MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_015865	CTC	2	6	1251980	1251985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582393
26003	NC_015865	TTG	2	6	1251998	1252003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582393
26004	NC_015865	ACC	3	9	1252028	1252036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582393
26005	NC_015865	CCA	2	6	1252161	1252166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582393
26006	NC_015865	TCC	2	6	1252181	1252186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582393
26007	NC_015865	CCTGA	2	10	1252228	1252237	20 %	20 %	20 %	40 %	341582393
26008	NC_015865	CTC	2	6	1252246	1252251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582393
26009	NC_015865	CTG	2	6	1252303	1252308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582393
26010	NC_015865	GCC	2	6	1252336	1252341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582393
26011	NC_015865	ACG	2	6	1252352	1252357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582393
26012	NC_015865	CCG	2	6	1252373	1252378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582393
26013	NC_015865	A	6	6	1252487	1252492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26014	NC_015865	TCC	2	6	1252566	1252571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582394
26015	NC_015865	TCG	2	6	1252616	1252621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582394
26016	NC_015865	CTT	2	6	1252633	1252638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582394
26017	NC_015865	CGC	2	6	1252665	1252670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582394
26018	NC_015865	TTC	2	6	1252733	1252738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582394
26019	NC_015865	AGA	2	6	1252755	1252760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582394
26020	NC_015865	CGTAGG	2	12	1252827	1252838	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341582394
26021	NC_015865	GGT	2	6	1252926	1252931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582394
26022	NC_015865	GGA	2	6	1252962	1252967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582394
26023	NC_015865	G	6	6	1253066	1253071	0 %	0 %	100 %	0 %	341582395
26024	NC_015865	GTA	2	6	1253140	1253145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582395
26025	NC_015865	GAG	2	6	1253197	1253202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582395
26026	NC_015865	AGG	2	6	1253252	1253257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582395
26027	NC_015865	GAG	2	6	1253266	1253271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582395
26028	NC_015865	GCCA	2	8	1253279	1253286	25 %	0 %	25 %	50 %	341582395
26029	NC_015865	TGAA	2	8	1253321	1253328	50 %	25 %	25 %	0 %	341582395
26030	NC_015865	GA	3	6	1253333	1253338	50 %	0 %	50 %	0 %	341582395
26031	NC_015865	GTA	2	6	1253419	1253424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582395
26032	NC_015865	ACC	2	6	1253510	1253515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582395
26033	NC_015865	AG	3	6	1253574	1253579	50 %	0 %	50 %	0 %	341582395
26034	NC_015865	GCA	2	6	1253583	1253588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582395
26035	NC_015865	TTTCC	2	10	1253643	1253652	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26036	NC_015865	AGC	2	6	1253703	1253708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582396
26037	NC_015865	TC	3	6	1253732	1253737	0 %	50 %	0 %	50 %	341582396
26038	NC_015865	CGAAG	2	10	1253749	1253758	40 %	0 %	40 %	20 %	341582396
26039	NC_015865	TCG	2	6	1253788	1253793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582396
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26041	NC_015865	TCG	2	6	1253829	1253834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582396
26042	NC_015865	TAG	2	6	1253835	1253840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582396
26043	NC_015865	CGT	2	6	1253944	1253949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582396
26044	NC_015865	TC	3	6	1254089	1254094	0 %	50 %	0 %	50 %	341582396
26045	NC_015865	TAGA	2	8	1254110	1254117	50 %	25 %	25 %	0 %	341582396
26046	NC_015865	GCA	2	6	1254131	1254136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582396
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26048	NC_015865	A	6	6	1254212	1254217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26049	NC_015865	CGA	2	6	1254255	1254260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26050	NC_015865	A	7	7	1254298	1254304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26051	NC_015865	CCG	2	6	1254342	1254347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582397
26052	NC_015865	GAG	2	6	1254353	1254358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582397
26053	NC_015865	AAG	2	6	1254359	1254364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582397
26054	NC_015865	GGA	2	6	1254376	1254381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582397
26055	NC_015865	GGA	2	6	1254388	1254393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582397
26056	NC_015865	TCG	2	6	1254477	1254482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582397
26057	NC_015865	CGG	2	6	1254547	1254552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582397
26058	NC_015865	CTG	2	6	1254620	1254625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582397
26059	NC_015865	ATA	2	6	1254638	1254643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582397
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26066	NC_015865	A	7	7	1254979	1254985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26067	NC_015865	TC	3	6	1254994	1254999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26068	NC_015865	C	6	6	1255045	1255050	0 %	0 %	0 %	100 %	341582398
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26089	NC_015865	GTG	2	6	1256160	1256165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26092	NC_015865	TTC	2	6	1256336	1256341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582400
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26099	NC_015865	TCCC	2	8	1256651	1256658	0 %	25 %	0 %	75 %	341582400
26100	NC_015865	GCC	2	6	1256663	1256668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582400
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26110	NC_015865	TTC	2	6	1257335	1257340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582400
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26113	NC_015865	TCA	2	6	1257413	1257418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582400
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26115	NC_015865	CGT	2	6	1257597	1257602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582400
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26117	NC_015865	CAT	2	6	1257634	1257639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582400
26118	NC_015865	GAT	2	6	1257640	1257645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582400
26119	NC_015865	GAT	2	6	1257651	1257656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582400
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26225	NC_015865	GAAG	2	8	1262430	1262437	50 %	0 %	50 %	0 %	341582405
26226	NC_015865	AACG	2	8	1262440	1262447	50 %	0 %	25 %	25 %	341582405
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26228	NC_015865	GAA	2	6	1262563	1262568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582405
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26230	NC_015865	GAT	2	6	1262881	1262886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582405
26231	NC_015865	GA	3	6	1262936	1262941	50 %	0 %	50 %	0 %	341582405
26232	NC_015865	TGC	2	6	1263043	1263048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582405
26233	NC_015865	CCA	2	6	1263057	1263062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582405
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26353	NC_015865	CTG	2	6	1268232	1268237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582410
26354	NC_015865	A	6	6	1268245	1268250	100 %	0 %	0 %	0 %	341582410
26355	NC_015865	CTA	2	6	1268395	1268400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582410
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26469	NC_015865	GTT	2	6	1274842	1274847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582417
26470	NC_015865	AT	3	6	1274857	1274862	50 %	50 %	0 %	0 %	341582417
26471	NC_015865	TAAAGA	2	12	1274907	1274918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341582417
26472	NC_015865	GACCAA	2	12	1274976	1274987	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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26474	NC_015865	TGG	2	6	1275094	1275099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26475	NC_015865	TAC	2	6	1275124	1275129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26476	NC_015865	AGCCT	2	10	1275147	1275156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26477	NC_015865	CTA	2	6	1275175	1275180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26478	NC_015865	CTC	2	6	1275276	1275281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582418
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26481	NC_015865	AAG	2	6	1275544	1275549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26483	NC_015865	TA	3	6	1275613	1275618	50 %	50 %	0 %	0 %	341582419
26484	NC_015865	GGA	2	6	1275679	1275684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582419
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26500	NC_015865	GCC	4	12	1276425	1276436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582420

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