MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015865	CTC	2	6	824067	824072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581945
17002	NC_015865	TCC	2	6	824098	824103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581945
17003	NC_015865	TCC	2	6	824125	824130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581945
17004	NC_015865	GCT	2	6	824218	824223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581945
17005	NC_015865	CGA	2	6	824237	824242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581945
17006	NC_015865	TCT	2	6	824276	824281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17007	NC_015865	CTT	2	6	824284	824289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_015865	TGAA	2	8	824304	824311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_015865	TCC	2	6	824332	824337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17010	NC_015865	TAAAC	2	10	824354	824363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17011	NC_015865	AG	3	6	824401	824406	50 %	0 %	50 %	0 %	341581946
17012	NC_015865	ACCGCT	2	12	824440	824451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581946
17013	NC_015865	GGT	2	6	824470	824475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581946
17014	NC_015865	CGG	2	6	824507	824512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
17015	NC_015865	CCT	2	6	824537	824542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581946
17016	NC_015865	G	6	6	824550	824555	0 %	0 %	100 %	0 %	341581946
17017	NC_015865	GC	3	6	824611	824616	0 %	0 %	50 %	50 %	341581946
17018	NC_015865	GGA	2	6	824650	824655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581946
17019	NC_015865	GCTCA	2	10	824727	824736	20 %	20 %	20 %	40 %	341581946
17020	NC_015865	GAG	2	6	824804	824809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581946
17021	NC_015865	GGGT	2	8	824868	824875	0 %	25 %	75 %	0 %	341581946
17022	NC_015865	GAT	2	6	824981	824986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581946
17023	NC_015865	CGT	2	6	825041	825046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
17024	NC_015865	GCG	2	6	825147	825152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
17025	NC_015865	CTC	2	6	825180	825185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581946
17026	NC_015865	GAGG	2	8	825203	825210	25 %	0 %	75 %	0 %	341581946
17027	NC_015865	G	6	6	825281	825286	0 %	0 %	100 %	0 %	341581946
17028	NC_015865	GAAG	2	8	825290	825297	50 %	0 %	50 %	0 %	341581946
17029	NC_015865	GCT	2	6	825314	825319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
17030	NC_015865	TGC	2	6	825373	825378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
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17032	NC_015865	CGT	2	6	825506	825511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
17033	NC_015865	CGG	2	6	825517	825522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
17034	NC_015865	ATC	2	6	825560	825565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581946
17035	NC_015865	GCG	2	6	825579	825584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
17036	NC_015865	G	6	6	825609	825614	0 %	0 %	100 %	0 %	341581946
17037	NC_015865	CTG	2	6	825624	825629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
17038	NC_015865	AG	3	6	825641	825646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_015865	GAA	2	6	825728	825733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581947
17040	NC_015865	GTG	2	6	825744	825749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581947
17041	NC_015865	CGA	2	6	825805	825810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581947
17042	NC_015865	GAG	2	6	825821	825826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581947
17043	NC_015865	ATA	2	6	825881	825886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581947
17044	NC_015865	CGT	2	6	825925	825930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581947
17045	NC_015865	CCCT	2	8	825933	825940	0 %	25 %	0 %	75 %	341581947
17046	NC_015865	CGGG	2	8	826078	826085	0 %	0 %	75 %	25 %	341581947
17047	NC_015865	GCCT	2	8	826105	826112	0 %	25 %	25 %	50 %	341581947
17048	NC_015865	CGG	2	6	826144	826149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581947
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17050	NC_015865	G	6	6	826636	826641	0 %	0 %	100 %	0 %	341581947
17051	NC_015865	CCCTGA	2	12	826699	826710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581947
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17053	NC_015865	CGGG	2	8	826783	826790	0 %	0 %	75 %	25 %	341581947
17054	NC_015865	TCC	2	6	826806	826811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581947
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17057	NC_015865	CTT	2	6	826907	826912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581947
17058	NC_015865	CG	3	6	826915	826920	0 %	0 %	50 %	50 %	341581947
17059	NC_015865	ACC	2	6	826959	826964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581947
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17061	NC_015865	TGG	2	6	827019	827024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17063	NC_015865	CCA	2	6	827077	827082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581948
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17065	NC_015865	CTTT	2	8	827201	827208	0 %	75 %	0 %	25 %	341581948
17066	NC_015865	CG	3	6	827393	827398	0 %	0 %	50 %	50 %	341581948
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17072	NC_015865	CCT	2	6	827632	827637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581948
