MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_015865	TGG	2	6	849376	849381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581963
17502	NC_015865	CCT	2	6	849407	849412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581963
17503	NC_015865	CTG	2	6	849484	849489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17504	NC_015865	CGGC	2	8	849491	849498	0 %	0 %	50 %	50 %	341581963
17505	NC_015865	TGT	2	6	849545	849550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581963
17506	NC_015865	TCT	2	6	849728	849733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
17507	NC_015865	CTG	2	6	849750	849755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17508	NC_015865	GAA	2	6	849758	849763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581963
17509	NC_015865	TCG	2	6	849776	849781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17510	NC_015865	GCA	2	6	849833	849838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17511	NC_015865	ATG	3	9	849868	849876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581963
17512	NC_015865	CTT	2	6	849939	849944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
17513	NC_015865	GGC	2	6	849957	849962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581963
17514	NC_015865	AGG	2	6	850012	850017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581963
17515	NC_015865	C	6	6	850042	850047	0 %	0 %	0 %	100 %	341581963
17516	NC_015865	GGA	2	6	850115	850120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581963
17517	NC_015865	TCC	2	6	850124	850129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581963
17518	NC_015865	GAC	2	6	850200	850205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17519	NC_015865	CTT	2	6	850278	850283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
17520	NC_015865	GACG	2	8	850305	850312	25 %	0 %	50 %	25 %	341581963
17521	NC_015865	TCCGCC	2	12	850336	850347	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	341581963
17522	NC_015865	TCC	2	6	850369	850374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581963
17523	NC_015865	GAG	2	6	850389	850394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581963
17524	NC_015865	CCTCG	2	10	850536	850545	0 %	20 %	20 %	60 %	341581963
17525	NC_015865	TTA	2	6	850562	850567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581963
17526	NC_015865	GTA	2	6	850583	850588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581963
17527	NC_015865	CGA	2	6	850595	850600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17528	NC_015865	TC	3	6	850604	850609	0 %	50 %	0 %	50 %	341581963
17529	NC_015865	AGA	2	6	850637	850642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581964
17530	NC_015865	TCC	2	6	850652	850657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581964
17531	NC_015865	TGG	2	6	850731	850736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581964
17532	NC_015865	CGG	2	6	850839	850844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581964
17533	NC_015865	ACC	2	6	850926	850931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581964
17534	NC_015865	GGCCAG	2	12	851089	851100	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	341581964
17535	NC_015865	GTC	2	6	851104	851109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581964
17536	NC_015865	AGA	2	6	851115	851120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581964
17537	NC_015865	TACA	2	8	851196	851203	50 %	25 %	0 %	25 %	341581964
17538	NC_015865	ACA	2	6	851244	851249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17539	NC_015865	CTG	2	6	851253	851258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17540	NC_015865	AGA	2	6	851274	851279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_015865	GTG	2	6	851352	851357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_015865	ATA	2	6	851369	851374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581965
17543	NC_015865	CTC	2	6	851375	851380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581965
17544	NC_015865	GCC	2	6	851386	851391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581965
17545	NC_015865	CTA	2	6	851455	851460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
17546	NC_015865	CCA	2	6	851545	851550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581965
17547	NC_015865	TGA	2	6	851556	851561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581965
17548	NC_015865	GAAGCG	2	12	851661	851672	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341581965
17549	NC_015865	CAC	2	6	851683	851688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581965
17550	NC_015865	ATA	2	6	851723	851728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581965
17551	NC_015865	CGA	2	6	851734	851739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581965
17552	NC_015865	TCAG	2	8	851747	851754	25 %	25 %	25 %	25 %	341581965
17553	NC_015865	CAT	2	6	851761	851766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
17554	NC_015865	CAC	2	6	851821	851826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581965
17555	NC_015865	GAA	2	6	851884	851889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581965
17556	NC_015865	TCC	2	6	851913	851918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581965
17557	NC_015865	GAG	3	9	852017	852025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581965
17558	NC_015865	TAC	2	6	852026	852031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
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17560	NC_015865	TGG	2	6	852104	852109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581965
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17562	NC_015865	ATCAAA	2	12	852161	852172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341581965
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17565	NC_015865	TCG	2	6	852252	852257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581965
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17567	NC_015865	GGC	2	6	852367	852372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581965
17568	NC_015865	TAC	2	6	852383	852388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
17569	NC_015865	GAG	2	6	852445	852450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581965
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17572	NC_015865	GAA	2	6	852533	852538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581966
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17574	NC_015865	CTA	2	6	852608	852613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581966
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17578	NC_015865	GAA	2	6	852947	852952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17579	NC_015865	CTT	2	6	852957	852962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581967
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17583	NC_015865	TCT	2	6	853085	853090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581967
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17600	NC_015865	ACGG	2	8	853614	853621	25 %	0 %	50 %	25 %	341581967
17601	NC_015865	CGA	2	6	853658	853663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581967
17602	NC_015865	GGC	2	6	853678	853683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581967
17603	NC_015865	TGA	2	6	853691	853696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581967
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17605	NC_015865	CAT	2	6	853743	853748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581967
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17608	NC_015865	TA	3	6	853830	853835	50 %	50 %	0 %	0 %	341581967
17609	NC_015865	ATA	2	6	853888	853893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581967
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17615	NC_015865	ACC	2	6	854218	854223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17616	NC_015865	AT	3	6	854264	854269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17618	NC_015865	CGA	2	6	854336	854341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17981	NC_015865	CTTGG	2	10	870871	870880	0 %	40 %	40 %	20 %	341581986
17982	NC_015865	CGGA	2	8	870908	870915	25 %	0 %	50 %	25 %	341581986
17983	NC_015865	GAC	2	6	870997	871002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581986
17984	NC_015865	GTC	2	6	871003	871008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581986
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17992	NC_015865	ACGAGC	2	12	871482	871493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581987
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17999	NC_015865	G	6	6	872216	872221	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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