MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_015865	CGGT	2	8	1111967	1111974	0 %	25 %	50 %	25 %	341582267
23002	NC_015865	ATG	2	6	1112035	1112040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582267
23003	NC_015865	CAA	2	6	1112085	1112090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23004	NC_015865	CGG	3	9	1112097	1112105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23005	NC_015865	ACC	2	6	1112128	1112133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23006	NC_015865	ATT	2	6	1112188	1112193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23007	NC_015865	ACC	2	6	1112206	1112211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23008	NC_015865	GAC	2	6	1112217	1112222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23009	NC_015865	ACACC	2	10	1112225	1112234	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23010	NC_015865	AC	3	6	1112299	1112304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23011	NC_015865	GAG	2	6	1112462	1112467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582268
23012	NC_015865	GAG	2	6	1112507	1112512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582268
23013	NC_015865	CGA	2	6	1112566	1112571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582268
23014	NC_015865	AGG	2	6	1112597	1112602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582268
23015	NC_015865	GAA	2	6	1112614	1112619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582268
23016	NC_015865	GAG	2	6	1112630	1112635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582268
23017	NC_015865	CTA	2	6	1112650	1112655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582268
23018	NC_015865	CTC	2	6	1112717	1112722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582268
23019	NC_015865	GAG	3	9	1112729	1112737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582268
23020	NC_015865	GAA	2	6	1112743	1112748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582268
23021	NC_015865	ACG	2	6	1112793	1112798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582268
23022	NC_015865	GC	3	6	1112836	1112841	0 %	0 %	50 %	50 %	341582268
23023	NC_015865	GAA	2	6	1112872	1112877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582268
23024	NC_015865	CCT	2	6	1112890	1112895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582268
23025	NC_015865	CGG	2	6	1112937	1112942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582268
23026	NC_015865	GAGG	2	8	1112974	1112981	25 %	0 %	75 %	0 %	341582268
23027	NC_015865	CGAGAT	2	12	1112983	1112994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341582268
23028	NC_015865	GAG	2	6	1113035	1113040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582268
23029	NC_015865	CGA	2	6	1113097	1113102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582268
23030	NC_015865	GAC	2	6	1113215	1113220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582268
23031	NC_015865	CTT	2	6	1113229	1113234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582268
23032	NC_015865	GGA	2	6	1113271	1113276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582268
23033	NC_015865	GAT	2	6	1113450	1113455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582269
23034	NC_015865	CGGC	2	8	1113456	1113463	0 %	0 %	50 %	50 %	341582269
23035	NC_015865	GTTCA	2	10	1113465	1113474	20 %	40 %	20 %	20 %	341582269
23036	NC_015865	A	6	6	1113489	1113494	100 %	0 %	0 %	0 %	341582269
23037	NC_015865	GAT	2	6	1113531	1113536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582269
23038	NC_015865	CCGCGG	2	12	1113542	1113553	0 %	0 %	50 %	50 %	341582269
23039	NC_015865	CCG	2	6	1113614	1113619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582269
23040	NC_015865	GAT	2	6	1113675	1113680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582269
23041	NC_015865	GC	3	6	1113719	1113724	0 %	0 %	50 %	50 %	341582269
23042	NC_015865	CGC	2	6	1113738	1113743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582269
23043	NC_015865	CTAC	2	8	1113761	1113768	25 %	25 %	0 %	50 %	341582269
23044	NC_015865	GCT	2	6	1113771	1113776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582269
23045	NC_015865	GGA	2	6	1113782	1113787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582269
23046	NC_015865	CGG	2	6	1113812	1113817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582269
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23049	NC_015865	GGA	2	6	1113893	1113898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582269
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23051	NC_015865	GGCCTG	2	12	1114000	1114011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	341582269
23052	NC_015865	CCG	2	6	1114040	1114045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582269
23053	NC_015865	GTT	2	6	1114159	1114164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582269
23054	NC_015865	GAG	2	6	1114183	1114188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582269
23055	NC_015865	GCG	2	6	1114189	1114194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582269
23056	NC_015865	TCG	2	6	1114265	1114270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582269
23057	NC_015865	GCC	2	6	1114342	1114347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582269
23058	NC_015865	T	6	6	1114366	1114371	0 %	100 %	0 %	0 %	341582269
23059	NC_015865	GAG	2	6	1114399	1114404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582269
23060	NC_015865	ATG	2	6	1114435	1114440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582269
