NC_015865	CCT	2	6	1279747	1279752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582423
26573	NC_015865	GAG	3	9	1279769	1279777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582423
26574	NC_015865	ATG	2	6	1279878	1279883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582423
26575	NC_015865	CGT	2	6	1279891	1279896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582423
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26584	NC_015865	GAC	2	6	1280168	1280173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582423
26585	NC_015865	CCA	2	6	1280212	1280217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582423
26586	NC_015865	CAG	2	6	1280222	1280227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582423
26587	NC_015865	GAG	2	6	1280252	1280257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582423
26588	NC_015865	GGC	2	6	1280267	1280272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582423
26589	NC_015865	AAGCC	2	10	1280277	1280286	40 %	0 %	20 %	40 %	341582423
26590	NC_015865	ATC	2	6	1280358	1280363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26596	NC_015865	GGA	2	6	1280653	1280658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582424
26597	NC_015865	TGA	2	6	1280671	1280676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582424
26598	NC_015865	TTC	2	6	1280720	1280725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582424
26599	NC_015865	TCC	2	6	1280844	1280849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582424
26600	NC_015865	TCC	2	6	1280851	1280856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582424
26601	NC_015865	ATT	2	6	1280886	1280891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582424
26602	NC_015865	TCT	2	6	1280896	1280901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582424
26603	NC_015865	TC	3	6	1280923	1280928	0 %	50 %	0 %	50 %	341582424
26604	NC_015865	T	6	6	1281000	1281005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26605	NC_015865	GGC	2	6	1281232	1281237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582425
26606	NC_015865	CGG	2	6	1281327	1281332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582425
26607	NC_015865	GGC	2	6	1281370	1281375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582425
26608	NC_015865	GAGC	2	8	1281381	1281388	25 %	0 %	50 %	25 %	341582425
26609	NC_015865	CGA	2	6	1281393	1281398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582425
26610	NC_015865	GGA	2	6	1281486	1281491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582425
26611	NC_015865	GGC	2	6	1281513	1281518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582425
26612	NC_015865	GTGAAG	2	12	1281670	1281681	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341582425
26613	NC_015865	GAA	2	6	1281687	1281692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582425
26614	NC_015865	TCG	2	6	1281722	1281727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582425
26615	NC_015865	GCGGA	2	10	1281740	1281749	20 %	0 %	60 %	20 %	341582425
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