MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_015865	GAA	2	6	99043	99048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581165
2003	NC_015865	CAA	2	6	99091	99096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581165
2004	NC_015865	CCG	2	6	99108	99113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581165
2005	NC_015865	GA	3	6	99137	99142	50 %	0 %	50 %	0 %	341581165
2006	NC_015865	GGA	2	6	99193	99198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581165
2007	NC_015865	GA	3	6	99227	99232	50 %	0 %	50 %	0 %	341581165
2008	NC_015865	AG	3	6	99280	99285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_015865	TTC	2	6	99315	99320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_015865	CAA	2	6	99450	99455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581166
2011	NC_015865	TCA	2	6	99499	99504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581166
2012	NC_015865	ACA	2	6	99543	99548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581166
2013	NC_015865	GAT	2	6	99661	99666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581166
2014	NC_015865	GAC	2	6	99674	99679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581166
2015	NC_015865	AAG	2	6	99734	99739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581166
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2017	NC_015865	AGC	2	6	99762	99767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581166
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2031	NC_015865	TTTC	2	8	100332	100339	0 %	75 %	0 %	25 %	341581167
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2124	NC_015865	TGG	2	6	104277	104282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581174
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2249	NC_015865	ACC	2	6	109999	110004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581184
2250	NC_015865	CTC	2	6	110007	110012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581184
2251	NC_015865	GAG	2	6	110031	110036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581184
2252	NC_015865	GAG	2	6	110109	110114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581184
2253	NC_015865	ATA	2	6	110121	110126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581184
2254	NC_015865	GCC	2	6	110178	110183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581184
2255	NC_015865	AAG	2	6	110226	110231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581184
2256	NC_015865	ACCT	2	8	110244	110251	25 %	25 %	0 %	50 %	341581184
2257	NC_015865	GAG	2	6	110304	110309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581184
2258	NC_015865	AAG	2	6	110337	110342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581184
2259	NC_015865	CCG	2	6	110383	110388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581184
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2261	NC_015865	ACG	2	6	110473	110478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581184
2262	NC_015865	CAT	2	6	110627	110632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581184
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2264	NC_015865	AGCG	2	8	110755	110762	25 %	0 %	50 %	25 %	341581185
2265	NC_015865	CTC	2	6	110801	110806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581185
2266	NC_015865	CTG	2	6	110810	110815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581185
2267	NC_015865	TGACGC	3	18	110842	110859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581185
2268	NC_015865	CTC	2	6	110876	110881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581185
2269	NC_015865	GAG	3	9	110897	110905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581185
2270	NC_015865	GGA	2	6	111094	111099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581185
2271	NC_015865	GTC	2	6	111113	111118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581185
2272	NC_015865	GAG	2	6	111203	111208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581185
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2275	NC_015865	TCA	3	9	111411	111419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581185
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2278	NC_015865	TCG	2	6	111546	111551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581185
2279	NC_015865	GGC	2	6	111571	111576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581185
2280	NC_015865	CGATG	2	10	111577	111586	20 %	20 %	40 %	20 %	341581185
2281	NC_015865	TCT	2	6	111703	111708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581186
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2283	NC_015865	AGG	2	6	111908	111913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581186
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2285	NC_015865	ACCC	2	8	112012	112019	25 %	0 %	0 %	75 %	341581186
2286	NC_015865	GGA	2	6	112063	112068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581186
2287	NC_015865	GTC	2	6	112083	112088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581186
2288	NC_015865	ACG	2	6	112210	112215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581186
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2295	NC_015865	GGT	2	6	112590	112595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2314	NC_015865	CTG	3	9	113296	113304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581188
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2320	NC_015865	TCC	2	6	113644	113649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581188
2321	NC_015865	ACTTGG	2	12	113697	113708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581188
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2324	NC_015865	TGA	2	6	113961	113966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581188
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2336	NC_015865	ATGG	2	8	114512	114519	25 %	25 %	50 %	0 %	341581188
2337	NC_015865	TC	3	6	114522	114527	0 %	50 %	0 %	50 %	341581188
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2349	NC_015865	AGCGC	2	10	115384	115393	20 %	0 %	40 %	40 %	341581189
2350	NC_015865	CTC	2	6	115436	115441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581189
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2352	NC_015865	CCTC	2	8	115492	115499	0 %	25 %	0 %	75 %	341581189
2353	NC_015865	CCG	2	6	115528	115533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581189
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2360	NC_015865	TAT	2	6	115787	115792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581189
2361	NC_015865	GAC	2	6	115859	115864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581189
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2363	NC_015865	GC	3	6	116111	116116	0 %	0 %	50 %	50 %	341581190
2364	NC_015865	GGC	2	6	116117	116122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581190
2365	NC_015865	GAAC	2	8	116127	116134	50 %	0 %	25 %	25 %	341581190
2366	NC_015865	AAG	2	6	116162	116167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581190
2367	NC_015865	TTC	2	6	116255	116260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581190
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2369	NC_015865	ACC	2	6	116390	116395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581190
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2487	NC_015865	AT	3	6	121567	121572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2489	NC_015865	GGT	2	6	121634	121639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2490	NC_015865	CAT	2	6	121652	121657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581195
2491	NC_015865	GAA	2	6	121660	121665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581195
2492	NC_015865	CCA	2	6	121693	121698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581195
2493	NC_015865	TGT	2	6	121742	121747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581195
2494	NC_015865	GAA	2	6	121754	121759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581195
2495	NC_015865	GGGC	2	8	121808	121815	0 %	0 %	75 %	25 %	341581195
2496	NC_015865	C	6	6	121839	121844	0 %	0 %	0 %	100 %	341581195
2497	NC_015865	TCG	2	6	121867	121872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581195
2498	NC_015865	GTC	2	6	121884	121889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581195
2499	NC_015865	ACG	2	6	121936	121941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581195
2500	NC_015865	AAC	2	6	122028	122033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581195

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