MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_015865	GAC	2	6	1136042	1136047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582289
23502	NC_015865	TGA	2	6	1136058	1136063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582289
23503	NC_015865	CTG	2	6	1136192	1136197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582289
23504	NC_015865	ATA	2	6	1136207	1136212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582289
23505	NC_015865	AAGG	2	8	1136254	1136261	50 %	0 %	50 %	0 %	341582289
23506	NC_015865	TGG	2	6	1136286	1136291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582289
23507	NC_015865	CCT	2	6	1136329	1136334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582289
23508	NC_015865	GGA	2	6	1136344	1136349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582289
23509	NC_015865	GA	3	6	1136348	1136353	50 %	0 %	50 %	0 %	341582289
23510	NC_015865	ATG	2	6	1136474	1136479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582289
23511	NC_015865	GGA	2	6	1136503	1136508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582289
23512	NC_015865	GAG	2	6	1136527	1136532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582289
23513	NC_015865	CAG	2	6	1136575	1136580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582289
23514	NC_015865	CGA	2	6	1136674	1136679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582289
23515	NC_015865	GGGC	2	8	1136706	1136713	0 %	0 %	75 %	25 %	341582289
23516	NC_015865	CCT	2	6	1136719	1136724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582289
23517	NC_015865	CGC	2	6	1136728	1136733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582289
23518	NC_015865	CGA	2	6	1136776	1136781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582289
23519	NC_015865	GGC	2	6	1136937	1136942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582290
23520	NC_015865	CCGG	2	8	1136977	1136984	0 %	0 %	50 %	50 %	341582290
23521	NC_015865	ATG	3	9	1137001	1137009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582290
23522	NC_015865	AGGA	2	8	1137307	1137314	50 %	0 %	50 %	0 %	341582290
23523	NC_015865	GAG	2	6	1137325	1137330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582290
23524	NC_015865	GAG	2	6	1137457	1137462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582290
23525	NC_015865	CGA	2	6	1137483	1137488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582290
23526	NC_015865	CAT	2	6	1137531	1137536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582290
23527	NC_015865	GTC	2	6	1137697	1137702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582290
23528	NC_015865	GTG	2	6	1137721	1137726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582290
23529	NC_015865	CGG	2	6	1137743	1137748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582290
23530	NC_015865	GAG	2	6	1137784	1137789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582290
23531	NC_015865	GCC	2	6	1137798	1137803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582290
23532	NC_015865	AGG	2	6	1137862	1137867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582290
23533	NC_015865	GGC	2	6	1137894	1137899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582290
23534	NC_015865	TGG	2	6	1137932	1137937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582290
23535	NC_015865	ATC	2	6	1137964	1137969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582290
23536	NC_015865	GGC	2	6	1137972	1137977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582290
23537	NC_015865	CCCAA	2	10	1138021	1138030	40 %	0 %	0 %	60 %	341582290
23538	NC_015865	CAGA	2	8	1138040	1138047	50 %	0 %	25 %	25 %	341582290
23539	NC_015865	GGAT	2	8	1138126	1138133	25 %	25 %	50 %	0 %	341582290
23540	NC_015865	GGT	2	6	1138173	1138178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582290
23541	NC_015865	GTC	2	6	1138202	1138207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582291
23542	NC_015865	CGC	2	6	1138214	1138219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582291
23543	NC_015865	GTG	2	6	1138221	1138226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582291
23544	NC_015865	TCC	2	6	1138243	1138248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582291
23545	NC_015865	TGG	2	6	1138297	1138302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582291
23546	NC_015865	CTACGC	2	12	1138307	1138318	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582291
23547	NC_015865	CAC	3	9	1138328	1138336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582291
23548	NC_015865	GCG	2	6	1138362	1138367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582291
23549	NC_015865	GGC	2	6	1138376	1138381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582291
23550	NC_015865	CGA	2	6	1138415	1138420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582291
23551	NC_015865	GCG	2	6	1138482	1138487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582291
23552	NC_015865	CGG	2	6	1138522	1138527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582291
23553	NC_015865	CCA	2	6	1138541	1138546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582291
23554	NC_015865	GGGCT	2	10	1138577	1138586	0 %	20 %	60 %	20 %	341582291
23555	NC_015865	CTC	2	6	1138599	1138604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582291
23556	NC_015865	TGG	2	6	1138651	1138656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582291
23557	NC_015865	GAG	3	9	1138731	1138739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582291
23558	NC_015865	TCC	2	6	1138907	1138912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582292
23559	NC_015865	G	6	6	1138949	1138954	0 %	0 %	100 %	0 %	341582292
23560	NC_015865	GCG	2	6	1139071	1139076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582292
23561	NC_015865	CTG	2	6	1139104	1139109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582292
