MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_015865	GGA	2	6	1159568	1159573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24002	NC_015865	TCG	2	6	1159612	1159617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582308
24003	NC_015865	GCTC	2	8	1159618	1159625	0 %	25 %	25 %	50 %	341582308
24004	NC_015865	GAA	2	6	1159628	1159633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582308
24005	NC_015865	GAG	2	6	1159710	1159715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24006	NC_015865	ACG	2	6	1159834	1159839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582308
24007	NC_015865	ACG	2	6	1159924	1159929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582308
24008	NC_015865	AGA	2	6	1160083	1160088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582308
24009	NC_015865	CGAGGC	2	12	1160150	1160161	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	341582308
24010	NC_015865	CTGGG	2	10	1160220	1160229	0 %	20 %	60 %	20 %	341582308
24011	NC_015865	TTC	3	9	1160289	1160297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582308
24012	NC_015865	GAG	2	6	1160336	1160341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24013	NC_015865	GGA	2	6	1160390	1160395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24014	NC_015865	GAG	2	6	1160417	1160422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24015	NC_015865	GAGG	2	8	1160450	1160457	25 %	0 %	75 %	0 %	341582308
24016	NC_015865	GCA	2	6	1160494	1160499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582308
24017	NC_015865	AGG	2	6	1160526	1160531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24018	NC_015865	TTC	2	6	1160568	1160573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582308
24019	NC_015865	GAA	2	6	1160600	1160605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582308
24020	NC_015865	AGG	2	6	1160628	1160633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24021	NC_015865	TCG	2	6	1160665	1160670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582308
24022	NC_015865	GAA	2	6	1160693	1160698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582308
24023	NC_015865	GAA	2	6	1160714	1160719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582308
24024	NC_015865	G	6	6	1160725	1160730	0 %	0 %	100 %	0 %	341582308
24025	NC_015865	AGG	2	6	1160782	1160787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582308
24026	NC_015865	AG	3	6	1160805	1160810	50 %	0 %	50 %	0 %	341582308
24027	NC_015865	TCA	2	6	1160944	1160949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24028	NC_015865	ATCC	2	8	1160981	1160988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24029	NC_015865	GCGA	2	8	1161002	1161009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24030	NC_015865	CAT	2	6	1161011	1161016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24031	NC_015865	CAA	2	6	1161049	1161054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24032	NC_015865	GCC	2	6	1161241	1161246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582309
24033	NC_015865	GAC	2	6	1161252	1161257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582309
24034	NC_015865	CGCC	2	8	1161311	1161318	0 %	0 %	25 %	75 %	341582309
24035	NC_015865	AGG	2	6	1161332	1161337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582309
24036	NC_015865	AAT	2	6	1161434	1161439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582309
24037	NC_015865	CG	3	6	1161491	1161496	0 %	0 %	50 %	50 %	341582309
24038	NC_015865	GAG	2	6	1161537	1161542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582309
24039	NC_015865	GTA	2	6	1161549	1161554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582309
24040	NC_015865	GTA	2	6	1161639	1161644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582309
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24044	NC_015865	GA	3	6	1161785	1161790	50 %	0 %	50 %	0 %	341582309
24045	NC_015865	TC	3	6	1161808	1161813	0 %	50 %	0 %	50 %	341582309
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24053	NC_015865	GAG	2	6	1162071	1162076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582309
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24055	NC_015865	AGG	2	6	1162300	1162305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582309
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24057	NC_015865	ATC	2	6	1162398	1162403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582309
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24061	NC_015865	TCCTC	2	10	1162715	1162724	0 %	40 %	0 %	60 %	341582309
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24065	NC_015865	GAG	2	6	1163024	1163029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582310
24066	NC_015865	TCA	2	6	1163061	1163066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582310
24067	NC_015865	ACG	2	6	1163097	1163102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582310
24068	NC_015865	GAG	2	6	1163144	1163149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582310
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24071	NC_015865	TCC	2	6	1163261	1163266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24072	NC_015865	GA	4	8	1163449	1163456	50 %	0 %	50 %	0 %	341582311
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24101	NC_015865	AAG	2	6	1165042	1165047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582312
24102	NC_015865	CAACCA	2	12	1165083	1165094	50 %	0 %	0 %	50 %	341582312