23061	NC_015865	TTCC	2	8	1114446	1114453	0 %	50 %	0 %	50 %	341582269
23062	NC_015865	TGG	2	6	1114454	1114459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582269
23063	NC_015865	GAGG	2	8	1114506	1114513	25 %	0 %	75 %	0 %	341582269
23064	NC_015865	CTC	2	6	1114519	1114524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582269
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23066	NC_015865	AAG	2	6	1114659	1114664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582269
23067	NC_015865	CGT	2	6	1114781	1114786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582270
23068	NC_015865	CTC	2	6	1114797	1114802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582270
23069	NC_015865	CGA	2	6	1114832	1114837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582270
23070	NC_015865	TCG	2	6	1114918	1114923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582270
23071	NC_015865	GTCG	2	8	1114938	1114945	0 %	25 %	50 %	25 %	341582270
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23074	NC_015865	CTC	2	6	1115082	1115087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582271
23075	NC_015865	AGTG	2	8	1115108	1115115	25 %	25 %	50 %	0 %	341582271
23076	NC_015865	ATG	2	6	1115147	1115152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582271
23077	NC_015865	GGT	2	6	1115203	1115208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23078	NC_015865	TGG	2	6	1115218	1115223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23079	NC_015865	ATC	2	6	1115310	1115315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23081	NC_015865	AG	3	6	1115514	1115519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23082	NC_015865	GTC	2	6	1115618	1115623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23083	NC_015865	TTCC	2	8	1115719	1115726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23084	NC_015865	CA	3	6	1115853	1115858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23085	NC_015865	TGG	2	6	1115983	1115988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23086	NC_015865	GGCG	2	8	1116027	1116034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23087	NC_015865	CCGG	2	8	1116081	1116088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23088	NC_015865	ACC	2	6	1116141	1116146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23089	NC_015865	GAG	2	6	1116167	1116172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23090	NC_015865	TCGG	2	8	1116191	1116198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23091	NC_015865	CGG	2	6	1116202	1116207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23092	NC_015865	TAGA	2	8	1116226	1116233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23093	NC_015865	GCT	2	6	1116297	1116302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23094	NC_015865	AAC	2	6	1116333	1116338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23095	NC_015865	AAT	2	6	1116436	1116441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23096	NC_015865	GCA	2	6	1116630	1116635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582272
23097	NC_015865	GA	3	6	1116664	1116669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23098	NC_015865	GAG	2	6	1116715	1116720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23099	NC_015865	A	6	6	1116751	1116756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23100	NC_015865	GACGGG	2	12	1116922	1116933	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23101	NC_015865	GGA	2	6	1117300	1117305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23102	NC_015865	ATA	2	6	1117317	1117322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23103	NC_015865	GTACCT	2	12	1117352	1117363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23104	NC_015865	CTG	2	6	1117380	1117385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23105	NC_015865	G	6	6	1117429	1117434	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23106	NC_015865	CTG	2	6	1117446	1117451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23107	NC_015865	GCA	2	6	1117668	1117673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582273
23108	NC_015865	AAAG	2	8	1117708	1117715	75 %	0 %	25 %	0 %	341582273
23109	NC_015865	GAA	2	6	1117815	1117820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582273
23110	NC_015865	TGA	2	6	1117856	1117861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582273
23111	NC_015865	AC	3	6	1117862	1117867	50 %	0 %	0 %	50 %	341582273
23112	NC_015865	CCG	2	6	1117897	1117902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582273
23113	NC_015865	GAT	2	6	1117907	1117912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582273
23114	NC_015865	AGGGA	2	10	1117926	1117935	40 %	0 %	60 %	0 %	341582273
23115	NC_015865	CGT	2	6	1118036	1118041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582273
23116	NC_015865	GC	3	6	1118054	1118059	0 %	0 %	50 %	50 %	341582273
23117	NC_015865	GAT	2	6	1118084	1118089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582273
23118	NC_015865	CGG	2	6	1118128	1118133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582273
23119	NC_015865	CTC	2	6	1118153	1118158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582273
23120	NC_015865	CCA	2	6	1118191	1118196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582273
23121	NC_015865	TGG	2	6	1118363	1118368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582273
23122	NC_015865	CTC	2	6	1118408	1118413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582273
23123	NC_015865	GAT	2	6	1118423	1118428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582273