23562	NC_015865	CCT	2	6	1139112	1139117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582292
23563	NC_015865	GCG	2	6	1139120	1139125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582292
23564	NC_015865	CGTT	2	8	1139126	1139133	0 %	50 %	25 %	25 %	341582292
23565	NC_015865	CAT	2	6	1139184	1139189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582292
23566	NC_015865	GCA	3	9	1139216	1139224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582292
23567	NC_015865	ATA	2	6	1139230	1139235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582292
23568	NC_015865	GCT	2	6	1139243	1139248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582292
23569	NC_015865	TCC	2	6	1139297	1139302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582292
23570	NC_015865	CGGA	2	8	1139312	1139319	25 %	0 %	50 %	25 %	341582292
23571	NC_015865	AG	3	6	1139320	1139325	50 %	0 %	50 %	0 %	341582292
23572	NC_015865	CTC	2	6	1139338	1139343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582292
23573	NC_015865	TCAC	2	8	1139436	1139443	25 %	25 %	0 %	50 %	341582292
23574	NC_015865	ATG	2	6	1139455	1139460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582292
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23576	NC_015865	A	6	6	1139526	1139531	100 %	0 %	0 %	0 %	341582292
23577	NC_015865	GA	3	6	1139537	1139542	50 %	0 %	50 %	0 %	341582292
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23581	NC_015865	CCG	2	6	1139623	1139628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582293
23582	NC_015865	AAG	2	6	1139629	1139634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582293
23583	NC_015865	TCA	3	9	1139689	1139697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582293
23584	NC_015865	ACATC	2	10	1139711	1139720	40 %	20 %	0 %	40 %	341582293
23585	NC_015865	ATA	3	9	1139730	1139738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582293
23586	NC_015865	CAA	2	6	1139855	1139860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582293
23587	NC_015865	TGA	2	6	1139957	1139962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582293
23588	NC_015865	CTG	2	6	1139980	1139985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582293
23589	NC_015865	TCCC	2	8	1140095	1140102	0 %	25 %	0 %	75 %	341582293
23590	NC_015865	GAA	2	6	1140186	1140191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582293
23591	NC_015865	CGTA	2	8	1140194	1140201	25 %	25 %	25 %	25 %	341582293
23592	NC_015865	GTC	2	6	1140267	1140272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582293
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23595	NC_015865	TCA	3	9	1140452	1140460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582293
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23597	NC_015865	TCA	2	6	1140488	1140493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23598	NC_015865	TGT	2	6	1140504	1140509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23599	NC_015865	ACC	2	6	1140533	1140538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23600	NC_015865	AAAT	2	8	1140541	1140548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23601	NC_015865	GAAA	2	8	1140558	1140565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23602	NC_015865	A	6	6	1140568	1140573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23603	NC_015865	CGG	2	6	1140608	1140613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23604	NC_015865	TGGA	2	8	1140670	1140677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23605	NC_015865	ATC	2	6	1140711	1140716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582294
23606	NC_015865	ATC	2	6	1140726	1140731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582294
23607	NC_015865	CCT	2	6	1140737	1140742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582294
23608	NC_015865	CTT	2	6	1140800	1140805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582294
23609	NC_015865	GTA	2	6	1140900	1140905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582294
23610	NC_015865	TCGGCC	2	12	1140913	1140924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	341582294
23611	NC_015865	AG	3	6	1141071	1141076	50 %	0 %	50 %	0 %	341582294
23612	NC_015865	CAT	2	6	1141136	1141141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582294
23613	NC_015865	CATC	2	8	1141144	1141151	25 %	25 %	0 %	50 %	341582294
23614	NC_015865	ACCC	2	8	1141173	1141180	25 %	0 %	0 %	75 %	341582294
23615	NC_015865	GGTC	2	8	1141259	1141266	0 %	25 %	50 %	25 %	341582294
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23617	NC_015865	ACA	2	6	1141357	1141362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582294
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23969	NC_015865	GCCT	2	8	1158123	1158130	0 %	25 %	25 %	50 %	341582305
23970	NC_015865	GGT	2	6	1158152	1158157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582305
23971	NC_015865	GAG	2	6	1158207	1158212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582305
23972	NC_015865	GAGT	2	8	1158231	1158238	25 %	25 %	50 %	0 %	341582305
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23975	NC_015865	AAG	2	6	1158342	1158347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23977	NC_015865	CT	3	6	1158432	1158437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23978	NC_015865	ATT	2	6	1158441	1158446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23979	NC_015865	ATGA	2	8	1158486	1158493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23980	NC_015865	TCTA	2	8	1158525	1158532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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23999	NC_015865	GACG	2	8	1159511	1159518	25 %	0 %	50 %	25 %	341582308
24000	NC_015865	TGA	2	6	1159543	1159548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582308

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