MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015865	CCTT	2	8	920784	920791	0 %	50 %	0 %	50 %	341582051
19002	NC_015865	CCCT	2	8	920829	920836	0 %	25 %	0 %	75 %	341582051
19003	NC_015865	CTC	2	6	920847	920852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582051
19004	NC_015865	GGC	2	6	920888	920893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582051
19005	NC_015865	TGC	2	6	921005	921010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582052
19006	NC_015865	CGG	2	6	921029	921034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582052
19007	NC_015865	TCCT	2	8	921148	921155	0 %	50 %	0 %	50 %	341582052
19008	NC_015865	GAC	3	9	921162	921170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582052
19009	NC_015865	CCTTC	2	10	921201	921210	0 %	40 %	0 %	60 %	341582052
19010	NC_015865	CCT	3	9	921255	921263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582052
19011	NC_015865	ACG	2	6	921280	921285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582052
19012	NC_015865	GAC	2	6	921297	921302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582052
19013	NC_015865	TGT	2	6	921314	921319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582052
19014	NC_015865	CTT	2	6	921399	921404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582052
19015	NC_015865	CT	3	6	921430	921435	0 %	50 %	0 %	50 %	341582053
19016	NC_015865	CTC	2	6	921552	921557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582053
19017	NC_015865	CTT	2	6	921578	921583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582053
19018	NC_015865	GGTAGT	2	12	921586	921597	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	341582053
19019	NC_015865	CGA	3	9	921607	921615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582053
19020	NC_015865	TCT	2	6	921619	921624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582053
19021	NC_015865	GAC	3	9	921638	921646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582053
19022	NC_015865	CAATC	2	10	921734	921743	40 %	20 %	0 %	40 %	341582053
19023	NC_015865	TC	4	8	921742	921749	0 %	50 %	0 %	50 %	341582053
19024	NC_015865	CTT	2	6	921763	921768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582054
19025	NC_015865	ATCTC	2	10	921771	921780	20 %	40 %	0 %	40 %	341582054
19026	NC_015865	CCG	2	6	921881	921886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582054
19027	NC_015865	CTCGT	2	10	921902	921911	0 %	40 %	20 %	40 %	341582054
19028	NC_015865	GAT	2	6	921994	921999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582054
19029	NC_015865	CTT	2	6	922059	922064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582054
19030	NC_015865	CCTTC	2	10	922098	922107	0 %	40 %	0 %	60 %	341582054
19031	NC_015865	CCG	2	6	922117	922122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582054
19032	NC_015865	CTT	2	6	922143	922148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582055
19033	NC_015865	ATC	2	6	922155	922160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582055
19034	NC_015865	CTG	2	6	922245	922250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582055
19035	NC_015865	CCT	2	6	922262	922267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582055
19036	NC_015865	CTT	2	6	922338	922343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582056
19037	NC_015865	GC	3	6	922356	922361	0 %	0 %	50 %	50 %	341582056
19038	NC_015865	CTT	2	6	922464	922469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582056
19039	NC_015865	ATG	2	6	922586	922591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582057
19040	NC_015865	GCCTG	2	10	922623	922632	0 %	20 %	40 %	40 %	341582057
19041	NC_015865	GGC	2	6	922795	922800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582057
19042	NC_015865	CCT	2	6	922801	922806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582057
19043	NC_015865	CCTCGA	2	12	922884	922895	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582057
19044	NC_015865	GCC	2	6	922957	922962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582057
19045	NC_015865	GGC	2	6	922987	922992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582057
19046	NC_015865	TCT	2	6	923022	923027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582057
19047	NC_015865	TCG	2	6	923078	923083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582057
19048	NC_015865	TGA	2	6	923109	923114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582057
19049	NC_015865	TC	3	6	923119	923124	0 %	50 %	0 %	50 %	341582057
19050	NC_015865	CCT	2	6	923142	923147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582058
19051	NC_015865	GGT	2	6	923175	923180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582058
19052	NC_015865	GTT	2	6	923304	923309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582058
19053	NC_015865	GAG	2	6	923319	923324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582058
19054	NC_015865	CTT	2	6	923328	923333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582058
19055	NC_015865	TACC	2	8	923359	923366	25 %	25 %	0 %	50 %	341582058
19056	NC_015865	CGT	2	6	923447	923452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582058
19057	NC_015865	CGT	2	6	923468	923473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582058
19058	NC_015865	CAT	2	6	923478	923483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582058