23124	NC_015865	ACGAT	2	10	1118449	1118458	40 %	20 %	20 %	20 %	341582273
23125	NC_015865	TGA	2	6	1118552	1118557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582273
23126	NC_015865	ACG	2	6	1118602	1118607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582273
23127	NC_015865	CTG	2	6	1118658	1118663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582273
23128	NC_015865	GAG	2	6	1118670	1118675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582273
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23132	NC_015865	CGC	2	6	1118910	1118915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582274
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23143	NC_015865	CGT	2	6	1119510	1119515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582274
23144	NC_015865	GAG	3	9	1119532	1119540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582274
23145	NC_015865	TCC	2	6	1119576	1119581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582274
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23147	NC_015865	GCT	2	6	1119705	1119710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582274
23148	NC_015865	GA	3	6	1119740	1119745	50 %	0 %	50 %	0 %	341582274
23149	NC_015865	TGC	2	6	1119746	1119751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582274
23150	NC_015865	GA	3	6	1119767	1119772	50 %	0 %	50 %	0 %	341582274
23151	NC_015865	AGAA	2	8	1119799	1119806	75 %	0 %	25 %	0 %	341582274
23152	NC_015865	GAA	2	6	1119831	1119836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582274
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23224	NC_015865	CAAA	2	8	1122961	1122968	75 %	0 %	0 %	25 %	341582277
23225	NC_015865	TAT	2	6	1122979	1122984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582277
23226	NC_015865	GCT	2	6	1122998	1123003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582277
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23228	NC_015865	GA	3	6	1123037	1123042	50 %	0 %	50 %	0 %	341582277
23229	NC_015865	CTC	2	6	1123065	1123070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582277
23230	NC_015865	A	7	7	1123090	1123096	100 %	0 %	0 %	0 %	341582277
23231	NC_015865	TAT	2	6	1123145	1123150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582277
23232	NC_015865	AT	3	6	1123218	1123223	50 %	50 %	0 %	0 %	341582277
23233	NC_015865	TAGT	2	8	1123329	1123336	25 %	50 %	25 %	0 %	341582277
23234	NC_015865	AGCAAA	2	12	1123412	1123423	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341582277
23235	NC_015865	AAT	2	6	1123472	1123477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582277
23236	NC_015865	A	6	6	1123603	1123608	100 %	0 %	0 %	0 %	341582277
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23238	NC_015865	A	7	7	1123708	1123714	100 %	0 %	0 %	0 %	341582277
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23240	NC_015865	GGA	2	6	1123806	1123811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582277
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23474	NC_015865	CTC	2	6	1135024	1135029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582288
23475	NC_015865	TCA	2	6	1135040	1135045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582288
23476	NC_015865	G	7	7	1135145	1135151	0 %	0 %	100 %	0 %	341582288
23477	NC_015865	CGT	2	6	1135158	1135163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582288
23478	NC_015865	GAG	2	6	1135252	1135257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582288
23479	NC_015865	CTC	2	6	1135297	1135302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582288
23480	NC_015865	GAC	2	6	1135309	1135314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582288
23481	NC_015865	CTT	2	6	1135386	1135391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582288
23482	NC_015865	CGA	2	6	1135401	1135406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582288
23483	NC_015865	CTC	2	6	1135441	1135446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582288
23484	NC_015865	AAT	2	6	1135488	1135493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582288
23485	NC_015865	GA	3	6	1135508	1135513	50 %	0 %	50 %	0 %	341582288
23486	NC_015865	CTG	2	6	1135564	1135569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582288
23487	NC_015865	TCA	2	6	1135598	1135603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582288
23488	NC_015865	TGGG	2	8	1135682	1135689	0 %	25 %	75 %	0 %	341582288
23489	NC_015865	CGA	2	6	1135704	1135709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582288
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23491	NC_015865	GCT	2	6	1135764	1135769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582288
23492	NC_015865	GCC	2	6	1135807	1135812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582288
23493	NC_015865	TCC	2	6	1135817	1135822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582288
23494	NC_015865	G	6	6	1135852	1135857	0 %	0 %	100 %	0 %	341582288
23495	NC_015865	GGC	2	6	1135865	1135870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582288
23496	NC_015865	GAG	2	6	1135906	1135911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582288
23497	NC_015865	GA	4	8	1135948	1135955	50 %	0 %	50 %	0 %	341582288
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23499	NC_015865	GAT	2	6	1135990	1135995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582289
23500	NC_015865	TAG	2	6	1136031	1136036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582289

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