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24106	NC_015865	AGC	2	6	1165234	1165239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582312
24107	NC_015865	GAC	2	6	1165255	1165260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582312
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24112	NC_015865	ACC	2	6	1165537	1165542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24113	NC_015865	CCA	2	6	1165544	1165549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24114	NC_015865	CCG	2	6	1165587	1165592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24115	NC_015865	AGA	2	6	1165597	1165602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24116	NC_015865	TGC	2	6	1165712	1165717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582313
24117	NC_015865	GTG	2	6	1165743	1165748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582313
24118	NC_015865	CGTCAC	2	12	1165769	1165780	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582313
24119	NC_015865	GTAG	2	8	1165815	1165822	25 %	25 %	50 %	0 %	341582313
24120	NC_015865	CAT	2	6	1165847	1165852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582313
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24130	NC_015865	CTGG	2	8	1166354	1166361	0 %	25 %	50 %	25 %	341582313
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24137	NC_015865	G	6	6	1166778	1166783	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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24145	NC_015865	A	6	6	1166991	1166996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24146	NC_015865	GA	3	6	1167013	1167018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24147	NC_015865	GCTC	2	8	1167112	1167119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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24149	NC_015865	CTTCG	2	10	1167162	1167171	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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24233	NC_015865	AGG	2	6	1171480	1171485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582315
24234	NC_015865	TCCC	2	8	1171495	1171502	0 %	25 %	0 %	75 %	341582315
24235	NC_015865	GAG	2	6	1171567	1171572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582316
24236	NC_015865	AGG	2	6	1171598	1171603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582316
24237	NC_015865	AAT	2	6	1171607	1171612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582316
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24242	NC_015865	GAAG	2	8	1171884	1171891	50 %	0 %	50 %	0 %	341582316
24243	NC_015865	TC	3	6	1171929	1171934	0 %	50 %	0 %	50 %	341582316
24244	NC_015865	AG	3	6	1171972	1171977	50 %	0 %	50 %	0 %	341582316
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24249	NC_015865	GCAA	2	8	1172139	1172146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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24253	NC_015865	ATC	2	6	1172344	1172349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582317
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24270	NC_015865	ATA	2	6	1173326	1173331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24302	NC_015865	CCCG	2	8	1174888	1174895	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24303	NC_015865	AGA	2	6	1174896	1174901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24337	NC_015865	GGC	2	6	1176932	1176937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582321
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24339	NC_015865	GTC	2	6	1177025	1177030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582321
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24343	NC_015865	CTG	2	6	1177386	1177391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582321
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24346	NC_015865	TGG	2	6	1177564	1177569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582321
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24349	NC_015865	GTA	2	6	1177655	1177660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582321
24350	NC_015865	GCA	2	6	1177731	1177736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582321
24351	NC_015865	CCA	2	6	1177741	1177746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582321
24352	NC_015865	CCT	2	6	1177789	1177794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24353	NC_015865	TA	3	6	1177863	1177868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24354	NC_015865	A	6	6	1177876	1177881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24355	NC_015865	GGA	2	6	1177895	1177900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582322
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24368	NC_015865	CGT	2	6	1178664	1178669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582322
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24373	NC_015865	CGA	2	6	1179089	1179094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582322
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24377	NC_015865	TGA	2	6	1179257	1179262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24378	NC_015865	TGAAGA	2	12	1179273	1179284	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24435	NC_015865	CGGC	2	8	1182334	1182341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24436	NC_015865	CAA	2	6	1182398	1182403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24438	NC_015865	AT	5	10	1182425	1182434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24439	NC_015865	GAT	2	6	1182442	1182447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24440	NC_015865	GAA	2	6	1182486	1182491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582325