19059	NC_015865	GAG	2	6	923499	923504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582058
19060	NC_015865	TCT	2	6	923558	923563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582058
19061	NC_015865	ACC	2	6	923614	923619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19062	NC_015865	GAC	2	6	923680	923685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582059
19063	NC_015865	ATC	2	6	923723	923728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582059
19064	NC_015865	TCC	2	6	923729	923734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582059
19065	NC_015865	CTG	2	6	923816	923821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582059
19066	NC_015865	TTG	2	6	923837	923842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582059
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19068	NC_015865	GAG	2	6	923875	923880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582059
19069	NC_015865	CTT	2	6	923881	923886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582059
19070	NC_015865	CTC	3	9	923915	923923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582059
19071	NC_015865	GAG	2	6	923935	923940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582059
19072	NC_015865	CTT	2	6	924007	924012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582059
19073	NC_015865	TCA	2	6	924024	924029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582060
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19076	NC_015865	GACC	2	8	924062	924069	25 %	0 %	25 %	50 %	341582060
19077	NC_015865	TTCC	2	8	924070	924077	0 %	50 %	0 %	50 %	341582060
19078	NC_015865	ACC	2	6	924129	924134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582060
19079	NC_015865	GGT	2	6	924140	924145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582060
19080	NC_015865	GTA	2	6	924207	924212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582060
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19082	NC_015865	CTG	2	6	924346	924351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582060
19083	NC_015865	ACG	2	6	924352	924357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582060
19084	NC_015865	CCG	2	6	924370	924375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582060
19085	NC_015865	GCC	2	6	924390	924395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582060
19086	NC_015865	CGA	2	6	924509	924514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582060
19087	NC_015865	ATG	2	6	924532	924537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582060
19088	NC_015865	CGA	2	6	924608	924613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582060
19089	NC_015865	CGA	2	6	924620	924625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582060
19090	NC_015865	TCT	2	6	924629	924634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582060
19091	NC_015865	CCTCT	2	10	924715	924724	0 %	40 %	0 %	60 %	341582060
19092	NC_015865	TCAC	2	8	924748	924755	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19093	NC_015865	ATCCT	2	10	924768	924777	20 %	40 %	0 %	40 %	341582061
19094	NC_015865	GCA	2	6	924779	924784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582061
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19098	NC_015865	TGG	2	6	924915	924920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582061
19099	NC_015865	GTTCTC	2	12	924949	924960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	341582061
19100	NC_015865	GAC	2	6	924985	924990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582061
19101	NC_015865	TC	3	6	925020	925025	0 %	50 %	0 %	50 %	341582061
19102	NC_015865	CT	3	6	925049	925054	0 %	50 %	0 %	50 %	341582062
19103	NC_015865	GGGT	2	8	925088	925095	0 %	25 %	75 %	0 %	341582062
19104	NC_015865	GAC	2	6	925135	925140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582062
19105	NC_015865	GGT	2	6	925152	925157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582062
19106	NC_015865	ACG	3	9	925193	925201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582062
19107	NC_015865	CTT	2	6	925216	925221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582062
19108	NC_015865	CTTACC	2	12	925240	925251	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	341582062
19109	NC_015865	TTC	2	6	925268	925273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582062
19110	NC_015865	GTC	2	6	925288	925293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582062
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19113	NC_015865	GAC	2	6	925363	925368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582062
19114	NC_015865	GCG	2	6	925436	925441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582062
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19116	NC_015865	TCC	2	6	925484	925489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582062
19117	NC_015865	GGGT	2	8	925514	925521	0 %	25 %	75 %	0 %	341582062
19118	NC_015865	GGC	2	6	925552	925557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582062
19119	NC_015865	CCCTG	2	10	925650	925659	0 %	20 %	20 %	60 %	341582062
19120	NC_015865	TGA	2	6	925701	925706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582062
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19122	NC_015865	AACCTT	2	12	925780	925791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582062