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17088	NC_015865	CGGG	2	8	828571	828578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17089	NC_015865	GAA	2	6	828617	828622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17090	NC_015865	TCC	2	6	828656	828661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581950
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17110	NC_015865	AG	3	6	830068	830073	50 %	0 %	50 %	0 %	341581950
17111	NC_015865	TCT	2	6	830109	830114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581950
17112	NC_015865	TCGAG	2	10	830124	830133	20 %	20 %	40 %	20 %	341581950
17113	NC_015865	TAGC	2	8	830195	830202	25 %	25 %	25 %	25 %	341581950
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17122	NC_015865	CAA	2	6	830634	830639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581950
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17241	NC_015865	GTT	2	6	836694	836699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581953
17242	NC_015865	TCC	2	6	836731	836736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581953
17243	NC_015865	TGGCAT	2	12	836788	836799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581953
17244	NC_015865	GAT	2	6	836810	836815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581953
17245	NC_015865	CAG	2	6	836817	836822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581953
17246	NC_015865	GGGA	2	8	836846	836853	25 %	0 %	75 %	0 %	341581953
17247	NC_015865	CTC	2	6	836889	836894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581953
17248	NC_015865	TAC	2	6	836913	836918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581953
17249	NC_015865	ACC	2	6	836919	836924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581953
17250	NC_015865	TTC	2	6	836955	836960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581953
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17253	NC_015865	CGGG	2	8	837089	837096	0 %	0 %	75 %	25 %	341581953
17254	NC_015865	GTACAC	2	12	837104	837115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341581953
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17259	NC_015865	AAG	2	6	837329	837334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581953
17260	NC_015865	CTG	2	6	837380	837385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581954
17261	NC_015865	ACG	2	6	837414	837419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581954
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17264	NC_015865	GGA	2	6	837454	837459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581954
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17275	NC_015865	GCTG	2	8	838164	838171	0 %	25 %	50 %	25 %	341581954
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17278	NC_015865	GCC	2	6	838400	838405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581954
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17283	NC_015865	TGC	2	6	838563	838568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581954
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17285	NC_015865	CAT	2	6	838618	838623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581954
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17289	NC_015865	TCG	2	6	838925	838930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581955
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17353	NC_015865	TCTA	2	8	841237	841244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17354	NC_015865	ATGG	2	8	841304	841311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17355	NC_015865	CG	3	6	841367	841372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17356	NC_015865	ATC	2	6	841396	841401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581956
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17479	NC_015865	CAGC	2	8	848107	848114	25 %	0 %	25 %	50 %	341581962
17480	NC_015865	CCGTA	2	10	848151	848160	20 %	20 %	20 %	40 %	341581962
17481	NC_015865	ACG	2	6	848220	848225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581962
17482	NC_015865	GGC	2	6	848249	848254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581962
17483	NC_015865	CCA	2	6	848293	848298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581962
17484	NC_015865	TGA	2	6	848392	848397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581962
17485	NC_015865	C	6	6	848448	848453	0 %	0 %	0 %	100 %	341581962
17486	NC_015865	GAA	2	6	848607	848612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581962
17487	NC_015865	CAC	2	6	848651	848656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17488	NC_015865	GTT	2	6	848697	848702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581963
17489	NC_015865	CTT	2	6	848727	848732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
17490	NC_015865	CTCC	2	8	848832	848839	0 %	25 %	0 %	75 %	341581963
17491	NC_015865	GTTGAC	2	12	848883	848894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581963
17492	NC_015865	CGA	2	6	848918	848923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17493	NC_015865	CT	3	6	848942	848947	0 %	50 %	0 %	50 %	341581963
17494	NC_015865	TTC	2	6	849001	849006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
17495	NC_015865	GCT	2	6	849020	849025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17496	NC_015865	CCG	2	6	849046	849051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581963
17497	NC_015865	ATG	2	6	849100	849105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581963
17498	NC_015865	CTG	2	6	849196	849201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
17499	NC_015865	CTC	2	6	849294	849299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581963
17500	NC_015865	CAT	2	6	849306	849311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581963

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