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24442	NC_015865	GGA	2	6	1182559	1182564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582325
24443	NC_015865	ACC	2	6	1182610	1182615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582325
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24447	NC_015865	GTC	2	6	1182703	1182708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582325
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24450	NC_015865	TGA	2	6	1182927	1182932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582325
24451	NC_015865	AGG	2	6	1182977	1182982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582325
24452	NC_015865	ACT	2	6	1183001	1183006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582325
24453	NC_015865	ACA	2	6	1183046	1183051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582325
24454	NC_015865	GAGC	2	8	1183062	1183069	25 %	0 %	50 %	25 %	341582325
24455	NC_015865	CGA	2	6	1183083	1183088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582325
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24457	NC_015865	CGA	2	6	1183206	1183211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582325
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24460	NC_015865	GAT	3	9	1183350	1183358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582325
24461	NC_015865	AAG	2	6	1183387	1183392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582325
24462	NC_015865	CGT	2	6	1183410	1183415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582325
24463	NC_015865	CGG	2	6	1183493	1183498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582325
24464	NC_015865	AGG	2	6	1183511	1183516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582325
24465	NC_015865	CAC	2	6	1183542	1183547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582325
24466	NC_015865	TCA	2	6	1183559	1183564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582325
24467	NC_015865	CAG	3	9	1183795	1183803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582325
24468	NC_015865	ACA	2	6	1183811	1183816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582325
24469	NC_015865	CCTG	2	8	1183902	1183909	0 %	25 %	25 %	50 %	341582326
24470	NC_015865	AAT	2	6	1183944	1183949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582326
24471	NC_015865	CGA	2	6	1184064	1184069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582326
24472	NC_015865	GTG	2	6	1184107	1184112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582326
24473	NC_015865	ACA	2	6	1184162	1184167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582326
24474	NC_015865	GCT	2	6	1184229	1184234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582326
24475	NC_015865	TCA	2	6	1184408	1184413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582326
24476	NC_015865	CGG	2	6	1184414	1184419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582326
24477	NC_015865	GGC	2	6	1184451	1184456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582326
24478	NC_015865	ATA	2	6	1184458	1184463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582326
24479	NC_015865	ACT	2	6	1184474	1184479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582326
24480	NC_015865	TCC	2	6	1184501	1184506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582326
24481	NC_015865	CCA	2	6	1184534	1184539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582326
24482	NC_015865	GCG	2	6	1184551	1184556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582326
24483	NC_015865	AGCC	2	8	1184649	1184656	25 %	0 %	25 %	50 %	341582326
24484	NC_015865	GATAAT	2	12	1184679	1184690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341582326
24485	NC_015865	AGG	2	6	1184747	1184752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582326
24486	NC_015865	GAT	2	6	1184762	1184767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582326
24487	NC_015865	GTC	2	6	1184787	1184792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582327
24488	NC_015865	CTG	2	6	1184811	1184816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582327
24489	NC_015865	TCA	2	6	1184833	1184838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582327
24490	NC_015865	CTA	2	6	1184852	1184857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582327
24491	NC_015865	TCG	2	6	1184863	1184868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582327
24492	NC_015865	CAT	2	6	1184912	1184917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582327
24493	NC_015865	CTG	2	6	1185042	1185047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582327
24494	NC_015865	ACG	3	9	1185205	1185213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582327
24495	NC_015865	ATA	2	6	1185231	1185236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582327
24496	NC_015865	CGT	2	6	1185302	1185307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582327
24497	NC_015865	TTC	2	6	1185366	1185371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582327
24498	NC_015865	TCA	2	6	1185391	1185396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582327
24499	NC_015865	TGC	2	6	1185412	1185417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582327
24500	NC_015865	TCG	2	6	1185430	1185435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582327

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