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19134	NC_015865	TCT	2	6	926302	926307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582063
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19160	NC_015865	T	6	6	927732	927737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19161	NC_015865	GCAAA	2	10	927738	927747	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19162	NC_015865	CTTCGC	2	12	927748	927759	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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19217	NC_015865	CAG	2	6	930720	930725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582069
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19228	NC_015865	TC	3	6	931254	931259	0 %	50 %	0 %	50 %	341582069
19229	NC_015865	CCA	2	6	931280	931285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582069
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19231	NC_015865	GCCC	2	8	931331	931338	0 %	0 %	25 %	75 %	341582069
19232	NC_015865	AGG	2	6	931378	931383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582069
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19235	NC_015865	CAT	2	6	931575	931580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582069
19236	NC_015865	CT	3	6	931613	931618	0 %	50 %	0 %	50 %	341582069
19237	NC_015865	GAG	3	9	931785	931793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582069
19238	NC_015865	ACC	2	6	931824	931829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19239	NC_015865	CCG	2	6	931968	931973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19240	NC_015865	CCG	2	6	932067	932072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582070
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19361	NC_015865	CCT	2	6	938173	938178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582078
19362	NC_015865	AGT	2	6	938248	938253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582078
19363	NC_015865	CGT	2	6	938308	938313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582078
19364	NC_015865	ATC	2	6	938442	938447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582078
19365	NC_015865	GGC	2	6	938493	938498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582078
19366	NC_015865	TTG	3	9	938595	938603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582078
19367	NC_015865	GCTTC	2	10	938746	938755	0 %	40 %	20 %	40 %	341582078
19368	NC_015865	CTC	2	6	938768	938773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582078
19369	NC_015865	CCT	2	6	938791	938796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582078
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19372	NC_015865	TTC	2	6	938886	938891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582078
19373	NC_015865	GTC	3	9	938933	938941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582078
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19379	NC_015865	CTTTGA	2	12	939232	939243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341582078
19380	NC_015865	TGA	2	6	939310	939315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582078
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19383	NC_015865	CGTT	2	8	939411	939418	0 %	50 %	25 %	25 %	341582078
19384	NC_015865	CGG	2	6	939441	939446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582078
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19390	NC_015865	GTA	2	6	939872	939877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582078
19391	NC_015865	GGCC	3	12	939889	939900	0 %	0 %	50 %	50 %	341582078
19392	NC_015865	CTC	2	6	939901	939906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582078
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19400	NC_015865	TGG	2	6	940333	940338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582078
19401	NC_015865	GGA	2	6	940417	940422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582078
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19403	NC_015865	C	6	6	940495	940500	0 %	0 %	0 %	100 %	341582079
19404	NC_015865	GCAG	2	8	940560	940567	25 %	0 %	50 %	25 %	341582079
19405	NC_015865	TGA	2	6	940676	940681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582079
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19408	NC_015865	GAC	2	6	940998	941003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582079
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19414	NC_015865	CGGCCT	2	12	941379	941390	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	341582079
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19416	NC_015865	CG	3	6	941528	941533	0 %	0 %	50 %	50 %	341582079
19417	NC_015865	CCT	2	6	941556	941561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582079
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19443	NC_015865	AGA	2	6	942771	942776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19474	NC_015865	GCT	2	6	944343	944348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582082
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19481	NC_015865	CGT	2	6	944697	944702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582082
19482	NC_015865	CT	3	6	944765	944770	0 %	50 %	0 %	50 %	341582082
19483	NC_015865	ATG	2	6	944787	944792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582082
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