MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015865	A	6	6	752904	752909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_015865	GTCC	2	8	752991	752998	0 %	25 %	25 %	50 %	341581867
15503	NC_015865	CAG	2	6	753033	753038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581867
15504	NC_015865	GGA	2	6	753041	753046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581867
15505	NC_015865	CCT	2	6	753065	753070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581867
15506	NC_015865	ATA	2	6	753105	753110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581867
15507	NC_015865	CCT	2	6	753140	753145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581867
15508	NC_015865	GTCC	2	8	753160	753167	0 %	25 %	25 %	50 %	341581868
15509	NC_015865	CTC	2	6	753168	753173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581868
15510	NC_015865	TCC	2	6	753204	753209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581868
15511	NC_015865	AGG	3	9	753219	753227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581868
15512	NC_015865	GAA	2	6	753260	753265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581868
15513	NC_015865	CAG	2	6	753269	753274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581868
15514	NC_015865	TGT	2	6	753277	753282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581868
15515	NC_015865	GTA	2	6	753311	753316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581868
15516	NC_015865	CAG	2	6	753344	753349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581868
15517	NC_015865	CG	3	6	753449	753454	0 %	0 %	50 %	50 %	341581868
15518	NC_015865	CAG	2	6	753523	753528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581868
15519	NC_015865	TTC	2	6	753611	753616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581868
15520	NC_015865	AGG	2	6	753660	753665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581868
15521	NC_015865	TCC	2	6	753731	753736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581868
15522	NC_015865	CCT	2	6	753761	753766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581868
15523	NC_015865	GGCTCG	2	12	753768	753779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	341581868
15524	NC_015865	CCA	2	6	753870	753875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15525	NC_015865	CGA	2	6	753960	753965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581869
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15527	NC_015865	CCA	2	6	753981	753986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581869
15528	NC_015865	GCG	2	6	753989	753994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581869
15529	NC_015865	GCC	2	6	754153	754158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581869
15530	NC_015865	GTA	2	6	754180	754185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581869
15531	NC_015865	CGA	2	6	754197	754202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581869
15532	NC_015865	GTA	3	9	754351	754359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581869
15533	NC_015865	GTA	2	6	754366	754371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581869
15534	NC_015865	GCC	3	9	754375	754383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581869
15535	NC_015865	ATC	2	6	754540	754545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581869
15536	NC_015865	AAGG	2	8	754554	754561	50 %	0 %	50 %	0 %	341581869
15537	NC_015865	CGG	2	6	754566	754571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581869
15538	NC_015865	TCG	2	6	754572	754577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581869
15539	NC_015865	GTC	2	6	754598	754603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581869
15540	NC_015865	ACC	2	6	754634	754639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581869
15541	NC_015865	CCT	2	6	754724	754729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15542	NC_015865	TCT	2	6	754754	754759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_015865	CCA	2	6	754807	754812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15544	NC_015865	CAC	2	6	754939	754944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581870
15545	NC_015865	CCTTC	2	10	754956	754965	0 %	40 %	0 %	60 %	341581870
15546	NC_015865	TCG	2	6	754973	754978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581870
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15548	NC_015865	GGA	2	6	755043	755048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581870
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15550	NC_015865	GGA	2	6	755079	755084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581870
15551	NC_015865	GAGGT	2	10	755191	755200	20 %	20 %	60 %	0 %	341581871
15552	NC_015865	TTC	2	6	755222	755227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581871
15553	NC_015865	AGT	2	6	755253	755258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581871
15554	NC_015865	TCG	2	6	755279	755284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581871
15555	NC_015865	GTC	2	6	755311	755316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581871
15556	NC_015865	CGT	2	6	755403	755408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581871
15557	NC_015865	TCC	2	6	755468	755473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581871
15558	NC_015865	AAGGA	2	10	755480	755489	60 %	0 %	40 %	0 %	341581871
15559	NC_015865	TCC	2	6	755501	755506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581871
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15561	NC_015865	GTC	2	6	755533	755538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581871
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15564	NC_015865	CGG	2	6	755605	755610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581871
15565	NC_015865	TCT	2	6	755619	755624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581871
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15570	NC_015865	GAT	2	6	755868	755873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_015865	GGGCT	2	10	756021	756030	0 %	20 %	60 %	20 %	341581872
15572	NC_015865	CCGA	2	8	756045	756052	25 %	0 %	25 %	50 %	341581872
15573	NC_015865	GACC	2	8	756055	756062	25 %	0 %	25 %	50 %	341581872
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15587	NC_015865	TATG	2	8	757294	757301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_015865	AT	3	6	757337	757342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_015865	GAAA	2	8	757441	757448	75 %	0 %	25 %	0 %	341581873
15590	NC_015865	TCGA	2	8	757460	757467	25 %	25 %	25 %	25 %	341581873
15591	NC_015865	AC	3	6	757683	757688	50 %	0 %	0 %	50 %	341581873
15592	NC_015865	GGC	2	6	757816	757821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581873
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15595	NC_015865	TCG	2	6	757857	757862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581873
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15602	NC_015865	TCG	3	9	758163	758171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581873
15603	NC_015865	CGGA	2	8	758298	758305	25 %	0 %	50 %	25 %	341581873
15604	NC_015865	TGA	2	6	758319	758324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581873
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15606	NC_015865	GC	3	6	758353	758358	0 %	0 %	50 %	50 %	341581873
15607	NC_015865	TGG	2	6	758394	758399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581873
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15612	NC_015865	CGG	2	6	758611	758616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581873
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15618	NC_015865	GAGC	2	8	758887	758894	25 %	0 %	50 %	25 %	341581874
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