MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015865	GTT	2	6	775452	775457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_015865	CGCCT	2	10	775558	775567	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16003	NC_015865	AGGCT	2	10	775672	775681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16004	NC_015865	T	6	6	775732	775737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_015865	CGG	2	6	775744	775749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_015865	GTG	2	6	775782	775787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_015865	GAT	2	6	775791	775796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581888
16008	NC_015865	CGT	2	6	775977	775982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581888
16009	NC_015865	GAA	2	6	775994	775999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581888
16010	NC_015865	AGG	2	6	776000	776005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_015865	CCT	2	6	776057	776062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581889
16012	NC_015865	CGG	2	6	776076	776081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581889
16013	NC_015865	CGAAGT	2	12	776174	776185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341581889
16014	NC_015865	TTC	2	6	776188	776193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581889
16015	NC_015865	CTC	2	6	776296	776301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581889
16016	NC_015865	CTC	2	6	776322	776327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581889
16017	NC_015865	CCT	2	6	776429	776434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581889
16018	NC_015865	GTA	2	6	776457	776462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581889
16019	NC_015865	TCA	2	6	776576	776581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581889
16020	NC_015865	TCG	2	6	776593	776598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581889
16021	NC_015865	TCT	3	9	776651	776659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581889
16022	NC_015865	GTT	2	6	776679	776684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581889
16023	NC_015865	TC	3	6	776712	776717	0 %	50 %	0 %	50 %	341581889
16024	NC_015865	GCCA	2	8	776753	776760	25 %	0 %	25 %	50 %	341581889
16025	NC_015865	TCC	2	6	776761	776766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581889
16026	NC_015865	G	6	6	776823	776828	0 %	0 %	100 %	0 %	341581889
16027	NC_015865	GCTCGG	2	12	776832	776843	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	341581889
16028	NC_015865	TGT	2	6	776852	776857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581889
16029	NC_015865	AGG	2	6	776869	776874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581889
16030	NC_015865	CGG	2	6	776906	776911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581889
16031	NC_015865	TTC	2	6	776950	776955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581889
16032	NC_015865	TC	3	6	776960	776965	0 %	50 %	0 %	50 %	341581889
16033	NC_015865	CTA	2	6	776969	776974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581889
16034	NC_015865	CCTC	2	8	776978	776985	0 %	25 %	0 %	75 %	341581889
16035	NC_015865	GTA	2	6	777012	777017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581889
16036	NC_015865	CCTC	2	8	777050	777057	0 %	25 %	0 %	75 %	341581889
16037	NC_015865	CGG	2	6	777066	777071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581889
16038	NC_015865	CTT	2	6	777126	777131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581889
16039	NC_015865	GAC	2	6	777153	777158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581889
16040	NC_015865	CT	3	6	777188	777193	0 %	50 %	0 %	50 %	341581889
16041	NC_015865	GAG	2	6	777230	777235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_015865	AGT	2	6	777281	777286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_015865	AGCA	2	8	777307	777314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16044	NC_015865	GAT	2	6	777330	777335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_015865	TTA	2	6	777368	777373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_015865	CTG	2	6	777495	777500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581890
16047	NC_015865	TTC	2	6	777510	777515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581890
16048	NC_015865	CTC	2	6	777558	777563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581890
16049	NC_015865	CTC	2	6	777618	777623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581890
16050	NC_015865	G	6	6	777626	777631	0 %	0 %	100 %	0 %	341581890
16051	NC_015865	CTG	2	6	777740	777745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581891
16052	NC_015865	CTC	2	6	777851	777856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581891
16053	NC_015865	CGC	2	6	777865	777870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581891
16054	NC_015865	CGC	2	6	777913	777918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581891
16055	NC_015865	CTG	2	6	778025	778030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581891
16056	NC_015865	ACG	2	6	778100	778105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581891
16057	NC_015865	TCG	2	6	778191	778196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581891
16058	NC_015865	CGG	2	6	778222	778227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581891
16059	NC_015865	T	6	6	778239	778244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_015865	GA	3	6	778349	778354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_015865	AAG	2	6	778397	778402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581892
16062	NC_015865	AAG	2	6	778430	778435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581892
16063	NC_015865	GAG	2	6	778441	778446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581892
16064	NC_015865	CCGG	2	8	778517	778524	0 %	0 %	50 %	50 %	341581892
16065	NC_015865	AAG	2	6	778541	778546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581892
16066	NC_015865	TCAGGT	2	12	778554	778565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581892
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16070	NC_015865	GAG	2	6	778675	778680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581893
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16072	NC_015865	ACC	2	6	778745	778750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581893
16073	NC_015865	GCG	2	6	778767	778772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581893
16074	NC_015865	TCG	2	6	778779	778784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581893
16075	NC_015865	CGG	2	6	778792	778797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581893
16076	NC_015865	CCTTTC	2	12	778842	778853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16077	NC_015865	GGT	2	6	778932	778937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_015865	CGA	2	6	779034	779039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581894
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16080	NC_015865	AGA	2	6	779126	779131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581894
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16082	NC_015865	GC	3	6	779235	779240	0 %	0 %	50 %	50 %	341581894
16083	NC_015865	CCT	2	6	779256	779261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581894
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16085	NC_015865	GAG	3	9	779329	779337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581894
16086	NC_015865	CGC	2	6	779352	779357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581894
16087	NC_015865	CGC	2	6	779367	779372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581894
16088	NC_015865	TCA	2	6	779402	779407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581894
16089	NC_015865	CGA	2	6	779409	779414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581894
16090	NC_015865	GAG	2	6	779563	779568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581894
16091	NC_015865	ACT	2	6	779636	779641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581894
16092	NC_015865	GGA	2	6	779649	779654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581894
16093	NC_015865	GAG	2	6	779674	779679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581894
16094	NC_015865	GCGG	2	8	779701	779708	0 %	0 %	75 %	25 %	341581894
16095	NC_015865	AAGG	2	8	779724	779731	50 %	0 %	50 %	0 %	341581894
16096	NC_015865	AAG	2	6	779743	779748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581894
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16100	NC_015865	AGG	3	9	779901	779909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581895
16101	NC_015865	AGC	2	6	779920	779925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581895
16102	NC_015865	GGGA	2	8	779937	779944	25 %	0 %	75 %	0 %	341581895
16103	NC_015865	AGTC	2	8	779957	779964	25 %	25 %	25 %	25 %	341581896
16104	NC_015865	CGC	2	6	780045	780050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581896
16105	NC_015865	CGC	2	6	780101	780106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581896
16106	NC_015865	TCA	2	6	780125	780130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581896
16107	NC_015865	AGA	2	6	780131	780136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581896
16108	NC_015865	CGT	2	6	780141	780146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581896
16109	NC_015865	TGA	2	6	780152	780157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581896
16110	NC_015865	CTA	2	6	780168	780173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581896
16111	NC_015865	GAA	2	6	780177	780182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581896
16112	NC_015865	CGA	2	6	780186	780191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581896
16113	NC_015865	CAT	2	6	780204	780209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581896
16114	NC_015865	ATC	2	6	780211	780216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581896
16115	NC_015865	CAG	2	6	780226	780231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581896
16116	NC_015865	CCAC	2	8	780235	780242	25 %	0 %	0 %	75 %	341581896
16117	NC_015865	GTC	2	6	780265	780270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581896
16118	NC_015865	GGC	2	6	780325	780330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581896
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